前言   处理vcf文件的时候,需要多种切割,正则匹配,如果要自己写其实会比较麻烦,并且每次还得根据vcf文件格式或者需要读取的值不同要修改相应的代码.因此很多人会选择一些python的vcf的库,但是首先你得安装这个库, 并且有一些库它固定了能够读的内容,如果你的vcf的信息不在它固定的里面,就读不出来.比如最近我想读一个样本的AF,但是它放在最后样本的GT那列,不在INFO那一列,有一些库竟然无能为力.   因此我写了这个通用的读vcf的类,直接复制粘贴这部分代码就可以方便的用这个类进行vc

Python读取txt文件,有两种方式: (1)逐行读取 data=open("data.txt") line=data.readline() while line: print line line=data.readline() (2)一次全部读入内存 data=open("data.txt") for line in data.readlines(): print line

近期看到好多使用Yaml文件做为配置文件或者数据文件的工程,随即也研究了下,发现Yaml有几个优点:可读性好.和脚本语言的交互性好(确实非常好).使用实现语言的数据类型.有一个一致的数据模型.易于实现. 既然有这么多好处,为什么不用呢,随后开始研究在Python中怎么读取Yaml文件,下面我们来看下: 1.首先需要下载Python的yaml库PyYAML,下载地址:http://pyyaml.org/,安装过程就省略...... 2.建立一个.py文件 3.import yaml 4.f = o

python 读取中文文件后,作为参数使用,经常会遇到乱码或者报错asii错误等. 我们需要对中文进行decode('gbk') 如我有一个data.txt文件有如下内容: 百度 谷歌 现在想读取文件中内容构建查询语句代码如下: f=open('data.txt','r') for i in f.readlines(): data_line=i.strip() data=data_line.decode("gbk") print "this is %s"%data

近日在做项目时,意外听说有一种SQLite的数据库,相比自己之前使用的SQL Service甚是轻便,在对数据完整性.并发性要求不高的场景下可以尝试! 1.SQLite简介: SQLite是一个进程内的库,实现了自给自足的.无服务器的.零配置的.事务性的 SQL 数据库引擎.它的设计目标是嵌入式的,而且目前已经在很多嵌入式产品中使用了它(如安卓系统),它占用资源非常的低,在嵌入式设备中,可能只需要几百K的内存就够了.它能够支持Windows/Linux/Unix等等主流的操作系统,同时能够跟很多

Python读取xlsx文件 脚本如下: from openpyxl import load_workbook workbook = load_workbook(u'/tmp/test.xlsx') #找到需要xlsx文件的位置 booksheet = workbook.active #获取当前活跃的sheet,默认是第一个sheet #如果想获取别的sheet页采取下面这种方式,先获取所有sheet页名,在通过指定那一页. # sheets = workbook.get_sheet_names

aa Python 读取WAV文件并绘制波形图 ffmpeg -i test_pcm_mulaw.wav -f wav -codec:a pcm_s16le -ar 8000 -ac 1 out.wav yingc@yingc:~/media/audio$ ffprobe out.wav ffprobe version 2.2.4 Copyright (c) 2007-2014 the FFmpeg developers built on Apr 13 2016 08:42:24 with gc

在做APP测试时,通常需要把参数存到一个字典变量中,这时可以将参数写入yaml文件中,再读取出来. 新建yaml文件(android_caps.yaml),文件内容为: platformName: Android platformVersion: '5.1' deviceName: Android Emulator appPackage: com.xx.xx appActivity: com.xx.xx.activity.WelcomeActivity python读取yaml文件: impor

python读取bin文件并下发串口   # coding:utf-8import time, serialfrom struct import *import binascii file = open('E:\\1.bin', 'rb')i = 0while 1: c = file.read(1) # 将字节转换成16进制: ssss = str(binascii.b2a_hex(c))[2:-1] print(str(binascii.b2a_hex(c))[2:-1]) if not c:

