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m6a修饰的功能怎样预测
2024-10-20
m6A甲基化及预测方法工具总结
DNA.RNA和蛋白三个层面的可逆修饰示意图(Fu et al. Nature Reviews Genetics, 2014) DNA和蛋白存在各种修饰,RNA也不例外,目前已知的RNA修饰已经超过上百种.RNA根据编码性可分为编码RNA(protein-coding RNA)和非编码RNA(noncoding RNA)两大类,这些RNA转录后会发生各种修饰,包括N6-腺苷酸甲基化(N6-methyladenosine,m6A).胞嘧啶羟基化(m5C).N1-腺苷酸甲基化(m1A)等等.m6A甲
解读人:林山云,Proteomic Identification of Protein Glutathionylation in Cardiomyocytes(心肌细胞蛋白质谷胱甘肽修饰的蛋白质组鉴定)
发表时间:(2019年4月) IF:3.950 单位:韦恩州立大学化学系 物种:小鼠心肌细胞 技术:谷胱甘肽修饰蛋白组学 一. 概述: 本研究采用化学选择性蛋白组学方法,鉴定出过氧化物诱导HL-1小鼠心肌细胞后的含有半胱氨酸特异位点谷胱甘肽修饰多肽1763个,经过生信分析发现125个与心肌疾病相关的谷胱甘肽修饰蛋白,这些被修饰蛋白包括肌节结构和收缩蛋白.分子伴侣.信号及调节蛋白.并进一步通过对修饰位点的结构分析,预测蛋白质谷胱甘肽修饰对功能的作用.本研究建立了一个选择性直接鉴定谷胱甘肽修饰蛋白质
预测氨基酸替换的致病性及分子机制:MutPred工具的使用
MutPred的功能是预测氨基酸替换后的致病性及其分子机制,旧版本见链接:http://mutpred1.mutdb.org/ 新版本更新为MutPred2,见网站链接:http://mutpred2.mutdb.org/index.html,如下图所示,点击predict here 操作步骤见下图: 输入邮件地址.输入想要查询的蛋白质序列.最后submit等结果. 重点讲中间输入的蛋白质序列怎么来的: 首先,进入网站https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/ 假
iOS 代理为啥要用weak修饰?
在开发中我们经常使用代理,或自己写个代理,而代理属性都用weak(assign)修饰,看过有些开发者用strong(retain),但并没发现有何不妥,也不清楚weak(assign)与strong(retain)修饰有何区别 功能实现就行了,考虑这么多干嘛~~~我只能哈哈哈 weak:指明该对象并不负责保持delegate这个对象,delegate这个对象的销毁由外部控制 @property (nonatomic, weak) id<HSDogDelegate>delegate; stron
Python 详解修饰器 附带 js使用修饰器
修饰器 功能 修饰器的主要功能是,在不改变已有代码的情况下,为某一个类,方法等扩展功能 首先看这样一段代码 def foo(): for i in range(10): print(i) foo() 添加需求 打印日志 现在需要在不改变这段代码前提下,计算出这段代码的运行时间日志 import time def log(fun): print('开始时间:{}'.format(time.time())) fun() print('结束时间:{}'.format(time.time())) def
PCE | 华中农大郭亮团队蛋白质组学揭示油菜内源氧化还原修饰介导盐胁迫响应
蛋白质翻译后修饰(PTM)在控制植物生长发育以及逆境适应方面发挥着重要的作用.发生在半胱氨酸巯基的亚磺酰化修饰(R-SOH)是一种可逆的氧化修饰类型,可以通过与其他修饰形态形成二硫键的形式来保护蛋白不被氧化损伤,是调控蛋白功能.代谢通路以及激素信号的重要方式.蛋白的氧化还原修饰被认为是ROS信号在细胞内和细胞间传递的重要途径. 2021年8月4日,华中农业大学油菜团队郭亮课题组在国际知名期刊Plant, Cell & Environment (IF=7.228)上发表了题为 "Prot
