核心程序调用 Primer3_core,基本用法: primer3_core [ -format_output ] [ -default_version=1|-default_version=2 ] [ -io_version=3|-io_version=4 ] [ -p3_settings_file= ] [ -echo_settings_file ] [ -strict_tags ] [ -output= ] [ -error= ] [ input_file ]   参数简析: *-form

如何实现批量设计url? 1.创建Django项目 2.新建app01 和 app02 3.在models.py中创建模型 4.在settings.py中完成数据库配置.app配置等 5.数据库迁移 6.在urls.py中配置路径: from django.contrib import admin from django.urls import path, include from django.conf.urls import url from django.shortcuts import

转载:http://fhqdddddd.blog.163.com/blog/static/1869915420124131096557/ MISA工具提供批量识别和定位简单重复序列(SSR),EST序列或是基因组序列都可以.另外,还提供一个与批量设计引物Primer3的接口工具,通过这个工具,可以把MISA识别出来的SSR,转为Primer3需要的格式,从而方便批量设计引物. 网址:http://pgrc.ipk-gatersleben.de/misa/ 下面分别介绍一下几个工具(.pl是per

qRT-PCR是指先由RNA进行反转录生成cDNA,然后以cDNA为模板进行检测,检测的是该cDNA的含量,而cDNA由特定的RNA逆转录而来,所以间接地检测了RNA的含量. 基因表达: 转录:DNA到RNA 翻译:RNA到氨基酸.蛋白 一般认为RNA, mRNA的量和最后的蛋白量一致「不考虑转录后调控」: 当然目前绝大数研究基因表达的都是qPCR和WB一起来. 基因表达水平一定意义上就是转录水平,转录出来的RNA经反转录成cDNA,荧光定量PCR时经多次复制扩增,使得其含量到达一定值, 所以复

SNP(单核苷酸多态性)准确性的验证,你造吗? [2016-12-12]       SNP(全称Single Nucleotide Polymorphisms)即单核苷酸多态性,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性,包括单个碱基的转换.颠换等.SNP定位分类:可分为基因编码区.基因周边以及基因间SNP等三类:SNP位置区域包括UTR区.编码区的外显子或内含子区 .可变剪切位点等等. SNP是人类可遗传变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上,所以SNP的应用范

DNA甲基化检测服务 DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5'-端的胞嘧啶转变为5'-甲基胞嘧啶.DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达.这种DNA修饰方在不改变基因序列前提下实现对基因表达的调控.脊椎动物DNA的甲基化状态与生长发育调控密切相关,比如在肿瘤发生时,抑癌基因CpG岛以外的CpG序列非甲基化程度增加, CpG岛中的CpG则呈高度甲基化状态,导致抑癌基因

SNP/单核苷酸多态性分析 SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态.一般来说,一个SNP位点只有两种等位基因,因此又叫双等位基因.SNP在人类基因组中的发生频率比较高,大约平均每1000个碱基中就有一个多态位点.有些SNP位点还会影响基因的功能,导致生物性状改变甚至致病.单核苷酸多态性是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据,因此被广泛用于群体遗传学研究(如生物的起源.进化及迁移等方面)和疾病相关基因

微信公众号:生物信息学起步如果觉得对你有帮助,欢迎关注/转发/分享[1] 内容目录 1.目的2.实验数据2.1 候选增强子识别2.2 转基因小鼠分析2.3 注释3.搜索数据库3.1 概括3.2 高级搜索3.3 搜索结果3.4 数据集页面4. Gallery5. 教程6. 试剂和胚胎可用性原文链接 1.目的 该项目的目的是鉴定人和小鼠基因组中的远距离转录增强子,首先通过各种计算和实验分析来完成鉴定推定的增强子元件,然后在转基因小鼠测定中进行测试以验证其体内功能并确定其活性模式. 2.实验数据 2.

前言 写了多年的LabVIEW程序,你是否面临这样的问题 总是在做一些重复的工作,感觉很没有意思: 总在不停的写代码,做类似的控件,实现相同的功能,丝毫没有成就感: 总在天加班,没有时间去提高自己; 你也知道简单的重复并不能带来效率的提高,却不知道走向何方,无奈而又焦急着? 小黑今天带你聊一聊LabVIEW吸星大法,让你在工作中越来越有效率,体会一切皆可掌控的妙感~ 记住,我们的口号是 : 告别重复造车,你的就是我的,万物皆为我所用~ 引言 经过了前两篇的介绍,相信接触LabVIEW你已经了解一

问题描述: 通过WebServer将监控数据入库到Hbase,在入库之前需要将指标与ip的列表更新到缓存中,以便前台页面随时选择查看.前两天上了一些新用户导致负载增加,逐渐发现某些用户的监控场景出现丢数据的情况,估计Tps要在1w以上.丢数据会导致前段曲线毛刺增加,体验极差,所以优化WebServer的接收程序需要立马执行. 解决过程: 查看GC,YGC频繁,但FGC基本很少发生,所以丢数据应该不是GC停顿导致的.既然是加了量导致,那么应该跟处理的性能有关.在看一遍代码,看出了问题.首先写入模块

功能分类 功能描述 一级 二级 关系 调度控制 作业依赖关系调度 作业依赖关系调度是调度最基本的功能,指作业间具有顺序的运行,比如:a.b.c三个作业,只有当a完成后才运行b,b完成才能运行c 作业并行调度 与依赖关系对应,同样是调度的基本功能,指作业间运行不存在关系,可同时运行. 作业间互斥调度 互斥调度,指作业间不能同时运行,具有相互排斥性.比如 AB两个作业,当A运行时, B就不能运行:当B作业运行A就不能同时运行. 容错策略 错误自动重做 在一个作业流中,可以对相应作业设置重做次数.在自

