▶ 计时器函数 MPI_Wtime() 以及头文件 timer.h 中的宏函数 GET_TIME(),类似 time.h 中函数 clock() 的用法.注意 函数 clock() 记录的是CPU时间(包含用户代码,库函数,系统调用耗时,不包括空闲等待时间),而 MPI_Wtime() 和 GET_TIME()记录的是墙上时间(在 CPU 时间的基础上包括了空闲等待时间). ● MPI_Wtime() 使用范例 { ; int globalDataInt[globalSize], i, comS

思路: 只保留奇数 (1)由输入的整数n确定存储奇数(不包括1)的数组大小: n=(n%2==0)?(n/2-1):((n-1)/2);//n为存储奇数的数组大小,不包括基数1 (2)由数组大小n.进程号id和进程数p,确定每个进程负责的基数数组的第一个数.最后一个数和数组维度: low_value = 3 + 2*(id*(n)/p);//进程的第一个数 high_value = 3 + 2*((id+1)*(n)/p-1);//进程的最后一个数 size = (high_value - lo

用c语言写了kmeans算法的串行程序,再用mpi来写并行版的,貌似参照着串行版来写并行版,效果不是很赏心悦目~ 并行化思路: 使用主从模式.由一个节点充当主节点负责数据的划分与分配,其他节点完成本地数据的计算,并将结果返回给主节点.大致过程如下: 1.进程0为主节点,先从文件中读取数据集,然后将数据集划分并传给其他进程: 2.进程0选择每个聚类的中心点,并发送给其他进程: 3.其他进程计算数据块中每个点到中心点的距离,然后标出每个点所属的聚类,并计算每个聚类所有点到其中心点的距离之和,最后将这

Time Limit: 1000MS Memory Limit: 10000K Description BIT has recently taken delivery of their new supercomputer, a 32 processor Apollo Odyssey distributed shared memory machine with a hierarchical communication subsystem. Valentine McKee's research ad

// MPI1.cpp : 定义控制台应用程序的入口点. // #include "stdafx.h" #include "mpi.h" #include <Windows.h> #include <stdio.h> #include <math.h> int main(int argc, char* argv[]) { int done=0,n,myid,numproces,i; double mypi,pi,sum; doub

并行处理结课实验,要用到MPI编程,我的电脑和VS2012都是64位的,以为MPICH也得是64位才行,结果饶了很大的弯——配置正确,添加引用之后,仍然无法识别MPI函数. 后来换了个32位的MPICH,配置完成后运行成功! 一般,在Windows 8 环境下装MPICH时,还是关了防火墙好点,不然可能会遇到老是注册不上的情况,一运行就是“Error: No smpd passphrase specified through theregistry or .smpd file, exiting.

系统:2015 win10专业版 x64 MPI安装包:mpich2-1.4.1p1-win-x86-64.man 将后缀改为.msi 以管理员身份安装 安装过程一路默认,注意<behappy为默认的phrase> 安装完成以管理员身份打开命令提示符(cmd.exe) cd \Program Files\MPICH2\bin C:\Program Files\MPICH2\bin>smpd -install -phrase behappy ::<此处behappy与之前phrase

原理不解释,直接上代码 代码中被注释的源程序可用于打印中间结果,检查运算是否正确. #include "mpi.h" #include <math.h> #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <string.h> void scatter_matrix(int* fstream,int n1,int n2,int*Q,int root,int tag){ /*每个矩阵块的大小*/

以前没接触过MPI编程,对并行计算也没什么了解.朋友的期末课程作业让我帮忙写一写,哎,实现结果很一般啊.最终也没完整完成任务,惭愧惭愧. 问题大概是利用MPI完成矩阵和向量相乘.输入:Am×n,Bn×1  ,输出:Cm×1 附:程序中定义m=400,n=100,矩阵和向量的取值为随意整型数,为了便于显示并行效果,循环完成该计算任务100000次. 实现过程 1.实验环境:WINDOWS8.1 64位+ MPICH + VS2013   / kubuntu 14.04 + mpich 2.解题思路

大数据集群计算利器之MPI/OpenMP ---以连通域标记算法并行化为例 1 背景 图像连通域标记算法是从一幅栅格图像(通常为二值图像)中,将互相邻接(4邻接或8邻接)的具有非背景值的像素集合提取出来,为不同的连通域填入数字标记,并且统计连通域的数目.通过对栅格图像中进行连通域标记,可用于静态地分析各连通域斑块的分布,或动态地分析这些斑块随时间的集聚或离散,是图像处理非常基础的算法.目前常用的连通域标记算法有1)扫描法(二次扫描法.单向反复扫描法等).2)线标记法.3)区域增长法.二次扫描法由

问题来源:在使用MPI时,将程序并行实现了,运行时需要在dos窗口下输入批处理命令,以完成程序的执行. 如:mpiexec -localroot -n 6 d:/mpi/pro.exe 但每次这样挺麻烦的,就将批处理命令写在bat文件中,需要运行时直接双击运行bat文件即可. 但使用MPI实现的程序是软件功能的一部分,需要在软件使用过程中从软件中进行调用,实现MPI的并行处理,上面的方法就不可行了,上面的方法单独用还可以,但是要将功能集成在软件中,就需要另想办法了. 解决办法:system函数

