LocusZoom图几乎是GWAS文章的必备图形之一,其主要作用是可以快速可视化GWAS找出来的信号在基因组的具体信息:比如周围有没有高度连锁的位点,高度连锁的位点是否也显著. 下面是locuszoom的示例图: 下面具体讲讲如何实现Locuszoom的绘制 1.进入Locuszoom的主页 http://locuszoom.org/ 2.进入Locuszoom的主页后,点击single plot 3.按如下图操作 第一步:上传关联分析结果的文件,plink格式的话是assoc.logistic

目录 什么是基因组选择? 基因组选择技术的发展 基因组选择的原理和流程 基因组选择的模型 基因组选择的展望 参考资料 什么是基因组选择? 基因组选择(Genomic Selection,简称GS)这一概念由挪威生命科学大学的Theo Meuwissen 教授于2001年提出.它是一种利用覆盖全基因组的高密度分子标记进行选择育种的新方法,可通过构建预测模型,根据基因组估计育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)进行早期个体的预测和选择,从而缩短世代间隔

目录 1.混合测序基础 2. 点突变检测 3. BSA 4. BSR 5. 混合样本GWAS分析 6. 混合样本驯化研究 7. 小结 1.混合测序基础 测序成本虽然下降了,但对于植物育种应用研究来说还是很高,动不动就上百群体,小小植物个体价值又低,测完了很可能后面就用不到了.这时,混合样本测序是一种省钱的好办法. 混池测序(Pool-seq)相对于GWAS或其他精细定位策略而言,其实是一个初定位产品,其结果很有可能是跟性状相关的候选区域. 概念: 混合样本测序一般是选择表型极端或目标性状差异的个

生物遗传学整理人PYJ (恋_紫花地丁) 高中生物唯一需要数学知识的就是遗传学的概率计算了.这里对简单的遗传学规律做一些总结. 目录: 1.      孟德尔第一定律(分离定律): 2.      孟德尔第二定律(自由组合定律) 3.      连锁交换 4.      基因的相互作用 1)      等位基因的相互作用 ①  完全显性 ②  不完全显性 ③  共显性关系 2)      等位基因的相互作用 ①  基因互作 ②  上位效应 ③  微效基因累加作用 5.      细胞质遗传 6.

目录 1. GS概况 2. GS模型 1)直接法 GBLUP 直接法的模型改进 ①单随机效应 ②多随机效应 2)间接法 间接法模型 基于间接法的模型改进 3. GS模型比较 模型比较结论 4.问题及展望 文献来源: 尹立林, 马云龙, 项韬, 朱猛进, 余梅, 李新云, 刘小磊, 赵书红. 全基因组选择模型研究进展及展望[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(2): 233-242. 华中农大赵书红老师于2019年发表在< 畜牧兽医学报>上的综述,主要针对动物. 1. GS概况 2009年

目录 1. GS/GP在植物育种中的角色 2. GP模型应用 3. GP模型的准确性 4. 植物育种的GS展望 5. 小结 Genomic SelectioninPlant Breeding: Methods,Models,and Perspectives 国际玉米小麦改良中心(CIMMYT)José Crossa 2017年发表在<Trends in Plant Science>上的综述. 1. GS/GP在植物育种中的角色 过去的植物育种主要借助分子标记辅助选择法(MAS)来进行表型选择(

微服务与敏捷开发(Scrum/Kanban)的核心思想之我见   关于"微服务"和"敏捷开发"的文章网络上有很多,所以这里不再重复叙述这些概念的解释和特点,而是就个人实际工作中对他们的核心思想的理解及运用分享给大家,希望能对大家有所帮助.   当下IT开发领域,"微服务"及"敏捷开发"越来越被各公司及团队重视.但是在交流中发现很多人对"微服务"及"敏捷开发"存在很大的误解,尤其在各公司的

疯狂创客圈 Java 高并发[ 亿级流量聊天室实战]实战系列之15 [博客园总入口 ] 前言 前言 疯狂创客圈(笔者尼恩创建的高并发研习社群)Springcloud 高并发系列文章,将为大家介绍三个版本的 高并发秒杀: 一.版本1 :springcloud + zookeeper 秒杀 二.版本2 :springcloud + redis 分布式锁秒杀 三.版本3 :springcloud + Nginx + Lua 高性能版本秒杀 以及有关Springcloud 几篇核心.重要的文章: 一.S

0. go-zero介绍 go-zero是一个集成了各种工程实践的web和rpc框架.通过弹性设计保障了大并发服务端的稳定性,经受了充分的实战检验. go-zero包含极简的API定义和生成工具goctl,可以根据定义的api文件一键生成Go, iOS, Android, Kotlin, Dart, TypeScript, JavaScript代码,并可直接运行. 使用go-zero的好处: 轻松获得支撑千万日活服务的稳定性 内建级联超时控制.限流.自适应熔断.自适应降载等微服务治理能力,无需配

Spring Cloud微服务学习笔记 SOA->Dubbo 微服务架构->Spring Cloud提供了一个一站式的微服务解决方案 第一部分 微服务架构 1 互联网应用架构发展 那些迫使系统演进的因素: 业务量上去了后,负载能力满足不了,对高负载能力的需求,以及高性能高可用.自动化运维管理.等的需求. 1.单体应用架构 优点: 缺点: 2.垂直应用架构 优点: 缺点: 3.SOA应用架构 优点: 缺点 4.微服务架构 2 微服务架构体现的思想及优缺点 优点: 微服务很小,便于特定业务功能的聚

