本文首发于“生信补给站”:https://mp.weixin.qq.com/s/lpkWwrLNtkLH8QA75X5STw 生存分析作为分析疾病/癌症预后的出镜频率超高的分析手段,而其结果展示的KM曲线也必须拥有姓名和颜值! 生存分析相关推文: 生存分析和KM曲线:R|生存分析(1) 分析结果一键输出:R|生存分析-结果整理 时间依赖生存分析:R|timeROC-分析 一 数据和R包 为方便,使用内置lung数据集 #载入所需的R包library("survival")library

转载:https://www.jianshu.com/p/d46cf6934a2f R语言基本绘图函数中可以利用par()以及layout()来进行图形排列,但是这两个函数对于ggplot图则不太适用,本文主要讲解如何对多ggplot图形多页面进行排列.主要讲解如何利用包gridExtra.cowplot以及ggpubr中的函数进行图形排列. 绘制图形 #load packages library(gridExtra) library(cowplot) library(ggpubr) #data

1.生存曲线 基础包survival+扩展包survminer. survival包内置肺癌数据集lung. library(survival) library(survminer) str(lung) #拟合模型 fit <- survfit(Surv(time,status)~sex,data=lung) #绘制生存曲线 ggsurvplot(fit, pval = TRUE, #添加log rank检验的p值 conf.int = TRUE, #添加置信区间 risk.table = TR

初学Python,大家应该都是用Python自带的IDLE了,我们可以让他颜值高一些,这样敲出的代码就赏心悦目,比如像下面这样:   我们首先要找到名为config-highlight.cfg的文件,文件的路径:在Win 7/win8/win10下路径为:C:\Users\<用户名>\.idlerc\ 对于Windows可以直接打开开始运行(win+R键)   %USERPROFILE%\.idlerc\ 找到这个名叫config-highlight.cfg文件后,接下来就需要编辑它了,如果找

简单plot()/legend/XY轴范围axis 除了坐标轴信息外还可以添加其它的信息,如所画曲线的信息等:测试代码如下 x=0:pi/20:2*pi; y1=sin(x); y2=cos(x); plot(x,y1,x,y2); grid on xlabel('变量 X') ylabel('变量 Y1 & Y2') title('正弦余弦波形')     %添加图像标题 text(1.5,0.3,'cos(x)')    %将cosx这个注解加到坐标中的某个位置 gtext('sin(x)'

2.横坐标为字符串的代码实例 cell={‘PLS’,’SVM’,’RF’,’NNET’,’NB’,’PLR’,’C5.0′,’PDA’,’KNN’,’GLM’,’BCT’};%分类方法yData=[7.78 7.16 7.75 9.06 1.94 5.47 6.19 3.44 6.38 1.81 9.03];%mean rank值n=size(cell,2);x=1:1:n;plot(x,yData,’k-‘,x,yData,’rs’);ylabel(‘mean rank’);xlabel(‘

最近在看<Python数据分析>这本书,而自己写代码一直用的是Pycharm,在练习的时候就碰到了plot()绘图不能显示出来的问题.网上翻了一下找到知乎上一篇回答,试了一下好像不行,而且答住提供的“from pylab import *”的方法也不太符合编程规范,最后在Stackoverflow找到了想要的答案,特在此分析一下给大家: 以下是有问题的代码,不能绘图成功: import pandas as pd from numpy import * import matplotlib.pyp

[转载请注明出处]http://www.cnblogs.com/mashiqi 2016/03/28 % 调整figure的位置scrsz = get(0,'ScreenSize'); % 这个命令是得到当前屏幕的尺寸,下一条语句可以控制新的figure出现在当前屏幕的什么地方.figure有多大figure1 = figure('Position',[scrsz(3)*03/40 scrsz(4)/3 scrsz(4)*1.8/5 scrsz(4)*1.8/5]); % rect = [lef

1.在linux中安装好R 2.准备好画曼哈顿图的R脚本即manhattan.r,manhattan.r内容如下: #!/usr/bin/Rscript #example : Rscript plot_manhatom.r XXX.assoc XXX.pdf argv <- commandArgs() #define the function to plot the manhatton and quantitle-quantitle plot plot_manhatton<-function(

