前言   处理vcf文件的时候,需要多种切割,正则匹配,如果要自己写其实会比较麻烦,并且每次还得根据vcf文件格式或者需要读取的值不同要修改相应的代码.因此很多人会选择一些python的vcf的库,但是首先你得安装这个库, 并且有一些库它固定了能够读的内容,如果你的vcf的信息不在它固定的里面,就读不出来.比如最近我想读一个样本的AF,但是它放在最后样本的GT那列,不在INFO那一列,有一些库竟然无能为力.   因此我写了这个通用的读vcf的类,直接复制粘贴这部分代码就可以方便的用这个类进行vc

一.使用open打开文件后一定要记得调用文件对象的close()方法.比如可以用try/finally语句来确保最后能关闭文件. 二.需要导入import os 三.下面是逐行读取文件内容的三种方法: 1.第一种方法: f = open("foo.txt") # 返回一个文件对象 line = f.readline() # 调用文件的 readline()方法 while line: print line, # 后面跟 ',' 将忽略换行符 #print(line, end = '')

#!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # @Time : 2019/4/24 9:57 # @File : Excel读.py # @Software: PyCharm """ excle处理有三个层次:文件,sheet页,行和列 打开excle文件,获取对应sheet页,获取对应sheet页的行或列的数据 xlsx类型文件用openpysl库操作 xls类型文件用xlrd库读取,xlwt库写 ""&q

# -*- coding: utf-8 -*- # 测试文件名为: # text.txt # 测试文件内容为: # abcdefg # 每次操作后将文件复原 # r # 以只读方式打开文件,文件不可写 # 要打开的文件不存在时会报错 # 文件的指针将会放在文件的开头 # 这是默认模式 # # file = open('test.txt', 'r') # # FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'test.txt' # f

f = open("foo.txt") # 返回一个文件对象line = f.readline() # 调用文件的 readline()方法while line: print line, # 后面跟 ',' 将忽略换行符 # print(line, end = '') # 在 Python 3中使用 line = f.readline() f.close() 也可以写成以下更简洁的形式 for line in open("foo.txt"): print line,

更详细的文件按行读取操作可以参考:http://www.cnblogs.com/xuxn/archive/2011/07/27/read-a-file-with-python.html 一行一行得从文件读数据,显然比较慢:不过很省内存 带缓存的文件读取 readlines 速度最快 1. 最基本的读文件方法: ? # File: readline-example-1.py file = open("sample.txt") while 1: line = file.readline()

Txt中保存以些数据,这些数据中我们要逐行read line出来进行处理,约定第一个字符为"#"的数据表示已经处理. 一个办法是读取txt,新增另外一个已完成处理txt来保存完成的数据.这样进行对比.但我现在要的效果是在同一个Txt文本里面来标记处理过的数据. 这里面就用道理open方法的各种模式. 原理是这样的: 首先"r"模式打开txt,读取每一行的数据,判断是否已经'#'过, 有"#"说明已经发送过,so continue跳过, 没有&qu

方法一: 复制代码代码如下: f = open("foo.txt")             # 返回一个文件对象  line = f.readline()             # 调用文件的 readline()方法  while line:      print line,                 # 后面跟 ',' 将忽略换行符      # print(line, end = '') # 在 Python 3中使用      line = f.readline()

fileHandle = open ( 'G:/qqfile/1.txt','w' )fileHandle.write('abcd')#写文件 地址要用反斜杠fileHandle.close() fileHandle = open ( 'G:/qqfile/1.txt' )print (fileHandle.read() )fileHandle.close()#读文件

1.定时执行脚本 http://tech.it168.com/a2011/0707/1214/000001214830_all.shtml /sbin/service crond start //启动服务 /sbin/service crond stop //关闭服务 /sbin/service crond restart //重启服务 /sbin/service crond reload //重新载入配置 可以将这个服务在系统启动的时候也自动启动: 在/etc/rc.d/rc.local这个脚

逐行读取txt文件 path = r'D:\123456\1.txt'with open(path, 'r', encoding='utf-8') as f:    for line in f:         value = line[:-1] #去掉换行符         print(value)

写在前边 其实一直想入门python很久了,慕课网啊,菜鸟教程啊python的基础的知识被我翻了很多遍了,但是一直没有什么实践.刚好,这两天被别人一直安利一本小说<我可能修的是假仙>,还在连载中的,我等屌丝,打钱是不可能打钱的,只好先去网上找一下资源了,基本笔趣阁啊,什么的提供很多在线的资源给我们.好吧,就看这个就行了,可是看也看得不爽啊,,浏览器上下部分都被什么 美女荷官在线发牌,一夜不射提升半小时之类你懂的画面遮盖了,还经常误触,如果是在电脑上看,我们可以用ADBLOCK之类的广告插件屏蔽

python读写excel的方式有很多,不同的模块在读写的讲法上稍有区别: 用xlrd和xlwt进行excel读写: 用openpyxl进行excel读写: 用pandas进行excel读写: import xlrd from xlutils.copy import copy import xlwt #打开表格 book = xlrd.open_workbook('木牛流马测评一期.xlsx') #获取表单名 booknames=book.sheet_names() #打开表单,,有以下两种方式

1 xlrd第三方库 注意:xlrd较新版本不支持读xlsx表,需安装1.2.0版本(pip install xlrd==1.2.0)或使用其他库. xlrd库官方文档:https://xlrd.readthedocs.io/en/latest/ 2 xlrd基础演示 import xlrd # 获取工作䈬workbook对象 book = xlrd.open_workbook("Excel表.xlsx") print("Excel文件中sheet数量:{0}".f

代码: fileReadObj = open("input.txt") fileWriteObj = open("output.txt", 'w') fileLineText = fileReadObj.readline() while ('' != fileLineText): string = fileLineText fileWriteObj.write(string) fileLineText = fileReadObj.readline() fileRea

读取文件的三个方法:read().readline().readlines().均可接受一个变量用以限制每次读取的数据量,但通常不使用.本章目的是分析和总结三种读取方式的使用方法和特点. 一.read方法 特点是:读取整个文件,将文件内容放到一个字符串变量中. 劣势是:如果文件非常大,尤其是大于内存时,无法使用read()方法. file = open('兼职模特联系方式.txt', 'r') # 创建的这个文件,也是一个可迭代对象 try: text = file.read() # 结果为st

import java.io.BufferedReader; import java.io.File; import java.io.FileInputStream; import java.io.IOException; import java.io.InputStreamReader; import java.util.ArrayList; import java.util.List; public class HelloWord { public static void main(Stri

# -*- coding: <encoding name> -*- import io LIMIT = 150000 file_count = 0 url_list = [] with io.open('D:\DB_NEW_bak\DB_NEW_20171009_bak.sql','r',encoding='utf-16') as f: for line in f: url_list.append(line) if len(url_list) < LIMIT: continue file

https://www.cnblogs.com/kongzhagen/p/6295925.html import os name = [] with open('/media/hdc/xing/DeepLabV2/dataset/cityspace/gtFine/gtFine_color.txt') as file: for line in file: name_dir = line.strip().split('./')[1].split('/')[0] if name_dir in name