对于pca , nmds, pcoa 这些排序分析来说,我们可以从图中看出样本的排列规则,比如分成了几组. 为例样本分组更加的直观,我们可以根据实验设计时的样本分组情况,对属于同一个group的样本添加1个椭圆或者其他多边形. 新版本的ggplot2 中提供了stat_ellipse 这个stat, 可以方便的实现上面的效果. 代码示例: ggplot(faithful, aes(waiting, eruptions, color = eruptions > 3)) + geom_point()