GWAS找到基因后怎么后续分析

2024-08-29

GWAS后续分析：LocusZoom图的绘制

LocusZoom图几乎是GWAS文章的必备图形之一,其主要作用是可以快速可视化GWAS找出来的信号在基因组的具体信息:比如周围有没有高度连锁的位点,高度连锁的位点是否也显著. 下面是locuszoom的示例图: 下面具体讲讲如何实现Locuszoom的绘制 1.进入Locuszoom的主页 http://locuszoom.org/ 2.进入Locuszoom的主页后,点击single plot 3.按如下图操作第一步:上传关联分析结果的文件,plink格式的话是assoc.logistic

Spring Ioc源码分析系列--Ioc容器BeanFactoryPostProcessor后置处理器分析

Spring Ioc源码分析系列--Ioc容器BeanFactoryPostProcessor后置处理器分析前言上一篇文章Spring Ioc源码分析系列--Ioc源码入口分析已经介绍到Ioc容器的入口refresh()方法,并且分析了refresh()方法里面的前三个子方法分析了一下.还记得分析了什么麽?估计早忘了分析了什么,可以说是看了个寂寞.但是不要慌,看了忘肯定是正常的,需要回顾复习一下,最好做点笔记记录一下,有自己的沉淀才会印象深刻.最好跟着代码自己调试几遍,纸上得来终觉浅,绝知此

Methods for follow-up research of exome analysis：外显子后续分析研究思路总结

外显子后续分析研究思路一般有以下几种(Methods for follow-up research of exome analysis): 1.对突变频率.突变类型.突变方式进行统计分析 Mutations statistical analysis 具体见下图: 参考文献:Di, Jiabo, et al. "Whole exome sequencing reveals intertumor heterogeneity and distinct genetic origins of sporad

【LeetCode】Find Minimum in Rotated Sorted Array 找到旋转后有序数组中的最小值

本文为大便一箩筐的原创内容,转载请注明出处,谢谢:http://www.cnblogs.com/dbylk/p/4032570.html 原题: Suppose a sorted array is rotated at some pivot unknown to you beforehand. (i.e., 0 1 2 4 5 6 7 might become 4 5 6 7 0 1 2). Find the minimum element. You may assume no duplica

webpack4.0源码解析之打包后js文件分析

首先,init之后创建一个简单的webpack基本的配置,在src目录下创建两个js文件(一个主入口文件和一个非主入口文件)和一个html文件,package.json,webpack.config.js代码如下: var name=require('./index1.js') console.log('我是入口js文件') console.log(name) module.exports="我不是入口文件" <!DOCTYPE html> <html> <

GWAS后续分析：多基因风险评分(Polygenic Risk Score)的计算

一.什么是多基因风险评分传统的GWAS研究只计算单个SNP位点与表型之间的关联性,再用Bonferroni校正,通过给定的阈值,筛选出显著的SNP位点. 这样会存在两个问题,第一.Bonferroni校正非常严格,很多对表型也有贡献的位点会因为达不到阈值而被过滤掉.第二.单个位点对表型的解释度是很低的,尤其是对于高血压这种多基因控制的表型,用一个个单独的位点解释高血压患病风险,就显得很单薄. 因此,开发一个能让我们直观的感受,患某种疾病的风险多高的工具,显然是非常有必要的. 为了更好理解多基

vlc-android对于通过Live555接收到音视频数据包后的处理分析

通过ndk-gdb跟踪调试vlc-android来分析从连接到RTSP服务器并接收到音视频数据包后的处理过程. 首先,从前面的文章有分析过vlc-android的处理过程通过线程函数Run()(Src/input/input.c)来处理的,代码如下: static void *Run( void *obj ) { input_thread_t *p_input = (input_thread_t *)obj; const int canc = vlc_savecancel(); if( Init

Cron连接正常工作5次后异常原因分析

目录目录 1 问题描述 1 分析定位 1 解决方法 2 附1:Cron工作流 3 附2:SIGPIPE发生的位置 3 如果一个shell命令的"$?"值为141,则它是收到了SIGPIPE信号.一些shell脚本中的sleep或ps.wc等命令无效,也可能是本文描述的原因,解决办法是忽略掉SIGPIPE,脚本中可以加句:trap "" SIGPIPE. 问题描述在Crontab中仅配置如下一条命令(为简化问题的描述和定位,剔除所有其它的): */1 * * *

平衡二叉树AVL - 插入节点后旋转方法分析

平衡二叉树 AVL( 发明者为Adel'son-Vel'skii 和 Landis)是一种二叉排序树,其中每一个节点的左子树和右子树的高度差至多等于1. 首先我们知道,当插入一个节点,从此插入点到树根节点路径上的所有节点的平衡都可能被打破,如何解决这个问题呢? 这里不讲大多数书上提的什么平衡因子,什么最小不平衡子树,实际上让人(me)更加费解.实际上你首要做的就是先找到第一个出现不平衡的节点,也就是从插入点到root节点的路径上第一个出现不平衡的节点,即深度最深的那个节点A,对以它为根的子树做一

R语言-妹子被追后的选择分析

前提假设妹子们一生中可以遇到100个追求者,追求者的优秀程度符合正态分布: 每个妹子都具备判断并比较追求者优秀程度的能力: 接受或拒绝一个追求者后永远无法后悔. 那么,问题来了当遇到追求者时,如何选择才能获得最优结果? 如果人的优秀程度符合均值为80,方差20的正态分布,随机产生100个追求者,其优秀程度分布情况见下图: p=rnorm(100,80,20) hist(p,main="追求者--统计", ylab="数量", xlab="优秀程度&qu