在coursera看机器学习课程的时候用到Octave来做数据处理,但是装了之后用plot画图时就会报错: set terminal aqua enhanced title "Figure 1" size 560 420 font "*,6" dashlength 1 ^ line 0: unknown or ambiguous terminal type; type just 'set terminal' for a list 在plot之前需要一句setenv(

y         黄色           ·             点线      m         粉红           ○             圈线      c         亮蓝           ×             ×线      r         大红           +             +字线       g         绿色           -             实线      b         蓝色           

http://stackoverflow.com/questions/6564561/gnuplot-conditional-plotting-plot-col-acol-b-if-col-c-x How can I do this in gnuplot: plot "test.csv" using 1:2 if value_in_column_3 == 80.0 It should only select those rows where column 3 == 80.0 and i

http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=5024 网络赛 Wang Xifeng's Little Plot Time Limit: 2000/1000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 65536/65536 K (Java/Others)Total Submission(s): 239    Accepted Submission(s): 156 Problem Description <Dream of the

Example import matplotlib.pyplot as plt import plotly.plotly as py # Learn about API authentication here: https://plot.ly/python/getting-started # Find your api_key here: https://plot.ly/settings/api y = [3, 10, 7, 5, 3, 4.5, 6, 8.1] N = len(y) x = r

plot a critical difference diagram , MATLAB code 建立criticaldifference函数 function cd = criticaldifference(s,labels,alpha) % % CRITICALDIFFERNCE - plot a critical difference diagram % % CRITICALDIFFERENCE(S,LABELS) produces a critical difference diagra

Q-Q图主要可以用来回答这些问题: 两组数据是否来自同一分布 PS:当然也可以用KS检验,利用python中scipy.stats.ks_2samp函数可以获得差值KS statistic和P值从而实现判断. 两组数据的尺度范围是否一致 两组数据是否有类似的分布形状 前面两个问题可以用样本数据集在Q-Q图上的点与参考线的距离判断:而后者则是用点的拟合线的斜率判断. 用Q-Q图来分析分布的好处都有啥?(谁说对了就给他) 两组数据集的大小可以不同 可以回答上面的后两个问题,这是更深入的数据分布层面的

转发自:http://blog.csdn.net/laoyaotask/article/details/22117745?utm_source=tuicool python matplotlib plot 数据中的中文无法正常显示的解决办法 在学习<NLP with Ptyhon>一中的过程中,总想用中文语料进行试验,结果在matplotlib.plot生成的统计图表中,中文总是无法正常显示.在网上也找了些资料,说是在程序中指定字体文件,不过那样的话需要对plot进行很多设置,而且都是说的设置

function fig = SetDrawParam() %.获得屏幕尺寸 figpos = , 'ScreenSize');%获得屏幕尺寸,单位像素 %.设置坐标系在画布中的位置,针对不同尺寸或不同分辨的屏幕需要动态调整才能达到预期的效果 axex = ;%坐标系原点在画布中的横坐标,单位像素 axey = ;%坐标系原点在画布中的纵坐标,单位像素 axew = ;%坐标系的宽度,单位像素 axeh = ;%坐标系的高度,单位像素 %.设置纸张在画布中的位置,需要坐标系位置确定的情况才能确定

功能 二维曲线绘图 语法 plot(Y) plot(X1,Y1,...) plot(X1,Y1,LineSpec,...) plot(...,'PropertyName',PropertyValue,...) plot(axes_handle,...) h = plot(...) hlines = plot('v6',...) 描述 plot(Y)如果Y是m×n的数组,以1:m为X横坐标,Y中的每一列元素为Y坐标,绘制n条曲线:如果Y是n×1或者1×n的向量,则以1:n为横坐标,Y为坐标表绘制1

plot中画线的颜色通常是八种: 标记符    颜色r          红g          绿b          蓝c          蓝绿m          紫红y          黄k          黑w          白 但是线的颜色是由红绿蓝(RGB)三原色组成的,通过设定三原色的权重可以改变线的颜色,命令如下(x为横坐标,y为纵坐标): color的域值为0—1 plot(x,y,'Color',[1 0 0]);代表红色 plot(x,y,'Color',[0