org.Hs.eg.db包做基因号转换

2024-08-31

org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID，symbol等之间的转换)

1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(installed.packages()) == FALSE) {source("http://bioconductor.org/biocLite.R");biocLite("org.Hs.eg.db")}suppressMessages(library(org.Hs.eg.db))

R 语言 select函数在org.Hs.eg.db上的运用

首先org.Hs.eg.db是一个关于人类的一,在R中导入包library(org.Hs.eg.db) http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html (在org.Hs.eg.db导入前需要导入一些其它的包,按要求导入就行) 二,查看org.Hs.eg.db里面的数据类型三,看你拥有什么类型的数据 e.g 1,"ENSEMBL" (来源于:http://www.b

shell 两个rpm包做差分

当前目录下两个rpm包做差分. *.rpm 两个目录,解压rpm包. export LANG=c 差分判断是脚本还是Binary Files 脚本添加命令行提示符,awk. [root@sj_x861 diff_rwz]# cat diff_rpm.sh #!/bin/bash export LANG=c source ~/.bashrc ############################# #basic command label ##########################

org.Hs.eg.db

bioconduction 主页 http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html 安装 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("org.Hs.eg.db"

C#中如何防止Excel做科学计算法转换

C#中如何防止Excel做科学计算法转换 string style = @"<style>.text{mso-number-format:\@;}</style>";//注意这是样式,不需要修改可直接使用 Response.Clear(); Response.Buffer = true; Response.Charset = "utf-8"; Response.AppendHeader("

iptables做nat网络地址转换

iptables做nat网络地址转换. 0. 权威文档 http://www.netfilter.org/documentation/HOWTO/NAT-HOWTO-6.html e文好的直接跳过本文. 1. Source NAT 在POSTROUTING链里面定义,用-j SNAT,--to-source 省略成--to,ip ,ip段,地址段 ## Change source addresses to 1.2.3.4. # iptables -t nat -A POSTROUTING -o

【C】EM卡韦根32/24格式卡号转换的实现

写在前面第八周实验报告的deadline马上就要到了,大家都在奋笔疾书.这次的实验报告中有一个十分秃然的任务,要求学生用C语言编写一段代码,来处理编码问题. 我的ddl是在第七周,所以较早地解决了这个问题.但解决过程也是十分的秃然.鉴此,我决定分享一下这个任务的解决经验,希望给予需要的同学一点微薄的帮助. 索引写在前面 EM卡韦根32/24格式卡号转换的实现 1.1 问题概述 1.2 EM卡的ID格式 1.3 规划卡号转换思路 1.4 代码实现写在最后注:本篇文章中的所有图片均添加了ti

NetAnalyzer笔记之六用C#打造自己的网络连接进程查看器（为进程抓包做准备）

[创建时间:2016-04-13 22:37:00] NetAnalyzer下载地址起因最近因为NetAnalyzer2016的发布,好多人都提出是否可以在NetAnalyzer中加入一个基于进程的抓包功能.所以最近研究了一下大概有这样一个想法: 获取系统打开端口的所有进程,并获取进程所开启的端口.IP地址以及使用的协议等信息,然后生成对应的过滤表达式,然后给NetAnalyzer设置该过滤表达式,然后开始抓包. 开始虽然.Net中提供了进程信息查看的相关库,但是却没有提供相关网络端口查询

arulesSequences包做序列模式的关联分析

实验数据: 实验文件: ? 001 002 003 004 005 006 007 008 009 010 011 012 013 014 015 016 017 018 019 020 021 022 023 024 025 026 027 028 029 030 031 032 033 034 035 036 037 038 039 040 041 042 043 044 045 046 047 048 049 050 051 052 053 054 055 056 057 058 059

Java BC包做sm2加密方法，签名验签方法

package com.sdyy.common.bc_sm2; import org.bouncycastle.jcajce.provider.asymmetric.x509.CertificateFactory;import org.bouncycastle.jce.provider.BouncyCastleProvider;import org.bouncycastle.util.encoders.Base64;import org.bouncycastle.util.encoders.He

Jenkins获取jar包的快照号

目录一.简介二.脚本一.简介主要用于打jar包的工程,显示快照包的名字.当jar打包完成后,会在target目录中,截取快照名. 二.脚本 1.脚本return-version.sh #!/bin/bash pwd=$1 ver=`ls ${pwd}/*.jar |head -n 1` ver_return=`echo ${ver##*-}` if [[ "$ver_return" == "SNAPSHOT.jar" ]];then ver=`echo ${

