本文首发于“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 连锁不平衡图,用来可视化不同SNP之间的连锁程度,前同事间俗称“倒三角”图. 本文使用自己的数据,因为安装R包后使用内置数据集运行出结果较容易,但是自己的数据就可能会有一些不大不小的“坑”,我替你们趟了... 一 载入R包 数据 数据为内置CEUData保存后,进行了“细微”的处理(去掉SNP碱基之间的“/”),这种基因型文件很常见: library("LDheatmap

毕竟才是初入linux,很多工具,先要要求有个用着,之后再要求小巧强大好用. 看图软件,不喜欢kde或者是gnome这种庞大的桌面环境,也就不喜欢一些跟特定桌面环境沾边的软件(总觉得用软件必须要用特定的桌面环境似的,其实非也). 自从对kde的软件进行了全面的清理,突然就发现,竟然连图片都没法看了,眼泪................. 几番搜索,发现了一个叫 geeqie 的看图软件,挺小巧的,先用着,以后遇到更好的再换. 软件的官网是:http://geeqie.sourceforge.ne

在linux中给你的应用做压力测试 作者: 立地 邮箱: jarvin_g@126.com QQ: 511363759 一.webbench 1.在Ubuntu中安装webbench —支持get,head等请求,但不支持post请求 wget http://blog.zyan.cc/soft/linux/webbench/webbench-1.5.tar.gz tar zxvf webbench-1.5.tar.gz cd webbench-1.5 make && make instal

答:完成读写功能即可,不要涉及任何针对从设备的特殊操作,这样就可以避免与从设备的代码产生冗余,linux中的i2c控制器驱动就做的特别棒,做好最简单的读写,然后其它的从设备驱动就是直接调用这些最简单的api即可实现i2c控制器与从设备之间的通信.无论从设备的时序是怎样的,都可以调用最基础的i2c控制器读写接口来组合出各种需要的时序. 举例:rtc pcf2127从设备的驱动实现,主要是实现时钟的获取和设定 1. 时钟的设定,请看pcf2127的写时序 整理一下: send [start bit]

linux中,权限的学习是必不可少的,不论是作为一名运维工程师或者是单一的管理者,学习好linux中的权限控制,你就可以保护好自己的隐私同时规划好你所管理的一切. 权限的学习是很多的,不要认为自己已经把自己的隐私保护的很好,漏洞总是有的,侧面的攻击往往是难以防守的.所以大家跟我一起学习一下基础的权限控制,在后面也会有更多关于权限控制的知识点分享出来.谢谢各位的关注和支持!  开班第九天: 今天的课程大纲: linux系统中文件目录的基本权限控制 如何来修改默认的生成权限 三种特殊的权限(s,s,

首先谢谢 @小尧弟 这位朋友对我昨天夜里写的一篇<浅谈Linux中的信号处理机制(一)>的指正,之前的题目我用的“浅析”一词,给人一种要剖析内核的感觉.本人自知功力不够,尚且不能对着Linux内核源码评头论足.以后的路还很长,我还是一步一个脚印的慢慢走着吧,Linux内核这座山,我才刚刚抵达山脚下. 好了,言归正传,我接着昨天写下去.如有错误还请各位看官指正,先此谢过. 上篇末尾,我们看到了这样的现象:send进程总共发送了500次SIGINT信号给rcv进程,但是实际过程中rcv只接受/处理

linux中fork()函数详解         一.fork入门知识 一个进程,包括代码.数据和分配给进程的资源.fork()函数通过系统调用创建一个与原来进程几乎完全相同的进程,也就是两个进程可以做完全相同的事,但如果初始参数或者传入的变量不同,两个进程也可以做不同的事.     一个进程调用fork()函数后,系统先给新的进程分配资源,例如存储数据和代码的空间.然后把原来的进程的所有值都复制到新的新进程中,只有少数值与原来的进程的值不同.相当于克隆了一个自己. 我们来看一个例子: /* *

