目前GWAS方向发了很多文献,但是并没有一个很完善的R包对这些文献的数据进行汇总. 接下来推荐的这个是最新发表的GWAS数据汇总R包​.看了一下功能齐全,但是数据不是收录的很齐全​. 下面具体讲一下.​ 在R上安装 install.packages("remotes") remotes::install_github("ramiromagno/gwasrapidd") 查询是否有发表关于自身免疫性疾病的文章 library(gwasrapidd) my_studie

1. Python包管理工具 在安装Python包的过程中,经常涉及到distutils.setuptools.distribute.setup.py.easy_install.easy_install和pip等等.突然对Python的包管理凌乱了,这些工具关系是什么,应该怎么去选择使用? 下面就简单介绍下Python包管理相关的一些内容. 1.1 distutils distutils 是 python 标准库的一部分,这个库的目的是为开发者提供一种方便的打包方式, 同时为使用者提供方便的安装

记得之前应同学之情,帮忙爬取人人贷网的借贷人信息,综合网上各种相关资料,改善一下别人代码,并能实现数据代码爬取,具体请看我之前的博客:http://www.cnblogs.com/Yiutto/p/5890906.html.但过了一段时间,发现之前的代码运行不能爬取到数据,而且数据爬取过多也会出现一些错误(我估摸这后台检测到同一个帐号过多访问,给强制下线了)老是弹出下面的错误如下图: 总而言之,代码可用性不高,性能不是很好. def parse_userinfo(loanid): timesta

分享一波油藏描述方面的Python开源包 前一阵去捷克参加了数学地质年会(IAMG2018),听完汇报,发现在数学地质领域用python的越来越多了,他们的很多成果都是用python做出来的.不管喜不喜欢,这个语言已经成了主流,特别是在人工智能领域,几乎所有的框架都有python接口,用起来很方便.秉承“人生苦短,我用python”的理念,也踏上了python学习之路,尽管感觉C#比python更优雅. 学习python的目的是帮助油气开发的智能化,特别是智能油田管理相关领域,为了避免重复造轮子

包管理 管理包和依赖的工具. pip – Python 包和依赖关系管理工具. pip-tools – 保证 Python 包依赖关系更新的一组工具. conda – 跨平台,Python 二进制包管理工具. Curdling – 管理 Python 包的命令行工具. wheel – Python 分发的新标准,意在取代 eggs. 文本处理 用于解析和操作文本的库. 通用 chardet – 字符编码检测器,兼容 Python2 和 Python3. difflib – (Python 标准库

用 Distiller 压缩 PyTorch 模型 作者: PyTorch 中文网发布: 2018年7月15日 5,101阅读 0评论 近日,Intel 开源了一个用于神经网络压缩的开源 Python 软件包 Distiller,它可以减少深度神经网络的内存占用.加快推断速度及节省能耗.Distiller 为 PyTorch 环境提供原型和分析压缩算法,例如产生稀疏性张量的方法和低精度运算等. 项目地址:https://github.com/NervanaSystems/distiller/ 文

1. PyPi的用途 Python中我们经常会用到第三方的包,默认情况下,用到的第三方工具包基本都是从Pypi.org里面下载. 我们举个栗子: 如果你希望用Python实现一个金融量化分析工具,目前比较好用的金融数据来源是 Yahoo 和 Google. 你可能需要读取这 2 个平台的 API,然后依次实现下载.分析数据的代码. 是不是好麻烦,这样你可以到 PyPi 到上面去找找有没有已经写过这个内容,幸运的是,你真找到了,你找到了一个 package 叫做 yfinance. https:/

离线pip下载Python包   这几天搞Windows离线断网环境下安装Python包,配置环境,各种坑!做个记录,供以后查询吧.      # 生产环境  windows xp# python 2.7# pip 8.1.2        友情提示:当你遇到无法安装包的不明错误时,可以回头来考虑如下建议了:       一.更新 pip版本              1.下载最新 pip       新建packages文件夹放在目录中:d:python27packages.      Uno

本系列分为两篇: 1.[转]windows和linux中搭建python集成开发环境IDE 2.[转]linux和windows下安装python集成开发环境及其python包 3.windows和linux中搭建python集成开发环境IDE——如何设置多个python环境 参考:http://blog.csdn.net/pipisorry/article/details/39902327 一.安装Python集成开发环境IDE 参考[linux和windows中搭建python开发环境] 二

