最近在上生物信息学原理,打算记录一些课上的作业.第一次作业:如题. 基本思路: 1.从GFF中读取CDS的起始终止位置以及正负链信息.GFF格式见http://blog.sina.com.cn/s/blog_8a4f556e0102yd3l.html. 2.利用起始/终止位置等信息从FNA文件中提取CDS序列.FNA格式见 http://boyun.sh.cn/bio/?p=1192. 3.利用CDS序列及密码子表得到FAA文件并输出. 注意:最需要注意的一点是:当GFF中CDS位于负链时,需要

#!/usr/bin/perl use strict; use warnings; ########input######## ];my $cut = &cut($gff);my %cut = %$cut; ],],]); #########main####### my %hash_2 = %{$cut{$gene_name}}; foreach my $key_2(keys %hash_2) { ][]+-;][]-+; print "$gene_name\t$key_2\t$arr[

最近发现了python版的MCScan,是个大宝藏.由于走了不少弯路,终于画出美图,赶紧记录下来. github地址 https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version) 软件安装 1 ## 安装lastal 2 网址:http://last.cbrc.jp 3 unzip last-1060.zip 4 cd last-1060 5 make 6 7 # 把scripts, src 添加到环境变量 8 9 ## jcvi

公众号:SAP Technical 本文作者:matinal 原文出处:http://www.cnblogs.com/SAPmatinal/ 原文链接:[ABAP CDS系列]ABAP CDS中的系统信息   前言部分 在ABAP语言中,我们习惯于系统字段,如sy-mandt,sy-uname,sy-langu以获取系统信息.对于日期和时间,我们使用sy-uzeit和sy-datum,或使用时间戳(GET TIME STAMP).ABAP CDS现在也提供了一些更方便的技巧. session变量

title: xpath提取多个标签下的text author: 青南 date: 2015-01-17 16:01:07 categories: [Python] tags: [xpath,Python,xml,scrapy] --- 本文首发在http://kingname.info 在写爬虫的时候,经常会使用xpath进行数据的提取,对于如下的代码: <div id="test1">大家好!</div> 使用xpath提取是非常方便的.假设网页的源代码在s

开博好久了,今天第一次发表技术文档,之前总是将一些好的事例保存在电脑,时间久了找起来也很麻烦,所以还是放在博客里进行归类比较方便,这样也能将自己在学习过程中的一些心得体会分享给大家,也能给需要的人一点帮助. 一个朋友需要我帮忙给写一个能够提取网页中Email地址的小程序,所以就用Java语言帮他做了一个,有不完善的地方还请大家谅解,并提出来,一起学习. 源代码详见附件!加压后将将readme.htm放在F:\\share\\readme.htm,也可自定义目录,自定义目录需要修改对应的代码文件路

gulp是前端开发过程中对代码进行构建的工具,是自动化项目的构建利器. browseriyf是模块化打包工具. 一般情况下,Browserify 会把所有的模块打包成单个文件.单个文件在大多数情况下是适用的,可以减少 HTTP 请求数量,提高性能.不过在其他一些情况下,打包的单个文件可能过大,使得页面的初始加载时间过长.这主要是因为单个文件中包含了全部的模块,其中的某些模块使用得很少,或是在页面初始加载的时候不需要,可以在需要的时候再加载.这个时候可以用 Browserify 的插件来创建不同的

模式识别课程的一次作业.其目标是对UCI的手写数字数据集进行识别,样本数量大约是1600个.图片大小为16x16.要求必须使用SVM作为二分类的分类器. 本文重点是如何使用卷积神经网络(CNN)来提取手写数字图片特征,主要想看如何提取特征的请直接看源代码部分的94行左右,只要对tensorflow有一点了解就可以看懂.在最后会有完整的源代码.处理后数据的分享链接.转载请保留原文链接,谢谢. UCI手写数字的数据集 源数据下载:http://oddmqitza.bkt.clouddn.com/ar

在vs里右击SharePoint项目,选择"部署",结果报错: Error occurred in deployment step 'Add Solution':Fail to extract the cab file in solution. 改用命令行部署,依然报错: Add-SPSolution:未能提取此解决方案中的cab文件. 原因: 出现此问题,多半是因为打包的项目中的文件的文件名中,有特殊的字符,比如:@,多个. 微软解释: 参考: https://msdn.micros

在python语言中,用丰富的函数库来从文件中提取数据,这篇博客讲解怎么从csv, xls文件中得到想要的数据. 点击下载数据文件http://seanlahman.com/files/database/lahman-csv_2015-01-24.zip 这个一个美国棒球比赛的统计数据解压文件夹,我们选取AwardsManagers.csv来练习 #-*- coding:utf-8 -*- import csv DIR = 'data/' fname = 'AwardsManagers.csv'

