注意:本文的内容主要来自于GATK官网的讲解,所以vcf也是GATK产生的,用其他caller,比如varscan2产生的vcf文件的内容注释可能不一致. 参考:https://gatkforums.broadinstitute.org/gatk/discussion/1268/what-is-a-vcf-and-how-should-i-interpret-it VCF:由HEADER和RECORDS组成. RECORDS的FORMAT内容详解: QUAL:指的是caller正确的识别该变异位

一: linux记录锁更恰当的称呼应该是范围锁,它是对文件某个范围的锁定. 关于记录锁的功能就是fcntl提供的第五个功能,具体使用如下: int fcntl(int fd, int cmd, struct flock *lock); cmd = F_GETLK, 主要用来检测是否有某个已存在锁会妨碍将新锁授予调用进程, 如果没有这样的锁,lock所指向的flock结构的l_type成员就会被置成F_UNLCK, 否则已存在的锁的信息将会写入lock所指向的flock结构中cmd = F_SET

1. atime, ctime 以及mtime 这三个名词属于文件/文件夹的属性,存在于inode数据结构之中. 通过系统调用stat可以获取stat结构,其中包括:atime(accesstime), ctime(create time) 以及mtime(modify time)的信息,man stat后的信息: +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

父子进程间交互执行是指用一种同步原语,实现父进程和子进程在某一时刻只有一个进程执行,之后由另外一个进程执行,用一段代码举例如下: SYNC_INIT(); , counter=; pid_t pid = fork (); ) err_sys ("fork error"); ) { // parent ; i<NLOOPS; i+=) { counter = update ((long *)area); if (counter != i) err_quit ("paren

SVN如何查看修改的文件记录 [日期:2014-11-20] 来源:Linux社区  作者:frogoscar [字体:大 中 小]     主要是有四个命令,svn log用来展示svn 的版本作者.日期.路径等等:svn diff,用来显示特定修改的行级详细信息:svn cat,取得在特定版本的某文件显示在当前屏幕:svn  list,显示一个目录或某一版本存在的文件. 比较常用的是svn diff命令.它可以比较不同版本之间.svn版本和本地版本库之间,以及检查本地修改的作用. svn d

日常开发中,做更新操作的时候的处理方法为:当这个字段有值则更新,没有值就不更新,在mybatis的xml中表现为: <!-- 修改记录,只修改只不为空的字段 --> <update id="updateBySelective" parameterType="Object" > update tb_mj_user set <trim suffixOverrides="," > <if test="

四则运算编程 PSP记录个人项目耗时情况 PSP Personal Software Process Stages Time(%) Planning 计划 7 Estimate 估计这个任务需要多少时间 7 Development 开发 85 Analysis 需求分析 4 Design Spec 生成设计文档 5 Design Review 设计复审 3 Coding Standard 代码规范 4 Design 具体设计 12 Coding 具体编码 40 Code Review 代码复审

Insus.NET的系列Web Api学习文章,这篇算是计划中最后一篇了,删除JSON格式的文件记录.前一篇<Web Api其中的PUT功能演示>http://www.cnblogs.com/insus/p/4346982.html中学习了怎样更新数据.程序开发涉及到数据的,为了让用户方便管理,一般提供了查询,添加,更新以及删除功能.本篇中是针对文件中的数据进行删除. 下面Insus.NET就对此进行详尽演示.Web Api的一个type: "DELETE".在API控制中

secureCRT简单上传.下载文件记录: 1)sz下载 -y 覆盖 2)rz上传 -y 覆盖 3)以上两个命令属于安装时包含在“Dial-up Networking Support"组中 yum install lrzsz -y yum groupinstall "Dial-up Networking Support"-y 4)只能上传下载文件 5)上传的文件可以是电脑里的任意文件

git clean 删除忽略文件 和 未被跟踪文件及文件夹 概念 首先我们需要认清 忽略的文件 和 未被跟踪的文件 忽略的文件:.gitignore 中忽略的文件 未被跟踪的文件:没有被忽略,但是还没 git add 的文件 git clean  -f 删除:未被跟踪的文件 git clean -fd 删除:未被跟踪的文件和文件夹 git clean -xfd 删除:忽略的文件.未被跟踪的文件和文件夹 git clean [-xfd] -n -n 会先打印一些将要删除的文件,并不执行删除动作,主

# shell-100只是为了练习!!适合新手! #!/bin/bash # 此脚本是记录每天的磁盘情况,记录保存30天! # 当前的日期 current_time=$(date +%F) # 保存的目录位置 dir=/date/logs/disklog # 判断目录是否存在.不存在则创建! if [ ! -d $dir ] then mkdir -p $dir fi # 记录日志! df -h > $dir/$d.log ##此目录下的日志只保存30天 find $dir/ -mtime +

