本文作者:余光创,目前就读于香港大学公共卫生系,开发过多个R/Bioconductor包,包括ChIPseeker, clusterProfiler, DOSE,ggtree,GOSemSim和ReactomePA. 进化树看起来和层次聚类很像.有必要解释一下两者的一些区别. 层次聚类的侧重点在于分类,把距离近的聚在一起.而进化树的构建虽然也可以说是一个聚类过程,但侧重点在于推测进化关系和进化距离(evolutionary distance). 层次聚类的输入是距离,比如euclidean或ma

目录 1. 注册 2. 去枝长 3. 加图例 4. 无根树颜色 5. 导出图片 iTOL基本用法已经会了,之前记录过一点:系统发育(进化)树绘制小结.最近重用,调图时又发现了些细节,记录下备忘. 1. 注册 不注册也可用,但注册登录可保存树在itol网站上. 2. 去枝长 进化树能展示枝长是最好的,能用来判断材料和群体间的特殊性.但现在大部分文章中的进化树都是去掉了枝长的,也可以理解,样本太多,展示不好看. 处理前: 处理后: 3. 加图例 对进化树添加分类后的注释,图片的图例是需要自己设置的.

我们在2016年年初推出了MIP,帮助移动页面加速(原理).内测数据表明,MIP页面在1s内加载完成.现在已经有十多家网站加入MIP项目,有更多的网站正在加入中.在我们收到的反馈中,大部分都提到了广告的加载问题. MIP for ads 介绍 MIP 对普通内容已经做得足够好,那么广告是否也可以得到相同加载速度的收益呢? 在阐述之前,先引用一段来自谷歌的数据:如果发行商能够将网页的加载速度从平均的19秒,提升到5秒,广告收入就可以翻倍,同时也能提升用户留存. 当然,广告加载速度提升一直是我们 M

UWP中新加的数据绑定方式x:Bind分析总结 0x00 UWP中的x:Bind 由之前有过WPF开发经验,所以在学习UWP的时候直接省略了XAML.数据绑定等几个看着十分眼熟的主题.学习过程中倒是也没遇到麻烦.直到在园子里看到了这篇文章: http://www.cnblogs.com/gaoshang212/p/4534138.html 原来UWP的绑定中新加了个x:Bind,从文章中可以看到x:Bind的效率是很高的.找到MSDN(数据绑定)看了一下(完整的学习目录可参见: http://w

下面的图片是我使用firefox和chrome浏览百度首页时候记录的http请求 下面是firefox: 下面是chrome: 在浏览百度首页前我都将浏览器的缓存全部清理掉,让这个场景最接近第一次访问百度首页的情景. 在firefox的请求瀑布图里有个表现非常之明显:就是javascript文件下载完毕后,有一段时间是没有网络请求被处理的,这段时间过后http请求才会接着执行,这段空闲时间就是所谓的http请求被阻塞. 浏览器里的http请求被阻塞一般都是由javascript所引起,具体原因是

Javascript在浏览器中的性能,可以说是前端开发者所要面对的最重要的可用性问题. 在Yahoo的Yslow23条规则当中,其中一条是将JS放在底部 .原因是,事实上,大多数浏览器使用单进程处理UI和更新Javascript运行等多个任务,而同一时间只能有一个任务被执行.Javascript运行了多长时间,那么在浏览器空闲下来响应用户交互之前的等待时间就有多长. 从基本层面说,这意味着<script>标签的出现使整个页面因脚本解析.运行而出现等待.不论实际的 JavaScript 代码是内

.Net开发者一定熟悉下面这个画面: 这就是宇宙第一IDE Visual Studio的启动画面,学名叫Splash Screen(或者Splash Window).同样,Javar们一定对Eclipse的启动画面不会陌生.不只是IDE,很多桌面程序都会有这个Splash 窗口,在程序进行初始化时显示. 这方面做得最赞的非Adobe旗下的设计类软件莫数了,毕竟是搞艺术出身的啊.博主从PS 8.0用起,每次升级新版本激动的不是新功能,首先是激动新的启动画面.下图是最新CC版PS的Splash Sc

       首先说明一下,hibernate的延迟加载特性(lazy).所谓的延迟加载就是当真正需要查询数据时才执行数据加载操作.因为hibernate当中支持实体对象,外键会与实体对象关联起来.如果没有这一特性,当查询某一个含有外键的实体对象时,hibernate会把其他实体对象的数据都查询出来.简单的来说,当你想查询某个对象时,实际上调用了多条查询语句.有了延迟加载特性,就避免了这种情况的发生,当你真正的使用get另外一个实体对象时,才再执行下面一条查询语句.           但有些时

关于前端框架系列的可以参考我我刚学Bootstrap时候写的LoT.UI http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4822808.html#lotui bootstrap-select没有select2那么强大的api,但是胜在漂亮啊,配合自己写的脚本基本上也是够用了 一般都是自己Ajax加载数据,然后字符串拼接.拼接完了之后用官网的方法刷新一下select就可以了 举个不成文的例子(有更好的方法可以留言):包含optgroup 前端HTML部分 初始化(可有可无)