本文实例讲述了ASP.NET利用第三方类库Newtonsoft.Json提取多层嵌套json数据的方法,具体例子如下. 假设需要提取的json字符串如下: {"name":"lily","age":23,"addr":{"city":guangzhou,"province":guangdong}} 先引用命名空间: using Newtonsoft.Json; using Newtons

将非maven项目转换为maven项目,首要第一步就是提取原工程依赖jar里的pom.xml,拼成<dependency>节点 import java.io.File; import java.io.FileFilter; import java.io.IOException; import java.util.Enumeration; import java.util.Scanner; import java.util.zip.ZipEntry; import java.util.zip.Z

所有cs端工具集成了一个工具面板 -打开(IE) Map工具系列-01-Map代码生成工具说明 Map工具系列-02-数据迁移工具使用说明 Map工具系列-03-代码生成BySQl工具使用说明 Map工具系列-04-SQL合并执行工具 Map工具系列-05-添加业务参数工具 Map工具系列-06-销售营改增历史数据处理工具 Map工具系列-07-TFS变更集提取工具 Map工具系列-08-map控件查看器 Map工具系列-09-文件自动对比合并工具 more... 微信小程序之明源商城系列 1.

参考:http://www.jianshu.com/p/3bd06f8816d7 项目原理:   实验基于简单共现关系,编写 Python 代码从纯文本中提取出人物关系网络,并用Gephi 将生成的网络可视化.下面介绍共现网络的基本原理.(共现网络简单的英文介绍)   共现网络的基本原理:    实体间的共现是是一种基于统计信息的提取,关系密切的人物往往会在文中的多段连续出现,通过文中以出现的实体(人名),计算不同实体共同出现的比率和次数,设定一个阈值,大于该阈值认为实体间存在某种联系.   准

QQ:231469242 原创 单个PDF内容提取 # -*- coding: utf-8 -*- """ io.open() is the preferred, higher-level interface to file I/O. It wraps the OS-level file descriptor in an object that you can use to access the file in a Pythonic manner. os.open() is

转载请标明处: 作者:微微苏荷 本文地址:关于QImage提取单色通道方法(vector) 近日,用QT和mxnet结合做一个图像识别的demo.遇到需要把图片从QImage转为vector单色分离的格式的要求,用来识别时输入. 经实践,找到3种方法,分享给大家:需要注意的是,QImage的存储顺序是 BGRA(opencv也是这样反着的),不是正常口述RGBA. 另:mx_float  == float一. int image_size = width * height * channels;

很多时候第三方库或其他项目提供的库多数会以动态库的形式提供dll以及相应的lib导入库.头文件,不过也有的只是提供dll和头文件,或者也提供了def模块定义(用于导出函数)文件,此时若使用将不得不调用LoadLibrary以及GetProcAddress以获取一系列需要的函数,相对来说比较繁琐:多数人更喜欢使用引入库的方式. 此时需要通过提供的dll或者def文件来获取lib导入库文件,操作步骤如下: 1. 若只提供dll,则需通过dumpbin工具提取dll中导出的各个函数: dumpbin

在下一篇文章中,我还将介绍如何完善ecshop的mysql类,使用ecshop的数据库前缀 下载ecshop后,解压缩,进入目录upload/includes,复制里面的cls_mysql.php放进你自己的网站 比如我的目录结构 / /Classes /Classes/cls_mysql.php /Classes/connfig.php /index.php 在/Classes目录里新建connfig.php文件,代码如下 <?php header("Content-Type:text/

最近在研究如何给Unity游戏进行加密,让别人不能轻易破解你的apk包,不过网上的加密方法都是有对应的破解方法~_~!!结果加密方法没找到好的,逆向工程倒会了不少.今天就来讲解如何提取一个没做任何保护的apk包中的资源和代码. (1)打开apk包 首先,将你的apk包重命名为zip或者rar类型的文件,然后进行解压缩,如下: 重命名为,然后进行解压缩,得到如下的目录内容: 各个部分的说明如下表: assets Unity游戏里面的资源和代码 lib arm和x86需要的so文件 META-INF

数据量的大小由两个方面决定:行的宽度和数据行的数量,为了减少ETL运行的时间,可以从源数据的提取上做优化,从数据源的输入上控制数据的质量和大小,减少转换和IO. 一,减少行的宽度 1,只加载需要的数据列 在Data Flow中,源适配器允许选择加载的Table 或View,虽然有复选框,从而过滤掉不需要的数据列,但是,问题是,过滤过程发生Client,换句话说,所有的列从DB中被传递到SSIS 源适配器(产生大量的IO开销),然后在SSIS中删除选中额数据列.建议使用SQL Command,在s