说到Linux中的软硬链接,就必须谈一下Linux的文件系统的组成的重要部分iNode和block. 首先是iNode,先用一张图了解一下iNode在Linux文件系统中的地位: Linux中的文件的文件名.文件属性和文件的数据是分开存储的.在文件系统初始化的时候,硬盘就被分成两个区域iNode区(iNode table)和数据区(block).文件名存放在目录项(dentry)中,文件的属性存放在iNode中,而文件的内容,即文件的实际数据存放在block中.目录文件是特殊的文件,这是因为目录

本文转载自: http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxODI5ODMwOA==&mid=2666538919&idx=1&sn=6013c451b5f14bf809aec77dd5df6cff&scene=21#wechat_redirect 上一篇<聊聊同步.异步.阻塞与非阻塞>已经通俗的讲解了,要理解同步.异步.阻塞与非阻塞重要的两个概念点了,没有看过的,建议先看这篇博文理解这两个概念点.在认知上,建立统一的模型.这样,大家在

Linux就这个范儿 第15章 七种武器  linux 同步IO: sync.fsync与fdatasync   Linux中的内存大页面huge page/large page  David Cutler  Linux读写内存数据的三种方式 台湾作家林清玄在接受记者采访的时候,如此评价自己30多年写作生涯:“第一个十年我才华横溢,‘贼光闪现’,令周边黯然失色:第二个十年,我终于‘宝光现形’,不再去抢风头,反而与身边的美丽相得益彰:进入第三个十年,繁华落尽见真醇,我进入了‘醇光初现’的阶段,真正

技术实现 本系列由两篇文章组成,介绍了当前用于 Linux 操作系统上的几种零拷贝技术,简单描述了各种零拷贝技术的实现,以及它们的特点和适用场景.第一部分主要介绍了一些零拷贝技术的相关背景知识,简要概述了 Linux 为什么需要零拷贝技术以及 Linux 中都有哪几种零拷贝技术.本文是本系列文章的第二部分,针对第一部分内容中提到的几种零拷贝技术分别进行更详细的介绍,并对这些零拷贝技术的优缺点进行分析. 0 评论: 黄 晓晨, 软件工程师, IBM 冯 瑞, 软件工程师, IBM 2011 年 1

概述 本系列由两篇文章组成,介绍了当前用于 Linux 操作系统上的几种零拷贝技术,简单描述了各种零拷贝技术的实现,以及它们的特点和适用场景.本文是本系列文章的第一部分,主要是介绍一些零拷贝技术的相关背景知识,简要概述了 Linux 为什么需要零拷贝技术以及 Linux 中都有哪几种零拷贝技术. 1 评论: 黄 晓晨, 软件工程师, IBM 冯 瑞, 软件工程师, IBM 2011 年 1 月 27 日 内容 在 IBM Bluemix 云平台上开发并部署您的下一个应用. 现在就开始免费试用 引

Linux中的文件描述符与打开文件之间的关系 导读 内核(kernel)利用文件描述符(file descriptor)来访问文件.文件描述符是非负整数.打开现存文件或新建文件时,内核会返回一个文件描述符.读写文件也需要使用文件描述符来指定待读写的文件. 1. 概述 在Linux系统中一切皆可以看成是文件,文件又可分为:普通文件.目录文件.链接文件和设备文件.文件描述符(file descriptor)是内核为了高效管理已被打开的文件所创建的索引,其是一个非负整数(通常是小整数),用于指代被打开

Linux的磁盘管理 (很重要请注意高能预警) 硬盘:几个盘片,双面,磁性颗粒, 处理速率不同步:借助于一个中间层 文件系统(FileSystem)     可以实现对磁盘行的文件进行读写     文件系统其实就是一个特殊软件,是直接安装到硬盘上的 硬盘分类     机械硬盘:         盘片组,磁头,磁头臂         马达.空气过滤片     固态硬盘         类似与内存的结构 机械硬盘简介     磁道(Track):磁盘旋转时候的同心圆,磁道编号从外向内,从0开始编号.

