0. 基本参数 基因组大小:G Read读长:L 总Read条数:n_r 1. 碱基深度分布 单条Read测序覆盖到某一个碱基的概率:L/G 因为L/G很小,n_r很大,每个碱基覆盖深度服从泊松分布. 则每个碱基的覆盖深度的期望为:d_n=(L/G)*n_r 2. K-mer深度分布 假设基因组对K是unique的,可以得到G个不同的K-mer. 单条Read测序覆盖某个K-mer的概率:(L-K+1)/G 同样因为(L-K+1)/G很小,n_r很大,每个K-mer的覆盖深度服从泊松分布. 则每

今天要分享的这篇论文是我个人最喜欢的论文之一,它的思想简单.巧妙,而且效果还相当不错.这篇论文借助数学上的 \(L_0\) 范数工具对图像进行平滑,同时保留重要的边缘特征,可以实现类似水彩画的效果(见下图). 另外这篇论文的作者徐立也是一个相当高产的研究员. 论文的目的 所谓图像平滑,就是突出图像中的低频成分,抑制高频成分,减小突变的梯度.大部分情况下,这么做的目的是为了去除图像中的噪声,因为噪声一般就是一些孤立的像素点,是像素变化比较大的区域.在传统的图像处理中,大部分操作都是用一些具有平滑性

书中存在的一些疑问 kd树的实现过程中,为何选择的切分坐标轴要不断变换?公式如:x(l)=j(modk)+1.有什么好处呢?优点在哪?还有的实现是通过选取方差最大的维度作为划分坐标轴,有何区别? 第一种方法网上也没具体的解释,我不是很清楚其原因(可能要去论文上找原因). 不过第二种方法的话,方差越大,说明这个维度数据的相似性就越差,就越容易通过选取中点的方式将数据集分开,kd树的效率就越高,试想如果你挑了一个维度其中数据全为一样,那么kd树的建立过程就无法将使用挑选中位数的方法来达到,而且后面的

论文翻译:https://arxiv.53yu.com/abs/2009.13931 基于高效多任务卷积神经网络的残余回声抑制 摘要 在语音通信系统中,回声会降低用户体验,需要对其进行彻底抑制.提出了一种利用卷积神经网络实现实时残余回声抑制(RAES)的方法.在多任务学习的背景下,采用双语音检测器作为辅助任务来提高性能.该训练准则基于一种新的损失函数,我们称之为抑制损失,以平衡残余回声的抑制和近端信号的失真.实验结果表明,该方法能有效抑制不同情况下的残余回声. 关键字:残余回声抑制,卷积神经网络

论文地址:https://indico2.conference4me.psnc.pl/event/35/contributions/3367/attachments/779/817/Thu-1-10-6.pdf 利用循环神经网络抑制非线性残差回声 摘要 免提通信设备的声学前端会对扬声器和麦克风之间的线性回声路径带来各种失真.虽然放大器可能会引入一个无记忆的非线性,但从扬声器通过设备外壳传递到麦克风的机械振动会引起记忆的非线性,这很难弥补.这些失真极大地限制了线性AEC算法的性能.虽然针对个别用例

转载来源:http://blog.csdn.net/fengbingchun/article/details/50087005 这篇文章主要是为了对深度学习(DeepLearning)有个初步了解,算是一个科普文吧,文章中去除了复杂的公式和图表,主要内容包括深度学习概念.国内外研究现状.深度学习模型结构.深度学习训练算法.深度学习的优点.深度学习已有的应用.深度学习存在的问题及未来研究方向.深度学习开源软件. 一.            深度学习概念 深度学习(Deep Learning, DL

AA(Anti-Aliasing)抗锯齿想必不少玩家在游戏画质设定中经常会遇到,说通俗一点AA抗锯齿的作用:将图像边缘及其两侧的像素颜色进行混 合,然后用新生成的具有混合特性的点来替换原来位置上...    AA(Anti-Aliasing)抗锯齿想必不少玩家在游戏画质设定中经常会遇到,说通俗一点AA抗锯齿的作用:将图像边缘及其两侧的像素颜色进行混 合,然后用新生成的具有混合特性的点来替换原来位置上的点以达到柔化物体外形.消除锯齿的效果.随着图形技术的不断革新,AA抗锯齿的技术也随之在不断的 发

Harris.Shi-Tomasi和亚像素角点都是角点,隶属于特征点这个大类(特征点可以分为边缘.角点.斑点). 一.Harris角点检测是一种直接基于灰度图像的角点提取算法,稳定性较高,但是也可能出现有用信息丢失的情况. 函数:cornerHarris() void cv::cornerHarris ( InputArray  src,  //需要为8位单通道     OutputArray  dst,  //结果     int  blockSize, //领域大小     int  ksi

上一篇文章我们引出了GoogLeNet InceptionV1的网络结构,这篇文章中我们会详细讲到Inception V2/V3/V4的发展历程以及它们的网络结构和亮点. GoogLeNet Inception V2 GoogLeNet Inception V2在<Batch Normalization: Accelerating Deep Network Training by Reducing Internal Covariate Shift>出现,最大亮点是提出了Batch Normal

1. 什么是残差(residual)? “残差在数理统计中是指实际观察值与估计值(拟合值)之间的差.”“如果回归模型正确的话, 我们可以将残差看作误差的观测值.” 更准确地,假设我们想要找一个 $x$,使得 $f(x) = b$,给定一个 $x$ 的估计值 $x_0$,残差(residual)就是 $b-f(x_0)$,同时,误差就是 $x-x_0$. 即使 $x$ 不知道,我们仍然可以计算残差,只是不能计算误差罢了. 2. 什么是残差网络(Residual Networks,ResNets)?

