因为linux安装软件的方式比较多,所以没有一个通用的办法能查到某些软件是否安装了.总结起来就是这样几类: 1.rpm包安装的,可以用rpm -qa看到,如果要查找某软件包是否安装,用 rpm -qa | grep “软件或者包的名字”.  rpm -qa | grep ruby 2.以deb包安装的,可以用dpkg -l能看到.如果是查找指定软件包,用dpkg -l | grep “软件或者包的名字”:  dpkg -l | grep ruby 3.yum方法安装的,可以用yum list i

包(package)是多个函数的集合,常作为分享代码的基本单元,代码封装成包可以方便其他用户使用.越来越多的R包正在由世界上不同的人所创建并分发,这些分发的R包,可以从CRAN 或 github 上获取,由于向 CRAN 提交包审核非常严格,有些开发者并没有将自己开发的R包提至CRAN的意向,通过 devtools 可以轻松从 github上下载安装.包的生命周期一般会经历 source.bundled.binary.installed和in-memory五个阶段.参考资料 (http://r-

安装R $sudo apt-get update $sudo apt-get install r-base $sudo apt-get install r-base-dev 安装一些可能的依赖包 $sudo add-apt-repository -y ppa:opencpu/imagemagick $sudo apt-get update $sudo apt-get install -y libmagick++-dev $sudo apt-get install libcurl4-openssl

1.综述 越来越多的R包正在由世界上不同的人所创建,其中一部分原因是devtools包使得开发R包1变得更加简单.devtools包不仅让开发R包变得简单,而且用于分发R包. 当开发者发布一个R包的时候,CRAN2一般是最常用的.使用install.packages()函数可以安装发布在CRAN上的R包.例如,如下方法可以安装dplyr包: install.packages('dplyr') devtools包的install_github()函数用于从Github上安装R包. library(

R包的安装 1)使用 Rstudio 手动安装 Rstudio的窗口默认为四个,在右下角的窗口的 packages 下会显示所有安装的 R 包 点击 Install -> 输入R 包名 -> 点击 Install 2)使用命令安装 install.packages("R包名") R包的卸载 remove.packages("R包名") R包的加载 library("R包名") R包的移除 detach("package:R包

软件的安装方式: 编译安装 RPM包安装 yum安装 一.编译安装 1.下载一个源码安装包:tengine-2.3.0.tar.gz.这是淘宝二次开发过的nginx.将其解压. .tar.gz 2.查看解压后的目录: [root@centos-clone1 tengine-]# ll total -rw-rw-r-- root root Mar AUTHORS.te drwxrwxr-x root root Mar auto -rw-rw-r-- root root Mar CHANGES -r

randomForest 包提供了利用随机森林算法解决分类和回归问题的功能:我们这里只关注随机森林算法在分类问题中的应用 首先安装这个R包 install.packages("randomForest") 安装成功后,首先运行一下example library(randomForset) ?randomForset 通过查看函数的帮助文档,可以看到对应的example data(iris) set.seed(71) iris.rf <- randomForest(Species

目前GWAS方向发了很多文献,但是并没有一个很完善的R包对这些文献的数据进行汇总. 接下来推荐的这个是最新发表的GWAS数据汇总R包​.看了一下功能齐全,但是数据不是收录的很齐全​. 下面具体讲一下.​ 在R上安装 install.packages("remotes") remotes::install_github("ramiromagno/gwasrapidd") 查询是否有发表关于自身免疫性疾病的文章 library(gwasrapidd) my_studie

https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/10984983.html Linux 的R环境,可以通过anaconda jupyter notbook很容易的配置,见我之前的博客  https://www.cnblogs.com/shanyr/p/11276755.html 安装R包 Linux下安装R包一般有2种方式: 1. R CMD INSTALL 下载源码 R CMD INSTALL /.../mypackage.tar.gz 也可指定安装库路径: R CMD

前言 R对windows使用很友好,对Linux来说充满了敌意.小数据可以在windows下交互操作,效果很好很棒.可是当我们要处理大数据,或者要在集群上搭建pipeline时,不得不面对在Linux上装R及想要的R包这个难题,尤其是对非root用户而言更是艰难重重. 准备依赖库 依次安装:zlib/bzip/liblzma/pcre/curl,注意顺序和版本.目前3.4以上3.6以下R版本相对较为稳定和不过时,我自己安装的是3.5.2. cd zlib-1.2.11 ./configure -

