Opti-Protein precision Marker图

2024-08-23

单细胞分析实录(9): 展示marker基因的4种图形（二）

在上一篇中,我已经讲解了展示marker基因的前两种图形,分别是tsne/umap图.热图,感兴趣的读者可以回顾一下.这一节我们继续学习堆叠小提琴图和气泡图. 3. 堆叠小提琴图展示marker基因相比于其他可视化形式,小提琴图可以更直观地展示某一类亚群的某一个基因的表达分布情况.我的marker基因一共选了12个,下面来画图: Seurat内置的VlnPlot函数可以直接画, library(xlsx) markerdf2=read.xlsx("ref_marker2.xlsx",

分类问题（三）混淆矩阵，Precision与Recall

混淆矩阵衡量一个分类器性能的更好的办法是混淆矩阵.它基于的思想是:计算类别A被分类为类别B的次数.例如在查看分类器将图片5分类成图片3时,我们会看混淆矩阵的第5行以及第3列. 为了计算一个混淆矩阵,我们首先需要有一组预测值,之后再可以将它们与标注值(label)进行对比.我们也可以在测试集上做预测,但是最好是先不要动测试集(测试集仅需要在最后的阶段使用,在我们有了一个准备上线的分类器后,最后再用测试集测试性能).接下来,我们可以使用cross_val_predict() 方法: from sk

confidence intervals and precision|The One-Mean z-Interval Procedure|When to Use the One-Mean z-Interval Procedure

Confidence Intervals for One Population Mean When σ Is Known Obtaining Confidence Intervals for a Population Mean When σ Is Known The z-interval procedure works reasonably well even when the variable is not normally distributed and the sample size is

opencv 61篇

(一)--安装配置.第一个程序标签: imagebuildincludeinputpathcmd 2011-10-21 16:16 41132人阅读评论(50) 收藏举报分类: OpenCV(60) 版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. 决心开始研究OpenCV.闲言少叙,sourceforge网站最近的版本是2011年8月的OpenCV2.3.1,下载安装,我这里使用的开发环境是vs2008,网上搜了一下配置的教程,与之前的几个OpenCV版本的配置过程大体相同:(

【沥血整理】灰度（二值）图像重构算法及其应用（morphological reconstruction）。

不记得是怎么接触并最终研究这个课题的了,认识我的人都知道我是没有固定的研究对象的,一切看运气和当时的兴趣.本来研究完了就放在那里了,一直比较懒的去做总结,但是想一想似乎在网络上就没有看到关于这个方面的资料,能搜索到的都是一些关于matlab相关函数的应用,决定还是抽空趁自己对这个算法还有点记忆的时候写点东西吧,毕竟这个算法还有一些应用是值得回味和研究的.而且也具有一定的工程价值. 怎么说呢,其实在很早浏览matlab的图像处理工具箱的时候,就无数次的看到过这些函数,但是无奈当时不知道他们有什么用

【高德地图API】从头德国高中生JS API（三）覆盖物——大喊|折线|多边形|信息表|聚合marker|点蚀图|照片覆盖

覆盖物,是一张地图的灵魂.有覆盖物的地图.才是完整的地图.在一张地图上,除了底层的底图(瓦片图,矢量图),控件(有功能可操作的工具).最重要最必不可少的就是覆盖物了.覆盖物有多种.包含.标注.折线.多边形.信息窗体.聚合marker.麻点图和图片覆盖物. 本文会具体介绍每一种覆盖物的概念.加入方法,改动方法.移除方法等.最后会提供演示样例和源码下载. 演示样例demo:http://zhaoziang.com/amap/zero_3_1.html ------------------------

