前言 这是代谢组学数据分析的一个R包,包括用于代谢组学数据分析.可视化和功能注释等众多功能.最近有同事在集群中搭建蛋白和代谢流程,安装这个包出现了问题,于是我折腾了一上午. 这个包的介绍在:https://github.com/xia-lab/MetaboAnalystR,安装确实还比较复杂,依赖的东西太多太多.废话不多说,记录下安装历程. 安装过程 首先最好是已经安装了自己的R版本(非root),比如我的是R-3.5.2.然后进入R中,依照文档给的顺序依次安装: 第一步:安装依赖包 insta

转载来源:http://genek.tv/article/40 1186 0 0 安装 r 里的 igraph 报错: foreign-graphml.c: In function ‘igraph_write_graph_graphml’: foreign-graphml.c:1408:46: error: expected ‘)’ before ‘GRAPHML_NAMESPACE_URI’ ret=fprintf(outstream, "<graphml xmlns=\"&q

同时安装Python2与Python3,安装第三方包,老是报错提示Fatal error in launcher: Unable to create process using '"',那可能是环境变量有冲突了. 解决办法: 是在环境变量Path中上下移调整两个"PythonX/Scripts"位置,使之位于前两位(哪个版本常用就靠前): 是使用另一种命令python3 -m pip install requests来安装.

MacOS 上安装 R 包 install.packages("data.table") 后面提示是否安装需要编译的版本: Do you want to install from sources the package which needs compilation?y/n 选择了 y 之后,报错 clang: error: unsupported option '-fopenmp' 网上找到的解决方法是: 安装 clang-omp brew install clang-omp 但是提

R 包 rgl 安装失败, X11 not found but required, configure aborted * installing *source* package ‘rgl’ ... ** package ‘rgl’ successfully unpacked and MD5 sums checked checking for gcc... gcc -std=gnu99 checking whether the C compiler works... yes checking f

linux上安装完torch后仍报错: Traceback (most recent call last): File , in <module> import torch ImportError: No module named torch 是因为还要进行环境配置: 首先进入: vim ~/.bashrc 添加下面的语句: . /home/yourdirectory/torch/install/bin/torch-activate # added by Anaconda3 installer

https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/10984983.html Linux 的R环境,可以通过anaconda jupyter notbook很容易的配置,见我之前的博客  https://www.cnblogs.com/shanyr/p/11276755.html 安装R包 Linux下安装R包一般有2种方式: 1. R CMD INSTALL 下载源码 R CMD INSTALL /.../mypackage.tar.gz 也可指定安装库路径: R CMD

安装R包("RcppArmadillo")失败,导致依赖该包的DESeq2 无法使用: 首先对gcc,g++升级至4.7, 但依然报错,还是安装不了RcppArmadillo: 报错如下: $ R > source("https://bioconductor.org/biocLite.R") > biocLite("DESeq2") BioC_mirror: https://bioconductor.org Using Biocond

R version: 3.5.3, 3.6.3 更新日期: 2020-9-10 大家测试后多提建议哈, 有问题我会持续更新的 在工作中,我们使用的服务器通常是不能联外网的,这在安装R包的时候产生了巨大的不便.网上有很多帖子使用tools::package_dependencies这个工具下载依赖,但是这个工具是有坑的,相信尝试过的同学依然会发现有些依赖包在下载时被漏掉了,查了很多帖子,这个问题一直没有很好的解决. 今天,我就来解决这个问题,一来,方便自己,二来,服务他人. 我们就用R自己来解决自

1.综述 越来越多的R包正在由世界上不同的人所创建,其中一部分原因是devtools包使得开发R包1变得更加简单.devtools包不仅让开发R包变得简单,而且用于分发R包. 当开发者发布一个R包的时候,CRAN2一般是最常用的.使用install.packages()函数可以安装发布在CRAN上的R包.例如,如下方法可以安装dplyr包: install.packages('dplyr') devtools包的install_github()函数用于从Github上安装R包. library(

Xamarin开发安装Visual Studio 2015 update2报错的解决办法错误信息:update 2 requires a member of the visual studio 2015 family当在没有安装VS 2015的电脑上安装update 2包,就会出现这个错误.所以,安装的时候需要识别VS的安装文件.VS 2015的安装文件大约5GB,VS 2015 with update 2的安装文件是7GB.

