ggplot2绘制箱线图设置散点的大小

2024-10-31

R绘图第四篇：绘制箱图（ggplot2）

箱线图通过绘制观测数据的五数总括,即最小值.下四分位数.中位数.上四分位数以及最大值,描述了变量值的分布情况.箱线图能够显示出离群点(outlier),离群点也叫做异常值,通过箱线图能够很容易识别出数据中的异常值. 箱线图提供了识别异常值的一个标准: 异常值通常被定义为小于 QL - l.5 IQR 或者大于 Qu + 1.5 IQR的值,QL称为下四分位数, Qu称为上四分位数,IQR称为四分位数间距,是Qu上四分位数和QL下四分位数之差,其间包括了全部观察值的一半. 箱线图的各个组成部分的

R语言绘制箱型图

箱形图是数据集中数据分布情况的衡量标准.它将数据集分为三个四分位数.盒形图表示数据集中的最小值,最大值,中值,第一四分位数和第四四分位数. 通过为每个数据集绘制箱形图, 比较数据集中的数据分布也很有用. R中的盒形图通过使用boxplot()函数来创建. 基本公式为: boxplot(x, data, notch, varwidth, names, main) x - 是向量或公式.data - 是数据帧.notch - 是一个逻辑值,设置为TRUE可以画出一个缺口.varwidth - 是一个

R语言绘图：箱线图

使用ggplot2绘制箱线图 ######*****绘制箱线图代码*****####### data1$学区房 <- factor(data1$school, levels = 0:1, labels = c("否", "是")) #设置学区房数据为因子类型 data1$CATE <- factor(data1$CATE, levels = c('xicheng', 'dongcheng', 'haidian', 'chaoyang', 'fengtai

一起来玩echarts系列（一）------箱线图的分析与绘制

一.箱线图 Box-plot 箱线图一般被用作显示数据分散情况.具体是计算一组数据的中位数.25%分位数.75%分位数.上边界.下边界,来将数据从大到小排列,直观展示数据整体的分布情况. 大部分正常数据在箱体中,上下边界之外的就是异常数据了. 上下边界的计算公式是: UpperLimit=Q3+1.5IQR=75%分位数+(75%分位数-25%分位数)1.5 LowerLimit=Q1-1.5IQR=25%分位数-(75%分位数-25%分位数)1.5 参数说明: 1.Q1表示下四分位数,即25%

箱线图(boxplot)简介与举例

简述: 盒图是在1977年由美国的统计学家约翰·图基(John Tukey)发明的.它由五个数值点组成:最小值(min),下四分位数(Q1),中位数(median),上四分位数(Q3),最大值(max).也可以往盒图里面加入平均值(mean).如上图.下四分位数.中位数.上四分位数组成一个"带有隔间的盒子".上四分位数到最大值之间建立一条延伸线,这个延伸线成为"胡须(whisker)". 由于现实数据中总是存在各式各样地"脏数据",也成为&q

箱线图boxplot

箱线图boxplot--展示数据的分布图表作用: 1.反映一组数据的分布特征,如:分布是否对称,是否存在离群点 2.对多组数据的分布特征进行比较 3.如果只有一个定量变量,很少用箱线图去看数据的分布,而是用直方图去观察.一般都要跟其余的定性变量做分组箱线图,可以起对比作用.(key) 适合数据类型: 针对连续型变量用法: 只有一个变量.一组的数据(1个变量,0个定性变量),比如:学生的成绩情况只有一个变量.多组数据(1个变量,1个定性变量[班级]),比如:1.2.3班学生的成绩情况只有一

R语言学习 - 箱线图（小提琴图、抖动图、区域散点图）

箱线图箱线图是能同时反映数据统计量和整体分布,又很漂亮的展示图.在2014年的Nature Method上有2篇Correspondence论述了使用箱线图的好处和一个在线绘制箱线图的工具.就这样都可以发两篇Nature method,没天理,但也说明了箱线图的重要意义. 下面这张图展示了Bar plot.Box plot.Volin plot和Bean plot对数据分布的反应.从Bar plot上只能看到数据标准差或标准误不同:Box plot可以看到数据分布的集中性不同:Violin

Matplotlib数据可视化（6）：饼图与箱线图

In [1]: from matplotlib import pyplot as plt import numpy as np import matplotlib as mpl mpl.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] # 中文字体支持 1 饼图-pie()¶ 1.1 pie()方法参数说明¶ pie()是matplotlib中画饼图的方法,其主要参数如下:

07-matplotlib-箱线图

import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt ''' 箱形图(Box-plot)又称为盒须图,盒式图,或箱线图: 是一种用在显示一组数据分散情况的资料统计图: 上边缘,上四分位数,中位数,下四分位数,下边缘,异常值: ''' np.random.seed(100) data = np.random.normal(size=1000,loc=0,scale=1) # sym 指定异常值的点:whis虚线的长度, 通过调整whis的大小来决定

