手把手教你看KEGG通路图! 亲爱的小伙伴们,是不是正关注代谢通路研究?或者你正面对数据,绞尽脑汁?小编当然不能让亲们这么辛苦,今天就跟大家分享KEGG代谢通路图的正确解读方法,还在迷糊中的小伙伴赶紧mark起来吧~ 怎么看KEGG中代谢通路图? KEGG,Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因和基因组百科全书,是系统分析基因功能,联系基因组信息和功能信息的知识库.其中包含有大量的通路图,如下图所示:   1.代谢通路中各种符号标识: 代谢通路图

1.https://www.kegg.jp/kegg/tool/map_pathway2.html 2.如下图,筛选出基因所在的通路,并标上不同的颜色. 3.结果页面如下,有些基因会找不到对应的通路,如下图红字,找到通路的会列在下方,点击可以查看对应通路.

转载:http://www.omicshare.com/forum/thread-107-1-3219.html (出处: OmicShare Forum) 不管是RNA-seq的分析数据,还是蛋白组的分析数据,都有一个数据库我们会经常遇到,那就是KEGG pathway.KEGG pathway中有着大量的通路图,以PI3K-Akt signaling pathway(ko04151)为例,里面包含了大量的蛋白等化合物,以及它们之间相互作用的关系,那么我们如何快速的读懂这些通路包含的信息,且看

问题:提取出序列中的值或者根据某些标准对序列做删减 解决方案:列表推导式.生成器表达式.使用内建的filter()函数 1.列表推导式方法:存在一个潜在的缺点,如果输入数据非常大可能会产生一个庞大的结果,考虑到该问题,建议选择生成器表达式 # Examples of different ways to filter data mylist = [1, 4, -5, 10, -7, 2, 3, -1] print('mylist=',mylist) # 使用列表推导式 pos = [n for n

2017年9月8日,证监会公布首批公募FOF基金名单,标志着公募FOF产品正式落地.FOF(Fund of Funds)是一种通过投资基金,而非直接投资具体证券标的(股票或债券等)来实现分散化资产配置的理财产品.其主要优势在于:(1)FOF投资者不再需要承担研究和跟踪每一类标的(股票.债券等)的繁重任务,而只需要专注于挑选不同领域表现优秀的专业投资管理顾问,从而实现投资流程的分工和专业化:(2)通过投资不同类型.不同风格的基金,实现多样化的资产配置,以适应不同的市场环境和经济周期. 首批发行的六

大家好,本周分享的是发表在Molecular & Cellular Proteomics 上的一篇关于人胃肠道间质瘤亚群蛋白质组图谱的文章,题目是Proteomic maps of human gastrointestinal stromal tumor subgroups,通讯作者是四川大学生物治疗国家重点实验室的戴伦治. 胃肠道间质瘤(Gastrointestinal stromal tumor, GIST)是一种起源于胃肠道间叶组织的肿瘤,也是最为常见的胃肠道肉瘤(Gastrointest

菜单:数据--更多筛选---标准筛选 点开“选项”,勾上“无重复值”. 然后还可以把结果复制到其它单元格.

在<Part 1 - 签证>的评论中有人提到,说我还没说如何申请职位就说签证的事情了.一方面,签证的周期决定了你申请职位的时间,错过关键时间点的话就可能错过重要的机会.另一方面,传统意义上的「申请」其实不是我的强项,而我个人的做法可能对大多数人来说是不容易实践的. 首先需要说明的是,我在找工作时有两件事情是绝对不做的: 大量投简历给众多公司 为面试做任何应试准备 我找工作基本上靠内部推荐,所以我是不会投简历给众多公司的.这不仅仅是因为内部推荐会使得公司更重视,还因为我需要了解一家公司是否适合我

每年的三四月是招聘的黄金时节,故有金三银四的说法.求贤纳才对于处在发展上升期的公司来说,是全年性的常态化工作.只是这俩月市场上求职者数量较别的月份多.基数大了,淘到金子的概率自然会增加.大部分公司的伯乐们是这样认为的.那金三银四究竟是不是真的有很多千里马呢?今天老俞就和大伙儿聊一聊这个话题. 寻找优秀的GISer 公司管理者们经常遇到一个头疼的问题:招不到合适的人.公司业务不断扩大,现有的人力资源跟不上业务发展的速度.生产效率在短时间内无法迅速提高的情况下,加班成了唯一的选择.另一方面,每年都会

一.定义 网络唤醒:唤醒休眠状态下的计算机,而不是已关机的计算机. 优势:可通过定时功能实现自动唤醒计算机,减少人力使用. 实现方法:通过被唤醒机的MAC地址进行广播发送请求,唤醒计算机. 二.硬件设置 1.Win7系统下设置如下图,计算机->设备管理器->网卡驱动属性 2.在BIOS设置允许网络唤醒 该功能设置介绍起来太墨迹,各位自行百度吧,很简单... 二.上代码 技术提示:通过被唤醒机的MAC地址进行唤醒,格式为6遍“FF”+17遍mac的byte类型字节. 本来想先传代码,再进行一步一

