NR数据库下载和使用

2024-11-05

NR 数据库简介

目前有很多的数据库都存储了蛋白序列,比如NCBI Refseq, protein, swissprot 等,在各个数据库之间,或者是在某个数据库中,蛋白序列有大量冗余:为了方便使用,ncbi 构建了nr 库, 全称是 RefSeq non-redundant proteins: Non-redundant protein sequences from GenPept, Swissprot, PIR, PDF, PDB, and NCBI RefSeq 完整的nr 数据库的蛋白序列和预先构建好的

【数据库】本地NR数据库如何按物种拆分？

目录 1.准备本地数据库文件 1.1 NR库下载 1.2 Taxonomy数据库下载 2.按物种拆分NR库 2.1 第一步:获得Aceesson和分类物种的对应关系 2.2 第二步:获得分类物种的序列 2.3 第三步:建库和比对 1.准备本地数据库文件 NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗余蛋白库,是所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列.Taxonomy物种分类数据库,包括大于7万余个物种的名字和系谱,这些物种都至

MySQL数据库下载安装和DataGrip的下载安装和破解

一: 数据库下载地址:官网https://dev.mysql.com/downloads/file/?id=482771;如果参数id失效,就选择之前的版本,5.7就可以,太新的没人用,老的很稳定.选300M多的,别选十几兆的那个. 选最下面的no,thanks,直接下载就可以. 二: 下载dataGrip 数据库管理系统地址: Get Brains官网https://www.jetbrains.com/datagrip/download/download-thanks.html?platf

ASP.NET中防止Access数据库下载

如何防止Access数据库下载是一个很老的话题了,网上的讨论也比较多.这里我们给出几种在ASP.NET下防止Access数据库被下载的方法. 我们这里假设Access数据库名字为 test.mdb. 1.把数据库放在WEB目录外如你的网站目录是D:\www,你可以把数据库放到D:\data 这个文件夹里,然后修改网站程序中的数据库连接字串地址部分为:"D:\data\test.mdb" ,这样数据库可以正常调用,但是无法下载的,因为它不在网站目录里. 假设在web.config中配置

SQLite数据库下载

一:SQLite简介 SQLite是一种嵌入式数据库,它的数据库就是一个文件.体积很小,经常被集成到各种应用程序中,甚至在iOS和Android的App中都可以集成. 要操作关系数据库,首先需要连接到数据库,一个数据库连接称为Connection 要操作硬盘中的文件,首先我们要获取输入流(或者输出流) 二:SQLite建库,建表文末有介绍怎么安装SQLite 1.创建数据库图片来自菜鸟教程 2:显示创建的数据库 3:建表 4.插入数据和查询数据自己电脑操作下载SQLite(就是获

SQLite数据库下载、安装和学习

SQLite 是一个开源的嵌入式关系数据库,实现自包容.零配置.支持事务的SQL数据库引擎. 其特点是高度便携.使用方便.结构紧凑.高效.可靠.与其他数据库管理系统不同,SQLite 的安装和运行非常简单,在大多数情况下 - 只要确保SQLite的二进制文件存在即可开始创建.连接和使用数据库.如果您正在寻找一个嵌入式数据库项目或解决方案,SQLite是绝对值得考虑. http://database.51cto.com/art/201205/335411.htm SQLite on Windows

day-01mysql数据库下载安装卸载及基本操作

MySQL5.5.40破解版地址(永久有效):链接:https://pan.baidu.com/s/1n-sODjoCdeSGP8bDGxl23Q 密码:qjjy 第2节数据库的介绍 MySQL:开源免费的数据库,小型的数据库,已经被 Oracle 收购了. MySQL6.x 版本也开始收费.后来 Sun公司收购了 MySQL,而 Sun 公司又被 Oracle 收购 2.1.2 什么是数据库1) 存储数据的仓库2) 本质上是一个文件系统,还是以文件的方式存在服务器的电脑上的.3) 所有的关系

oracle10-11数据库下载

Oracle数据库官方下载,需要注册oracle账号,方可下载! 11G 7个压缩包含义: p102025301120——Linux-x86-64_1of7.zip database安装介质 p102025301120——Linux-x86-64_2of7.zip database安装介质 p102025301120——Linux-x86-64_3of7.zip grid安装介质 p102025301120——Linux-x

sqlite数据库下载安装和初步操作和所遇到的问题near "sqlite3":syntax error

1.下载sqlite数据库:http://www.sqlite.org/download.html 假设是在window上安装须要在 Windows 区下载预编译的二进制文件.如图下载下载 sqlite-shell-win32-*.zip 和 sqlite-dll-win32-*.zip 压缩文件. watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvbGlfbGlfbGlu/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCM

MongoDB 数据库下载和安装

MongoDB是一款非常流行的非关系型数据库,将面向对象数据存储做的非常好.这里就不具体介绍它的使用,本文主要解说怎样安装MongoDB数据库.把自己安装过程中碰到的问题和最后解决方法分享给大家,希望能够给大家带来帮助. 一.首先下载MongoDB数据库官网地址:https://www.mongodb.org/downloads,选择操作系统及位数,进入下载页.然后点击箭头处的Download not starting? 下载,不要填写资料. 因为国外站点訪问有点慢,我是在http://www

