欢迎关注微信公众号"bio生物信息" GeneATLAS的数据全部来自 UK Biobank 的452,264个英国白人样本. 总共囊括的表型有778个,位点有三千万个. 优点 网站所有关联分析的summary数据都是可以下载的. 而且提供了所有表型的原始基因型数据的曼哈顿图.imputation的曼哈段图.Q-Q Plot 可以说是相当贴心了. 缺点 不能下载原始基因型数据. 样本是欧洲群体,可能某些结果在其他群体有差异. 这个网站可以下载什么 1. 下载表型数据 比如搜索肥胖表型,

GWAS Catalog The NHGRI-EBI Catalog of published genome-wide association studies EBI负责维护的一个收集已发表的GWAS研究的数据库 Catalog stats Last data release on 2019-09-24 4220 publications 107486 SNPs 157336 associations Genome assembly GRCh38.p12 dbSNP Build 151 Ense

目前GWAS方向发了很多文献,但是并没有一个很完善的R包对这些文献的数据进行汇总. 接下来推荐的这个是最新发表的GWAS数据汇总R包​.看了一下功能齐全,但是数据不是收录的很齐全​. 下面具体讲一下.​ 在R上安装 install.packages("remotes") remotes::install_github("ramiromagno/gwasrapidd") 查询是否有发表关于自身免疫性疾病的文章 library(gwasrapidd) my_studie

相关文章: A Unified Framework for Association Analysis with Multiple Related Phenotypes 太重要了,不得不单独拿出来分析一下.本review高度总结了GWAS这10年的成绩.以及现在的局限性.每个搞统计遗传的都必须要好好看看. 第一篇GWAS是什么时候?谁提出的?The first successful GWAS published in 2002 studied myocardial infarction. Ozak

在看知乎比较php框架的优劣的时候提到为什么laravel这么好国内用的少,还有就是yii2,有人提到原因就是composer在国内无法使用.这制约了使用composer进行包管理的框架在国内的传播和使用而国内的框架如thinkphp以及一些不需要使用composer进行包管理的框架得以流行. 在ubuntu下学习,首先要学会安装composer,并处理各种问题 比如关于fxp插件的问题,系统里面如果有多个composer.phar之间会互相干扰的问题,一定要解决还有就是composer下载东西

想系统的学习生信数据库可以先看一下北大的公开课,有一章专门讲的数据库与软件: -生物信息学:导论与方法 北大\ 生物信息数据库及软件资源 一个优秀的生信开发者能够解决如下问题: 如何鉴定一个重要的且没有被解决的生物学问题? 如何将该问题转化为一个可计算的问题? 如何提出一个解决此问题的算法? 如何实现该算法? 如何评估算法? 生信工具使用者需要解决如下问题: 每个方法解决的是哪个生物学问题? 该方法有哪些基本的假设? 每个参数是什么意思,都是用来干什么的? 准确度评估,sensitivity a

一. 最近几年,手机APP市场发展非常迅速,随着手机的硬件水平的不断升级,大量资本涌入,越来越多的开发者从桌面平台开发转移到移动平台开发,面对数以万计的手机APP,如何推广自己的APP成了难题,APP分发渠道应运而生.本文将针对手机APP应用的分发渠道进行讨论. Apple store应该是比较耳熟能详的渠道了,它是苹果设备的官方渠道,也是最主要渠道(第三方渠道的份额远远不及).Apple store上架的应用都要经过苹果官方的批准,同样地,ios开发的火爆也让苹果借着自己的渠道赚得盆满钵满.

安装前记: 近来容器对企业来说已经不是什么陌生的概念,Kubernetes作为Google开源的容器运行平台,受到了大家的热捧.搭建一套完整的kubernetes平台,也成为试用这套平台必须迈过的坎儿.kubernetes1.5版本以及之前,安装还是相对比较方便的,官方就有通过yum源在centos7安装kubernetes.但是在kubernetes1.6之后,安装就比较繁琐了,需要证书各种认证,对于刚接触kubernetes的人来说很不友好,按照官方文档在本地安装"集群"的的话,我

Android Wear从2014年3月发布到现在已经从1.0发展到2.0(目前还没正式发布).其产品定位也发化了巨大变化,因为Android Wear 1.0通讯方式只有蓝牙,限定了系统,比较依赖手机.比如:重新连接新的手机,手表端会删除所有安装的应用,重新同步新手机的应用到手表.所有应用更新,系统更新都需要通过手机端来完成,没有单独的应用市场.可以理解为Android Wear手表是个手机伴侣.Android Wear 2.0定位则完全不同,Android Wear 2.0支持通讯方式有蓝牙

