注意:本文的内容主要来自于GATK官网的讲解,所以vcf也是GATK产生的,用其他caller,比如varscan2产生的vcf文件的内容注释可能不一致. 参考:https://gatkforums.broadinstitute.org/gatk/discussion/1268/what-is-a-vcf-and-how-should-i-interpret-it VCF:由HEADER和RECORDS组成. RECORDS的FORMAT内容详解: QUAL:指的是caller正确的识别该变异位

1)背景 伴随着大规模的基因分型及测序工程的产生(例如1000 Genomes Project),之前的信息贮存格式例如gff文件它记录了每一个基因的详细信息,其中许多基因信息在基因组之间是共享的,而我们需要记录的仅仅是不同基因组之间变异的地方,因此这些格式会显得格外冗余.这就迫切需要一种新的格式来记录高效的记录这些变异信息.VCF(Variant Call Format)就是这样一种用来贮存基因序列变异信息的文本文件(通常是压缩格式). 2)VCF格式简介 VCF 格式文件包含有2部分:1)

Variant Call Format(VCF)是一个用于存储基因序列突变信息的文本格式.表示单碱基突变, 插入/缺失, 拷贝数变异和结构变异等.BCF格式文件是VCF格式的二进制文件. CHROM [chromosome]: 染色体名称. POS [position]: 参考基因组突变碱基位置,如果是INDEL(插入缺失),位置是INDEL的第一个碱基位置. ID [identifier]: 突变的名称.若没有,则用'.'表示其为一个新变种. REF [reference base(s)]:

  Intel低字节在前 Motorola高字节在前    在进行CAN总线通信设计或者测试过程中,经常看到CAN总线信号的编码格式有两种定义:Intel格式与Motorola格式.究竟两种编码格式有什么样的区别呢?设计者.dbc文件编辑者或者测试人员又该如何判断两种格式,并进行有效正确的配置和解析呢?下面作者给出自己在设计和测试过程中的一点体会和见解,希望能够总结出来加深一下印象和理解. 在编码优缺点上,Motorola格式与Intel格式并没有孰优孰劣之分,只不过根据设计者的习惯,由用户自主

Android sdk 支持vcf处理的(忘记最低哪个版本开始支持的了,可以查一查) 备注:此代码来自Stack Overflow(原地址找不到了,o(╥﹏╥)o) 1. 导出联系人为vcf格式 Contact provider中有ContactsContract.Contacts.CONTENT_VCARD_URI的定义,说明他是支持vCard规范的 package com.mygmer.contactstest; import java.io.File; import java.io.Fil

YUV420介绍: YUV420格式是指,每个像素都保留一个Y(亮度)分量,而在水平方向上,不是每行都取U和V分量,而是一行只取U分量,则其接着一行就只取V分量,以此重复(即4:2:0, 4:0:2, 4:2:0, 4:0:2 .......),所以420不是指没有V,而是指一行采样只取U,另一行采样只取V.在取U和V时,每两个Y之间取一个U或V.但从4x4矩阵列来看,每4个矩阵点Y区域中,只有一个U和V,所以它们的比值是4:1.所以对于一个像素,RGB需要8 * 3 = 24位,即占3个字节:

VIA是一款很好用的标注软件,基于网页,不过现在开源的大多数目标检测器都是基于COCO训练和测试的,我们如果想要训练自己的数据集,要么修改源代码,要么将自己的标注格式改成COCO格式,采用第一种方法很容易出错,那么格式转换就是一个比较简单的办法,我找了好久没有看到VIA格式转为COCO格式的工具或者博客,于是干脆决定自己写一个吧,写的过程参考了https://github.com/waspinator/pycococreator/,在我的另一篇博客"PANet训练自己的数据集“中,我解释了二者格

Django---Http协议简述和原理,HTTP请求码,HTTP请求格式和响应格式(重点),Django的安装与使用,Django项目的创建和运行(cmd和pycharm两种模式),Django的基础文件配置,Web框架的本质,服务器程序和应用程序(wsgiref服务端模块,jinja2模板渲染模块)的使用 一丶Http协议 http协议简介       超文本传输协议(hyper Text Transfer Protocol :HTTP),是一种用于分布式,协作式和超媒体信息系统的应用层协议

一.CAN数据帧的标准格式和扩展格式 我们知道CAN总线上的数据帧都可以配置一个ID号,其可以为11位(标准ID格式)或者29位(扩展ID格式),这也是数据帧的标准格式和扩展格式的区别所在. 这个ID在CAN优先级中起着重要的作用,它决定了数据帧发送的优先级.对于优先级高的信息,可以给他打包上一个高优先级的ID,使它能够及时的发送出去. RTR:用于区分此帧是数据帧还是遥控帧,显性电平(逻辑0)表示数据帧,隐性电平(逻辑1)表示遥控帧. 数据帧:包含了我们要传输的数据的帧,用于往总线上发送数据.

