主流的motif数据库 JASPAR dbcorrdb - SCENIC使用的 TRANSFAC® 7.0 Public 2005 and TRANSCompel 7.0 Public 2005 - 现在最新版要收费了 motif格式问题 我关注的这个motif (ENCSR000ARI) 是Ezh2的,并没有被收录在常规的TF数据库里,所以Homer里面没有. dbcorrdb这个数据库里有,但是很老的JASPAR格式,可以转成meme格式.[dbcorrdb__EZH2__ENCSR000A

Finding Enriched Motifs in Genomic Regions (findMotifsGenome.pl) 在指定区域做motif enrichment,大大降低了假阳性. MEME也可以做,但是设定更加复杂. 转录因子的表达具有高度的组织特异性,而且已知的TF只有1000多个,基因有30000多个,所以一个TF的靶基因可能有几百个,而且具有高度的时空组织特异性. 实验的方法就不说了,可靠.成本高.耗费劳力. 以下只说高通量数据的预测方法. 最简单的预测就是基于基因表达,c

编辑人员注释:本文章由 Windows Azure 网站团队项目经理 Erez Benari 撰写. 我们的网站 http://www.windowsazure.com 包含大量信息,并且也在不断添加和更新内容,但您可能有时会想寻找其他形式的信息.例如,如果您经常乘坐飞机或由于其他原因无法保持在线,通过书籍获取信息可能更便捷.而在其他情况下,您会觉得想要寻找比文章更具交互性的信息来源.今天我们将探讨为您提供的部分 Azure 资源. 许多人的首选信息来源是博客,比如您现在所阅读的就是一篇博客文章

UVA 10465 Homer Simpson(全然背包: 二维目标条件) http://uva.onlinejudge.org/index.php? option=com_onlinejudge&Itemid=8&page=show_problem&problem=1406 题意: 有两种汉堡包(汉堡数量无限多),第一种吃一个须要花n分钟,另外一种吃一个须要花m分钟. 如今你有t分钟的时间, 问你最少浪费几分钟不能吃汉堡(你每次要么完整的吃完一个汉堡,要么不吃). 当吃汉堡花费的

概述 HOMER是一款100%开源的针对SIP/VOIP/RTC的抓包工具和监控工具. HOMER是一款强大的.运营商级.可扩展的数据包和事件捕获系统,是基于HEP/EEP协议的VoIP/RTC监控应用程序,并可以使用即时搜索.处理和存储大量的信令.RTC事件.日志和统计信息. 之前的文章中,我们介绍过一款针对SIP的抓包工具sngrep,相比来说,HOMER有更加成熟完善的架构和体系,包括后台的数据库存储和前台的web页面展示数据. 在我们的生产环境中,一直有使用HOMER来作为呼叫信令的收集

其实并不能找到好的词语来形容过去的一年,感觉就如此平淡的过了!没有了毕业的稚气,看事情淡了,少了一丝浮躁,多了一分认真.2016也许就是那句话-多读书,多看报,少吃零食多睡觉,而我更愿意说--Be Better. 工作 我并不在一个互联网公司,在纯粹的工作中好像并没有什么令人激动的事情.公司氛围很好,能让人随时保持最高的精力,在我司工作是幸福的,有一群可爱的同事,和谐的氛围能然你感受到无比温暖. 过去一年的工作好像并没有特别的可以拿出来说的地方,做了web api,做了前端,做了后台:也像我自己

title: 可爱的豆子--使用Beans思想让Python代码更易维护 toc: false comments: true date: 2016-06-19 21:43:33 tags: [Python, Java, 经验] category: Python --- 我曾经是一个对Java非常反感的人,因为Java的语法非常啰嗦.而用惯了动态类型的Python再使用静态类型的Java就会觉得多出了很多的工作量. 因为工作的关系,我开始使用Java来做项目.在这个过程中,我发现Java在某些方面

很多人说 Redux 代码多,开发效率低.其实 Redux 是可以灵活使用以及拓展的,经过充分定制的 Redux 其实写不了几行代码.今天先介绍一个很好用的 Redux 拓展-- redux-amrc.它可以帮助我们使用更少的样板代码发起异步 action. 低效的过去 一般情况下,为了清楚地记录异步的过程,我们需要使用 三个 action 来记录状态变化.通常,我们的代码会是这样: const LOAD = 'redux-example/auth/LOAD'; const LOAD_SUCCE

我们在2016年年初推出了MIP,帮助移动页面加速(原理).内测数据表明,MIP页面在1s内加载完成.现在已经有十多家网站加入MIP项目,有更多的网站正在加入中.在我们收到的反馈中,大部分都提到了广告的加载问题. MIP for ads 介绍 MIP 对普通内容已经做得足够好,那么广告是否也可以得到相同加载速度的收益呢? 在阐述之前,先引用一段来自谷歌的数据:如果发行商能够将网页的加载速度从平均的19秒,提升到5秒,广告收入就可以翻倍,同时也能提升用户留存. 当然,广告加载速度提升一直是我们 M

什么是Linq表达式?什么是Lambda表达式? 如图: 由此可见Linq表达式和Lambda表达式并没有什么可比性. 那与Lambda表达式相关的整条语句称作什么呢?在微软并没有给出官方的命名,在<深入理解C#>中称为点标记. 查询表达式.点标记你更喜欢哪个? 所以,我们的标题的提问根本就不合适.应该是“查询表达式和点标记你更喜欢哪个?”.如: //查询表达式 var students1 = from t in db.Students where t.Name == "张三&quo

