HOMER只能处理chi-seq的数据吗

2024-10-17

homer进行motif分析 ChIP-seq

http://homer.salk.edu/homer/ [怪毛匠子-整理] 使用HOMER分析CLIP-SEQ数据 24 5 2月 2013 | 程序员 Tags: 生物信息学 · 软件 HOMER是一个使用perl和C写成的motif分析工具.之前在分析clip-seq分析时,按照文献中材料和方法所写的流程进行分析,却无法得到与文献一致的结果.想来多半是文章发表时,并没有把所有的细节写清楚,导致我在重复时参数选择方面并没有与原作者保持一致.另一个原因是基因组几经修改,原本的hg17的数据

关于MyBatis的collection集合中只能取到一条数据的问题

问题:在涉及多表查询的时候,使用collection元素来映射集合属性时,出现了只能查询到一条数据的情况,但用sql语句在数据库中查询会有多条记录. 解决:如果两表联查,主表和明细表的主键都是id的话,明细表的多条只能查询出来第一条.所以涉及查询所用的表的主键的命名不要相同,否则会混淆.

将Excel导入SQL Server 只能导入数字，其他数据变为NULL怎么解决？

先新建一个TXT文件,把数据粘贴进去再新建一个Excel文件,在菜单栏中选Data再选From Text 找到txt文件,点import 一定要选Text 点Finish,点OK. 接下来在往数据库中导入打开SQL Server Management Studio 在需要导入数据的数据库名上点击鼠标右键选Task,选Import Date 点Next Data Soure选Microsoft Excel file path选你的Excel文件点Next Authentication中选Us

只能用于文本与图像数据？No！看TabTransformer对结构化业务数据精准建模

作者:韩信子@ShowMeAI 深度学习实战系列:https://www.showmeai.tech/tutorials/42 TensorFlow 实战系列:https://www.showmeai.tech/tutorials/43 本文地址:https://www.showmeai.tech/article-detail/315 声明:版权所有,转载请联系平台与作者并注明出处收藏ShowMeAI查看更多精彩内容自 Transformers 出现以来,基于它的结构已经颠覆了自然语言处理和

SQLServer2008只能编辑前面200行数据

设置编辑所有行:操作步骤:打开数据库-〉工具-〉选项-〉sqlserver对象资源管理器-〉命令把200改为0,即可编辑所有行了

volatile并不能保证数据同步、只能保证读取到最新主内存数据

在 java 垃圾回收整理一文中,描述了jvm运行时刻内存的分配.其中有一个内存区域是jvm虚拟机栈,每一个线程运行时都有一个线程栈, 线程栈保存了线程运行时候变量值信息.当线程访问某一个对象时候值的时候,首先通过对象的引用找到对应在堆内存的变量的值,然后把堆内存变量的具体值load到线程本地内存中,建立一个变量副本,之后线程就不再和对象在堆内存变量值有任何关系,而是直接修改副本变量的值, 在修改完之后的某一个时刻(线程退出之前),自动把线程变量副本的值回写到对象在堆中变量.这样在堆中的对象的

解决spark streaming集成kafka时只能读topic的其中一个分区数据的问题

1. 问题描述我创建了一个名称为myTest的topic,该topic有三个分区,在我的应用中spark streaming以direct方式连接kakfa,但是发现只能消费一个分区的数据,多次更换comsumer group依然如此. 2 环境配置 kafka集群环境, 主机 IP 操作系统 kakfa node1 192.168.1.101 Centos 6.5 kafka_2.11-0.10.1.1 node2 192.168.1.102 Centos 6.5 kafka_2.11-0.

FunDA（2）－ Streaming Data Operation：流式数据操作

在上一集的讨论里我们介绍并实现了强类型返回结果行.使用强类型主要的目的是当我们把后端数据库SQL批次操作搬到内存里转变成数据流式按行操作时能更方便.准确.高效地选定数据字段.在上集讨论示范里我们用集合的foreach方式模拟了一个最简单的数据流,并把从数据库里批次读取的数据集转换成一串连续的数据行来逐行使用.一般来说完整的流式数据处理流程包括了从数据库中读取数据.根据读取的每行数据状态再对后台数据库进行更新,包括:插入新数据.更新.删除等.那么在上篇中实现的流式操作基础上再添加一种指令行类型就可

大数据篇：Spark

大数据篇:Spark Spark是什么 Spark是一个快速(基于内存),通用,可扩展的计算引擎,采用Scala语言编写.2009年诞生于UC Berkeley(加州大学伯克利分校,CAL的AMP实验室),2010年开源,2013年6月进入Apach孵化器,2014年成为Apach顶级项目,目前有1000+个活跃者.就是说用Spark就对了. Spark支持Scala,Java,R,Python语言,并提供了几十种(目前80+种)高性能的算法,这些如果让我们自己来做,几乎不可能. Spark得到

c语言数据拼包

单片机数据拼包对于数据包拼包方式常规方式有: 数组指针结构体流下文将此三种方式分别列举此数据包的实现. 然后对比优缺点. 本文举例数据包协议: 包头长度Length 消息类型消息序列号Seq 负载数据校验 2字节 1字节 1字节 1字节 N字节 2字节名称描述其他包头固定 0X0A,0X0A 对于以太网数据包可以不设立此段.串口一般需要使用,对解包有利,这里不赘述. 长度 Length 数据包长度,(除去包头和自身) 消息类型 - 低7bit是消息类型,最高bit标记是