今天遇到了这些问题索性就 写篇文章吧 话不多说直接上栗子 不管任何是HTML格式还是JS格式必须要在  controller 里面写 // new Date() 获取当前时间 yyyy-MM-ddd //是返回的格式 下面会一 一列出 这种返回格式$scope.wwwwwww = $filter(new Date(),'yyyy-MM-dd') //或者这样写//这样是 指定date类型 可以省略不写 下面的是多此一举 但是我感觉有人会钻牛角尖所以嘛 嘿嘿 $scope.wwwwwww = $f

.net中,处于安全的考虑,RSACryptoServiceProvider类,解密时只有同时拥有公钥和私钥才可以.原因是公钥是公开的,会被多人持有.这样的数据传输是不安全的.C#RSA私钥加密,公钥解密出错的原因! C#中用RSA算法生成公钥和私钥 方法一: 公钥密钥生成后,保存在同名文件夹下面,如下图: 公钥密钥生成,所在路径[RSA\RSA\bin\Debug] using System; using System.IO; using System.Security.Cryptograph

前言 最近由于项目需求,服务端由c#编写,客户端由java编写.通信数据使用RSA非对称加密.但是java和c#生成的密钥格式是不一样的,所以需要转换格式才可以正常使用.网上搜到使用java进行格式转换的代码(如:http://blog.csdn.net/road2010/article/details/40071881 ),本文将给出一种c#的实现方法. 密钥格式 java密钥格式如下: 私钥: MIICdwIBADANBgkqhkiG9w0BAQEFAASCAmEwggJdAgEAAoGBA

在从事软件开发的过程中,经常会涉及到在Linux下将数据库脚本文件从sh格式变为sql格式的问题.本文以一个实际的脚本文件为例,说明格式转换的过程.        1. sh文件内容 本文中的文件名为example.sh,其内容如下: #!/bin/bash function Init() { if [ -f"example.sql" ] then echo"example.sql is exits and is deleting it,then recreate it&qu

TLV 格式是什么格式 一种可变格式, TLV 的意思就是: Type 类型, Lenght 长度, Value 值: Type 和 Length 的长度固定,一般那是 2 . 4 个字节: Value 的长度有 Length 指定: 解析方法: 1. 读取 type 转换为 ntohl . ntohs 转换为主机字节序得到类型:指针偏移 +2 或 4 2. 读取 lenght ,转换为 ntohl . ntohs 转换为主机字节序得到长度:指针偏移 +2 或 4 3. 根据得到的长度读取 va

把硬盘格式化成ext格式的cpu占用率就下来了我是使用ext4格式 @Paulz 还有这种事情? 现在是什么格式?- - ,你自己用top命令看一下啊就知道什么东西在占用cpu了下载软件一半cpu都用在ntfs3g上了,有个球用 这些命令我都懂,但是我怎么没想到关键是你这硬盘就需要专用路由器了,

在软件开发过程中,经常参与Linux从下一个脚本文件数据库sh格式改变sql格式问题.在本文中,一个实际的脚本文件,例如.描述格式转换过程.        1. sh文件内容 本文中的文件名称为example.sh,其内容例如以下: #!/bin/bash function Init() { if [ -f"example.sql" ] then echo"example.sql is exits and is deleting it,then recreate it&quo

Excel 转vCard格式(常用于Gmail, Yahoo, 163等).CSV格式(常用于Outlook, Foxmail等) 最近公司邮件通讯录需要更新,我就将原来的通讯录给删除了,准备重新导入.删除后才发现,原来只支持vCard格式和CSV格式,然而公司给我的是Excle文件,怎么都导不进去.最后,通过百度,试了很多方法,都不太适合我,经过几次修改数据,终于导入成功.现在分享一下我的经历. 我们导入邮箱通讯录的信息只需要"姓名"和"邮件地址"两个,不需要其他

html格式转md格式 # 模块html2text pip install html2text/pip3 install html2text 测试: import html2text as ht text_maker = ht.HTML2Text() # 读取html格式文件 with open('./*.html', 'r', encoding='UTF-8') as f: htmlpage = f.read() # 处理html格式文件中的内容 text = text_maker.handl

2014-04-23 18:55:49:123    日期格式 1398250549123        时间戳格式 前台显示日期格式,则 function tsToTime(ts) { var date = new Date(ts * 1000);//时间戳为10位需*1000,时间戳为13位的话不需乘1000 var Y = date.getFullYear() + '-'; var M = (date.getMonth()+1 < 10 ? '0'+(date.getMonth()+1)

这周工作终于不太忙了,可以写点笔记总结一下了. 之前的文章如何在Keil-MDK开发环境生成Bin格式文件,介绍了如何在Keil开发环境使用fromelf软件,将生成的axf文件转换为bin文件,这次我们再来介绍一下如何将elf文件转换为hex文件. 如何将elf文件转换为hex文件 elf(Executable and Linkable Format)文件一般是由gcc编译器生成的,在Linux开发环境使用较多,但Windows一般情况下需要使用hex文件来进行烧录,那么如何将elf格式转换为

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