韦恩图 Venn Diagram Venn Diagram,也称韦恩图.维恩图.文氏图,用于显示元素集合重叠区域的图示.   韦图绘制工具 常用R语言的VennDiagram包绘制,输出PDF格式方便修改.此外还有非常多的在线工具,使用方便.详见“轻松绘制各种Venn图”   韦恩图在扩增子中用途 展示各样品和组间共有.各组特有的OTU:由于此类结果缺少统计支持,假阳性率高,近年来使用越来越少. 展示各组间差异OTU共有或特有情况:较常用. 展示差异OTU所属的Taxonomy归类后的共有或特有

本节课程,需要先完成 扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类   先看一下扩增子分析的整体流程,从下向上逐层分析 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾:我们制作了Usearch要求格式的Fasta文件,对所有序列进行去冗余和低丰度过滤,并聚类生成了OTU.   接下来我们对OTU进一步去除嵌合体,并生成代表性序列和OTU表.   什么是chimeras(嵌合体)? 嵌合体序列

本节课程,需要完成扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 先看一下扩增子分析的整体流程,从下向上逐层分析 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾:我们拿到了双端数据,进行了质控.并对实验设计进行了填写和检查.最后将双端数据合并为单个文件进行下游分析.   接下来我们将序列末端的barcode标签切下来,因为它们是人为添加的,不属于实验对象:再根据标签序列与实验设计文件比对,对每条序列属于哪个样品进行分类:最后我们切除掉扩增使用的引物,因为它们是人工合成的

在正文开始之前需要介绍一个人:Sean Sexton. 来自明尼苏达双城的软件工程师,对C#和WPF有着极深的热情.最为出色的是他维护了两个博客:2,000Things You Should Know About C# 和 2,000 Things You Should Know About WPF .听到博客名字就懂这个人有多伟大了吧.他以类似微博式的150字简短语言来每天更新一条WPF和C#重要又容易被遗忘的知识.Follow他的博客也有一段日子了,很希望能够分享给大家. 本系列我不仅会翻译

通常我们下机得到的数据是raw reads,但是公司通常会质控一份给我们,所以到很多人手上就是clean data了.我们再次使用fastqc来进行测序数据质量查看以及结果分析. fastqc的操作: 1. FastQC使用 fastqc -f [bam | sam | fastq] -o [output] [filename1 filename2] 常用选项: -f --format:输入文件格式.[bam,sam,fastq文件格式] -o --outdir:输出文件夹指定 -t --thr

转自http://www.dxy.cn/bbs/topic/35655953 1.OTU是什么? OTU(operational taxonomic units),即操作分类单元.通过一定的距离度量方法计算两两不同序列之间的距离度量或相似性,继而设置特定的分类阈值,获得同一阈值下的距离矩阵,进行聚类操作,形成不同的分类单元.专业解释太书面不好理解?没事儿,给你举个“栗子”就明白了! 2.OTU在16S测序中有何用? 高通量测序得到的16S序列有成千上万条,如果对每条序列都进行物种注释的话,工作量

16S结题报告中都会有这么一张图: 这张图是OTU Rank曲线,该曲线可以展示样品的多样性.而样品的多样性常通过以下两个方面进行解释:物种的丰富程度和均匀程度.Rank曲线中,曲线在横轴上的跨度越长,表明样品的物种含量越丰富:曲线越平坦,表示样品的物种组成越均匀. 图中,横坐标按照丰度由高至低排序的OTU数量,纵坐标为OTU丰度.样本曲线的延伸终点的横坐标位置为该样本的OTU数量.若曲线越平滑下降,表明样本的多样性高:若曲线快速陡然下降.则表明样本中的优势菌群所占比例高,多样性低. relat

版权声明:本文源自 解螺旋的矿工, 由 XP 整理发表,共 13781 字. 转载请注明:从零开始完整学习全基因组测序(WGS)数据分析:第4节 构建WGS主流程 | Public Library of Bioinformatics 转载地址:https://www.plob.org/article/11698.html WGS数据分析的目的是准确检测出每个样本(这里特指人)基因组中的变异集合,也就是人与人之间存在差异的那些DNA序列.我把整个分析过程按照它们实际要完成的功能,将其分成了三个大的

本节课程,需要先完成<扩增子分析解读>系列之前的操作 1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类 4去嵌合体 非细菌序列 生成代表性序列和OTU表 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾:我们学习了嵌合体的形成,以及基于参考数据库去嵌合体:也学习了基于数据库比对来筛选细菌或真菌:最后基于最确定的OTU,我们生成代表性序列和OTU表,这是每种高通量测序都有的结果,后续的结果将全部基于这两个文件.