目录 1. 简介 2. BLUP类模型 3. Bayesian类模型 4. 机器学习 5. GWAS辅助的GS 6. 杂交育种 7. 多性状 8. 长期选择 9. 预测准确性评估 10. GS到植物育种 11. 未来展望 2020年10月张志武老师联合多家单位的大佬撰写的植物GS育种的最新进展,目前还只是预印版(改到第二版).这篇综述涉及到GS在植物领域应用的最新进展,长达48页.不同于其他的综述描写空洞宽泛,这一篇特别对模型方法进行了介绍,正好解决了我的需求.缺点就是可能重点说明了他们自己开发

综述:Genomic Selection in the Era of Next Generation Sequencing for Complex Traits in Plant Breeding 要点: MAS仅对数量较少的主效QTL有效,而GS适用于大量微效QTL控制的复杂数量性状.GS根据分布在整个基因组中的大量标记信息来估计个体的遗传价值,而不是像MAS中那样基于少量标记. GS由Meuwissen(2001)等人提出,一开始应用于动物,最近才应用作物育种.主要是因为NGS的成本下降(尤

我们用一个系列来讲解从需求到上线.从代码到k8s部署.从日志到监控等各个方面的微服务完整实践. 整个项目使用了go-zero开发的微服务,基本包含了go-zero以及相关go-zero作者开发的一些中间件,所用到的技术栈基本是go-zero项目组的自研组件,基本是go-zero全家桶了. 实战项目地址:https://github.com/Mikaelemmmm/go-zero-looklook 1. go-zero 网关概念 go-zero架构往大的说主要由两部分组成,一个是api,一个是rp

前言 本文根据 安前松 的视频分享整理而来,视频回放地址如下: https://www.bilibili.com/video/BV1Hr4y1x7Ne goctl 的由来 1. goctl 的诞生 goctl 的最早功能是为了解决 GRPC 内网调试问题,大约是在 2019 年,在我们的生产环境中,rpc 是内网隔离的,不可通过外网访问,为了快速去 mock 一些线上 RPC client 的请求,就简单的实现了第一版本的代码生成,主要目的是去访问 RPC Server 做一些调试. 2. 为什

摘自:http://www.infoq.com/cn/articles/ecosystems-of-microservices 多元化(polyglot)微服务是终极游戏 大规模系统和多元化微服务最终一定会有所牵连.其中,多元化的意思是多种语言共同编写. 创建于1995年的eBay共经历了3次架构变更. eBay最早采用的是创始人花费两天时间所编写的Perl程序. 之后,它开始使用由340万行C++代码所编写的程序. 然后,eBay使用Java编写的分布式系统. 现在的ebay仍然使用了大量Ja

转载自:http://www.cocoachina.com/ios/20160214/15250.html 前言:很多动效都是多种动画的组合,有时候你可能只是需要其中某个动画,但面对庞杂的代码库或是教程,你可能比较困惑,本系列将复杂动效中不常见的动画效果拆解出来便于学习,授人以鱼不如授人以渔. 第一讲是来自 BubbleTransition 中最夺人眼球的形变动画.这个效果在 StarWars.iOS转场动效有两次应用,非常地炫酷:Raywenderlich.com 也出过一个教程来实现这种效果

最近博客园出现了一篇文章<微服务时代之2017年五军之战:Net PHP谁先死>,掀起了一波撕逼,作者只是从一个使用者的角度来指点江山,这个姿势是不对的..NET Core就是专门针对模块化的微服务架构而设计,在微服务架构这方面Java的Spring Cloud具有非常高的人气,这个正是这篇文章作者的立脚点.然后他没有看到蓬勃发展的.NET 社区的微服务的相关框架,本文主要梳理下当前.NET社区微服务的相关项目的汇集. 1. Service Fabric 微软作为.NET的主战场,自然在当前的

注:文章内容为摘录性文字,自己阅读的一些笔记,方便日后查看. 微服务(Microservices) 在过去的 2016 年和 2017 年,微服务技术迅猛普及,和容器技术一起成为这两年中最吸引眼球的技术热点.而以 Spring Cloud 为代表的传统侵入式开发框架,占据着微服务市场的主流地位. 微服务(Microservices)是一种架构风格,一个大型复杂软件应用由一个或多个微服务组成.系统中的各个微服务可被独立部署,各个微服务之间是松耦合的.每个微服务仅关注于完成一件任务并很好地完成该任务

本文来自作者 未闻 在 GitChat 分享的{基于 Docker 的微服务架构实践} 前言 基于 Docker 的容器技术是在2015年的时候开始接触的,两年多的时间,作为一名 Docker 的 DevOps,也见证了 Docker 的技术体系的快速发展.本文主要是结合在公司搭建的微服务架构的实践过程,做一个简单的总结.希望给在创业初期探索如何布局服务架构体系的 DevOps,或者想初步了解企业级架构的同学们一些参考. Microservice 和 Docker 对于创业公司的技术布局,很多声

微服务的概念最早由Martin Fowler与James Lewis于2014年共同提出,核心思想是围绕业务能力组织服务,各个微服务可被独立部署,服务间是松耦合的关系,以及数据和治理的去中心化管理.微服务能够帮助企业应对业务复杂.频繁更新以及团队规模庞大带来的挑战,实现IT对业务创新的驱动. 1月12日,网易云主办的"微服务实践沙龙"将走进深圳,邀请业界微服务的先行者,分享落地实践过程中总结的干货经验. 报名地址:点击报名 时间:2019年1月12日 13:30-17:00 地点:广东

在前面介绍了spring cloud hystrix及其hystrix dashboard,但都是对单个项目的监控,对于一个为项目而言,必定有很多微服务,一个一个去看非常的不方便,如果有一个能集中熔断器监控的地方就完美了,spring cloud turbine 就实现了这样的功能,这篇文章就来介绍spring cloud turbine. (一) 版本说明 a) Spring boot 2.0.6.RELEASE b) Spring cloud Finchley.SR2 c) Java ver