Holm's-Bonferroni怎么做

  • 2024-08-23

Holm–Bonferroni method

sklearn实战-乳腺癌细胞数据挖掘(博主亲自录视频) https://study.163.com/course/introduction.htm?courseId=1005269003&utm_campaign=commission&utm_source=cp-400000000398149&utm_medium=share 医药统计项目联系:QQ231469242 # -*- coding: utf-8 -*- # Import standard packages impor

Beautiful and Powerful Correlation Tables in R

Another correlation function?! Yes, the correlation function from the psycho package. devtools::install_github("neuropsychology/psycho.R") # Install the newest version library(psycho) library(tidyverse) cor <- psycho::affective %>% correla

SAGE|DNA微阵列|RNA-seq|lncRNA|scripture|tophat|cufflinks|NONCODE|MA|LOWESS|qualitile归一化|permutation test|SAM|FDR|The Bonferroni|Tukey's|BH|FWER|Holm's step-down|q-value|

生物信息学-基因表达分析 为了丰富中心法则,研究人员使用不断更新的技术研究lncRNA的方方面面,其中技术主要是生物学上的微阵列芯片技术和表达数据分析方法,方方面面是指lncRNA的位置特征. Background:根据中心法则,发现DNA与RNA与protein之间的关系,此时认为找到的RNA全部用于编码protein,但是实验结果中:非编码RNA含量高,而coding区只占很少的一部分.研究非编码RNA,发现noncoding与protein expression有关,所以总思路变成了研究n

Bonferroni校正法

Bonferroni校正:如果在同一数据集上同时检验n个独立的假设,那么用于每一假设的统计显著水平,应为仅检验一个假设时的显著水平的1/n http://baike.baidu.com/view/1217813.htm?fr=aladdin Bonferroni校正法: 此方法是在进行两两比较时对检验水准进行调整的办法,但是该方法在比较的次数较多时,就不太适合,因为校正后的检验水准会过小.此时可采用sidark法进行多重比较(仍然是对检验水准进行调整). 统计学中一般以小概率作为判断差异是否显著

学习笔记50—多重假设检验与Bonferroni校正、FDR校正

总结起来就三句话: (1)当同一个数据集有n次(n>=2)假设检验时,要做多重假设检验校正 (2)对于Bonferroni校正,是将p-value的cutoff除以n做校正,这样差异基因筛选的p-value cutoff就更小了,从而使得结果更加严谨 (3)FDR校正是对每个p-value做校正,转换为q-value.q=p*n/rank,其中rank是指p-value从小到大排序后的次序. 举一个具体的实例: 我们测量了M个基因在A,B,C,D,E一共5个时间点的表达量,求其中的差异基因,具体

使用LSTM做电影评论负面检测——使用朴素贝叶斯才51%，但是使用LSTM可以达到99%准确度

基本思路: 每个评论取前200个单词.然后生成词汇表,利用词汇index标注评论(对 每条评论的前200个单词编号而已),然后使用LSTM做正负评论检测. 代码解读见[[[评论]]]!embedding层本质上是word2vec!!!在进行数据降维,但是不是所有的LSTM都需要这个,比如在图像检测mnist时候,就没有这层! import tensorflow as tf from tensorflow.contrib.learn.python import learn from sklearn

用php做注册审核

做注册审核就像前面讲的注册登录一样,也是要连接数据库 首先在数据库内要做这样一张表: 表名为users表 里面的列名分别为用户名,密码,姓名,性别,生日,账户的状态,照片 然后就可以写代码了,要注册的话,先来做一个简单注册页面: <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd&qu

我们是怎么做Code Review的

前几天看了<Code Review 程序员的寄望与哀伤>,想到我们团队开展Code Review也有2年了,结果还算比较满意,有些经验应该可以和大家一起分享.探讨.我们为什么要推行Code Review呢?我们当时面临着代码混乱.Bug频出的状况.当时我觉得要有所改变,希望能提高产品的代码质量,改善开发团队面临的困境.并且我个人在开发上有很多经验,也希望这些知识能够在团队内传播.各种考虑后,我们最后认为推行Code Review能改善或解决我们面临的很多问题. 这篇文章的目的不是告诉大家怎么在