与asp.net 打交道很多年,如今天微软的优秀框架越来越多,其中微软在基于mvc的思想架构,也推出了自己的一套asp.net mvc 框架,如果你亲身体验过它,会情不自禁的说‘漂亮’.回过头来,‘漂亮’终归有个好的思想,其中类似于AOP的思想,就在其中体现的淋漓尽致,今天本文主要讨论的是基于AOP思想构成的‘异常过滤器’.我们的目的只有一个,让try...catch...无处盾形,让代码更健壮优美. 一.理解mvc里filter是怎么运行的 老外的一篇文章是这样的草图 通过翻译中文是这样的 其

我在写CSS的时候经常会碰到些麻烦事儿: 1)看上去蛮简单的排版却写了很久 2)代码写的越来越散,总是这里补一句,那里补一句,没有条理性 3)margin.padding.font-size等属性在不停的重写 效率提不上去,工期又赶,最后只能加班加点做. 后面仔细想想,其实自己可以做的更有计划性,更有条不紊的推进. 一.全局观 我们这边开发是按流程来进行的,UI设计没给出,是坚决不开工的. 在UI设计给出后,最多只是做些无伤大雅的微调,这样的话,其实在给出所有UI设计稿后,可以做个大概的评估.

最近用php做了点小东东,用上了ezSQL,感觉真的很ez,所以拿来跟大家分享一下~ ezSQL是一个非常好用的PHP数据库操作类.著名的开源博客WordPress的数据库操作就使用了ezSQL的MySQL部分.该数据库操作类支持几乎所有主流的数据库,如:PHP-PDO, mySQL, Oracle, InterBase/FireBird, PostgreSQL, SQLite以及MS-SQL等.ezSQL具有很强的调试功能,可以快速地查看SQL代码的执行情况.使用ezSQL,可以为我们节省开发

一.写在前面 还在为时间接收而烦恼吗?还在为各种组件间的消息传递烦恼吗?EventBus 3.0,专注于android的发布.订阅事件总线,让各组件间的消息传递更简单!完美替代Intent,Handler,BroadCast,接口等传统方案.这么优雅的功能实现,却只有50k左右的jar包,无疑集快.小.优雅解耦于一身,目前最新版本为3.0,与之前版本有所冲突,官方网址:https://github.com/greenrobot/EventBus 二.使用简介 总的流程只需要4步:添加依赖=>编写

最近开始重构一个稍嫌古老的C/S项目,原先采用的技术栈是『WinForm』+『WCF』+『EF』.相对于现在铺天盖地的B/S架构来说,看上去似乎和Win95一样古老,很多新入行的,可能就没有见过经典的C/S架构的系统.事实上,作为企业信息管理系统,包括ERP/CRM/SCM等,桌面客户端还是很OK的. 这次重构原定的目标有两个: 1.客户端还是WinForm不变,但使用MVC模式重写: 2.WCF改成WebAPI. 经过2周时间的尝试和探索,重构计划变更为: 1.使用VMVC模式来重构WinFo

老牌管理杂志.每期都值得精度.本期我还是给4星. 以下是本书中的一些内容的摘抄: 1:他们发现在Airbnb上,如果客人姓名听起来像黑人,那么比名字像白人的客人的接受率会低16%.#45 2:对立组织沟通时首先肯定对方(说些好话,至少也得准备好说好话),就事论事不掺杂对身份的考虑,会进展良好.#152 3:领导层的行为会推动企业文化的形成.不过这也正是已成型的企业文化难以改变的原因.#167 4:亚马逊的创始人和CEO杰夫·贝索斯(JeffBezos)说过,如果公司员工发现有十分之一几率获得百倍

系列文章 C#开发奇技淫巧一:调试windows系统服务 C#开发奇技淫巧二:根据dll文件加载C++或者Delphi插件 C#开发奇技淫巧三:把dll放在不同的目录让你的程序更整洁 程序目录的整理 想必C#的开发者都遇到过这个问题,引用的dll都放在根目录下,随着项目的日益增大,根目录下充满了各种各样的dll,非常的不美观. 如果能够把dll按照想要的目录来存放,那么系统就美观多了,以下是我常用的程序各文件的分布: [3rdLibs] NLog.dll Newtonsoft.Json.dll

没想到上一篇文章有这么多人喜欢,多谢大家支持.继续- 很多比较通用的快捷键的默认设置其实是有一些缩写在里面的,这个估计也是MS帮助我们记忆.比如说注释代码的快捷键是Ctrl + E + C,我们如果知道它是 Ctrl + Edit + Comment Code 的缩写不是更好记么?我也会尽量YY把快捷键和功能联系起来来帮助我自己记忆.另外很多功能在VS中有多个快捷键可以实现,我猜是为了防止一些快捷键冲突所设计的吧,我一般只会去记好记的,冲突了再说. 三.继续更有效率的编辑器 3.1 更有效的编辑

React 号称通过引入 Virtual DOM 带来了性能的提升,而其实 React 之所以需要 Virtual DOM,是因为它的架构下,state 的变更是全量的,然后触发 render 返回全量的新的 Virtual DOM 树形结构,通过对比新旧 Virtual DOM 结构,决定如何增量式更新 DOM.   所以 React 其实是因为不用 Virtual DOM + Diff + Patch,会有严重的性能问题,所以才这么做,而不是因为这么做了性能好.   想一想,不论是 MVVM

问题 你正在使用POCO,你想提高修改跟踪的性能,同时使内存消耗更少.另外,你想通过EF的CodeFirst方式来实现. 解决方案 假设你有一个关于Account(帐户)和相关的Payments(支付)的模型,如Figure 13-7 Figure 13-7. A model with an Account entity and a related Payment   首先,本例用EF的CodeFirst方式实现,在Listing 13-16,我们创建实体类:Account和Payment.为达