汽车后市场SWOT分析

客户接待系统SWOT分析版本 V0.1 所有人: 王超 S 客户接待系统符合市场的目前阶段需求.填补了市场的空白部分. W 市场推广的力度差异,市场由蓝海编成红海,多种厂商参与,创业团队不断进入,漫长的开发流程. O 客户接待系统可以将客户,门店,品牌商紧密联系在一起,填补上一代ERP系统的不足,与缺憾. T 市场需求日新月异,开发速度是否可以跟上,需要的资源是否保证,如何把握市场的大方向,推广,分销的合作推广方式. 核心模块,CFT客户接待系统方便门店接待人员的快速收集接待信息,提高信

java抛出异常后，后续代码是否可继续执行

参考:https://www.cnblogs.com/wangyingli/p/5912269.html 仅此可正常执行异常后内容 try{ throw new Exception("参数越界"); }catch(Exception e) { e.printStackTrace(); } System.out.println("异常后");//可以执行注意:在catch中抛异常后续不能执行

linux 用vi命令的使用以及vi编辑后的后续保存退出等相关命令的使用

一.首先用vi命令打卡要编辑的文件: 注意:vi命令的使用如下打开或新建文件,并将光标至于第一行首:[root@centos6 /]# vi /etc/my.cnf 打开文件,并将光标移至最后一行行首:[root@centos6 /]# vi + /etc/my.cnf 打开文件,并将光标置于第n行首:[root@centos6 /]# vi +n /etc/my.cnf 打开文件,并将光标置于第一个与pattern匹配的串处:vi +/pattern filename 二.按键盘上“a”键,

在css加载完毕后执行后续代码

最近在写项目的framework,写个JQueryMessageBox的类,以使用jquery ui中的dialog()来显示消息框,为了使方法方便调用,便加入了自动判断页面是否加入了ui.js和ui.css,代码如下: //如果没有包含ui.js,则引用 if ($('script[src$=""jquery-ui-1.8.11.custom.min.js""]').length == 0) {{ $(""<script src='/js

解决在Filter中读取Request中的流后，后续controller或restful接口中无法获取流的问题

首先我们来描述一下在开发中遇到的问题,场景如下: 比如我们要拦截所有请求,获取请求中的某个参数,进行相应的逻辑处理:比如我要获取所有请求中的公共参数 token,clientVersion等等:这个时候我们通常有两种做法前提条件是我们实现Filter类,重写doFilter方法 1.通过getParameter方法获得 HttpServletRequest hreq = (HttpServletRequest) req; String param = hreq.getParameter("pa

进化后的const分析

C语言中的const const修饰的变量是只读的,本质还是变量 const修饰的局部变量在栈上分配空间 const修饰的全局变量在只读存储区分配空间 const只在编译期有用,在运行期无用注意:const修饰的变量不是真的常量,它只是告诉编译器该变量不能出现在赋值符号的左边. 总结: C语言中的const使得变量具有只读属性 const将具有全局生命周期的变量存储于只读存储区 const不能定义真正意义上的常量! C语言中只有通过enum定义的标识符才是真正意义上的常量. 编程实验 C/C+

第3课进化后的 const分析

1. C语言中的const (1)const修饰的变量是只读的,使得变量具有只读属性,但本质还是变量.所以不是真正的常量,它只是告诉编译器该变量不能出现在赋值符号的左边. (2)const修饰的局部变量在栈上分配空间,全局变量在只读存储区分配空间 (3)const只在编译期有用,在运行期无用 [编程实验]C/C++中的const #include <stdio.h> int main() { ; //C语言中会为变量c分配内存 int* p = (int*)&c; //C++中遇到&

第3课进化后的const分析

C语言中的const const修饰的变量是只读的,本质还是变量 const修饰的局部变量在栈上分配空间(改变这个空间的值,这个变量就会改变) const修饰的全局变量在只读存储区分配空间 const只在编译期游泳有用,在运行期无用 const修饰的变量不是真的常量,它只是告诉编译器该变量不能出现在赋值符号的左边 C语言中的const使得变量具有只读属性 const将具有全局生命周期的变量存储于只读存储区 const不能定义真正意义上的常量 C语言中通过enum定义的标识符才是真正意义上的常量,

C++解析(2)：进化后的 const 分析

0.目录 1.C语言中的const 2.C++中的const 3.对比 3.1 C语言与C++中的const 3.2 C++中的const与宏定义 4.小结 1.C语言中的const const修饰的变量是只读的,本质还是变量 const修饰的局部变量在栈上分配空间 const修饰的全局变量在只读存储区分配空间 const只在编译期有用,在运行期无用也就是说:const修饰的变量不是真的常量,它只是告诉编译器该变量不能出现在赋值符号的左边. (如果我们修改了const修饰的全局变量,那么程序将

JS对象中，在原型链上找到属性后最终将值拷贝给原对象而不是引用

遇到一个面试题要求写一个函数A,每次进行new操作时候能输出2,3,4,5... new A() // 输出2 new A() // 输出3 new A() // 输出4 function A() { this.a++ console.log(this.a) } A.prototype.a = 1 这样写是错误的,因为实例化对象中的a属性并不是原型上的引用,而是把原型上的a给拷贝了一份给a. 所以这样每次输出都是2. 正确答案: function A() { this.__proto__.a+

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