传播正能量——做一个快乐的程序员

引子 今天在博客园看到施瓦小辛格的文章我们搞开发的为什么会感觉到累,顿时有感而发.自己本来不擅长写文章,更不擅长写这种非技术性的文章,但是在思绪喷薄之际,还是止不住有很多话要说.针对从客观上说"搞开发的很累"这种说法,我也来发表一下我的看法. 我们的累 我们搞开发的为什么会感觉到累,文中已经说了很多,简单的讲,主要是担心和紧张感以及加班的劳累. 明天项目上线,通宵改BUG,好累. 需求变来变去,这个项目什么时候是个头,好累 现有的技术将要过时,面临淘汰,一堆的新技术要学,好累 每天上下

为什么做java的web开发我们会使用struts2，springMVC和spring这样的框架?

今年我一直在思考web开发里的前后端分离的问题,到了现在也颇有点心得了,随着这个问题的深入,再加以现在公司很多web项目的控制层的技术框架由struts2迁移到springMVC,我突然有了一个新的疑问无法得到正确的解释,为什么我们现在做java的web开发,会选择struts2或者springMVC这样的框架,而不是使用servlet加jsp这样的技术呢?特别是现在我们web的前端页面都是使用velocity这样的模板语言进行开发,抛弃了jsp,这样的选择又会给我们java的web开发带来什么

调用AJAX做登陆和注册

先建立一个页面来检测一下我们建立的用户名能不能用,看一下有没有已经存在的用户名吗 可以通过ajax提示一下 $("#uid").blur(function(){ //取用户名 var uid = $(this).val(); //查数据库,调ajax $.ajax({ url:"testchuli.php",//处理页面的地址 data:{u:uid},//要传递的数据 type:"POST",//提交方式 dataType:"TEXT

WPF做12306验证码点击效果

一.效果 和12306是一样的,运行一张图上点击多个位置,横线以上和左边框还有有边框位置不允许点击,点击按钮输出坐标集合,也就是12306登陆的时候,需要向后台传递的参数. 二.实现思路 1.获取验证码图片 首先,我们看12306登陆页面,F12,通过如图的位置,我们可以观察到,验证码的请求URL是“https://kyfw.12306.cn/otn/passcodeNew/getPassCodeNew?module=login&rand=sjrand&0.8291445260649148

使用 JavaScript 和 canvas 做精确的像素碰撞检测

原文地址:Pixel accurate collision detection with Javascript and Canvas 译者:nzbin 我正在开发一个需要再次使用碰撞检测的游戏.我通常会使用简单高效的盒模型碰撞检测.盒子模型的主要原则就是把所有的物体都抽象成正方形,如果两个正方形有重叠,就认为是一次碰撞.这通常是一个简单的游戏所需要的.但是因为这种模型我之前用过多次,我想尝试一些更深刻更准确的方法. 我选择从像素级层面来看是否发生了碰撞.首先我要了解“像素是什么”.我测试的元素透

做一个gulp+webpack+vue的单页应用开发架子

1.目标 最近项目上的事情不多,根据我自己的开发习惯,决定开发一些简单的开发架子,方便以后事情多的时候直接套用.本文讲的一个gulp+webpack+vue的单页应用架子,想要达到的目的: 可以通过命令打包开发chunk,并支持热替换 可以通过命令打包可发布的chunk 支持路由 路由中的代码实现按需加载 用CommonJs的风格组织代码 代码结构尽量清晰易懂 尽我所能先做出一个满足以上特点的架子吧,最近看完ES6,准备再去看看flux和reduce,看过之后再来思考下前端数据如何管理比较科学规