Java用native2ascii命令做unicode编码转换

背景:在做Java开发的时候,常常会出现一些乱码,或者无法正确识别或读取的文件,比如常见的validator验证用的消息资源(properties)文件就需要进行Unicode重新编码.原因是java默认的编码方式为Unicode,而我们的计算机系统编码常常是GBK等编码.需要将系统的编码转换为java正确识别的编码问题就解决了. 1.native2ascii简介:native2ascii是sun java sdk提供的一个工具.用来将别的文本类文件(比如*.txt,*.ini,*.proper

基因id转换

DAVID网站提供了id转换的功能 1 选择上传gene list文件 2 选择上传ID的类型,我们ID-list.txt中的是Ensembl Gene ID,所以这里选ENSEMBL_GENE_ID 3 这个是类型,因为只做ID转换,所以选Gene List就ok了 4 选择你要转换的ID类型,这里我选的ENTREZ_GENE_ID 5 然后选择提交就ok了 bioDBnet 1 输入文件ID类型 2 输出ID类型,这里的Gene ID就是指ENTREZ GENE ID 3 输入ID列表,点击

java使用ffmpeg和mencoder做视频格式转换

首发:个人博客,持续更新和纠错主要使用技术:1)FFmpeg,用于主流格式之间的转换,例如AVI,MP4,FLV等.2)MEncoder,用于奇葩格式转主流格式,例如RMVB转AVI.这样我们可以把奇葩格式先转AVI,再由FFmpeg把AVI转成想要的格式.3)java的执行命令行操作的技术,这样安装在服务器上的↑这两个转换器就可以被java调用了.包括ProcessBuilder和Runtime这两种调法.可以参考这篇. FFmpeg的官网在这里,其文档在这里.MEncoder的官网在这里,

淘宝三角做法防CSS2D转换

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml"> <head> <meta http-equiv="Content-

vue 对px 做rem 自动转换

插件:postcss 安装: npm install postcss-pxtorem vue.config.js 配置 css: { loaderOptions: { postcss: { plugins: [ require('postcss-pxtorem')({ rootValue: 16, // 换算的基数 selectorBlackList: [], // 忽略转换正则匹配项 propList: ['*'] }) ] } } }

Neutron 理解 (6): Neutron 是怎么实现虚拟三层网络的 [How Neutron implements virtual L3 network]

学习 Neutron 系列文章: (1)Neutron 所实现的虚拟化网络 (2)Neutron OpenvSwitch + VLAN 虚拟网络 (3)Neutron OpenvSwitch + GRE/VxLAN 虚拟网络 (4)Neutron OVS OpenFlow 流表和 L2 Population (5)Neutron DHCP Agent (6)Neutron L3 Agent (7)Neutron LBaas (8)Neutron Security Group (9)Neutro

Neutron 是怎么实现虚拟三层网络的

Neutron 对虚拟三层网络的实现是通过其 L3 Agent (neutron-l3-agent).该 Agent 利用 Linux IP 栈.route 和 iptables 来实现内网内不同网络内的虚机之间的网络流量,以及虚机和外网之间网络流量的路由和转发.为了在同一个Linux 系统上支持可能的 IP 地址空间重叠,它使用了 Linux network namespace 来提供隔离的转发上下文. 1. 基础知识 1.1 Linux network namespace 1.1.1 概念和

openstack-mitaka版本DRV基础

一.基础知识 1.1 路由 1.1.1 策略路由 1.1.2 路由表 (使用 ip route 命令操作静态路由表) 1.1.3 路由分类之静态路由 1.1.4 路由分类之动态路由 1.1.5 ip rule,ip route,iptables 三者之间的关系 1.1.6 Traceroute 工具二.Neutron 的传统和 DVR Router 2.1 传统(Legacy) Router 2.1.1 基础知识 2.1.1.1 Linux network namespace 2.1.1.2

【Express系列】第2篇——主程序的改造

上一篇对项目的目录结构和 app.js 等一些文件做了一些改造,然而那只是开始. 接下来将做进一步的改造和完善. 我们先看看几个主要的脚本文件,下面的代码是我稍微修改过并添加注释的,方便理解每句代码的意思. app.js: var express = require('express'), path = require('path'), favicon = require('serve-favicon'), logger = require('morgan'), cookieParser = r

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