首先,理解按需加载当你需要用到某个js里面的函数什么鬼,或者某个css里的样式的时候你才开始加载这个文件. 然后是怎样实现的,简单来说就是在js中动态的createElem<script><link>这两种元算--这句话是说给自己的.可以绑定点击事件,滚轮事件(例如图片的懒加载是动态的.) 使用 require.js (一个按需加载的插件)管理.js按需加载,来自http://www.cnblogs.com/chenxizhang/archive/2013/05/16/308194

Vue-Router 页面正在加载特效 如果你在使用 Vue.js 和 Vue-Router 开发单页面应用.因为每个页面都是一个 Vue 组件,你需要从服务器端请求数据,然后再让 Vue 引擎来渲染到页面上. 例如,这里有个用户个人资料的页面. user.vue 文件如下: <template> <div> <h2 v-text="user.name"></h2> <p v-text="user.description&

前言:不知不觉中又加班到了10点半,整个启动页面做了一天多的时间,一共有三个页面,每个页面都有动画效果,动画效果调试起来麻烦,既要跟ios统一,又要匹配各种不同的手机,然后产品经理还有可能在中途改需求,程序员各种苦逼有木有,在这个过程中也学到了蛮多东西的,所以写一篇博客跟大家分享一下.   先看效果图: 1.显示三个页面的Activity  用view pager去加载三个fragment实现,控制点点点的切换,监听view pager的切换,控制fragment动画的开始跟结束,重写了view

title: 带你实现开发者头条APP(五)--RecyclerView下拉刷新上拉加载 tags: -RecyclerView,下拉刷新,上拉加载更多 grammar_cjkRuby: true --- 一 .前言 最近实在太忙,一个多礼拜没有更新文章了,于是今晚加班加点把demo写出来,现在都12点了才开始写文章. 1.我们的目标 把RecyclerView下拉刷新上拉加载更多加入到我们的开发者头条APP中. 2.效果图 3.实现步骤 找一个带上拉刷新下载加载更多的RecyclerView开

WeTest 导读 现在app越来越炫,动不动就搞点动画,复杂的动画用原生实现起来挺复杂,如是就搞起gif播放动画的形式,节省开发成本.   背 景 设计同学准备给一个png序列,开发读取png序列,一帧一帧的播放出来,实现一个动画的效果. 为什么不直接使用gif,github上有好的开源库可以直接播放gif的,为嘛?大部分原因还是要回答,项目需求决定. 实现思路: 1.比较偷懒的方式,将设计同学给的png序列直接放到一个 animation-list中,就像这样子: 然后直接,放在设置为一个I

2017 新年好 ! 新年第一天对我来说真是悲伤 ,早上兴冲冲地爬起来背着书包跑去实验室,结果今天大家都休息 .回宿舍的时候发现书包湿了,原来盒子装的牛奶盖子松了,泼了一书包,电脑风扇口和USB口都进牛奶了,赶紧拔掉电池,用风扇吹啊吹.强行开机,无线网卡坏掉,屏幕里面进牛奶,难看死啦 ~ 鼠标也坏掉了,谁能赠送我一个鼠标啊 ..O... 中午吃完饭,就开始完善模块加载器了.到傍晚,差不多了,出去浪了一会儿 ~ my-Require.js 回顾 在 使用RequireJS 并实现一个自己的Requ

看了网上这样自带加减的edittext写得好复杂,还有各种监听事件,我觉得没有必有.于是我自己写了一个. 我这个edittext仅仅限制整数,每次加减1. public class TestEditTextActivity extends Activity implements OnClickListener { private TextView tv_subtract, tv_add; private EditText et_rate; // 存储全局变量的数字 private int num

模块加载痛点 大家也或多或少的了解node模块的加载机制,最为粗浅的表述就是依次从当前目录向上级查询node_modules目录,若发现依赖则加载.但是随着应用规模的加大,目录层级越来越深,若是在某个模块中想要通过require方式以依赖名称或相对路径的方式引用其他模块就非常麻烦,影响开发效率和美观. 示例demo: // 当前目录: /usr/local/test/index.js // gulp模块所在路径为 /usr/lib/node_modules var gulp = require(

相信很多小伙伴都在android开发中遇到调用jni的各种巨坑,因为我们不得不在很多地方用到第三方库so文件,然而第三方官方通常都只会给出ADT环境下的集成方式,而谷歌亲儿子android studio默认采用的却是gradle方式,与ADT编辑的方式大不相同,那再andorid studio中如何导入so文件呢? 在android studio 中我们可能会用到jar包和so文件的方式,对于jar包可能接触更多,只需要我们把工程转换为project显示方式,打开app下的libs文件夹,导入即

问题: 打开Visual Studio 的时候,总提示未能加载相应的Package包,有时候还无法打开项目,各种提示 解决方案: 进入用户目录 C:\Users\用户名\AppData\Local\Microsoft\VisualStudio\VS版本(12.0)\ComponentModelCache 该目录 删除 Microsoft.VisualStudio.Default.cache 该文件,即可解决VS 未能加载各种Package包的问题了

做一个学习记录. 有两个需求: 1.点击按钮,异步加载数据,不卡顿UI. 2.把获取的数据加载到gridview上面. 对于需求1,2,代码如下: public delegate void ShowDatatableDelegate(DataTable dt); private async void button1_Click(object sender, EventArgs e) { //way1.ok Thread t = new Thread(ShowDatatable); t.IsBac