今天的内容讲讲单细胞文章中经常出现的展示细胞marker的图:tsne/umap图.热图.堆叠小提琴图.气泡图,每个图我都会用两种方法绘制. 使用的数据来自文献:Single-cell transcriptomics reveals regulators underlying immune cell diversity and immune subtypes associated with prognosis in nasopharyngeal carcinoma. 去年7月发表在Cell Re

在上一篇中,我已经讲解了展示marker基因的前两种图形,分别是tsne/umap图.热图,感兴趣的读者可以回顾一下.这一节我们继续学习堆叠小提琴图和气泡图. 3. 堆叠小提琴图展示marker基因 相比于其他可视化形式,小提琴图可以更直观地展示某一类亚群的某一个基因的表达分布情况.我的marker基因一共选了12个,下面来画图: Seurat内置的VlnPlot函数可以直接画, library(xlsx) markerdf2=read.xlsx("ref_marker2.xlsx",

写在前面 最近有道作业题需要将机器人的历史路径显示出来,但是网上很多相关的教程都是搬运了官网的链接,并没有详细的操作流程...因此我又花费了很多时间去ros官网上学习marker的用法,学习怎么写publisher和subscriber,最终成功将路径显示了出来.这篇文章是对这个过程的详细的介绍,原理和代码实践部分会分开,因此如果你赶时间只要一个结果的话,把详细的讲解跳过即可.不过我还是推荐看完,毕竟我花了这么多精力来写知其然也要知其所以然. (我是ROS新手,从作业这一点也应该看出来了XD,有

这次和大家分享的是自己写的一个table常用几种展示格式的js插件取名为(table-shenniu),样式使用的是bootstrap.min.css,还需要引用jquery.min.js包,这个插件由来的目的是项目中需要一个table格式的提交数据的页面,功能有合并单元格,只能提交选中行数据,全选功能,和一个下拉选功能:这几种功能感觉朋友们肯定都会遇到,所以干脆封装一个插件,发布出来说不定能帮到有些朋友快速完成任务哈哈,当然最主要的还是希望朋友们能相互交流里面的代码,逻辑,谢谢:中秋节就要到了

一.前沿 数据挖掘就是从大量的.不完全的.有噪声的.模糊的.随机的数据中,提取隐含在其中的.人们事先不知道的但又是潜在有用的信息和知识的过程.数据挖掘的任务是从数据集中发现模式,可以发现的模式有很多种,按功能可以分为两大类:预测性(Predictive)模式和描述性(Descriptive)模式.在应用中往往根据模式的实际作用细分为以下几种:分类,估值,预测,相关性分析,序列,时间序列,描述和可视化等. 数据挖掘涉及的学科领域和技术很多,有多种分类法.根据挖掘任务分,可分为分类或预测模型发现.数

一.前 沿 数据挖掘就是从大量的.不完全的.有噪声的.模糊的.随机的数据中,提取隐含在其中的.人们事先不知道的但又是潜在有用的信息和知识的过程.数据挖掘的任务是从数据集中发现模式,可以发现的模式有很多种,按功能可以分为两大类:预测性(Predictive)模式和描述性(Descriptive)模式.在应用中往往根据模式的实际作用细分为以下几种:分类,估值,预测,相关性分析,序列,时间序列,描述和可视化等. 数据挖掘涉及的学科领域和技术很多,有多种分类法.根据挖掘任务分,可分为分类或预测模型发现.

直接贴代码吧 Ext.define("build.controller.MainController",{ extend:"Ext.app.Controller", config:{ refs:{ mainDataview:"main dataview", createAdd:"createAdd" }, control:{ "mainDataview":{ itemtap:function(data,in

最近在做一个跟微博相关的应用.其中涉及到了对微博中@.##以及URL链接的解析与展示.分享一下个人处理的方式,希望对需要的人有所帮助. 最终的展现效果: 首先,第一步是你得从纯文本中找到它们.毫无疑问,采用正则表达式匹配是最佳的方式.我采用的是RegexKitLite库. 解析这三种格式的正则表达式如下: /*****************************regular expressions**************************/ #define ALABEL_EXPR

题目描述 上了大学之后,小W和小Z一起报了一门三宝课,在实践课上遇到了一些问题. 一条染色体上有nn对基因,每种基因都可以用一个数ai来表示,作为标号. 现在,在其中一条染色单体上某基因发生了突变. 此时染色体上有n−1对相同的基因和一对不同的基因. 他们通过某种方法获得了这条染色体上的全部基因. 现在他们想知道发生突变的基因的标号是什么. 输入 第一行一个数n 第二行2×n个数表示. 输出 两个数,代表发生突变的基因的标号. 样例输入 5 1 2 3 4 7 8 4 3 2 1 样例输出 7