【高德地图API】从零开始学高德JS API（三）覆盖物——标注|折线|多边形|信息窗口|聚合marker|麻点图|图片覆盖物

原文:[高德地图API]从零开始学高德JS API(三)覆盖物——标注|折线|多边形|信息窗口|聚合marker|麻点图|图片覆盖物摘要:覆盖物,是一张地图的灵魂.有覆盖物的地图,才是完整的地图.在一张地图上,除了底层的底图(瓦片图,矢量图),控件(有功能可操作的工具),最重要最不可缺少的就是覆盖物了.覆盖物有多种,包括,标注.折线.多边形.信息窗口.聚合marker.麻点图和图片覆盖物.本文会详细介绍每一种覆盖物的概念,添加方法,修改方法,移除方法等.最后会提供示例和源代码下载. 示例dem

javascript 百度地图无秘钥（appkey）创建marker标记地图

创建简单的marker地图不一定需要去百度地图申请key,简单代码实现marker地图,效果如图: html代码如下,代码中的baidu.api.js参考后面的隐藏代码: <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="utf-8"> <title>Examples</title> </head> <body> <div id="di

numpy.meshgrid的理解以及3D曲面图绘制（梯度下降法实现过程）

相关概念: 1.x向量和y向量 import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt x = np.array([[0,1,2,3], [0,0,0,0], [0,0,0,0], [0,0,0,0]]) y = np.array([[0,0,0,0], [1,0,0,0], [2,0,0,0], [3,0,0,0]]) plt.plot(x,y, color = 'red', ##全部点设置红色 marker='o', ##形状:实心圆圈 line

iOS开发系列--打造自己的“美图秀秀”

--绘图与滤镜全面解析概述在iOS中可以很容易的开发出绚丽的界面效果,一方面得益于成功系统的设计,另一方面得益于它强大的开发框架.今天我们将围绕iOS中两大图形.图像绘图框架进行介绍:Quartz 2D绘制2D图形和Core Image中强大的滤镜功能. Quartz 2D 基本图形绘制视图刷新其他图形上下文 Core Image Quartz 2D 在iOS中常用的绘图框架就是Quartz 2D,Quartz 2D是Core Graphics框架的一部分,是一个强大的二维图像绘制引擎.

[No000098]SVN学习笔记5-分支，合并，属性，补丁，锁，分支图

行结束符和空白选项在项目的生命周期中,有时可能会将行结束符由 CRLF 改为 LF,或者修改一段代码的缩进.不幸的是这样将会使大量的代码行被标记为已修改,尽管代码本身并没有被修改.这里列出的选项将会在比较差异和应用补丁时帮助你应对这些修改.你将会在合并和追溯对话框中看到这些设置,它们同样也出现在TortoiseMerge 的设置中. 忽略行结束符排除仅行结束符的差异. 比较空白将所有缩进和行内空白差异视为增加/删除的行. 忽略空白修改排除那些完全是针对空白数量或类型的修改,例如,修改缩

Matplotlib——第一章轻松画个图

首先安装matplotlib,使用pip install matplotlib.安装完成后在python的命令行敲入import matplotlib,如果没问题,说明安装成功可以开始画图了. 看好了,见证奇迹的时刻 from matplotlib import pyplot as plt plt.plot([1,2,3,4,5],[4,3,4,3,4]) #在画布上画图 plt.show() #显示画布画线,需要给出线上的点的坐标,然后Matplotlib会自动将点连成线.我们看到两个点的坐

ChartControl 折线图柱状图

添加折线图(柱状图) 拖动ChartControl到Form上在Series Collection中添加Line(或Bar) DevExpress.XtraCharts.Series series1 = new DevExpress.XtraCharts.Series(); DevExpress.XtraCharts.LineSeriesView lineSeriesView1 = new DevExpress.XtraCharts.LineSeriesView(); series1.View

PR曲线，ROC曲线，AUC指标等，Accuracy vs Precision

作为机器学习重要的评价指标,标题中的三个内容,在下面读书笔记里面都有讲: http://www.cnblogs.com/charlesblc/p/6188562.html 但是讲的不细,不太懂.今天又理解了一下.看了这篇文章: https://www.douban.com/note/247271147/?type=like 讲的很好. 都是基于这张图,先贴一下: PR Precision-Recall曲线,这个东西应该是来源于信息检索中对相关性的评价吧,precision就是你检索出来的结果中,

