索引 1.统计fasta.fa和fastq文件的长度,统计fastq的reads个数,单个reads长度,reads总长度:统计fasta文件中contig的个数,列出名称,单条的长度,以及总长度. 2.1局部组装:创建目录,将比对好的reads按100k为单位,用samtools切,并用awk工具提起reads,分别存放在对应文件夹内 2.2局部组装:用得到的reads_name,去原始的下机reads里提取reads序列 2.3局部组装:使用canu/soapdenovo按窗口组装 基本套路

package com.demo.blog; import java.io.DataOutputStream;import java.io.File;import java.io.FileOutputStream;import java.io.IOException; import com.jfinal.aop.Before;import com.jfinal.core.Controller; /** * BlogController * 所有 sql 与业务逻辑写在 Model 或 Servi

下面利用一个python的实例程序,来学习python.这个程序的目的就是分析出所有MP3文件的Tag信息并输出. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67

转自 https://blog.csdn.net/secondjanuary/article/details/9206151 文件说明: /ect/profile 此文件为系统的每个用户设置环境信息,当用户第一次登录时,该文件被执行.并从/etc/profile.d目录的配置文件中搜集shell的设置. /etc/bashrc 为每一个运行bash shell的用户执行此文件.当bash shell被打开时,该文件被读取. ~/.bash_profile 每个用户都可使用该文件输入专用于自己使用

问题现象: nginx配置反向代理后,网页可以正常访问,但是页面上的js css文件无法加载,页面样式乱了. (1)nginx配置如下: (2)域名访问:js css文件无法加载: (3)IP访问:js css文件可以正常加载: 解决方法: nginx配置文件中,增加如下配置: location ~ .*\.(js|css)$ { proxy_pass http://127.0.0.1:8866; } 原因分析: 反向代理的路径下找不到文件,需要单独指定js css文件的访问路径.

当debug为true的时候,ALLOWED_HOSTS是跳过不管用的.所以这里需要将debug关掉,令debug=false,ALLOWED_HOSTS=[ '*' ]表示所有的主机都可以访问 开启django远程访问的命令是python manage.py runserver 0.0.0.0:8000,现在改为python manage.py runserver 0.0.0.0:8000 --insecure 即可. 参考链接:Django项目关闭debug模式后,静态文件无法加载的解决办法

故障现象:nginx做代理转发后,发现页面上的js css文件无法加载,页面样式乱了. 原因:没有配置静态资源 解决js css文件无法加载无法访问的问题 解决办法: 修改配置文件nginx.conf,在server字段中添加黄色标注部分 server { listen ; server_name test.com; #charset koi8-r; access_log logs/opc.access.log main; location / { proxy_pass http://opcse

开启内置服务器,由于项目中local_settings.py文件中的DEBUG=True,进行开发和调试一直没什么问题. 但是现在需要编写404,500等出错页面,在debug模式下出了错都会出现报错页面,无法转向到404或500页面,这时我将local_settings.py中的DEBUG设为false,这时候应该可以转向到404页面.实验证明确实如此,404和500页面都可以得到,但是出现了新的问题:css和js文件无法加载. 在网上找了找,很快就找到了问题的原因:Django框架仅在开发模

[怪毛匠子 整理] samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步:sort 一下 BAM 文件,得到map.sorted.bam system"samtools sort map.b/am map.sorted"; #第三步:创建一个关于bam的索引文件,我们得到一个map.sorted.b

今日遇见一个开超市的朋友,真没想到在高校开超市一个月可以达到月净利润50K,相比起我们程序员的工资,真是不可同日而语,这个世道啊,真是做程序员不如经商开超市, 我们高科技的从业者,真是造原子弹不如卖茶叶蛋. 请见代码详细注释 //  修复涉及后视列表的Win2K兼容性 //  Fixes Win2K compatibility regarding lookaside lists. // #ifndef _WIN2K_COMPAT_SLIST_USAGE // Add content(增加内容)

最近接触的数据都是靶向测序,或者全外测序的数据.对数据的覆盖深度及靶向捕获效率的评估成为了数据质量监控中必不可少的一环. 以前都是用samtools depth 算出单碱基的深度后,用perl来进行深度及捕获效率的计算.今天无意中看到了bamdst(https://github.com/shiquan/bamdst)这个软件,用起来也很方便,参考GitHub,在此记录使用方法. 下载并安装:下载安装包并解压后, cd ./bamdst-master make 安装好后,需要准备.bed文件及.b