使用yum安装应用程序时候,报错:[Errno 14] PYCURL ERROR 7 - "Failed to connect to 2001:da8:8000:6023::230: 网络不可达" 1.系统环境 物理机:Windows 7(32位)旗舰版 虚拟机:CentOS 6.5 2.问题描述 从安装好系统之后,用yum源安装软件,一直可以用,今天突然就报了如下的错误,yum也无法使用了: Loaded plugins: fastestmirror Loading mirror s

转自 http://bnuzhutao.cn/archives/901 一般 R 语言的书籍上,介绍安装 R 包的方法都是这样的: install.packages("packagename"); 一般而言这不会成功,因为它默认会安装到系统目录下面,而普通用户在这个目录里并没有写入的权限. 因此,需要在 install.packages 这个函数里面指定安装的路径,例如想安装到 /home/myname/R 这个目录,就这么写: install.packages("packa

Mac安装HomeBridge适配小米Homekit报错:module未找到 具体错误是: module.js:471 throw err; balabalal...... 问了一圈,终于解决,但是又有新的问题,真是头疼.微信交流:Jeff520888

在CentOS上安装node.js的时候报错:No acceptable C compiler found! 原因:没有c编译器. 解决办法:安装GCC 命令如下: #yum install gcc Is this ok [y/N]: y Complete! 安装完成后

在 Windows 10 上安装 3D Stuido Max 2016 报错,无法正常安装,查看日志是 VC 运行时安装错误,经过分析发现在 Windows 10 上已经有这些运行时并且版本比安装包中自带的还要高,所以安装总是失败,分析安装程序配套的 setup.ini 文件,发现里面有运行时安装的配置信息,并且可以忽略错误,因此修改 setup.ini 文件,然后就可以顺利进行安装了,修改后的 setup.ini 文件如所示 #============= VCREDIST Begin ====

简单记录一下,Windows Server 2012 R2 安装.NET Framework 3.5报错,下面是解决方法 载入ISO文件Windows Server 2012 R2,而且在安装的过程中,指定到D:\sources\sxs作为备用路径.再安装,就能够了. 由於之前安装的老版本号没有全然清除,问题在注冊表,HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFWARE\wd=Microsoft&tn=44039180_cpr&fenlei=mv6quAkxTZn0IZRqIHckPjm4

R包的安装 1)使用 Rstudio 手动安装 Rstudio的窗口默认为四个,在右下角的窗口的 packages 下会显示所有安装的 R 包 点击 Install -> 输入R 包名 -> 点击 Install 2)使用命令安装 install.packages("R包名") R包的卸载 remove.packages("R包名") R包的加载 library("R包名") R包的移除 detach("package:R包

在安装intervention/image图像处理扩展 报错fileinfo is missing 报错信息如下: \blog>composer require intervention/imageUsing version ^2.3 for intervention/image./composer.json has been updatedLoading composer repositories with package informationUpdating dependencies (i

使用npm install安装项目依赖的时候报错: npm ERR! code ELIFECYCLE npm ERR! errno 1 npm ERR! node-sass@4.14.1 postinstall: `node scripts/build.js` npm ERR! Exit status 1 npm ERR! npm ERR! Failed at the node-sass@4.14.1 postinstall script. npm ERR! This is probably n

安装 RPM 包或者安装源码包 在windows下安装一个软件很轻松,只要双击.exe的文件,安装提示连续“下一步”即可,然而linux系统下安装一个软件似乎并不那么轻松了,因为我们不是在图形界面下.所以你要学会如何在linux下安装一个软件. 在前面的内容中多次提到的yum,这个yum是Redhat所特有的安装RPM程序包的工具,使用起来相当方便.因为使用RPM安装某一个程序包有可能会因为该程序包依赖另一个程序包而无法安装.而使用yum工具就可以连同依赖的程序包一起安装.当然CentOS同样可