1. 起因 之前的代码(单细胞分析实录(17): 非负矩阵分解(NMF)代码演示)没有涉及到python语法,只有4个python命令行,就跟Linux下面的ls grep一样的.然鹅,有几个小伙伴不会命令行,所以我决定再改写一下,把命令行都放到R下面运行. 2. 尝试 2.1 一开始,我的想法是教大家在R里面调用python,需要提前下载好anaconda和一些python包 然而想了想在Windows上安装python包可能对大家不是很友好,有些包很难装,我之前也弄了很久.考虑到这次更新是针

本次演示使用的数据来自2017年发表于Cell的头颈鳞癌单细胞文章:Single-Cell Transcriptomic Analysis of Primary and Metastatic Tumor Ecosystems in Head and Neck Cancer.本次演示提供处理好的测试数据,以及所有代码,一共6个脚本(我目前写得最详细的教程,也是全网少有的). 数据的预处理就不演示了,预处理的代码存放在0.pre.R文件中. 以下是肿瘤细胞tsne图和原图的对比,和原文一致,说明前面

http://blog.csdn.net/pipisorry/article/details/52098864 非负矩阵分解(NMF,Non-negative matrix factorization) NMF的发展及原理 著名的科学杂志<Nature>于1999年刊登了两位科学家D.D.Lee和H.S.Seung对数学中非负矩阵研究的突出成果.该文提出了一种新的矩阵分解思想--非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization,NMF)算法,即NMF是在矩阵中所

A Play application can be assembled from several application modules. This allows you to reuse application components across several applications or split a large application into several smaller applications. What is a module? A module is just anoth

转载来源: http://blog.csdn.net/mengxiangbaidu/article/details/7041296 http://blog.csdn.net/colzer/article/details/8443042 在YII中,程序入口是一个继承CApplication的CWebApplication的应用程序,在一个web请求的整个过程中,控制器,模型和视图都是由Application进行创建和控制.首先我们来看一下CWebApplication的类的继承结构: 从上面我们

在Angular1.5中,增加了一个Component方法,并且定义了组件的若干生命周期hook,在代码规范中也是推崇组件化开发,但是很遗憾的是,CSS模块化组件化的问题并没有得到解决,大部分项目的打包方式还是将所有CSS打包成一个完整的CSS文件,然后插入到html中,这样做的坏处显而易见,如果团队没有良好的CSS代码规范,很容易引起CSS的冲突,本文使用CSS Modules来解决Angular1.X中存在的CSS 冲突问题. 为了便于读者查看并动手操作,我将所有的代码打包成了一个库,首先在

最近遇到一个问题 seport is not a legal parameter in an Ansible task or handler 原因是我本地 Ansible 的 Extra Modules 已经过时,需要更新.但是Ansible的官方文档只给了这么一句话 There should be no need to install this repo separately as it should be included in any Ansible install using the o

在eclipse里面配置tomcat时候遇到的问题: Tomcat version 6.0 only supports J2EE 1.2, 1.3, 1.4, and Java EE 5 Web modules 解决方法: project的.setting folder下面,有个名为org.eclipse.wst.common.project.facet.core.xml的文件, 把

在一些Dell较旧的服务器上安装ESXi 5.x时, 会遇到卡在Relocating modules and starting up the kernel过不去的问题. 比如我装的这台CS24VSS. 问题的原因是Headless模式不能设定. 解决办法是添加 ignoreHeadless=TRUE 参数 1. 在ESXi安装开始前有一个倒计时, 这时按下 Shift + O, 在显示的命令后添加 ignoreHeadless=TRUE, 回车, 安装就能正常进行 2. 以下的步骤是把这个参数值

catalog . 漏洞描述 . 漏洞触发条件 . 漏洞影响范围 . 漏洞代码分析 . 防御方法 . 攻防思考 1. 漏洞描述2. 漏洞触发条件 0x1: POC http://localhost/phpcms_v9/index.php?m=member&c=index&a=login dosubmit=&username=phpcms&password=%26username%3d%%2bunion%2bselect%2b%%%252c%2527test%255c%%25

