mRNA文库构建 Posted: 三月 27, 2017  Under: Transcriptomics  By Kai  no Comments RNA-seq测序方法 在测mRNA过程中,首先要去除rRNA.以人为例,在抽提的总RNA中,95%的RNA是rRNA,2%的RNA是mRNA,剩下的则是lncRNA.microRNA.siRNA等. rRNA整个人类当中是非常保守的,在各个组织器官中也是非常稳定的,因此这些测序结果对我们的研究是没有用处的.mRNA则是RNA中比较重要的部分. Il

RNA提取和建库流程对mRNA-Seq的影响 已有 10460 次阅读 2014-8-14 14:21 |个人分类:转录组测序|系统分类:科研笔记|关键词:转录组测序,RNA-Seq,,链特异性RNA-Seq,转录组文库构建,总RNA提取| RNA-seq, 转录组测序, 链特异性RNA-Seq, 转录组文库构建, 总RNA提取   目前RNA-Seq是挖掘不同生长时期及不同胁迫条件下.不同组织细胞中其差异表达基因通常所采用的研究方法,同时还可以鉴定获得新的转录本信息以及不同的可变剪切事件,因而

灵敏度高 == 假阴性率低,即漏检率低,即有病人却没有发现出来的概率低. 用于判断:有一部分人患有一种疾病,某种检验方法可以在人群中检出多少个病人来. 特异性高 == 假阳性率低,即错把健康判定为病人的概率低. 用于:被某种试验判定为患病的人中,又有多少是真的患了这种病的. 好的检测方法:有高的灵敏度(低的假阴性率).同时又有高的特异性(低的假阳性率). ROC 曲线: 横轴:100 — 特异性..即100减去特异性,特异性高,100减去特异性就低,故越小越好. 纵轴:灵敏度值. ROC分析图的

一些参考资料 http://www.360doc.com/content/17/0528/22/19913717_658086490.shtml https://www.cnblogs.com/triple-y/p/9338890.html 一.对miRNA进行分析  1.bowtie比对 "bowtie -q -v 2 -l 10 -k 15 /data/pub/shehb/Spinach_genome/spinach_genome_v1.fa "+fq+" -S &quo

通过前面几节的准备工作,对于 npm / node / gulp 应该已经有了基本的认识,本节主要介绍如何构建一个基本的前端自动化开发环境. 下面将逐步构建一个可以自动编译 sass 文件.压缩 javascript 文件.多终端多浏览器同步测试的开发环境,并且还可以通过 piblish 命令对项目下的文件进行打包操作. 相关连接导航 在windows下安装gulp —— 基于 Gulp 的前端集成解决方案(一) 执行 $Gulp 时发生了什么 —— 基于 Gulp 的前端集成解决方案(二) 常

在Web App和Hybrid App横行的时代,为了拥有更好的用户体验,单页面应用顺势而生,单页面应用简称`SPA`,即Single Page Application,就是只有一个HTML页面的应用程序,应用中所有的视图都包含在这个HTML页面中,并通过JavaScript控制相关视图的显示和隐藏,这种模式可以让用户在Web App感受Native App的速度和流畅.本篇文章的目的就是教你如何来快速的构建一个H5单页面切换骨架. 一. 页面设计 在构建SPA应用时,首先要确定你的应用需要包含

.NET Core中间件的注册和管道的构建(3) ---- 使用Map/MapWhen扩展方法 0x00 为什么需要Map(MapWhen)扩展 如果业务逻辑比较简单的话,一条主管道就够了,确实用不到Map.不过当业务逻辑比较复杂的时候,有时候我们可能希望根据情况的不同使用特殊的一组中间件来处理HttpContext.这种情况下如果只用一条管道,处理起来会非常麻烦和混乱.此时就可以使用Map/MapWhen建立一个分支管道,当条件符合我们的设定时,由这个分支管道来处理HttpContext.使用

.NET Core中间件的注册和管道的构建(2)---- 用UseMiddleware扩展方法注册中间件类 0x00 为什么要引入扩展方法 有的中间件功能比较简单,有的则比较复杂,并且依赖其它组件.除了直接用ApplicationBuilder的Use()方法注册中间件外,还可以使用ApplicationBuilder的扩展方法UseMiddleware()注册中间件.这种情况下可以注册类型,这个方法会通过反射解析这个类型,并把它包装成Func<ReuqestDelegate,RequestDe

.NET Core中间件的注册和管道的构建(1)---- 注册和构建原理 0x00 问题的产生 管道是.NET Core中非常关键的一个概念,很多重要的组件都以中间件的形式存在,包括权限管理.会话管理.路由等.所以搞明白中间件是如何注册并最终构建成管道的很重要.园子里很多先驱早已经开始了这方面的研究学习,也写了很多文章,不过我看了后有些地方还不是特别明白.毕竟每个人都是不同的,有些内容作者觉得是常识不需要多写的地方对我来说可能就是个盲区.幸好.NET Core整个项目都是开源的,找到源码看了下解