Effective HPA:预测未来的弹性伸缩产品
作者 胡启明,腾讯云专家工程师,专注 Kubernetes.降本增效等云原生领域,Crane 核心开发工程师,现负责成本优化开源项目 Crane 开源治理和弹性能力落地工作. 余宇飞,腾讯云专家工程师,专注云原生可观测性.成本优化等领域,Crane 核心开发者,现负责 Crane 资源预测.推荐落地.运营平台建设等相关工作. 田奇,腾讯高级工程师,专注分布式资源管理和调度,弹性,混部,Kubernetes Contributor,现负责 Crane 相关研发工作. 引言 业务的稳定性和成本之间的
NLP之TextRNN(预测下一个单词)
TextRNN @ 目录 TextRNN 1.基本概念 1.1 RNN和CNN的区别 1.2 RNN的几种结构 1.3 多对多的RNN 1.4 RNN的多对多结构 1.5 RNN的多对一结构 1.6 RNN的缺点 2.实验 2.1 实验步骤 2.2 算法模型 1.基本概念 1.1 RNN和CNN的区别 并非刚性地记忆所有固定⻓度的序列,⽽是通过隐藏状态来存储之前时间步的信息 1.2 RNN的几种结构 一对一,一对多,多对一,多对多(长度相等/不等) 多个输入时,由a和x生成y和下一个a, 这一过
Linux内核源码特殊用法
崇拜并且转载的: http://ilinuxkernel.com/files/5/Linux_Kernel_Source_Code.htm Linux内核源码特殊用法 1 前言 Linux内核源码主要以C语言为主,有一小部分涉及汇编语言,编译器使用的是Gcc.初次看内核源码,会遇到一些难以理解.晦涩的代码:而恰恰是这些晦涩的代码,在内核源码中经常出现.把一些晦涩.常见的代码看懂后,大家会发现看内核代码越来越顺利. 本文以x86_64架构中的Linux 2.6.32-71.el6(RHEL 6)源
mplayer - Linux下的电影播放器
概要 mplayer [选项] [ 文件 | URL | 播放列表 | - ] mplayer [全局选项] 文件1 [特定选项] [文件2] [特定选项] mplayer [全局选项] {一组文件和选项} [针对该组的特定选项] mplayer [dvd|vcd|cdda|cddb|tv]://title [选项] mplayer [mms[t]|http|http_proxy|rt[s]p]:// [用户名:密码@]URL[:端口] [选项] mencoder [选项] [ 文件 | URL
.Net多线程编程—预备知识
1 基本概念 共享内存的多核架构:一个单独的封装包内封装了多个互相连接的未处理器,且所有内核都可以访问主内存.共享内存的多核系统的一些微架构,例如内核暂停功能,超频. 内核暂停功能:当使用内核不多的时候,操作系统会使剩下的内核进入休眠状态,当需要使用这些内核时,操作系统会唤醒这些睡眠的内核. 超频:提升一个内核频率的过程.当内核工作繁重时,使内核以更高的频率工作. 分布式内存系统:由多个处理器(CPU)组成,每个处理器可以位于不同的计算机上,计算机之间可以有不同类型的通信信道,并且都有自己私有的
设计模式之结构类模式大PK
结构类模式大PK 结构类模式包括适配器模式.桥梁模式.组合模式.装饰模式.门面模式.享元模式和代理模式.之所以称其为结构类模式,是因为他们都是通过组合类或对象产生更大结构以适应更高成层次的逻辑需求.我们来分析一下装饰模式和代理模式.装饰模式和适配器模式. 装饰模式VS代理模式 首先要说明的是装饰模式是代理模式的特殊应用,两者的共同点是有相同的接口,不同点事代理模式着重对代理过程的控制,而装饰模式则是对类的功能进行加强或减弱,着重
java必备基础知识点
Java基础 1. 简述Java的基本历史 java起源于SUN公司的一个GREEN的项目,其原先目的是:为家用消费电子产品发送一个信息的分布式代码系统,通过发送信息控制电视机.冰箱等 2. 简单写出Java特点,写出5个以上,越多越好 简单的.面向对象的.分布式的.安全的.稳定的.与平台无关的.可解释的.多线的.动态的语言. 3. 什么是Java? JAVA:一种编程语言 一种开发环境 一种应用环境 一种部署环境 4. 请写出Java的版本分类,以及每种版本的应用方向 三种版本: JME:是面
