这里以火山图为例进行说明,在转录组分析中,火山图是很常见的一类图,纵轴表示p_value,横轴表示log (fold change).单一的散点图绘制很简单,火山图比较难处理的地方就是一些基因的注释,基因越多,加文本注释越困难,因为文字会堆在一起,看不清. 示例数据df1是转录组做差异表达后的部分结果,df2将logFC绝对值大于0.3的挑出来了. > head(df1) p_val avg_logFC class gene cd avg_logFC_new2 p_val_new 1 1.628

火山图 Volcano plot 在统计学上,火山图是一种类型的散点图,被用于在大数据中快速鉴定变化.由于它的形成像火山喷发的样子,所以被称为火山图.和上文讲的曼哈顿图类似.   火山图基本元素 火山图也有很多种样式,在生物学高通量测序结果中,常见有的X和Y轴分别为aboundance 和 fold-change,或p-value和fold-change两种样式.如上图中为p-value versus fold-change的样式,,先此为例进行图中基本元素解读: - X轴:通常为两组基因表达或

火山图(Volcano Plot)常用于展示基因表达差异的分布,横坐标常为Fold change(倍数),越偏离中心差异倍数越大;纵坐标为P值(P值),值越大差异越显着.原因得名也许的英文因为查询查询结果图像火山吧 一载入R函数包及数据集 library(ggplot2)data <- read.csv("火山图.csv",header=TRUE,row.names = 1) head(data) #查看数据类型,主要有P值,Fold change和基因ID即可. 二ggplot

标记系统: 笔记的要点 题材 缘起 目标 等级: 细节性 事实性 规律 法则 适用范围: 时间.地点.人物.起因.经过.结果,who what where when why how whom 6W1H 行动指南 计划 闹钟 提醒 文本注释系统 粗体.斜体突出 [??][!!][..]思辨:观点.结论.描述.叙述,陈述,逻辑 添加文字 [eg]例证:[ref:化学.物理.政治.经济学][then]引申:引发细节.联想.思辨.存疑: [Tips1:]行动指南:计划.提醒.目标 不兼容 [--]细节,

添加类注释: File---Setting----Editor----Code Style-----File and    Code  Templates--------Class #if (${PACKAGE_NAME} && ${PACKAGE_NAME} != "")package ${PACKAGE_NAME};#end #parse("File Header.java") /** *@program: ${PROJECT_NAME} *@d

MFC的PNG贴图按钮类(详细注释) (转载请注明出处) 作者:梦镜谷雨 萌新第二次写帖子,请多多包涵.末尾附上相应代码(PS公司繁体系统所以部分注释繁体请别介意). 因自带控件不美观,于是网上参考学习了些代码做了个按钮类.可以载入通过资源的ID加载也可以通过外部动态加载PNG图片,可以选择半透明贴膜效果. 参考代码:https://blog.csdn.net/qq_16123279/article/details/82858238 参考代码:https://blog.csdn.net/zhon

conda  install seaborn  是安装到jupyter那个环境的 1. 整体风格设置 对图表整体颜色.比例等进行风格设置,包括颜色色板等调用系统风格进行数据可视化 set() / set_style() / axes_style() / despine() / set_context() import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns % ma

问题:在文本编辑器中编辑Python文件时添加中文注释,运行python文件时报错.SyntaxError: Non-UTF-8 code starting with '\xc1' 解决方法:在文本开头添加 # coding=gbk

只有两个步骤: 1.设置模板 Windows—Preference—Java—Code Style—Code Templates 图中, Configure generated code and comments中的每种被注释的类型,都可以在下面Pattern中预览其注释模板,如果需要修改,点击右上角的 edit 就可以修改成需要的格式. 修改时,@后面的内容为注释中需要原原本本显示的内容,${}中的内容都是系统定义的函数,用于显示类型名称——${type_name},显示当前日期${date}

一,Android Studio新建类头部注释 是不是有时候看到这个很心烦 其实Studio中有设置修改这些注释模板的信息的功能 其实很简单,只需要两步: 1.打开Setting设置面板,找到File and Code Templates,选择Includes下的File Header 2.修改成自己需要的变量名即可 二,Android Studio添加函数注释模板及快捷键 1,javaDoc自动生成注释 如果我们想获取到方法名,参数返回值的信息,想让这些信息全部自动生成的注释里面的话,我们可以