返回<.Net中的AOP>系列学习总目录 本篇目录 开始一个新项目 没有AOP的生活 变更的代价 使用AOP重构 本系列的源码本人已托管于Coding上:点击查看. 本系列的实验环境:VS 2013 Update 5(建议最好使用集成了Nuget的VS版本,VS Express版也够用),安装了PostSharp. 这篇博客覆盖的内容包括: 为项目创建需求 从零编写代码来满足需求 不使用AOP重构凌乱的代码 使用AOP来重构代码 这一节会构建一个汽车租赁系统,先是给定业务需求,然后逐渐地添加代

提到构建WebService服务,大家肯定第一个想到的是使用WCF,因为简单快捷嘛.首先要说明的是,本人对WCF不太了解,但是想快速建立一个WebService,于是看到了MSDN上的这一篇文章 Building Cross-Platform Web Services with ServiceStack,所以这里简要介绍一下如何使用ServiceStack快速建立一个WebService服务. 当然,在开始之前,首先要说明一下ServiceStack是个什么东西. 在国内用ServiceStac

首先为什么要自己编写Dockerfile来构建 nginx.php.mariadb这三个镜像呢?一是希望更深入了解Dockerfile的使用,也就能初步了解docker镜像是如何被构建的:二是希望将来可以定制自己的images,特别是能针对不同的系统环境与目标需求适当对镜像进行调整改进.在编辑Dockerfile过程中也参考了以下相关范例: https://hub.docker.com/_/php/ https://hub.docker.com/_/mysql/ https://hub.dock

使用webstorm+webpack构建简单入门级"HelloWorld"的应用&&构建使用jquery来实现 1.首先你自己把webstorm安装完成. 请参考这篇文章进行安装和破解http://www.cnblogs.com/chengxs/p/6245281.html 2.然后需要你的电脑安装了node.js. 可以参考这篇文章http://www.cnblogs.com/chengxs/p/6221393.html 2.第一种方法:使用命令行窗口.可以在你要创建

上一篇文章我提到:为了使用"国货",我把 Linux 上的构建和测试委托给了 DaoCloud,而 Travis-CI 不能放着不用啊.还好,这货支持 macOS 系统.所以就把 CoreCRM 在 macOS 上的构建和测试任务交给它了. 我想国内已经有很多写怎么用 Travis-CI 的博客文章了,我就不需要在这里多费话了.当然,最好的文章其实就是 Travis-CI 的文档:最好的帮助都在 StackOverflow 和 GitHub 上.如果还觉得自己英语不够用,看不懂这些站的

注册的服务器和中间件共同构成了ASP.NET Core用于处理请求的管道, 这样一个管道是在我们启动作为应用宿主的WebHost时构建出来的.要深刻了解这个管道是如何被构建出来的,我们就必须对WebHost和它的创建者WebHostBuilder这个重要的对象具有深刻的理解.[本文已经同步到<ASP.NET Core框架揭秘>之中] 目录一.WebHost    WebHostOptions    构建管道的三个步骤二.WebHostBuilder    WebHost的创建    几个常用的

在<中篇>中,我们对管道的构成以及它对请求的处理流程进行了详细介绍,接下来我们需要了解的是这样一个管道是如何被构建起来的.总的来说,管道由一个服务器和一个HttpApplication构成,前者负责监听请求并将接收的请求传递给给HttpApplication对象处理,后者则将请求处理任务委托给注册的中间件来完成.中间件的注册是通过ApplicationBuilder对象来完成的,所以我们先来了解一下这究竟是个怎样的对象.[本文已经同步到<ASP.NET Core框架揭秘>之中] [

FileProvider构建了一个抽象文件系统,作为它的两个具体实现,PhysicalFileProvider和EmbeddedFileProvider则分别为我们构建了一个物理文件系统和程序集内嵌文件系统.总的来说,它们针对的都是"本地"文件,接下来我们通过自定义FileProvider构建一个"远程"文件系统,我们可以将它视为一个只读的"云盘".由于文件系统的目录结构和文件内容都是通过HTTP请求的方式读取的,所以我们将这个自定义的FileP

这是一篇非常优秀的 React 教程,这篇文章对 React 组件.React Router 以及 Node 做了很好的梳理.我是 9 月份读的该文章,当时跟着教程做了一遍,收获很大.但是由于时间原因,直到现在才与大家分享,幸好赶在年底之前完成了译文,否则一定会成为 2016 年的小遗憾.翻译仓促,其中还有个别不通顺的地方,望见谅. 原文地址:Build a universal React and Node App 演示地址:https://judo-heroes.herokuapp.com/

STEP 1:设置开发环境 与yeoman的所有交互都是通过命令行.Mac系统使用terminal.app,Linux系统使用shell,windows系统可以使用cmder/PowerShell/cmd.exe. 1.1 安装条件 安装yeoman之前,你需要先安装如下内容 Nodejs v4或者更高版本 npm git 通过以下命令检查是否安装node环境以及npm管理工具. $ node -v && npm -v npm默认随node一起安装.有些node版本可能安装的是旧版本的np

本次要分享的是利用windows+nginx+iis+redis+Task.MainForm组建分布式架构,上一篇分享文章制作是在windows上使用的nginx,一般正式发布的时候是在linux来配置nginx,我这里测试分享内容只是起引导作用:下面将先给出整个架构的核心节点简介,希望各位多多点赞: . 架构设计图展示 . nginx+iis构建服务集群 . redis存储分布式共享的session及共享session运作流程 . redis主从配置及Sentinel管理多个Redis集群 .