用GEOquery从GEO数据库下载数据--转载

https://www.plob.org/article/9969.html Gene Expression Omnibus database (GEO)是由NCBI负责维护的一个数据库,设计初衷是为了收集整理各种表达芯片数据,但是后来也加入了甲基化芯片,甚至高通量测序数据! GEO数据库基础知识 GEO Platform (GPL) 芯片平台 GEO Sample (GSM) 样本ID号 GEO Series (GSE) study的ID号 GEO Dataset (GDS) 数据集的ID号

Caché，Cache数据库下载

Caché数据库主要用于医疗领域,国内的开发人员比较少接触,使用环境相对封闭,前段时间刚才用到,下载也费了许多时间,特记录一下,帮助那些需要的人. 顺便说一下,TreeSoft数据库管理系统,目前支持 MySQL,Oracle,PostgreSQL, SQL Server, MongoDB, Hive, SAP HANA, Caché 1.打开下载地址:https://download.intersystems.com/download/register.csp 2.进行用户注册,并填写一份简单

解压版(.zip)的MySQL数据库下载安装

1.首先到mysql官网下载(https://dev.mysql.com/downloads/mysql/5.6.html#downloads): 2.解压下载好的压缩包文件,并将解压后的文件夹放到合适的位置注意:①可以将改文件夹改名,如:mysql-5.6.38 ②由于解压版不需要安装,解压后的文件夹就相当于安装目录,因此建议放到个人安装的根目录下,如:D:\ProgramFiles\ 3.配置环境变量: ①新建环境变量:我的电脑->属性->高级系统设置->环境变量->新建,[

0-mysql数据库下载及安装

1 下载mysql源安装包 wget http://dev.mysql.com/get/mysql57-community-release-el7-8.noarch.rpm 2 安装mysql源 yum localinstall mysql57-community-release-el7-8.noarch.rpm3 检查mysql源是否安装成功yum repolist enabled | grep "mysql.*-community.*"4 安装mysqlyum install my

千人基因组计划数据库下载某段区域SNP

进入http://browser.1000genomes.org/index.html网站假定要寻找“6:133098746-133108745”这段距离的SNP数据,“6”表示6号染色体,后面的数据表示距离. 点击“Go”,进入如下界面后,再点击左栏的“Get VCF data” 弹出如下界面,再继续点击“VCF to PED converter” 再点击“Next” 接下来,弹出来的窗口让你选择种族(population),比如有中国CHB,日本JPT,挑选完感兴趣的种族,然后点击“Nex

在线读取Mongodb数据库下载EXCEL文件

版本:Mongodb2.4.8 通过页面下载Excel文件 jsp <%@ page language="java" contentType="text/html; charset=UTF-8" pageEncoding="UTF-8"%> <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.or

数据库下载word预览功能的研究

本文参考了这里的一些方法http://tobetobe.blog.51cto.com/1392243/354420 一直想通过缓存来实现,奈何技术不够,走了曲线救国的思路,先下载,然后预览,删除下载文件.好吧主要给自己做个备忘. 注意 1.关闭前清空剪切板,否则会提示删除文件失败或者打开word预览是弹提示说已占用. 2.打开新预览之前要sleep一段时间确保word完全退出 3.粘贴时需要sleep一段时间确保粘贴完成代码: using System; using System.Collec

Access2007数据库下载地址与AccessHelper

链接:https://pan.baidu.com/s/1pLzOlTv0nqSbhzujHZht1w 提取码:1m9l AccessHelper: using System; using System.Collections.Generic; using System.Data; using System.Data.OleDb; using System.Linq; using System.Text; namespace AccessIReaderDemo { public class Acc

MySQL数据库下载、安装

地址:https://www.mysql.com/ 解压下载的文件配置环境变量新建系统变量变量名:MYSQL_HOME 变量值:解压 mysql-5.7.24-winx64.zip 后的路径编辑系统变量变量名:Path 变量值:添加 %MYSQL_HOME%\bin 在解压后的文件夹中新建一个my.txt文件,然后通过重命名修改文件后缀为.ini 文件的内容如下: [client]port=3306default-character-set=utf8 [mysqld] # 设置为

mysql数据库----下载安装、操作

一.mysql概述 1.什么是数据库 ? 答:数据的仓库,如:在ATM的示例中我们创建了一个 db 目录,称其为数据库 2.什么是 MySQL.Oracle.SQLite.Access.MS SQL Server等 ? 答:他们均是一个软件,都有两个主要的功能: a. 将数据保存到文件或内存 b. 接收特定的命令,然后对文件进行相应的操作PS:如果有了以上软件,无须自己再去创建文件和文件夹,而是直接传递命令给上述软件,让其来进行文件操作,他们统称为数据库管理系统(DBMS,Database

NR数据库下载和使用

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