一.circRNA序列提取 环状RNA (circRNA)是一类不具有 5' 末端帽子和 3' 末端 poly(A)尾巴.并以共价键形成环形结构的非编码 RNA 分子. 环状RNA (circRNA) 是区别于传统线性 RNA 的一类新型 RNA,大量存在于真核转录组中且表达具有时空特异性.在调控基因转录.作为疾病诊断marker等方面具有重要的研究和临床意义. 在预测circRNA时,都是检测breakpoint 处的reads 数,最后给出的环状RNA的ID 都是诸如 chr14:10699

使用的工具:NumPy和Matplotlib NumPy是全书最基础的Python编程库.除了提供一些高级的数学运算机制以外,还具备非常高效的向量和矩阵运算功能.这些对于机器学习的计算任务是尤为重要的.因为不论是数据的特征表示也好,还是参数的批量设计也好,都离不开更加快捷的矩阵和向量计算.而NumPy更加突出的是它内部独到的设计,使得处理这些矩阵和向量计算比起一般程序员自行编写,甚至是Python自带程序库的运行效率都要高出许多. Matplotlib是一款Python编程环境下免费试用的绘图工

在预测circRNA时,都是检测breakpoint 处的reads 数,最后给出的环状RNA的ID 都是诸如 chr14:106994222-107183708 这样的形式,给出了起始和终止位置: 对于某一个基因来说,其可能产生的circRNA的类型是多样的,以下图为例进行说明 1) 由单个外显子组成的环状RNA, 比如 2)有多个外显子组成的环状RNA, 比如 以上的两种circRNA在序列提取时都非常容易,只需要将circRNA的起始和终止位置能够和某些外显子正好对应上,那么就可以确定其序

最近被刷屏应该就是世界杯.世界杯和世界杯了... 进行了到第七天的球迷们,你们还好么 私房钱还剩下多少?上班有没有请假迟到? 哎,中国的小龙虾都去俄罗斯了,就国足队员没去… 满屏而来的不仅是手机朋友圈,微博动态,还有超市促销,总之你能看到的或者看不到的一切... 只要与世界杯沾边的似乎.好像都是人们津津乐道的 女球迷们更注重什么样的妆容更能凸显世界杯,我很关注的好伐,已画好妆容发胖圈了 死忠党说,看球我是认真的,不懂的来问我啊 陪看团表示四年才一次的表演,虽然我是个不懂足球的女生,但也要假装很懂

盼呀盼,望穿秋水~盼呀盼,何时降价~ 6.4开始,CDR X6全民狂欢618放价活动全面开启 力度之大,范围之广,时间之久,价格之低,都是前所未有的 不负众望,这个618,CDR真的做到一降到底,没有最低,只有更低,这次可谓是低到尘埃,让人不接招都说不过去,打的破解无处可逃... 正版都一千多了,还要受你破解威胁么,这个亏,老子吃过了(此处设计人员感触颇深) 此次618降价活动旨在让每一个设计人员包括图文爱好者都能够拥有一套,自己的,正版的,终身的,不会崩溃的软件. 都说艺术生是最耗钱的,有门手

明人不说暗话,我.要.来.个.小.资.讯. CDR X6打了3折,再送魔镜插件,是真的么?   先来说说CorelDRAW,CorelDRAW众所周知,软件的确不便宜啊,对于个人来说,相当于一个高配苹果X啊,但是我说的那是新版本.对于X6来说还是占有大大优势的,首先版本够经典,其次功能够全面,操作够流畅,兼容够稳定,再有价格够低啊,怎么样说到痛点了吧,天下商品,低价全给破,然后就是产出比,你说现在一个设计师怎么着也比我挣得多啊(此处留有遐想空间,看透不说透)照顾大多数的个体设计师,所以本次的活动

CorelDRAW是迄今最具创意的图形设计程序,并获得所有行业的公认的知名工具.在刚刚结束的CorelDRAW X6限量活动之后,CorelDRAW官方继续加推800套CorelDRAW X6满足用户需求.本次加推活动,同新春活动一样,仅限于图文工作室.个体用户购买.于此用时,这次还推出CorelDRAW X6+PhotoZoom Pro 7组合套餐.两款知名产品联合,让您的图片制作变得更简单.更精致! 活动内容: ① CorelDRAW X6+赠送魔镜专业批量设计插件2799元 ② Corel

文章版权由作者李晓晖和博客园共有,若转载请于明显处标明出处:http://www.cnblogs.com/naaoveGIS/. 1.背景 在制作整体的开源工具箱产品中,数据入库是一个重要的环节.虽然PostGIS提供了数据入库界面化操作,但是毕竟此工具无法集成至我方工具箱中,并且该工具界面.操作都不是很理想,也无法定制化完成一些具体需求.所以,自制一个shp入库工具还是比较有必要的. 2.思路 2.1  shp导入思路 Shp导入至数据库中,无论是Postgresql.mysql.oracle

大致花了一个月时间,利用各种空闲时间,将这个客户端实现了,在这里主要是想记录下,设计的大体思路以及实现过程中遇到的坑...... 这个项目的github地址:https://github.com/wzpziyi1/GroupPurchase 主要实现的功能,用UICollectionViewController展示团购数据,根据拼音进行检索并展示数据,离线缓存团购数据,浏览记录与收藏记录的批量删除,友盟分享的集成,利用UIView+AutoLayout写布局,实现地图定位.自定义大头针等 整个项