hmmer 使用 » 转载文章请注明,转载自:博耘生物 » <hmmer的安装与使用> » 原文链接:http://boyun.sh.cn/bio/?p=1753   从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及,这里是一篇入门级的介绍文章. hmmer下载与安装 对于Mac OS/X, Linux, UNIX系统,用源代码编译安装:

Hmmer的安装与使用   从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及. hmmer下载与安装 对于Mac OS/X, Linux, UNIX系统,用源代码编译安装: % wget ftp://selab.janelia.org/pub/software/hmmer3/3.0/hmmer-3.0.tar.gz % tar zxf hm

cmder cmder是一个增强型命令行工具,不仅可以使用windows下的所有命令,更爽的是可以使用linux的命令,shell命令. 安装包 安装包链接 下载后,直接解压即用. 修改命令提示符λ为$ 进入解压后的cmder的目录,进入vendor,打开init.bat文件. 修改第15行的代码 @prompt $E[1;32;40m$P$S{git}{hg}$S$_$E[1;30;40m{lamb}$S$E[0m 改为: @prompt $E[1;32;40m$P$S{git}{hg}$S$

 下面所列的是常见的参数(选项)义: --help,-h                              显示帮助信息 --version,-V                       显示版本信息 -v                                              繁琐模式(显示命令完整的执行过程) -i                                               交谈模式(指定界面) -l               

2016年6月27日.NET Core & ASP.NET Core 1.0在Redhat峰会上正式发布,社区里涌现了很多文章,我也计划写个系列文章,原因是.NET Core的入门门槛相当高,很有必要写个深入浅出的系列文章,本节内容帮助你入门.我将可能用Windows做开发环境,也可能用Linux/Mac,但是所有的dotnet CLI命令都是跨平台的,我们在windows/Linux/mac平台上开发跨平台的应用. 安装.NET Core .NET Core 包括.NET Core Runti

MVVM模式解析和在WPF中的实现(三) 命令绑定 系列目录: MVVM模式解析和在WPF中的实现(一)MVVM模式简介 MVVM模式解析和在WPF中的实现(二)数据绑定 MVVM模式解析和在WPF中的实现(三)命令绑定 MVVM模式解析和在WPF中的实现(四)事件绑定 MVVM模式解析和在WPF中的实现(五)View和ViewModel的通信 MVVM模式解析和在WPF中的实现(六)用依赖注入的方式配置ViewModel并注册消息 0x00 命令绑定要达到的效果 命令绑定要关注的核心就是两个方

异常处理汇总-数据库系列  http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4522990.html 一般都是清理垃圾清理过头了,把不该删的目录删了 网上说法: 问题描述: 1.sqlserver 打开表提示:目录名称无效 2.在执行sql语句时提示:在执行批处理时出现错误.错误消息为: 目录名无效 3.所有的数据库都存在1跟2的问题 问题分析: 1.操作系统重装或进行过系统镜像还原,导致temp目录下的文件夹丢失. 2.杀毒软件误删. 3.被人为或其他软件删除. 解决方案:

汇总篇:http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4822808.html#tsql 收缩前 图形化演示: 不仅仅可以收缩日记文件,数据库文件也是可以收缩的,只不过日记收缩比较明显点(为什么这么大?这么浪费?===>你还记得你建库时候的filegrowth了吗) 效果立竿见影 补充:(如果你感觉日记还是很大就用这种方法) 先改成简单 重复上面收缩步骤,完成后再改成完整 命令行演示: use [master] go --alter database [BigValues]

在 Windows 下使用 Larave 框架做开发,从 Composer 到 artisan 总是避免不了和 cmd.exe 打交道,系统默认的命令行界面却是不怎么好看,且每行显示的字符数是做了限制.伟大的 cmd.exe ,就是这么任性! 一些情况下,我们需要让每行显示更多的字符,从而避免频繁的换行导致界面出现出现一堆乱糟糟的字符串.当然,你或许也已经看烦了黑底白字的 cmd.exe 界面. 那么,如何改善这种现状呢?其实很简单, cmd.exe 具备一些基本的设置功能,只是不常用而已.如下

坚持每天学习,坚持每天复习,技术永远学不完,自己永远要前进 总结日常开发生产中常用的Git版本控制命令 ------------------------------main-------------------------------- <极客镇楼> 一 创建版本库 $ git clone <url> #克隆远程版本库 url为git远程库的地址 $ git init #初始化本地版本库 二 修改和提交 $ git status #查询状态 $ git diff #查看变更内容 $