基于都志辉老师MPI编程书中的第15章内容. 通信域是MPI的重要概念:MPI的通信在通信域的控制和维护下进行 → 所有MPI通信任务都直接或间接用到通信域这一参数 → 对通信域的重组和划分可以方便实现任务的划分 (1)通信域(communicator)是一个综合的通信概念.其包括上下文(context),进程组(group),虚拟处理器拓扑(topology).其中进程组是比较重要的概念,表示通信域中所有进程的集合.一个通信域对应一个进程组. (2)进程(process)与进程组(group)

基于都志辉老师<MPI并行程序设计模式>第14章内容. 前面接触到的MPI发送的数据类型都是连续型的数据.非连续类型的数据,MPI也可以发送,但是需要预先处理,大概有两类方法: (1)用户自定义新的数据类型,又称派生类型(类似定义结构体类型,但是比结构体复杂,需要考虑<类型,偏移量>两方面的内容) (2)数据的打包和解包(将不连续的数据给压缩打包到连续的区域,然后再发送:接受到打包数据后,先解包再使用) 这样做的好处,我猜一个是可以有效减少通信的次数,提高程序效率:另一方面可以减轻

相关章节:第13章组通信MPI程序设计. MPI组通信与点到点通信的一个重要区别就是:组通信需要特定组内所有成员参与,而点对点通信只涉及到发送方和接收方. 由于需要组内所有成员参与,因此也是一种比较复杂的通信方式.程序员在设计组通信语句的时候,需要同时考虑两点: a. 程序运行起来之后,当前正在运行的进程的行为方式 b. 将组通信作为一个整体,考虑所有进程的行为方式 (1)概述 组通信从功能上实现了三个方面: a. 通信:完成组内数据传输(广播.收集.散发.组收集.全互换各种数据交换传输方式)

这一章讲了MPI非阻塞通信的原理和一些函数接口,最后再用非阻塞通信方式实现Jacobi迭代,记录学习中的一些知识. (1)阻塞通信与非阻塞通信 阻塞通信调用时,整个程序只能执行通信相关的内容,而无法执行计算相关的内容: 非阻塞调用的初衷是尽量让通信和计算重叠进行,提高程序整体执行效率. 整体对比见下图: (2)非阻塞通信的要素 非阻塞通信调用返回意味着通信开始启动:而非阻塞通信完成则需要调用其他的接口来查询. 要素1:非阻塞通信的调用接口 要素2:非阻塞通信的完成查询接口 理想的非阻塞通信设计应

学习了MPI四种通信模式 及其函数用法: (1)标准通信模式:MPI_SEND (2)缓存通信模式:MPI_BSEND (3)同步通信模式:MPI_SSEND (4)就绪通信模式:MPI_RSEND 四种通信模式的区别都在消息发送端,而消息接收端的操作都是MPI_RECV. 1.标准通信模式 原理图如下 标准通信模式由MPI决定是否用缓存. 如果MPI决定缓存将要发出的数据:发送操作不管接受操作是否执行,都可以进行:而且缓存结束后发送操作就可以返回,不需要等待接受操作收到数据 如果MPI决定不缓

这里的内容主要是都志辉老师<高性能计算之并行编程技术——MPI并行程序设计> 书上有一些代码是FORTAN的,我在学习的过程中,将其都转换成C的代码,便于统一记录. 这章内容分为两个部分:MPI对等模式程序例子 & MPI主从模式程序例子 1. 对等模式MPI程序设计 1.1 问题背景 这部分以Jacobi迭代为具体问题,列举了三个求解Jacobi迭代问题的MPI对等模式程序. 这里需要阐明一下,书上的Jacobi迭代具体的背景可以参考这个内容:http://www.mcs.anl.g

有了apue的基础,再看mpi程序多进程通信就稍微容易了一些,以下几个简单程序来自都志辉老师的那本MPI的书的第七章. 现在ubuntu上配置了一下mpich的环境: http://www.cnblogs.com/liyanwei/archive/2010/04/26/1721142.html 注意,为了编译运行方便,在~/.bashrc文件中添加mpi的两个环境变量 设置完之后注意执行source ~/.bashrc命令 程序1 计时功能 主要用到的MPI_Wtime()这个函数 #inclu

什么是MPI: MPI是一个库,而不是一门语言.但是按照并行语言的分类,可以把FORTRAN+MPI或者C+MPI看作是一种在原来串行语言基础上扩展后得到的并行语言.MPI库可以被FORTRAN77/C/FORTRAN90/C++调用,从语法上说,它遵守所有对库函数/过程的调用规则,和一般的函数/过程没有什么区别. MPI是一种标准或规范的代表,而不特指某一个对它的具体实现.迄今为止,所有的并行计算机制造商都提供对MPI的支持,可以在网上免费得到MPI在不同并行机上的实现.一个正确的MPI程序,

MPI Maelstrom Time Limit : 2000/1000ms (Java/Other)   Memory Limit : 20000/10000K (Java/Other) Total Submission(s) : 2   Accepted Submission(s) : 1 Problem Description BIT has recently taken delivery of their new supercomputer, a 32 processor Apollo

一.Mac下OpenMPI的安装 所用电脑:MacBook Pro,OSX 10.11.2 从openmpi官网下载相应版本:OpenMPI 1.8下载 解压文件 双击解压或者tar zxvf openmpi***.tar.gz 指定安装路径 进入解压的目录,指定要安装的路径:./condigure --prefix=/usr/local 编译mpi源码 make all sudo make安装 sudo make install 检查是否加入环境变量 echo $PATH 查看MPI所在的/u