原文网址:http://blog.chinaunix.net/uid-20583479-id-1920134.html 工作队列一般用来做滞后的工作,比如在中断里面要做很多事,但是比较耗时,这时就可以把耗时的工作放到工作队列.说白了就是系统延时调度的一个自定义函数. 工作队列是实现延迟的新机制,从 2.5 版本 Linux 内核开始提供该功能.不同于微线程一步到位的延迟方法,工作队列采用通用的延迟机制, 工作队列的处理程序函数能够休眠(这在微线程模式下无法实现). 工作队列可以有比微线程更高的时

欢迎大家前往腾讯云+社区,获取更多腾讯海量技术实践干货哦~. 作者:赵坤|腾讯魔王工作室后台开发工程师 在项目开发中,经常会遇到程序启动时间过长.CPU使用率过高等问题,这个时候需要依靠性能分析工具来定位性能的消耗点.本文介绍三个常用的工具的入门级使用及图形化方法,供大家参考. 本文介绍Perf.gprof和Valgrind三个性能分析工具,及其分析结果图形化的方法,旨在让大家更快的上手使用工具.出于篇幅的限制,本文不会对每种工具的使用参数及结果分析做详细的介绍,只做入门级的使用说明,更多详细的

点击打开链接 上一篇中,我们追踪了probe函数在何时调用,知道了满足什么条件会调用probe函数,但probe函数中传递的参数我们并不知道在何时定义,到底是谁定义的,反正不是我们在驱动中定义的(当然,驱动中也不会定义设备的详细信息),但也不是在我们设备信息定义时的结构体.这就相当于武林绝学中只打通了任脉,而督脉还没打通,要想成为武林高手还差一步,本文就致力于打通我们设备驱动probe函数的任督二脉,做到正向逆向全顺畅,当任督二脉全都打通后,...,就可以独步武林.指点江山啦,再然后按照武林高手

特别说明:要在我的随笔后写评论的小伙伴们请注意了,我的博客开启了 MathJax 数学公式支持,MathJax 使用$标记数学公式的开始和结束.如果某条评论中出现了两个$,MathJax 会将两个$之间的内容按照数学公式进行排版,从而导致评论区格式混乱.如果大家的评论中用到了$,但是又不是为了使用数学公式,就请使用\$转义一下,谢谢. 想从头阅读该系列吗?下面是传送门: Linux 桌面玩家指南:01. 玩转 Linux 系统的方法论 Linux 桌面玩家指南:02. 以最简洁的方式打造实用的

转自:http://www.lupaworld.com/?uid-296380-action-viewspace-itemid-118973 vi/vim 基本使用方法本文介绍了vi (vim)的基本使用方法,但对于普通用户来说基本上够了!i/vim的区别简单点来说,它们都是多模式编辑器,不同的是vim 是vi的升级版本,它不仅兼容vi的所有指令,而且还有一些新的特性在里面.例如语法加亮,可视化操作不仅可以在终端运行,也可以运行于x window. mac os. windows. vi编辑器是

原文:https://mp.weixin.qq.com/s?src=11&timestamp=1533697106&ver=1047&signature=poqrJFfcNABv4biKKpa4mZdIW7No2Wo1F5sbZL7ggoVS2GqcSqwQQ8hMulAmezT*zL*klB-eE5BeMyNuyjuIH7YgkBAN25i6*ahhEpWyxqx6vPct-Vr7q7AU0YGe-F*l&new=1 http://blog.scoutapp.com/ar

转自:https://blog.csdn.net/suifengpiao_2011/article/details/47260085 linux中定义对齐字节 typedef struct  sdk_handler { char comm_ver[10];  char name[20]; char reserve[20]; }PACKED  sdk_handler_t; #define PACKED //__attribute__((aligned(1),packed))  // 一字节对齐 首