近年来,注意力(Attention)机制被广泛应用到基于深度学习的自然语言处理(NLP)各个任务中.随着注意力机制的深入研究,各式各样的attention被研究者们提出,如单个.多个.交互式等等.去年6月,google机器翻译团队在arXiv上的<Attention is all you need>论文受到了大家广泛关注,其中,他们提出的自注意力(self-attention)机制和多头(multi-head)机制也开始成为神经网络attention的研究热点,在各个任务上也取得了不错的效果.

写在前面 整个项目都托管在了 Github 上:https://github.com/ikesnowy/Algorithms-4th-Edition-in-Csharp 查找更为方便的版本见:https://alg4.ikesnowy.com/ 这一节内容可能会用到的库文件有 Quick,同样在 Github 上可以找到. 善用 Ctrl + F 查找题目. 习题&题解 2.3.1 解答 2.3.2 解答 2.3.3 解答 N / 2 在快速排序中,一个元素要被交换,有以下两种情况 1.该元素是

1.官网简介 http://cab.spbu.ru/software/quast-lg/ QUAST- lg是QUAST的一个扩展,用于评估大型基因组装配(直至哺乳动物大小).QUAST- lg从5.0.0版本开始包含在QUAST包中(下载最新版本).像往常一样运行QUAST,不要忘记在您的命令中添加‐large选项! 新功能的简短列表(参见所有更改): 通过使用新的快速比对(minimap2)和重构对齐分析模块,显著提高了速度 新的基于k-mer的评估基因组完整性和正确性度量 BUSCO增加了

1.      k近邻(k-NearestNeighbor)算法介绍及在推荐系统中的应用 https://zhuanlan.zhihu.com/p/25994179 k近邻(k-NearestNeighbor)算法是一种基本分类和回归方法.分类问题的k近邻法即给定一个训练数据集,对新的输入实例,在训练数据集中找到与该实例最邻近的K个实例,这K个实例的多数属于某个类,就把该输入实例分类到这个类中.(这就类似于现实生活中少数服从多数的思想) 算法注意点:K值选取(过小容易过拟合,过大大大降低预测准确

仅用作自己学习 这篇文章中我们会详细讲到Inception V2/V3/V4的发展历程以及它们的网络结构和亮点. GoogLeNet Inception V2        GoogLeNet Inception V2在<Batch Normalization: Accelerating Deep Network Training by Reducing Internal Covariate Shift>出现,最大亮点是提出了Batch Normalization方法,它起到以下作用:  使用

目录 一. 前言 1.1 本文动机 1.2 PBR知识体系 1.3 本文内容及特点 二. 初阶:PBR基本认知和应用 2.1 PBR的基本介绍 2.1.1 PBR概念 2.1.2 与物理渲染的差别 2.1.3 PBR的特征 2.2 PBR的衍变历史 2.2.1 Lambert(1760年) 2.2.2 Smith(1967年) 2.2.3 Phong(1973年) 2.2.4 Cook-Torrance(1982年) 2.2.5 Oren Nayarh(1994年) 2.2.6 Schlick(

Spatial Temporal Graph Convolutional Networks for Skeleton-Based Action Recognition 摘要 动态人体骨架模型带有进行动作识别的重要信息,传统的方法通常使用手工特征或者遍历规则对骨架进行建模,从而限制了表达能力并且很难去泛化. 作者提出了一个新颖的动态骨架模型ST-GCN,它可以从数据中自动地学习空间和时间的patterns,这使得模型具有很强的表达能力和泛化能力. 在Kinetics和NTU-RGBD两个数据集上a

TiKV事务实现浅析 Percolator事务的理论基础 Percolator的来源 Percolator事务来源于Google在设计更新网页索引的系统时提出的论文Large-scale Incremental Processing Using Distributed Transactions and Notifications中,Google用它在支持单行事务的分布式数据库Bigtable的基础上实现跨节点的分布式事务.Percolator是一种优化版的2PC,但是与 常见的2PC不同,它并没

Google 2017年的论文 Attention is all you need 阐释了什么叫做大道至简!该论文提出了Transformer模型,完全基于Attention mechanism,抛弃了传统的RNN和CNN. 我们根据论文的结构图,一步一步使用 PyTorch 实现这个Transformer模型. Transformer架构首先看一下transformer的结构图: 解释一下这个结构图.首先,Transformer模型也是使用经典的encoer-decoder架构,由encode

论文提出stand-alone self-attention layer,并且构建了full attention model,验证了content-based的相互关系能够作为视觉模型特征提取的主要基底.在图像分类和目标检测实验中,相对于传统的卷积模型,在准确率差不多的情况下,能够大幅减少参数量和计算量,论文的工作有很大的参考意义   来源:[晓飞的算法工程笔记] 公众号 论文: Stand-Alone Self-Attention in Vision Models 论文地址:https://a

CondenseNet特点在于可学习分组卷积的提出,结合训练过程进行剪枝,不仅能准确地剪枝,还能继续训练,使网络权重更平滑,是个很不错的工作   来源:晓飞的算法工程笔记 公众号 论文:Neural Architecture Search with Reinforcement Learning 论文地址:https://arxiv.org/abs/1711.09224 论文代码:https://github.com/ShichenLiu/CondenseNet Introduction   De