Service Worker 随着前端快速发展,应用的性能已经变得至关重要,关于这一点大佬做了很多统计.你可以去看看. 如何降低一个页面的网络请求成本从而缩短页面加载资源的时间并降低用户可感知的延时是非常重要的一部分.对于提升应用的加载速度常用的手段有Http Cache.异步加载.304缓存.文件压缩.CDN.CSS Sprite.开启GZIP等等.这些手段无非是在做一件事情,就是让资源更快速的下载到浏览器端.但是除了这些方法,其实还有更加强大的Service Worker线程. Servic

HTTP协议与TCP/IP协议的关系 HTTP的长连接和短连接本质上是TCP长连接和短连接.HTTP属于应用层协议,在传输层使用TCP协议,在网络层使用IP协议.IP协议主要解决网络路由和寻址问题,TCP协议主要解决如何在IP层之上可靠的传递数据包,使在网络上的另一端收到发端发出的所有包,并且顺序与发出顺序一致.TCP有可靠,面向连接的特点. 长连接短连接操作过程 短连接的操作步骤是: 建立连接——数据传输——关闭连接…建立连接——数据传输——关闭连接 长连接的操作步骤是: 建立连接——数据传输

本文由云+社区发表 PWA(Progressive Web App)起源背景 传统的Web网页存在以下几个问题: 进入一个页面必须要记住它的url或者加入书签,入口不便捷: 没网络就没响应,不具备离线能力: 不像APP一样能进行消息推送. Native app: 开发成本高 软件上线需要审核 即使使用频率不高,想使用一个app必须先下载安装 PWA概念的提出 2016 年Google I/O 大会上提出一个 Next Web Generation 的概念.PWA是在传统Web应用的基础上,结合M

Android Studio遇到的问题 Android Studio一直提示右下角那个错误,Failed to open zip file.我是根据这位大佬的博客https://www.cnblogs.com/guanshaoye/p/6378949.html解决的.下载Gradle.配置环境变量.修改设置之后,虽然不报这个错误了,但是又出了Connection timed out: connect错误.这个错误好像是因为国内无法使用谷歌导致的,我也没找到解决方法,可能***能解决吧. Ecli

2008年4月7日google推出Google App Engine(GAE),时间过得真快,10年过去了,2010年3月google退出中国,一转眼也过去7年了.早在2009年的时候GAE就在中国内陆无法访问了.其实,这10年间,作为云平台服务的PaaS(Platform-as-a-Service)获得了飞速的发展,在国内阿里云.腾讯云.新浪云.华为云.亚马逊AWS各领风骚,但其中很难觅goole云平台的身影.虽然不时有传出google回归中国大陆的消息,但目前看来google回归中国还是遥遥

1. What is KOBAS 3.0? KOBAS (KEGG Orthology Based Annotation System) is a web server for gene/protein functional annotation (Annotation module) and functional set enrichment (Enrichment module). Given a set of genes or protein, it can determine wheth

动机 使用Markdown撰写博客,并以静态页面形式发布. 选择hugo 现在jekyll似乎更加流行,但是jekyll是基于Ruby的,在windows下安装很繁琐. 而hugo是用go写的,windows版本只有一个exe,安装起来非常方便. 因此决定使用hugo作为站点生成器. 系统环境 Windows 8.1 x64(主流Windows系统应该都没有问题) git(用来下载皮肤) 安装hugo 下载 通过Github的下载页面获得最新版本的hugo. 解压并配置PATH 解压到任意文件夹

移动端Push推送 移动端开发逃不掉要做推送,这里给出服务端一种省时省力的解决方案. iOS:PushSharp.Apple.苹果有自己的推送服务,我们按照规则推送数据就好.这里我选取PushSharp.Apple插件. 注:等待推送结果很是耗费性能. Android:Google本身也有推送服务,但是由于种种原因,国内无法使用.于是应运而生一批公司专门做Android推送,顺便做点数据分析.对比的有极推.个推.米推. 前两个都是商业推送,少量免费,大量按照到达量收费,也可以给用户单独部署,价格

我们的网站,经常会用到google的一些数据. 但在国内无法使用google, 360这个良心的企业,解决了这个问题. 把google替换成useso就可以了. 比如, <link href="http://fonts.googleapis.com/css?family=Open+Sans:300,400,600,700&subset=all" rel="stylesheet" type="text/css"> <lin

PWA技术 PWA全称Progressive Web App,即渐进式WEB应用. 解决的问题 实现离线缓存功能,即使用户手机没有网络,依然可以使用一些离线功能 可以添加至主屏幕,点击主屏幕图标可以实现启动动画以及隐藏地址栏 实现了消息推送 service worker 必须要https,除了127.0.0.1 html要设置为每次都response.clone(),这样html每次更新可以及时生效 除了配置的每次会更新外,其他的不设置,如果配置文件发生修改(例如manifest.json)要修

如何使用google地图的api(整理) 一.总结 一句话总结:直接用script标签引google地图api即可. 1.如何使用google地图的api? 页面引用javascript文件<script src="http://ditu.google.com/maps?file=api&hl=zh-CN&v=2&key=abcdefg" type="text/javascript"></script> 自己的实例也是