R绘图第六篇：绘制线图（ggplot2）

线图是由折线构成的图形,线图是把散点从左向右用直线连接起来而构成的图形,在以时间序列为x轴的线图中,可以看到数据增长的趋势. geom_line(mapping = NULL, data = NULL, stat = "identity", position = "identity", na.rm = FALSE, show.legend = NA, inherit.aes = TRUE, ...) 线图中的常用参数: group:线的分组 alpha:线的透明度

matplotlib绘制多组散点连线图【用于对比】待实现

绘制散点+连线图: http://www.cnblogs.com/aaronhoo/p/5150596.html http://zhidao.baidu.com/link?url=Q1b7NG8eEz-e-pg5PonP1M0A70sctCvfMgyvtjbu7jdGzRQX5TTpg5vqKEvRb1Vc7iRQ2BBp9h--rKHsYLoxH_ 其他参考: http://blog.csdn.net/baibaibai66/article/details/51260759 http://ww

tecplot 把散点绘成曲面图【转载】

转载自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_a319f5ff0101q6s8.html 找了好久,终于自己研究出来,如何使用tecplot绘制曲面图了第一步:数据的整理如图: 把散点绘成曲面图[转载]"> 第一行是X坐标,第一列是Y,中间的数据时与XY对应的Z值,数据一定是这样的,要不就不能用tecplot完成曲面图的绘制. 第二部:导入tecplot Load Data files->excel Loader->一直下一步就可以,有的地方自己可以

R语言与医学统计图形-【15】ggplot2几何对象之线图

ggplot2绘图系统--几何对象之线图曲线:点连线.路径曲线.时间序列曲线.模型拟合曲线...... 直线:水平直线.垂直直线.斜线. 1.曲线对象及其参数. #路径图 geom_path(mapping = , data = , stat = 'identity', position = 'identity', lineend = 'butt', #线段两端样式,round/square linejoin = 'round', #线段交叉样式,mitre/bevel linemitre

R语言-线图（二）

1.线图示例 plot()为高水平作图命令,axis().lines().legend()都为低水平作图命令 > rain<-read.csv("cityrain.csv") > plot(rain$Tokyo,type="b",lwd=2, #type ="b"表示即画散点也画直线,lwd设置线宽 + xaxt="n",ylim=c(0,300),col="black", #xaxt

highstock K线图深入研究

K线图,相信每个股民都不陌生,如何用SVG画好一个K线图是一个难题. 我选择用highstock做为画图组件,适当的修改了一下源码,参考了数个财经网站的案例,完成了一个不太成熟的K线图,欢迎大家批评指正. 上图就是整个K线图的样子,图的上半部分是K线图和5日均线,10日均线,30日均线,下半部分是成交量,用柱状图显示,tooltips显示了用户选择点的股票指标,所有颜色符合红涨绿跌的原则. 实现的功能主要有: 1.根据用户选择的时间区间,显示最高价和最低价. 2.点击最高价或最低价的flags会

第166天：canvas绘制饼状图动画

canvas绘制饼状图动画 1.HTML <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8"> <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0, user-scalable=no"> <title>

R语言学习 - 线图绘制

线图是反映趋势变化的一种方式,其输入数据一般也是一个矩阵. 单线图假设有这么一个矩阵,第一列为转录起始位点及其上下游5 kb的区域,第二列为H3K27ac修饰在这些区域的丰度,想绘制一张线图展示. profile="Pos;H3K27ac -5000;8.7 -4000;8.4 -3000;8.3 -2000;7.2 -1000;3.6 0;3.6 1000;7.1 2000;8.2 3000;8.4 4000;8.5 5000;8.5" 读入数据 profile_text <

扩增子统计绘图1箱线图：Alpha多样性

绘制Alpha多样性线箱图绘图和统计全部为R语言,建议复制代码,在Rstuido中运行,并设置工作目录为存储之前分析结果文件的result目录 # 运行前,请在Rstudio中菜单栏选择“Session - Set work directory -- Choose directory”,弹窗选择之前分析目录中的result文件夹 # 安装相关软件包,如果末安装改为TRUE运行即可安装 if (FALSE){ source("https://bioconductor.org/biocLite.R

canvas绘制饼型图

<!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8"> <title>Document</title> </head> <body> <canvas id="c"></canvas> <script> var cv = document.getEl

ggplot2|玩转Manhattan图-你有被要求这么画吗？

本文首发于“生信补给站”,ggplot2|玩转Manhattan图-你有被要求这么画吗?更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号. Manhattan图算是GWAS分析的标配图了,可参考Bio|manhattan图进行绘制. 由于Manhattan点太多,后期AI/PS修改的话难度有点大,如果可以“个性化”绘制的话那是极好的! 一载入R包,数据 1)载入数据处理的tidyverse包,使用qqman中gwasResults示例数据集 #载入R包#install.pac

ggplot2绘制箱线图设置散点的大小

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