系统自带的数据表格(存放在github上https://github.com/mwaskom/seaborn-data),使用时通过sns.load_dataset('表名称')即可,结果为一个DataFrame. print(sns.get_dataset_names()) #获取所有数据表名称 # ['anscombe', 'attention', 'brain_networks', 'car_crashes', 'diamonds', 'dots', 'exercise', 'flight

为了进一步补充说明文件中的一些重要内容,PDF文件的创建者会为一些文本创建链接,方便阅读者访问相关的网站,获取更多的信息. 我们可以通过使用pdfFactory文本链接功能来实现以上需求,另外,我们还可以通过文本链接功能定制链接的外观,以更好地引起阅读者的注意. 图1:软件链接编辑面板 我们可以通过页面快捷菜单以及链接功能面板两种方式添加文本链接.页面快捷菜单的方式会比较便捷,但仅能使用默认的链接外观:而链接功能面板则可以定制链接外观,但操作起来不如页面快捷菜单便捷. 方法一.使用页面快捷菜单添

一.绘制简单的几何形状和添加文本 opencv中绘制图形很简单,我们只需要使用下面这些常用函数即可. #画线 cv2.line() #画圆 cv2.circle() #画矩形 cv. rectangle() #画椭圆 cv.ellipse() #向图像添加文本 cv.putText() 在上述所有功能中,我们可以看到一些常见的参数,如下所示: img:我们要绘制形状的图像 color:形状的颜色.对于BGR,将其作为元组传递,例如:(255,0,0)就是蓝色.灰度图的话,我们只需要传递标量值即可

页眉常用于显示文档的附加信息,我们可以在页眉中插入文本或者图形,例如,页码.日期.公司徽标.文档标题.文件名或作者名等等.那么我们如何以编程的方式添加页眉呢?今天,这篇文章向大家分享如何使用了免费组件Free Spire.PDF给PDF文档添加文本和图片页眉.这个组件提供了一些方法,可以帮助我们快速方便地实现此目的. 添加页眉步骤: 首先,创建一个Visual C#控制台项目,添加组件引用并使用以下命名空间. using System; using System.Drawing; using S

对于我这个js 小白来说 今天鼓起勇气做起了邮箱认证这个特效 但是这次不是想说如何实现这这个特效而是想记录一下特效当中的某个部分 那就是向元素节点动态添加文本节点 百度了一下动态添加文本节点的方式 是使用document.createNodeChild("要想添加的内容");   这个方法 它的使用方式是: var correct = document.createTextNode("输入正确"); var error = document.createTextNo

Apple当前启用了Markup语法形式的富文本注释格式,并且为此列出了官方文档,可以参考此链接:https://developer.apple.com/library/ios/documentation/Xcode/Reference/xcode_markup_formatting_ref/index.html#//apple_ref/doc/uid/TP40016497 这么一来,直接在代码内部实现文档化就更方便.直观.灵活强大了-

1.自定义函数 新建一个m文件 在m文件里面第一行输入function [X,Y]=pll(X1,Y1,X2,Y2),这里x1 x2 y1 y2是你函数的输入值, x y是输出值,接着定义你要实现的功能,比如:x = x1 + x2; y = y1 + y2; 接着保存这个m文件,注意!! 这个m文件的名字必须是定义的函数的名字,即保存为pll.m 否则会出错. 接着在matlab命令窗口中输入 pll(1,2,3,4)看看会得到什么? 也可以另外创建一个m文件,在这里调用pll()这个函数.

菜单“Add->Text”,然后在右侧Options栏设置好合适的Class and Subclass,Text block,然后在布板界面上点击鼠标左键,设置起始点,接着点击鼠标右键,在弹出的菜单中选择“Read from File”. 注意,该文本文件名不能包含中文字符及文本内容不能包含allegro所规定的特殊字符. 上图 原创文章,转载请注明: 转载自 http://www.mr-wu.cn/ 吴川斌的博客 本文链接地址: Cadence Allegro小技巧-从外部文本文件添加文本 h

转:http://www.cnblogs.com/lantionzy/archive/2009/10/23/1588511.html 1.新建Word文档 #region 新建Word文档/// <summary>/// 动态生成Word文档并填充内容 /// </summary>/// <param name="dir">文档目录</param>/// <param name="fileName">文档名

oracle添加表注释和表字段注释 创建Oracle数据库表时候加上注释 CREATE TABLE t1(id  varchar2(32) primary key,name VARCHAR2(8) NOT NULL,age number,) 添加表注释:COMMENT ON table t1 IS '个人信息'; 添加字段注释:comment on column t1.id  is 'id';comment on column t1.nameis '姓名';comment on column t