catalog . 漏洞描述 . 漏洞触发条件 . 漏洞影响范围 . 漏洞代码分析 . 防御方法 . 攻防思考 1. 漏洞描述 安装phpcms的时候会强制安装它的通行证 Relevant Link: http://www.wooyun.org/bugs/wooyun-2014-066394 2. 漏洞触发条件 0x1: POC1 . 访问头像上传页面 http://localhost/phpcms_v9/index.php?m=member&c=index&a=account_manag

catalog . 漏洞描述 . 漏洞触发条件 . 漏洞影响范围 . 漏洞代码分析 . 防御方法 . 攻防思考 1. 漏洞描述 ECSHOP支付插件存在SQL注入漏洞,此漏洞存在于/includes/modules/payment/alipay.php文件中,该文件是ECshop的支付宝插件.由于ECShop使用了str_replace函数做字符串替换,黑客可绕过单引号限制构造SQL注入语句.只要开启支付宝支付插件就能利用该漏洞获取网站数据,且不需要注册登入.GBK与UTF-8版本ECshop均

本文概述了TypeScript中如何使用模块以各种方式来组织代码.我们将涵括内部和外部的模块,并且讨论他们在适合在何时使用和怎么使用.我们也会学习一些如何使用外部模块的高级技巧,并且解决一些当我们使用TypeScript的模块时遇到的陷阱. 案例的基础 接下来开始写程序,我们将会在这里写上使用案例.我们来写个小型的简单字符串验证器,在我们检查网页上表单的input用户名或者检查外部数据文件格式的时候可能会用到. 单一的验证器: interface StringValidator { isAcce

安装模块的时候出现错误:modprobe: chdir(3.0.35-g6774ed9-dirty): No such file or directory. 内核模块没有安装正确.本文记录解决方法. 参考链接 http://linfengdu.blog.163.com/blog/static/1177107320132710370696/ 问题描述 安装模块的时候出现错误. root@freescale $ modprobe g_mass_storage.ko modprobe: chdir(3

Python中所有加载到内存的模块都放在sys.modules.当import一个模块时首先会在这个列表中查找是否已经加载了此模块,如果加载了则只是将模块的名字加入到正在调用import的模块的Local名字空间中.如果没有加载则从sys.path目录中按照模块名称查找模块文件,模块文件可以是py.pyc.pyd,找到后将模块载入内存,并加入到sys.modules中,并将名称导入到当前的Local名字空间. 详细信息参考: http://www.cnblogs.com/qq78292959/a

<project xmlns="http://maven.apache.org/POM/4.0.0" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 http://maven.apache.org/maven-v4_0_0.xsd"> <modelVersion&

著名的科学杂志<Nature>于1999年刊登了两位科学家D.D.Lee和H.S.Seung对数学中非负矩阵研究的突出成果.该文提出了一种新的矩阵分解思想――非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization,NMF)算法,即NMF是在矩阵中所有元素均为非负数约束条件之下的矩阵分解方法.该论文的发表迅速引起了各个领域中的科学研究人员的重视:一方面,科学研究中的很多大规模数据的分析方法需要通过矩阵形式进行有效处理,而NMF思想则为人类处理大规模数据提供了一种新的途径

英文链接:http://scikit-learn.org/stable/auto_examples/applications/topics_extraction_with_nmf_lda.html 这是一个使用NMF和LDA对一个语料集进行话题抽取的例子. 输入分别是是tf-idf矩阵(NMF)和tf矩阵(LDA). 输出是一系列的话题,每个话题由一系列的词组成. 默认的参数(n_samples/n_features/n_topics)会使这个例子运行数十秒. 你可以尝试修改问题的规模,但是要注

目录 . 引言 . Linux Security Module Framework Introduction . LSM Sourcecode Analysis . LSMs Hook Engine:基于LSM Hook进行元数据的监控获取 . LSM编程示例 . Linux LSM stacking 0. 引言 从最佳实践的角度来说,在Linux Kernel中进行安全审计.Access Control(访问控制)最好的方式就是使用Linux提供的原生的框架机制,例如 . Kprobe: Li

一.安装apache(http服务) 1. 从apache.org下载源码安装包 2. 解压缩# tar zxf httpd-2.2.4.tar.gz# cd httpd-2.2.4 3. 安装apache依赖包apr和apr-util,他们都在srclib目录中 3.1 安装apr# cd srclib/apr# ./configure --prefix=/usr/local/apr# make# make install 3.2 安装apr-util# cd ../apr-util# ./c