IOS 中openGL使用教程3（openGL ES 入门篇 | 纹理贴图（texture）使用）

在这篇文章中,我们将学习如何在openGL中使用纹理贴图. penGL中纹理可以分为1D,2D和3D纹理,我们在绑定纹理对象的时候需要指定纹理的种类.由于本文将以一张图片为例,因此我们为我们的纹理对象绑定一个GL_TEXTURE_2D的纹理. 本文将分为两个部分,一部分是如何通过图片获取一个2D的纹理,另一部分是如何使用一个纹理. 在上一篇中,我们介绍了如何使用shader来绘制一个多边形,本文是基于上一篇的提高,我们也将继续使用shader,对于shader使用不熟的童鞋可以看上一篇. 首先我

LBS数据分析：使用地图展示统计数据——麻点图与麻数图

作为一个LBS的APP,都获得了用户经纬度,也都使用了友盟统计.google ana等等统计分析系统,不过没有地图展示功能,不能进行直观的展示. 友盟统计.google ana等系统是总体数据统计,无法和业务结合起来,比如淘宝提供每个店.每个商品的用户统计. 当有上述需求时,就需要自己服务器保存一份经纬度,进行统计,这时候如何直观的展示? 查看各个地图开放平台的文档,发现有的提供了“麻点图/点聚合(Marker Cluster)”功能. 原理是:把每个点都画在地图上,缩放时累加聚合. 缺点:只能

一款开源且功能强大的C#甘特图控件.NET Winforms Gantt Chart Control

甘特图在项目管理中非常重要,甘特图的思想比较简单,即以图示的方式通过活动列表和时间刻度形象地表示出任何特定项目的活动顺序与持续时间.它直观地表明任务计划在什么时候进行,及实际进展与计划要求的对比.管理者由此可便利地弄清一项任务(项目)还剩下哪些工作要做,并可评估工作进度.甘特图可以显示几个部门.机器或设备的运行和闲置情况.这表示了该系统的有关工作负荷状况,这样可使管理人员了解何种调整是恰当的. 由于项目需要,在网上找了很久,经过大量的对比和评估,发现一款真正开源且功能强大的C#甘特图控件.NET

准确率(Accuracy), 精确率(Precision), 召回率(Recall)和F1-Measure

yu Code 15 Comments 机器学习(ML),自然语言处理(NLP),信息检索(IR)等领域,评估(Evaluation)是一个必要的工作,而其评价指标往往有如下几点:准确率(Accuracy),精确率(Precision),召回率(Recall)和F1-Measure.(注: 相对来说,IR 的 ground truth 很多时候是一个 Ordered List, 而不是一个 Bool 类型的 Unordered Collection,在都找到的情况下,排在第三名还是第四名损失

8-Highcharts曲线图之对数直线图

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最牛逼android上的图表库MpChart（二）折线图

最牛逼android上的图表库MpChart二折线图 MpChart折线图介绍 MpChart折线图实例 MpChart效果最牛逼android上的图表库MpChart(二) 折线图最近工作中,用到了mpchart图表库,现在分享受下mpchart图表库的各个图表在实际工作应用场景: 最牛逼android上的图表库MpChart(一) 介绍篇最牛逼android上的图表库MpChart(二) 折线图最牛逼android上的图表库MpChart(三) 条形图最牛逼android上的图表

UML精粹3 - 类图，序列图，CRC

类图Class diagram 类图描述系统中的对象类型,以及它们之间的各种静态关系.类图也展示类的性质和操作,以及应用于对象连接方式的约束.UML中的特性feature,涵盖了性质property和操作operation. 性质property 性质可以以两种方式出现:属性attribute和关联association.属性是类方框内的一行文本(语法“visibility name: type multiplicity = default {property-string}”),关联是一根两个

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