kegg-kass注释--转载
在注释KEGG的时候,一直用到kaas,具体kaas是个什么东东,简单的总结一下吧. KEGG是由日本人搞的一个代谢图,收录基因和基因组的数据库,数据库可以分为 3大部分,基因数据库, 化学分子物质数据库,以及基于基因和化学分子物质相互关系而建立起来的代谢路径数据库,在KEGG数据库中,有一个"专有名词"KO(KEGG Orthology),它是蛋白质(酶)的一个分类体系,序列高度相似,并且在同一条通路上有相似功能的蛋白质被归为一组,然后打上KO(或K标签,KEGG ortho
第27章 结构型模式大PK
27.1 代理模式 VS 装饰模式 27.1.1 代理模式 (1)场景:客人找运动员代理要求安排运动员参加比赛 (2)说明:代理人有控制权,可以拒绝客人的要求,也可以答应安排,甚至自己下去跑(因为有些运动员本身就作自己的代理) [编程实验]找代理安排运动员比赛 //结构型模式大PK——代理模式和装饰模式 //实例:找代理安排运动员比赛 #include <iostream> #include <ctime> using namespace std; //抽象运动员 class IR
Auty自动化测试框架第三篇——添加异常处理与日志收集
[本文出自天外归云的博客园] 本次对框架进行完善,增加了日志收集功能和修饰运行功能,完善后的lib目录如下:
《疯狂Java:突破程序员基本功的16课》读书笔记-第二章 对象与内存控制
Java内存管理分为两个方面:内存分配和内存回收.这里的内存分配特指创建Java对象时JVM为该对象在堆内存中所分配的内存空间.内存回收指的是当该Java对象失去引用,变成垃圾时,JVM的垃圾回收机制自动清理该对象,并回收该对象所占用的内存.由于JVM内置了垃圾回收机制回收失去引用的Java对象所占用的内存,所以很多Java开发者认为Java不存在内存泄漏,资源泄漏的问题.实际上这是一种错觉,Java程序依然会有内存泄漏. 由于JVM的垃圾回收机制由一条后台线程完成,本身也是非常消耗性能的,因此
TP学习笔记
ThinkPHP采用单一入口模式访问应用,对应用的所有请求都定向到应用的入口文件,系统会从URL参数中解析当前请求的模块.控制器和操作,下面是一个标准的URL访问格式: http://serverName/index.php/模块/控制器/操作 如果我们直接访问入口文件的话,由于URL中没有模块.控制器和操作,因此系统会访问默认模块(Home)下面的默认控制器(Index)的默认操作(index),因此下面的访问是等效的: http://serverName/index.phphttp://se
华为C语言编程规范
DKBA华为技术有限公司内部技术规范DKBA 2826-2011.5C语言编程规范2011年5月9日发布 2011年5月9日实施华为技术有限公司Huawei Technologies Co., Ltd.版权所有 侵权必究All rights reserved密级:confidentiality levelDKBA 2826-2011.52011-06-02 华为机密,未经许可不得扩散 Huawei Confidential 第2页,共61页Page 2 , Total61修订声明Revision
iOS7适配之设计篇
(注:文章简要翻译自 Apple <iOS 7 UI Transition Guide>,由于该文档为开发者预览版,并非最终文档,所以 iOS7 正式上线可能有部分不同) 准备工作 iOS7 带来了很多界面上的改变,如:没有边框(圆角)的按钮,半透明的工具条(UINavigationBar, UIToolBar 等),视图控制器的全屏布局等.使用 Xcode5,你就可以创建 iOS7 工程,并在 iOS7 模拟器中看看 iOS7 的界面. UIStyle 从 iOS7 系统应用的改变可以看出,
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