切换仓库地址: git remote set-url origin xxx.git切换分支:git checkout name撤销修改:git checkout -- file删除文件:git rm file查看状态:git status添加记录:git add file 或 git add .添加描述:git commit -m "miao shu nei rong"同步数据:git pull提交数据:git push origin name分支操作查看分支:git branch创建

svn 命令篇 svn pget svn:ignore // 查看忽略项 svn commit -m "提交说明" // 提交修改 svn up(update) // 获取最新版本 svn st(status.stat) // 查看状态 svn ps svn:ignore "node_modules" . // 设置忽略指定目录项 (目录) svn ps svn:ignore "test.dat" . // 设置忽略指定项 (文件) svn ps

前面的话   在网上找了一些关于命令提示符CMD的资料,但是很多资料都是把所有的功能罗列出来,大部分都不会用到.所以,自己把常用的CMD命令总结如下,方便查阅 操作类 help 列出所有支持的指令及说明 help 命令名,如help cd说明cd命令的详细用法 cls 清屏 exit 退出当前程序 ctrl+c 使用ctrl+c快捷键中止当前命令 文件类 文件名,如index.html,打开文件 c: 切换到C盘,其他盘类似 cd 目录名,如cd test,进入test目录 cd / 返回根目录

本文转载自345大神.... 查看原文 先上个图形化界面GIT工具 SourceTree下载链接 windows版 1.8.3 & Mac版 2.2.4 链接: http://pan.baidu.com/s/1bpnxx5l 密码: 36jj Git 常用命令 git clone git remote git fetch git pull git push 1. git clone 远程操作的第一步,通常是从远程主机克隆一个版本库,这时就要用到git clone命令. $ git clone &l

前置技能 npm工具为nodejs提供了一个模块和管理程序模块依赖的机制,当我们希望把模块贡献出去给他人使用时,可以把我们的程序发布到npm提供的公共仓库中,为了方便模块的管理,npm规定要使用一个叫package.json的文件来描述我们模块的名称.版本等信息. 我们贡献出去的程序模块,可能也依赖了别人所编写的模块,所以需要在package.json中写明我们依赖了哪些模块,便于别人安装. 简单的nodejs程序可以通过 node xxx.js 来运行,当我们希望直接在控制台中使用xxx命令运

1.net模块基本API 要使用Node.js的net模块实现一个命令行聊天室,就必须先了解NET模块的API使用.NET模块API分为两大类:Server和Socket类.工厂方法. Server类如下图所示: net.Server类可以用来创建一个TCP或本地服务器,继承了EventEmitter. Socket类如下: net.Socket类一般用创建一个socket客户端或者是net.Server connection事件的参数. 工厂方法如下: 以上三个图展示了API的使用,其实NET

常用命令: command &:将进程放在后台执行 ctrl + z:暂停当前进程 并放入后台 jobs:查看当前后台任务 bg( %id):将任务转为后台执行 fg( %id):将任务调回前台 kill( %id):杀掉任务 1. 文件/文件夹传输命令 文件传输: $ cp local_file remote_username@remote_ip:remote_folder 示例(注意~): $ scp Nuget.config vagrant@10.9.10.173:~/hwapp_web

格式: mysql -h主机地址 -u用户名 -p用户密码 1.连接到本机上的MYSQL.首先打开DOS窗口,然后进入目录mysql\bin,再键入命令mysql -u root -p,回车后提示你输密码.注意用户名前可以有空格也可以没有空格,但是密码前必须没有空格,否则让你重新输入密码. 如果刚安装好MYSQL,超级用户root是没有密码的,故直接回车即可进入到MYSQL中了,MYSQL的提示符是: mysql> 2.连接到远程主机上的MYSQL.假设远程主机的IP为:110.110.110.

系统信息 arch 显示机器的处理器架构(1) uname -m 显示机器的处理器架构(2) uname -r 显示正在使用的内核版本 dmidecode -q 显示硬件系统部件 - (SMBIOS / DMI) hdparm -i /dev/hda 罗列一个磁盘的架构特性 hdparm -tT /dev/sda 在磁盘上执行测试性读取操作 cat /proc/cpuinfo 显示CPU info的信息 cat /proc/interrupts 显示中断 cat /proc/meminfo 校验

几个重要的概念 首先先明确几个概念: WorkPlace : 工作区 Index: 暂存区 Repository: 本地仓库/版本库 Remote: 远程仓库 当在Remote(如Github)上面clone一个项目到本地时(假设项目名为GitTest),在本地就会看到一个名为GitTest的目录,目录下有项目代码和一个名为.git的目录,什么是工作区呢,就是除了.git文件夹以外的所有东西,我们主要在工作区上阅读,修改,添加删除代码和其他内容,而这个.git目录就称为一个版本库,这个版本库中存