[更新]跨平台物联网通讯框架 ServerSuperIO v1.2（SSIO），增加数据分发控制模式

1.[开源]C#跨平台物联网通讯框架ServerSuperIO(SSIO) 2.应用SuperIO(SIO)和开源跨平台物联网框架ServerSuperIO(SSIO)构建系统的整体方案 3.C#工业物联网和集成系统解决方案的技术路线(数据源.数据采集.数据上传与接收.ActiveMQ.Mongodb.WebApi.手机App) 4.开源地址:https://github.com/wxzz/ServerSuperIO 1.SSIO更新内容: 增加数据分发模式(DeliveryMode),在网络通

分布式大数据高并发的web开发框架

一.引言通常我们认为静态网页html的网站速度是最快的,但是自从有了动态网页之后,很多交互数据都从数据库查询而来,数据也是经常变化的,除了一些新闻资讯类的网站,使用html静态化来提高访问速度是不太现实的方案.我们不得不在代码与数据库之间寻求一种更合适的解决方案. 减少数据库访问次数,文件和数据库分离,大数据分布式存储,服务器的集群负载均衡,页面缓存的使用,nosql内存数据库代替关系型数据库,这些方案措施都是提高系统高并发性能的关键,下面一一分解. 二.分解 (1) 分布式服务器

【php爬虫】百万级别知乎用户数据爬取与分析

代码托管地址:https://github.com/hoohack/zhihuSpider 这次抓取了110万的用户数据,数据分析结果如下: 开发前的准备安装Linux系统(Ubuntu14.04),在VMWare虚拟机下安装一个Ubuntu: 安装PHP5.6或以上版本: 安装MySQL5.5或以上版本: 安装curl.pcntl.pdo扩展. 使用PHP的curl扩展抓取页面数据 PHP的curl扩展是PHP支持的允许你与各种服务器使用各种类型的协议进行连接和通信的库. 本程序是抓取知乎的

SQL SERVER几种数据迁移/导出导入的实践

SQLServer提供了多种数据导出导入的工具和方法,在此,分享我实践的经验(只涉及数据库与Excel.数据库与文本文件.数据库与数据库之间的导出导入). (一)数据库与Excel 方法1: 使用数据库客户端(SSMS)的界面工具.右键选择要导出数据的数据库,选择“任务”——“导出数据”,下图1,按照向导一步一步操作即可.而导入则相反,导入时,SQLServer会默认创建一张新表,字段名也默认跟导入的Excel标题一样,并且会默认字段数据类型等.当然在可以在向导进行修改.需要注意的是如果标题不是

kaggle数据挖掘竞赛初步--Titanic<数据变换>

完整代码: https://github.com/cindycindyhi/kaggle-Titanic 特征工程系列: Titanic系列之原始数据分析和数据处理 Titanic系列之数据变换 Titanic系列之派生属性&维归约缺失值填充之后,就要对其他格式有问题的属性进行处理了.比如Sex Embarked这些属性的值都是字符串类型的,而scikit learn中的模型都只能处理数值型的数据,需要将这些原始的字符串类型的数据转为数值型数据.所有数据通常可以分成两种类型:定量与定性.定量的

用curl向指定地址POST一个JSON格式的数据

昨天的一个任务,用POST 方式向一个指定的URL推送数据.以前都用的数组来完成这个工作. 现在要求用json格式.感觉应该是一样的.开写. <?php $post_url = "http://news.php"; $post_data = json_encode($output_news);//$output_news处理好的数组 $ch = curl_init();//初始化 curl_setopt($ch, CURLOPT_TIMEOUT, '30');//超时时间 cur

使用Hive或Impala执行SQL语句，对存储在HBase中的数据操作

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Json数据的学习

JSON 教程 <body><h2>JSON Object Creation in JavaScript</h2> <p>Name: <span id="jname"></span><br /> Age: <span id="jage"></span><br /> Address: <span id="jstreet"&g

Android下的数据储存方式

安卓系统默认提供了一下几种数据储存的方式: Shared Preferences 内部储存外部储存 SQLite数据库保存到网络服务器使用Shared Preferences Shared Preferences类主要用于保存键值对的数据类型.我们可以使用它保存一些简单的数据类型. 获得SharedPreferences对象有两种方法: 通过getSharedPreferences()方法通过getPreferences()方法上面两种方法的分别主

SQL Server表结构和数据导入到MySQL

借助的工具:Navicat for MySQL,链接:http://pan.baidu.com/s/1kVCw8IF 密码:g927 可以很明确的肯定,主键和自增列是没办法导入的,只能是表结构和数据.主键和自增列这些可以后续自己新建. 具体操作: 1.在Navicat新建一个数据库.并打开. 2.在刚才新建的数据库上单击,留意右上角的导入向导按钮: 注意:这里选择包含唯一键.索引及外键. 完成!

html只允许输入的数据校验，只允许输入字母汉字数字等

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml"> <head> <meta http-equiv="Content-

HOMER只能处理chi-seq的数据吗

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