转自 http://bnuzhutao.cn/archives/901 一般 R 语言的书籍上,介绍安装 R 包的方法都是这样的: install.packages("packagename"); 一般而言这不会成功,因为它默认会安装到系统目录下面,而普通用户在这个目录里并没有写入的权限. 因此,需要在 install.packages 这个函数里面指定安装的路径,例如想安装到 /home/myname/R 这个目录,就这么写: install.packages("packa

参考  设置环境变量R_LIBS将R包安装到自定义路径   实际上是可以解决问题的, #环境变量完成以后,启动(重启)R,运行 .libPaths() 加载R包时,发现路径仍然未变成自定义的. 那么参考  quantreg软件包加载失败.是要改路径么?新手求帮忙 开启R的时候用管理者身份打开[鼠标右键RStudio→以管理者身份运行],再运行,就会发现路径自定义成功. .libPaths()

MacOS 上安装 R 包 install.packages("data.table") 后面提示是否安装需要编译的版本: Do you want to install from sources the package which needs compilation?y/n 选择了 y 之后,报错 clang: error: unsupported option '-fopenmp' 网上找到的解决方法是: 安装 clang-omp brew install clang-omp 但是提

查询这个包是否已安装rpm -q 包名rpm -qa-q 查询-a all 查询已安装软件包和未安装软件包详细信息 rpm -qi 包名rpm -qip 包全名-i 查询软件信息-p package,查询未安装包信息 查询软件包安装位置 rpm -ql 包名-l 列表-p 查询未安装包信息 rpm -ql pth/usr/lib64/libpth.so.20/usr/lib64/libpth.so.20.0.27/usr/share/doc/pth-2.0.7/usr/share/doc/pth

安装R包("RcppArmadillo")失败,导致依赖该包的DESeq2 无法使用: 首先对gcc,g++升级至4.7, 但依然报错,还是安装不了RcppArmadillo: 报错如下: $ R > source("https://bioconductor.org/biocLite.R") > biocLite("DESeq2") BioC_mirror: https://bioconductor.org Using Biocond

R包的使用方法 包就是提供了种类繁多的函数,当然还有它的一些数据集,可以使用这些函数来操作这些数据集,来学习使用. library(),当前的工作环境里,可以使用的包 包的帮助文档:help(package="包名") help(package="car"),显示当前工作环境没有安装car包 安装 install.packages("car")  联网的话,会自动到网上找镜像,用户对找到的镜像进行选择,然后自动安装 安装完成后,help(pack

R 包 rgl 安装失败, X11 not found but required, configure aborted * installing *source* package ‘rgl’ ... ** package ‘rgl’ successfully unpacked and MD5 sums checked checking for gcc... gcc -std=gnu99 checking whether the C compiler works... yes checking f

R version: 3.5.3, 3.6.3 更新日期: 2020-9-10 大家测试后多提建议哈, 有问题我会持续更新的 在工作中,我们使用的服务器通常是不能联外网的,这在安装R包的时候产生了巨大的不便.网上有很多帖子使用tools::package_dependencies这个工具下载依赖,但是这个工具是有坑的,相信尝试过的同学依然会发现有些依赖包在下载时被漏掉了,查了很多帖子,这个问题一直没有很好的解决. 今天,我就来解决这个问题,一来,方便自己,二来,服务他人. 我们就用R自己来解决自

最近安装github上的R包,经常显示Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet, : 无法打开URL'https://api.github.com/repos/之类的错误.起初以为是网络的问题,换了网不行,登梯子不行,关闭重启也不行. 在网上查了下,说是R默认是通过IE浏览器来下载包的,所以需要设置IE的安全选项. but,我已经很多年没用过IE了(但很多政府官方网站的操作都是默认IE,而且是要

1,先将R包下载到本地 2,getwd() setwd("F:\\CNV\\Paper\\Case-control\\mHMM") 3, install.packages("mHMM_1.0.zip",repos=NULL) 4, library(mHMM)

列出已安装的包 pip freeze or pip list 导出requirements.txt pip freeze > <目录>/requirements.txt 安装包 在线安装 pip install <包名> 或 pip install -r requirements.txt 通过使用== >= <= > <来指定版本,不写则安装最新版 requirements.txt内容格式为: APScheduler==2.1.2 Django==1.