查看结果树查看响应有哪几种方法,可通过左侧面板底部的下拉框选择 1.Text 查看结果树中请求的默认格式为text,会显示请求的取样器结果.请求.响应数据3个部分内容. 取样器结果: 默认Raw视图,可以切换为Parsed视图,表单显示更直观. 请求:默认Raw视图下,Restquest Body 及Restquest Headers两部分.HTTP显示更直观.输入信息查找,还可以设置区分大小写.正则表达式. 响应数据: 显示Response Body 及Response Headers两部分内

查看结果树查看响应有哪几种方法,可通过左侧面板底部的下拉框选择 1 Text 查看结果树中请求的默认格式为Text,显示取样器结果.请求.响应数据3个部分内容. 取样器结果: 默认Raw展示,可以切换为Parsed视图,表单展示更直观.   请求:默认Raw展示,包括Restquest Body 及Restquest Headers两部分. HTTP视图展示更直观.还可输入信息查找,并可以设置区分大小写.正则表达式. 响应数据: 显示Response Body 及Response Headers

前言 近年来,无人机的发展越发迅速,既可民用于航拍,又可军用于侦察,涉及行业广泛,也被称为“会飞的照相机”.但作为军事使用,无人机的各项性能要求更加严格.重要.本系统则是通过 Hightopo 的  HT for Web  产品来搭建的一款 无人机 3D 可视化系统,通过对无人机及其信息的全景展示来模拟无人机状态的监控. 系统中包含 4 种展示模式:实体模式 .热力模式.线框模式和内部模式,通过飞机下方操作按钮即可进行模式切换. 预览地址:http://www.hightopo.com/demo

前言 近年来,无人机的发展越发迅速,既可民用于航拍,又可军用于侦察,涉及行业广泛,也被称为“会飞的照相机”.但作为军事使用,无人机的各项性能要求更加严格.重要.本系统则是通过 Hightopo 的  HT for Web  产品来搭建的一款 无人机 3D 可视化系统,通过对无人机及其信息的全景展示来模拟无人机状态的监控. 系统中包含 4 种展示模式:实体模式 .热力模式.线框模式和内部模式,通过飞机下方操作按钮即可进行模式切换. 预览地址:http://www.hightopo.com/demo

下午花了两个小时回答读者的疑问,觉得可以记录下来,也许能帮到一部分人. 第一位读者做的是非模式物种的单细胞. 一开始以为是想问我非模式物种的marker基因在哪儿找,读者朋友也提到了blast 研究的主要细胞类型的marker是有的 让读者朋友困惑的是一张表,cluster乘样本的表,每一个值表示表达这个marker基因的细胞数目.这个表其实没有多少信息,且容易给人误导.应该直接从小提琴图看. 解答完了这个问题,另一个问题还是回到"非模式物种如何找marker".找同源基因是一个思路,

本文来源:http://blog.csdn.net/mengdong_zy/article/details/8980842 文章作者真是个好人啊!!!!!!!! 原文如下: Symbols Symbol level drawing Join and merge Marker symbols Line symbols Fill symbols Text symbols Chart symbols   本文由本人翻译ESRI官方帮助文档.尊重劳动成果,转载请注明来源. Symbols ArcObje

原文:[百度地图API]如何制作班级地理通讯录?LBS通讯录 摘要:班级通讯录必备的功能,比如人员列表,人员地理位置标注,展示复杂信息窗口,公交和驾车等.一般班级人员都不会超过300个,因为可以高效地把全部人员的地理位置都显示在地图上. --------------------------------------------------------------------------- 预备知识1.为啥marker数量不能超过300个? 答:由于浏览器能支持的dom元素有限,所以建议不超过该数量

  image Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) is a computational method that determines whether an a priori defined set of genes shows statistically significant, concordant differences between two biological states (e.g. phenotypes). 用GSEA做富集分析是非常简单的,结

1>压缩文件格式:使用.zip格式较好 2>charset(字符集)  国内最新字符集格式为:gb18030   国际上通用的字符集是:UTF-8 3>添加图片 <img src=”path” alt=”text” title=”text” width=”x” height=”y”/> 4>path路径: 绝对路径:指文件在硬盘上真是存在的路径. eg: <body backround="E:\book\网页布局\代码\第2章\bg.jpg"

使用limma.Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, Luyi Tian1, Gordon K. Smyth4 and Matthew E. Ritchie5 1The Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research, 1G Royal Parade, Parkville, VIC 3052, Melbo

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