由于最近老是用到python读取excel文件,所以特意记录一下python读取excel文件的大体框架. 库:xlrd(读),直接pip安装即可.想要写excel文件的话,安装xlwd库即可,也是直接pip安装就可以啦~ 下面直接贴代码了: import xlrd #读取excel文件内容(path为文件路径) def read_excel(path): # 获取所有sheet workbook = xlrd.open_workbook(path) sheet_names = workbook

Python读取CSV文件,报错:UnicodeDecodeError: 'gbk' codec can't decode byte 0xa7 in position 727: illegal multibyte sequence 解决办法: 在语句open(sFileName,newline='')中,增加encoding='UTF-8',如下: open(sFileName,newline='',encoding='UTF-8')

Python读取大文件(GB) - CSDN博客 https://blog.csdn.net/shudaqi2010/article/details/54017766

python读取单个文件,参考<笨方法学python>的第15节. 运行方式是采用:python python文件名 要读取的文件名 代码中 script, filename = argv agrv是获取参数的,要理解sys.argv的用法. 读文件的代码示例: from sys import argv script, filename = argv txt = open(filename) print("Here's your file %r:" % filename)

python读取yaml文件使用,有两种方式: 1.使用ddt读取 2,使用方法读取ddt的内容,在使用方法中进行调用 1.使用ddt读取 @ddt.ddt class loginTestPage(unittest.TestCase): @ddt.file_data(path) @ddt.unpack def testlogin(self,**kwargs): u''' "输入邮件账号.用户名.密码符合要求 勾选同意协议" 1.注册成功,跳转到注册成功页面 " 1.验证URL

这是一道著名的 Python 面试题,考察的问题是,Python 读取大文件和一般规模的文件时的区别,也即哪些接口不适合读取大文件. 1. read() 接口的问题 f =open(filename, 'rb') f.read() 我们来读取 1 个 nginx 的日至文件,规模为 3Gb 大小.read() 方法执行的操作,是一次性全部读入内存,显然会造成: MemoryError ... 也即会发生内存溢出. 2. 解决方案:转换接口 (1)readlines() :读取全部的行,构成一个

php读取大文件的方法   <?php function readFile($file) { # 打开文件 $handle = fopen($file, 'rb'); while (feof($handle) === false) { # 重点 每次读取 1024 个字节 yield fread($handle, 1024); } fclose($handle); } foreach (readFile("./test.zip") as $n => $line) { # 把

caffemodel是二进制的protobuf文件,利用protobuf的python接口可以读取它,解析出需要的内容 不少算法都是用预训练模型在自己数据上微调,即加载"caffemodel"作为网络初始参数取值,然后在此基础上更新.使用方式往往是:同时给定solver的prototxt文件,以及caffemodel权值文件,然后从solver创建网络,并从caffemodel读取网络权值的初值.能否不加载solver的prototxt,只加载caffemodel并看看它里面都有什么东

关于python读取xml文章很多,但大多文章都是贴一个xml文件,然后再贴个处理文件的代码.这样并不利于初学者的学习,希望这篇文章可以更通俗易懂的教如何使用python 来读取xml 文件. 什么是xml? xml即可扩展标记语言,它可以用来标记数据.定义数据类型,是一种允许用户对自己的标记语言进行定义的源语言. abc.xml <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> <catalog> <max

朋友问我如何通过python把csv格式的文件另存为xls文件,自己想了想通过读取csv文件然后再保存到xls文件中即可,也许还有其他简单的方法,但这里也为了练习python语法及其他知识,所以采用了如下方法,这里做一记录,方便自己也希望对他人有所帮助. #coding:utf-8 #导入相应模块 import csv import xlwt #新建excel文件 myexcel = xlwt.Workbook() #新建sheet页 mysheet = myexcel.add_sheet("t

python读取EXCEL,利用 Google 搜索 Python Excel,点击第一条结果http://www.python-excel.org/ ,能够跨平台处理 Excel. 按照文档一步步去做,要安装 三个包: xlrd(用于读Excel): xlwt(用于写Excel): xlutils(处理Excel的工具箱) from xlrd import open_workbook import re #创建一个用于读取sheet的生成器,依次生成每行数据,row_count 用于指定读取多