Win10删除或不显示快速访问中最近使用文件记录 安装win10系统后,在文件资源管理器的快速访问将默认记录使用和访问了电脑的一些文件,但是有些最近访问文件的历史纪录,并不想让别人看到,所以就想快速删除或者不显示最近使用文件记录,具体的方法如下 1.首先打开文件资源管理器,右键点击所选文件,弹出列表选择 从快速访问中删除 à这个是笨办法,如果文件超多的话,可能要删除多次 2.快速访问右键选中“选项”,一键清除记录 à可将所有的记录均清除,包括最进使用的文件及文件夹你,此方法只能清除记录,以后还是

Dockerfile + Nginx.conf文件记录(用于前端项目部署) 本教程依据个人理解并经过实际验证为正确,特此记录下来,权当笔记. 注:基于linux操作系统(敏感信息都进行了处理),默认服务器安装了docker以及nginx 此文结合另一篇博客共同构成前端服务部署的教程,特此记录.我使用了Docker进行发布,并使用了nginx进行静态资源处理,这里并不详细解析Dockerfile以及Nginx.conf的作用以及内部指令. Dockerfile FROM nginx:1.15.2-

Dockerfile文件记录(用于后端项目部署) 本教程依据个人理解并经过实际验证为正确,特此记录下来,权当笔记. 注:基于linux操作系统(敏感信息都进行了处理) 此文结合另一篇博客共同构成后端服务部署的教程,特此记录,并不详细解析Dockerfile的作用以及内部指令的详细解析,个人理解约定大于配置,学习docker或者nginx等等这些工具都只是在学习创造他们的人当初对工具进行的约定,比如我约定ENTRYPOINT关键字为Dockerfile中对于镜像来说的入口命令,约定Dockerfi

使用input:file控件在微信内置浏览器上传文件返回未显示选择的文件 原来的写法: <input type="file" accept="image/x-png,image/jpeg" /> 改成: <input type="file" accept="image/*" /> 解决!

对应Framework版本重新注册 2.0:C:\Windows\Microsoft.NET\Framework\v2.0.50727\aspnet_regiis.exe -i 4.0:C:\Windows\Microsoft.NET\Framework\v4.0.30319\aspnet_regiis.exe -i   (32位) 4.0:C:\Windows\Microsoft.NET\Framework64\v4.0.30319\aspnet_regiis.exe -i  (64位) 修改

日志级别: 是按严重(重要)程度来分的(如下6种): ALL < TRACE < DEBUG < INFO < WARN < ERROR < FATAL < OFF   打印日志的规则: levelP>=levelQ,则levelP会打印在levelQ的log里. 即:如果设置的日志级别是info,则会包括info.warn.error等高级别的日志   如下demo以打印到控制台来做测试.   log4j2依赖 <properties> <

背景 很多人记录过怎么执行Go test单个文件或者单个函数,但是要么对执行单文件用例存在函数或变量引用的场景避而不谈,要么提示调用了其它文件中的模块会报错.其实了解了go test命令的机制之后,这个问题就迎刃而解了. 也是一个同事向我求助我才知道有这样一个问题存在,因为场景特殊他只想执行我们的测试代码其中一个文件中的测试代码,因为调用的信息都在同一目录(package)下,原代码执行是不存在引用问题的,直接执行go test也是可以运行的,但是单独运行其中一个文件时,出现了下面的错误: bi

unit UntOpenMenu; //download by http://wwww.NewXing.com interface uses Windows, Messages, SysUtils, Classes, Graphics, Controls, Forms, Dialogs, Menus,registry; type TFrmMain = class(TForm) MainMenu1: TMainMenu; F1: TMenuItem; open: TMenuItem; Recent

[a] 概念 建议锁:在遵循相同记录锁规则的进程间生效,通常用于保证某个程序自身多个进程间的数据一致性 强制锁:意在保证所有进程间的数据一致性,但不一定有效:如不能应对先 unlink 后建立同名副本的行为 [b] fcntl #include <fcntl.h> int fcntl(int fd, int cmd, struct flock *flockp) //出错返回 -1  struct flock { short l_type; //锁类型:F_RDLCK / F_WRLCK / F

先记录一些零碎的知识点: 1. 一个类可以被声明多次,但只能定义一次,也就是可以 class B;  class B;  class B; ……;  class B {……};  这样子. 2. 一个类 C 的声明中(函数只声明还没定义)可以使用一个只被声明还没定义的类 B,但只能使用类 B 的指针或引用(用作函数参数或其他等等),不能是完整的对象. 3. 若类 C 的函数中需要使用到类 B 的函数,则类 B 的函数必须已定义好而不能只是声明. #include<iostream> class