(本博客为原创,http://www.cnblogs.com/linguanh/) 目录: 一,为什么说是真正的高仿? 二,为什么要搞缓慢效果? 三,我的实现思路 四,代码,内含注释 五,使用方法与截图 六,完整项目 一,为什么说是真正的高仿? 阐述这个问题前,先说下之前网上的,各位可以复制这段字,去百度一下  "仿微信打开网页的进度条效果" ,你会看到有很多类似的文章,不过他们有个共同点,就是实现方法都是一样的,而且,都忽略了微信加载网页时,进度条的缓慢动画效果,它不是生硬地一滑而过

文章版权由作者李晓晖和博客园共有,若转载请于明显处标明出处:http://www.cnblogs.com/naaoveGIS/ 1. 背景 项目中有1000万条历史案卷,为某地方坐标系数据,我们的真实需求是将地方坐标系坐标反转成WGS84坐标,如果现在需要将其转换成百度坐标系数据.常规方案是先建立好整个该市的本地坐标和百度坐标之间的控制点库后再进行转换.但是在具体实施中发现转换特别慢,由于控制点库也有200多万条记录,大概一个点需要一秒钟才能转换完. 2.将Update变成Insert关键字段值

原文地址:css3圆形百分比进度条的实现原理 今天早上起来在查看jquery插件机制的时候,一不小心点进了css3圆形百分比进度条的相关文章,于是一发不可收拾,开始折腾了... 关于圆形圈的实现,想必用2个圆心相同,半径不同的div即可实现.大圆的颜色即为圆形进度条的底色,小圆的颜色即为中间百分比的遮罩颜色白色,还要加上左右2边一边一个半圆,也就是说总共应该有4个div,一个大圆的div中包含3个div,左右一边半个圆,遮罩div处于最上面. 那这里的一边半个圆怎么实现呢?使用css的clip属

圆环形进度条制作的基本思想还是画出基本的弧线图形,然后CSS3中我们可以控制其旋转来串联基本图形,制造出部分消失的效果,下面就来带大家学习图解CSS3制作圆环形进度条的实例教程 首先,当有人说你能不能做一个圆形进度条效果出来时,如果是静态完整圆形进度条,那么就很简单了: .circleprogress{        width: 160px;        height: 160px;        border:20px solid red;        border-radius: 50

如果我想得到这样一个结果集:分组排序,并且每组限定记录集的数量,用一条SQL语句能办到吗? 比如说,我想找出学生期末考试中,每科的前3名,并按成绩排序,只用一条SQL语句,该怎么写? 表[TScore]的结构 code      学号 char subject  科目 int score     成绩 int 可以这样写: SELECT [code]        ,[subject]        ,[score]    FROM (        SELECT *        ,RANK(

正常查询语句中TOP的运用: SELECT TOP 1000 * FROM MP_MemberGrade   随意更新一张表中满足条件的前N条数据: UPDATE TOP (1) MP_Member SET FKGradeID=2 WHERE IsDeleted=2   更新A表中满足B表前N条记录的数据 UPDATE MP_Member SET FKGradeID=2 FROM MP_Member A LEFT JOIN (SELECT TOP 10 * FROM MP_MemberGrade

最近瞎逛的时候发现了一个超炫的粒子进度效果,有多炫呢?请擦亮眼镜!   // _this.ch){ _this.particles.splice(i, 1); } }; this.Particle.prototype.render = function(){ _this.ctx.fillStyle = 'hsla('+this.hue+', 100%, '+_this.rand(50,70)+'%, '+_this.rand(20,100)/100+')'; _this.ctx.fillRect

本文主要针对WPF新手,高手可以直接忽略,更希望高手们能给出一些更好的实现思路. 前期一个小任务需要实现一个类似含步骤进度条的控件.虽然对于XAML的了解还不是足够深入,还是摸索着做了一个.这篇文章介绍下实现这个控件的步骤,最后会放出代码.还请高手们给出更好的思路.同时也希望这里的思路能给同道中人一些帮助.话不多说,开始正题. 实现中的一些代码采用了网上现有的方案,代码中通过注释标记了来源,再次对代码作者一并表示感谢. 首先放一张最终效果图. 节点可以被点击 控件会根据绑定的集合数据生成一系列节

灯光的亮度控制需要一个滑动条,先借用lamp源码中Bar: var Bar = function (opt) { var defaults = { $id: "", // 进度条dom节点id min: 1, // 刻度最小值 stepCount: 5, // 刻度步数 step: 1, // 刻度步长 $alpha: "",//显示亮度的id touchEnd: function () { } // 拖动完成回调 }; this.option = $.extend

在正文开始之前需要介绍一个人:Sean Sexton. 来自明尼苏达双城的软件工程师.最为出色的是他维护了两个博客:2,000ThingsYou Should Know About C# 和 2,000 Things You Should Know About WPF .他以类似微博式的150字简短语言来每天更新一条WPF和C#重要又容易被遗忘的知识.很希望能够分享给大家. 本系列我不仅会翻译他的每一个tip,也会加入自己开发之中的看法和见解.本系列我希望自己也能和他一样坚持下来,每天的进步才能

在正文开始之前需要介绍一个人:Sean Sexton. 来自明尼苏达双城的软件工程师.最为出色的是他维护了两个博客:2,000ThingsYou Should Know About C# 和 2,000 Things You Should Know About WPF .他以类似微博式的150字简短语言来每天更新一条WPF和C#重要又容易被遗忘的知识.很希望能够分享给大家. 本系列我不仅会翻译他的每一个tip,也会加入自己开发之中的看法和见解.本系列我希望自己也能和他一样坚持下来,每天的进步才能

在正文开始之前需要介绍一个人:Sean Sexton. 来自明尼苏达双城的软件工程师.最为出色的是他维护了两个博客:2,000ThingsYou Should Know About C# 和 2,000 Things You Should Know About WPF .他以类似微博式的150字简短语言来每天更新一条WPF和C#重要又容易被遗忘的知识.很希望能够分享给大家. 本系列我不仅会翻译他的每一个tip,也会加入自己开发之中的看法和见解.本系列我希望自己也能和他一样坚持下来,每天的进步才能