结构如下: appsdk\ appsdk.py(这里面有多个类,包括appsdk,appsdksync等类) __init__.py ... ① 有个appsdk的文件夹(符合python包的定义) ② 将这个appsdk的文件夹copy到/usr/lib/python2.7/site-packages目录下 ③ 进入这个appsdk文件夹,vim __init__.py,然后输入如下内容(这是一种参考模式,因为之前我试过很多方式,发现RF加载不了包里面的py里面的多个类): from apps

本文适用于刚入门的小白,欢迎大牛们批评指正. 因为要开始数据分析,而python又不像R和matlab那么简洁.需要安装的包很多~ 网上找了好多牛人博客,想在centos7下安装numpy,scipy等包,一开始就懵逼了,网上的指导帖很多,试了很多方法, 绕了很多弯路,总结一下经验~ ——————————————————————华丽分割线—————————————————————————— 最简单的方法: 命令行执行: sudo yum -y install gcc gcc-c++ numpy

python 包管理工具 Python当前的包管理工具链是 easy_install/pip + distribute/setuptools + distutils,显得较为混乱. 而将来的工具链组合非常简单:pip + distutils2. 1.distutils:Python 自带的基本安装工具,适用于非常简单的应用场景,使用: 为项目创建 setup.py 脚本: 执行 setup.py install 可进行安装: 2.setuptools:针对 distutils 做了大量扩展,尤其

Python 包管理工具解惑 本文链接:http://zengrong.net/post/2169.htm python packaging 一.困惑 作为一个 Python 初学者,我在包管理上感到相当疑惑(嗯,是困惑).主要表现在下面几个方面: 这几个包管理工具有什么不同? distutils setuptools distribute disutils2 distlib pip 什么时候该用pip,什么时候该用 setup.py ,它们有关系么? easy_install.ez_setup

[Python 包的相对导入讲解] 参考:http://www.dai3.com/python-import.html

from: http://www.linuxde.net/2014/05/15576.html CentOS 6.4安装pip,CentOS安装python包管理安装工具pip的方法 2014/05/12 centos, pip, Python 运维管理经验与工具 2 70,955   之前有的朋友问我,CentOS版本怎么安装python的pip,我之前给出的Ubuntu下apt-get的方法 ubuntu 需要先安装下pip吧, apt-get install python-pip 安装re

如果你有多个模块需要发布,而它们又存在于多个包中,那么指定整个包比指定模块可能要容易地多.即使你的模块并不在一个包内,这种做法也行的通:你可以告诉Distutils从根包(root package)处理模块,并且它工作起来和其他任意的包一样(除非你不需要拥有一个__init__.py文件). 例1.1 根包发布 文件结构为: <root>/ setup.py foo.py bar.py setup脚本可以这样写: from distutils.core import setup setup(n

位置 \Windows\System32 python包依赖包安装 rtree 依赖 spatialindex(spatialindex.dll   spatialindex_c.dll) shapely 依赖 geos(geos.dll  geos_c.dll) 在windows安装时把dll文件拷贝到\windows\Systems32即可

常见的包管理工具及关系 setuptools -->distribute easy_install-->pip 1.distribute distribute是对标准库disutils模块的增强,我们知道disutils主要是用来更加容易的打包和分发包,特别是对其他的包有依赖的包.distribute被创建是因为setuptools包不再维护了. 主页:https://pypi.python.org/pypi/distribute 安装及使用 wget https://pypi.python.

pip 是一个安装和管理 Python 包的工具 , 是 easy_install 的一个替换品.本文将详细说明 安装 pip 的方法和 使用 pip 的一些基本操作如安装.更新和卸载 python 包. 一.pip是基于setuptools的,所以要事先把setuptools安装好. 下载安装包: https://pypi.python.org/packages/source/s/setuptools/setuptools-1.4.2.tar.gz 解压并进入到目录:python setup.

python 包导入规则,恶心了一天,终于搞清楚了 1.目录 speed data __init__.py __init__.py static templates view __init__.py table_alding_data.py table_odp_us.py 2.文件 data/__init__py #!/usr/bin/env python # encoding: utf-8 import json def get_data(data_name="result"): d

python包管理-distutils,setuptools,pip,virtualenv等介绍 对于每个编程语言来说打包和发布开发包往往非常重要,而作为一个编程者能够快速容易的获得并应用这些由第三方提供的包同样非常重要.类似于java为了便于管理有人开发了maven等管理工作,而python自然而然也需要便捷的打包和发布工具,以下就介绍python的几个包管理方式. 一  distutils - Python自带的基本安装工具, 适用于非常简单的应用场景使用 通过distutils来打包,生成