错误一: 2014-10-08 13:09:32,238 [uk.ac.ebi.interpro.scan.jms.worker.LocalJobQueueListener:193] ERROR - Execution thrown when attempting to executeInTransaction the StepExecution.  All database activity rolled back. java.lang.IllegalStateException: IOExc

一.需求:计算网页访问量前三名 import org.apache.spark.rdd.RDD import org.apache.spark.{SparkConf, SparkContext} /** * 需求:计算网页访问量前三名 * 用户:喜欢视频 直播 * 帮助企业做经营和决策 * * 看数据 */ object UrlCount { def main(args: Array[String]): Unit = { //1.加载数据 val conf:SparkConf = new Spa

将interproscan的结果转化格式 很奇怪 tsv格式里没有go, kegg, inter-domain信息,但是xml文件里面却有,tsv文件比较好处理,所以先将xml文件转化为tsv.用软件自带的工具: The convert mode is designed to work only for XML documents created with the same version. This makes sure we can introduce new schema updates

InterProScan 5.18-57.0 安装和使用,目前最新版的interproscan 引用自 每日一生信--interproscan安装及使用(终结版)原文官网:http://code.google.com/p/interproscan/wiki/Introduction 配置要求:至少2 cores and 4 GB of RAM, 这样才能同时分析5 - 10 sequences . 软件要求: Linux, 32 bit or 64 bit (64 bit recommended

InterProScan 5.25-64.0 安装和使用,目前最新版的interproscan 引用自 每日一生信--interproscan安装及使用(终结版)原文官网:http://code.google.com/p/interproscan/wiki/Introduction 配置要求:至少2 cores and 4 GB of RAM, 这样才能同时分析5 - 10 sequences . 软件要求: Linux, 32 bit or 64 bit (64 bit recommended

背景起因: 记起以前的另一次也是关于内存的调优分享下   有个系统平时运行非常稳定运行(没经历过大并发考验),然而在一次活动后,人数并发一上来后,系统开始卡. 我按经验开始调优,在每个关键步骤的加入如下代码耗时统计进行压测:   long startTime = System.currentTimeMillis();  callRpc();   //这里比如调用RPC伪代码,当然还在插入数据库,中间件地方都加入统计  long costTime = (System.currentTimeMill

摘要   接触ElasticSearch已经有一段了.在这期间,遇到很多问题,但在最后自己的不断探索下解决了这些问题.看到网上或多或少的都有一些介绍ElasticSearch相关知识的文档,但个人觉得都不是很全面.因此就有了写ElasticSearch开发教程的想法,将学习到的技术经验分享出来,帮助更多需要的朋友,也希望借此认识同行的朋友,共同交流,共同进步! 系列文章的总括 下面将对即将推出的ElasticSearch开发系列连载教程做简单的说明.教程主要是面向有一定Java编程基础的朋友,不

比尔盖茨公认的IT界领军人物,打造了辉煌一时的PC时代. 2008年,史蒂夫鲍尔默接替了盖茨的工作,成为微软公司的总裁. 2013年他与微软做了最后的道别. 2013年以后,我才真正看到了微软的变化.尤其是它的"云优先,移动优先"的战略,这才是符合新时代潮流的大势. 今天,既然我们重点是来讨论Java与.NET领域的,那关于微软的是是非非且放置脑后.我说.NET看起来更新很快,目前只是在弥补曾经犯下的错. 那.NET之前究竟错在哪里..NET既然是微软实现跨平台与Java竞争的利器,那

背景,服务器上的一个JAVA服务进程突然挂掉,查看产生了崩溃日志,如下: # Set larger code cache with -XX:ReservedCodeCacheSize= # This output file may be truncated or incomplete. # # Out of Memory Error (os_linux.cpp:2673), pid=28610, tid=139813184919296  日志分析原因很简单,服务器的内存不够用,导致进程崩溃 JA

运行个JAVA 用sleep去hold住 package org.hjb.test; public class TestOnly { public static void main(String[] args) { System.out.println("sleep .."); try { Thread.sleep(10000000); } catch (InterruptedException e) { e.printStackTrace(); } } }   java -Xmx10

有一种场景, 手机内存卡空间被用光了,但又不知道哪个文件占用了太大,一个个文件夹去找又太麻烦,所以我开发了个小程序把手机所有文件(包括路径下所有层次子文件夹下的文件)进行一个排序,这样你就可以找出哪个文件占用了内存太大了. 使用例子如下,用JAVA 运行Sort 1, 输入你要排序的文件路径 , 如 例子是对H:\下的文件和它所有子文件夹下的文件进行排序 2, 输入需要进行排序显示的最新大小,如 例子是对10M 大小 以上的文件进行排序 3,从大到小排序后按 文件路径\文件名-------大小