Question 118You are creating a Business Connectivity Services (BCS) entity.You need to ensure that all data returned by the entity is available in search results.Which type of method instance should you implement?A. Finder and GenericInvokerB. Finder

虽然大多数时候你的Javascript交互将通过使用datatable初始化对象作为描述在使用这个网站的部分,有时,你会发现它有用一些外部控制表.可以使用以下函数从jQuery.dataTable对象. 也有一些插件API函数可用的扩展的功能之外的datatable内置函数描述这个页面. 注意对于那些使用服务器端处理:大量的API函数假设数据存储在客户端完成它,而不是在服务器端.这样的功能,比如fnAddData和 fnDeleteRow不会影响数据库的数据上举行.事实上datatable不知道

主要途径是参考苹果官方文档,所以介绍以翻译官方文档为主.由于内容比较多,会分阶段来介绍. 以下来自苹果官方文档中对Instruments描述 介绍 Instruments是一个强大而灵活的性能分析和测试工具,它是Xcode开发工具集的一部分,它被设计用于帮助分析OS X和iOS的应用.进程与设备,以便更好的理解和优化它们的行为和表现.结合Instruments从你的app开发工作刚刚开始,可以节省你的时间,帮助你在开发周期的早期发现问题. 在Instruments中,可以使用指定的工具,跟踪应用

简单地自我介绍:本人于纽约完成了研究生阶段的学习后,在华尔街混迹了几年的时间,已获取FRM证书,正在积极准备CFA. 上海财经大学FRM培训中心前言导读 经常看到CFA持证人平均年收入为$XXX之类的统计数据.但其实个人认为职业发展和证书的关系是“鸡与蛋”的关系,说清谁因谁果恐怕并非易事.这个回答主要是本人对CFA以及FRM知识点的异同.应用的领域.对就业/跳槽的帮助.与实际操作的差异等问题的理解.希望能帮助尚未决定的朋友结合自身情况作出选择. 1. 成本与难度: 两个考试难度相差很大. CFA

一.写在前面的话~ 刚吃饭的时候同学问我,你为什么要用R做文本分析,你不是应该用R建模么,在我和她解释了一会儿后,她嘱咐我好好写这篇博文,嗯为了娟儿同学,细细说一会儿文本分析. 文本数据挖掘(Text Mining)是指从文本数据中抽取有价值的信息和知识的计算机处理技术.顾名思义,文本数据挖掘是从文本中进行数据挖掘(Data Mining).从这个意义上讲,文本数据挖掘是数据挖掘的一个分支. 文本分析是指对文本的表示及其特征项的选取:文本分析是文本挖掘.信息检索的一个基本问题,它把从文本中抽取出

一般来说,回归不用在分类问题上,因为回归是连续型模型,而且受噪声影响比较大.如果非要应用进入,可以使用logistic回归. logistic回归本质上是线性回归,只是在特征到结果的映射中加入了一层函数映射,即先把特征线性求和,然后使用函数g(z)将最为假设函数来预测.g(z)可以将连续值映射到0和1上. logistic回归的假设函数如下,线性回归假设函数只是. logistic回归用来分类0/1问题,也就是预测结果属于0或者1的二值分类问题.这里假设了二值满足伯努利分布,也就是 当然假设它满

1.泛型 public class List<T>{ } 当定义泛型类的实例时,必须指定这个实例所存储的实际类型,泛型允许程序员将一个实际的数据类型规约延迟至泛型的实例被创建时才确定,泛型主要有两个有点: 1)编译时可以保证类型安全 2)不用做类型装换,获得一定的性能提升. 2.泛型方法.泛型委托.泛型接口 //泛型委托 public delegate void Del<T>(T item); public static void Notify(int i){} //泛型接口 pu

python信用评分卡(附代码,博主录制) https://study.163.com/course/introduction.htm?courseId=1005214003&utm_campaign=commission&utm_source=cp-400000000398149&utm_medium=share https://www.jianshu.com/p/a8037a38e219(原文链接) https://www.jianshu.com/p/4b4e0c343d3e(

有关 Oracle 的著名谣传 1.如果你想把表中数据复制到另一张表,或者想根据现有表创建一个类似的新表,网上有大量不明所以的帖子告诉你实现该功能的语法是select field1,field2 into tableA from tableB.实际上这个是 T-SQL 的语法,用于 SQL Server,而在 Oracle 支持的 PL/SQL 中的语法是CREATE TABLE tableA AS SELECT * FROM tableB. 我相信这个谣传害过很多人,许多新手搜到 SQL Se

一.产生背景 我们有一堆“人”的对象,我们应该怎么选择出其中的男性.女性或者其他类型的呢?这时候我们可以用过滤器模式 二.通常做法 我们将创建一个 Person 对象.Criteria 接口和实现了该接口的实体类,来过滤 Person 对象的列表.CriteriaPattern,我们的演示类使用 Criteria 对象,基于各种标准和它们的结合来过滤 Person 对象的列表. 三.实例 1.创建person类 namespace FilterPattern { public class Per