UWP开发之ORM实践：如何使用Entity Framework Core做SQLite数据持久层？

选择SQLite的理由 在做UWP开发的时候我们首选的本地数据库一般都是Sqlite,我以前也不知道为啥?后来仔细研究了一下也是有原因的: 1,微软做的UWP应用大部分也是用Sqlite.或者说是微软推荐使用Sqlite吧! 2,简单!就只有一个类库没有多余的参照什么的.不像其他数据库还得做复杂配置什么的麻烦! 3,不需要数据库服务,数据服务和客户都在同一个进程里面.如下图: 4,作为存储系统它只支持一个用户一个数据实体. 5,跨平台跨结构,这个好! Sqlite主要使用内容 如果想充分使用好S

用原生js做单页应用

最近在公司接到一个需求,里面有一个三级跳转.类似于选择地址的时候,选择的顺序是:省份->市->区.如果分三个页面跳转,那么体验非常不好,如果引入其他框架做成单页应用,又比较麻烦.所以可以用js把这一块做成单页应用的样子... 主要思路 通过改变url的hash值,跳到相应模块.先把默认模块显示出来,其他模块隐藏,分别给三个模块定义三个hash值,点击默认模块的选项的时候,改变hash值,同时在window上监听hashchange事件,并作相应模块跳转逻辑处理.这样即可模拟浏览器的前进后退,而

动手做第一个Chrome插件

Chrome插件是令人惊讶的简单,一旦你弄懂它的工作和实现原理.它是由一部分HTML,一部分Js,然后混合了一个叫做manifest.json的Json文件组合而成的整体.这意味着你可以使用你最擅长的js框架去实现它. 如果你还是一个Chrome插件的新手并且想尝试写一个的话,下面的文章将会带领大家并且尝试让大家理解Chrome插件的工作机制.这篇文章将会讲述每一块架构,以及相互之间的联系和插件的一般化形式. 架构 Chrome插件中的文件大体上可以分成2部分:Chrome插件中确确实实存在的文

【定有惊喜】android程序员如何做自己的API接口？php与android的良好交互（附环境搭建），让前端数据动起来~

一.写在前面 web开发有前端和后端之分,其实android还是有前端和后端之分.android开发就相当于手机app的前端,一般都是php+android或者jsp+android开发.android和php在当下如此热门,我想作为一个android程序员还是应该清楚android与php的交互的,那么,今天我们就来尝试一波~ 二.环境准备 1)虽然现在十分流行wamp(windows+apache+mysql+php)和lamp的php开发模式,但是为了省时省力,今天我们就暂且使用xampp

游戏AI系列内容 咋样才能做个有意思的AI呢

游戏AI系列内容 咋样才能做个有意思的AI呢 写在前面的话 怪物AI怎么才能做的比较有意思.其实这个命题有点大,我作为一个仅仅进入游戏行业两年接触怪物AI还不到一年的程序员来说,来谈这个话题,我想我是不够格的.不过,在这有限的时间里边,我也多多少少的写过几个怪物.最初,很多怪物写完之后,就感觉很傻.一点意思都没有到后来的,慢慢的觉得,像是一点一点的赋予这个怪物生命一样,成就感满满.然后让我一步一步的告诉你什么是有意思的AI. 啊 什么才是有意思的AI呢 从宏观上来说,大到一个人,小到一只青蛙,都

手把手教你做个人 app

我们都知道,开发一个app很大程度依赖服务端:服务端提供接口数据,然后我们展示:另外,开发一个app,还需要美工协助切图.没了接口,没了美工,app似乎只能做成单机版或工具类app,真的是这样的吗?先来展示下我的个人app,没有服务端,没有美工完成的,换言之,我干了所有人的活: 这个app叫"微言",他对于我意义很重大,最初微言只是我一个练手的项目,刚刚工作,技术有限,微言只是sqlite记事本类app,只能本地操作,后来慢慢演变现在几近完美的app,从中我学到很多,熟悉了立项到上线的

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