9. 线程安全/共享变量——同步 当多个线程用到同一个变量时,在修改值时存在同时修改的可能性,而此时该变量只能被赋值一次.这就会导致出现“线程安全”问题,这个被多个线程共用的变量称之为“共享变量”. 为了解决线程安全的问题,我们可以使用“同步”来控制线程访问.当一个线程在使用这个共享资源(不仅仅是变量,还可以是集合.对象等)的时候,其他线程就无法访问. package threadStudy; public class ThreadSynchronizedTest { public static

1. 创建线程    1.1 通过构造函数:public Thread(Runnable target, String name){}  或:public Thread(Runnable target){} 示例: Thread thread1 = new Thread(new MyThread(), "mythread"); class MyThread extends Thread(){ public void run(){ System.out.println("My

经常有人问这种问题,用了些时间java之后,发现这俩玩意除了一小部分壳子长的还有能稍微凑合上,基本上没什么相似之处,可以说也就是马甲层面上的相似吧,还是比较短的马甲... 一般C#多用于业务系统的开发,快速实现,微软官方的各种封装,各种语法糖,使得c#在语义语法层面上更人性化,开发思路更专注于业务逻辑,对技术的实现并不需要关心的很细(当然这是指初级的入门程度),不过也带来的一些缺陷,当表面上的功夫不能满足的时候,.net程序员就不得不去了解微软封装起来的东西,所以我认识的.net程序员几乎人手一

高并发,听起来高大上的一个词汇,在身处于互联网潮的社会大趋势下,高并发赋予了更多的传奇色彩.首先,我们可以看到很多招聘中,会提到有高并发项目者优先.高并发,意味着,你的前雇主,有很大的业务层面的需求,而且也能怎么你在整个项目中的一个处理逻辑的能力体现.那么,你真的知道什么是高并发吗?这不是一个很简单的话题.高并发,往往会牵扯到很多的问题,如何才能快速响应,如何处理各个线程之间的交互,如何完成逻辑之间的高负载运转,甚至,一个系统,如果没有做好前期高并发的合理配置,整个产品会遇到瓶颈,以及不可预期的

Java是最早开始有并发的语言之一,再过去传统多任务的模式下,人们发现很难解决一些更为复杂的问题,这个时候我们就有了并发. 引用 多线程比多任务更加有挑战.多线程是在同一个程序内部并行执行,因此会对相同的内存空间进行并发读写操作.这可能是在单线程程序中从来不会遇到的问题.其中的一些错误也未必会在单CPU机器上出现,因为两个线程从来不会得到真正的并行执行.然而,更现代的计算机伴随着多核CPU的出现,也就意味着不同的线程能被不同的CPU核得到真正意义的并行执行. 那么,要开始Java并发之路,就要开

一.Java 集合框架 集合框架是一个用来代表和操纵集合的统一架构.所有的集合框架都包含如下内容: 接口:是代表集合的抽象数据类型.接口允许集合独立操纵其代表的细节.在面向对象的语言,接口通常形成一个层次. 实现(类):是集合接口的具体实现.从本质上讲,它们是可重复使用的数据结构. 算法:是实现集合接口的对象里的方法执行的一些有用的计算,例如:搜索和排序.这些算法被称为多态,那是因为相同的方法可以在相似的接口上有着不同的实现. 集合接口 序号 name 接口描述 1 Collection Col

最近在搞一个电商系统中由于业务需求,需要在插入一条产品信息后返回产品Id,刚开始遇到一些坑,这里做下笔记,以防今后忘记. 类似下面这段代码一样获取插入后的主键 User user = new User(); user.setUserName("chenzhou"); user.setPassword("xxxx"); user.setComment("测试插入数据返回主键功能"); System.out.println("插入前主键为:

建议75:集合中的元素必须做到compareTo和equals同步 实现了Comparable接口的元素就可以排序,compareTo方法是Comparable接口要求必须实现的,它与equals方法有关系吗?有关系,在compareTo的返回为0时,它表示的是 进行比较的两个元素时相等的.equals是不是也应该对此作出相应的动作呢?我们看如下代码: class City implements Comparable<City> { private String code; private S

一:进程与线程 概述:几乎任何的操作系统都支持运行多个任务,通常一个任务就是一个程序,而一个程序就是一个进程.当一个进程运行时,内部可能包括多个顺序执行流,每个顺序执行流就是一个线程.   进程:进程是指处于运行过程中的程序,并且具有一定的独立功能.进程是系统进行资源分配和调度的一个单位.当程序进入内存运行时,即为进程.   进程的三个特点: 1:独立性:进程是系统中独立存在的实体,它可以独立拥有资源,每一个进程都有自己独立的地址空间,没有进程本身的运行,用户进程不可以直接访问其他进程的地址空间