开发中会经常涉及到文件上传的需求,根据业务不同的需求,有不同的文件上传情况. 有简单的单文件上传,有多文件上传,因浏览器原生的文件上传样式及功能的支持度不算太高,很多时候我们会对样式进行美化,对功能进行完善. 本文根据一个例子,对多文件的上传样式做了一些简单的美化(其实也没怎么美化..),同时支持选择文件后自定义删除相关的文件,最后再上传 文章篇幅较长,先简单看看图示: 目录 文件上传基础 单文件上传 多文件上传 表单文件上传的美化 选中文件后的删除 界面的处理 脚本的处理 FileList F

当测序得到的fastq文件map到基因组之后,我们通常会得到一个sam或者bam为扩展名的文件.SAM的全称是sequence alignment/map format.而BAM就是SAM的二进制文件(B取自binary). 那么SAM文件的格式是什么样子的呢?如果你想真实地了解SAM文件,可以查看它的说明文档.SAM由头文件和map结果组成.头文件由一行行以@起始的注释构成.而map结果是类似下面的东西: HWI-ST1001:137:C12FPACXX:7:1115:14131:66670

原创内容,转载请注明出处! 为了方便资源管理和提升工作效率,常用的js和css文件的加载应该放在一个统一文件里面完成,也方便后续的资源维护.所以我用js写了以下方法,存放在“sourceController.js”文件内. /** * Created by MingChen on 2016/11/3. */ function sourceController() { this.root = ""; this.callfunc = null; // 回调函数 this.css = [];

类文件及类加载机制 标签(空格分隔): Java 本篇博客的重点是分析JVM是如何进行类的加载的,但同时我们会捎带着说一下Class类文件结构,以便对类加载机制有更深的理解. 类文件结构 平台无关性 众所周知,Java是平台无关的语言,那么是如何实现平台无关的呢? Java程序要在Java虚拟机(JVM)上运行,而JVM并不与包括Java在内的任何语言绑定,它只与"Class文件"这种特定的二进制文件格式所关联. 也就是说,任何语言,只要可以编译成符合某种特定规则的Class文件,都可

Javascript 异步加载详解 这篇文章很详细的介绍了HTML的页面处理以及资源文件的加载. 本文总结一下浏览器在 javascript 的加载方式. 关键词:异步加载(async loading),延迟加载(lazy loading),延迟执行(lazy execution),async 属性, defer 属性   一.同步加载与异步加载的形式   1. 同步加载 我们平时最常使用的就是这种同步加载形式: <script src="http://yourdomain.com/scr

很详细.很移动的Linux makefile 教程 内容如下: Makefile 介绍 Makefile 总述 书写规则 书写命令 使用变量 使用条件推断 使用函数 make 的运行 隐含规则 使用make更新函数库文件 后序 近期在学习Linux下的C编程,买了一本叫<Linux环境下的C编程指南>读到makefile就越看越迷糊,可能是我的理解能不行. 于是google到了以下这篇文章.通俗易懂.然后把它贴出来,方便学习. 后记,看完发现这篇文章和<Linux环境下的C编程指南>

上一节中用sencha工具自动创建了一个项目,并且可以在浏览器中查看.现在我们来看看js类加载过程.如下图所示: 1､首先:浏览器中输入 localhost:1841 ,调用 index.html; <!DOCTYPE HTML> <html> <head> <meta charset="UTF-8"> <title>app</title> <!-- The line below must be kept i

WeTest 导读 此文总结了笔者在Web静态资源方面的一些优化经验. 一.如何优化 用户在访问网页时, 最直观的感受就是页面内容出来的速度,我们要做的优化工作, 也主要是为了这个目标.那么为了提高页面加载(或者渲染)速度呢?一般来说有三个方面: 1.代码逻辑:优秀的代码逻辑结构可以有效减少渲染页面使用的内存和速度(比如虚拟DOM),此方面不在本文讨论范围内. 2.SSR服务器渲染,也就是所谓的"直出".将首屏所有内容在服务器端渲染成html静态代码后,直接输出给浏览器,可以有效加快用

轮询判断加载进度 img的加载完成有onload方法,一直不知道该怎么判断swf文件是否加载完毕了? 在应用中使用了轮询判断加载进度值PercentLoaded是否达到100,经测试,可以达到效果. //轮询判断swf是否加载完成 (function () { var flash = flashObject;//flashObject的对象 that.intervalId = setInterval(function () { try { console.log(flash.PercentLoa

一.组件介绍 Spire.XLS是E-iceblue开发的一套基于企业级的专业Office文档处理的组件之一,全称Spire.Office for .NET.旗下有Spire.Doc,Spire XLS,Spire.PDF,Spire.BarCode等多款专业组件,为各种Office文档在程序处理上提供了很大的方便,官方为各种功能提供了大量的在线api,简化了使用组件的难度.组件使用时不需要本地Office组件的支持.Spire.Office是一款企业级组件,它提供了收费版本和免费版本两种级别,