本文首发于“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 连锁不平衡图,用来可视化不同SNP之间的连锁程度,前同事间俗称“倒三角”图. 本文使用自己的数据,因为安装R包后使用内置数据集运行出结果较容易,但是自己的数据就可能会有一些不大不小的“坑”,我替你们趟了... 一 载入R包 数据 数据为内置CEUData保存后,进行了“细微”的处理(去掉SNP碱基之间的“/”),这种基因型文件很常见: library("LDheatmap

解决方案有好几种: 网页版,无脑绘图,就是麻烦,没有写代码方便 极简版,gplots::venn 文艺版,venneuler,不好安装rJava,参见Y叔 酷炫版,VennDiagram 特别注意: 目前主流的韦恩图都只支持5个类别,多了不能使用韦恩图. UpSet某种程度上可以显示多于5个类别,但是结果不是很直观,不推荐. library(ComplexHeatmap) m = make_comb_mat(venn.list) UpSet(m) 1. 网页版的就不说了,非常简单,直接输入数据就

线图是由折线构成的图形,线图是把散点从左向右用直线连接起来而构成的图形,在以时间序列为x轴的线图中,可以看到数据增长的趋势. geom_line(mapping = NULL, data = NULL, stat = "identity", position = "identity", na.rm = FALSE, show.legend = NA, inherit.aes = TRUE, ...) 线图中的常用参数: group:线的分组 alpha:线的透明度

R语言中有很多现成的R包,可以绘制venn图,但是最多支持5组,当组别数大于5时,venn图即使能够画出来,看上去也非常复杂,不够直观: 在实际的数据分析中,组别大于5的情况还是经常遇到的,这是就可以考虑用花瓣图来进行数据的可视化 比如下面这个例子: 来源于该链接  https://www.researchgate.net/figure/235681265_fig3_The-pan-genome-of-Sinorhizobium-The-flower-plots-and-Venn-diagram

目录 一. 任务说明 二. 重点提示 三. 示例代码 四. 文字淹水效果的实现 五. 关于canvas抗锯齿 六. 小结 示例代码托管在:http://www.github.com/dashnowords/blogs 博客园地址:<大史住在大前端>原创博文目录 华为云社区地址:[你要的前端打怪升级指南] 一. 任务说明 使用原生canvasAPI绘制水球图,这将是一个非常有意思的挑战任务.水球图是一种常见的加载动画,属于扩展图形,在echarts中使用时需要下载扩展库(同为扩展库的还包括文字云

目录 一. 任务说明 二. 重点提示 三. 示例代码 示例代码托管在:http://www.github.com/dashnowords/blogs 博客园地址:<大史住在大前端>原创博文目录 华为云社区地址:[你要的前端打怪升级指南] 一. 任务说明 使用原生canvasAPI绘制雷达图.(截图以及数据来自于百度Echarts官方示例库[查看示例链接]). 二. 重点提示 雷达图绘制的看起来并不复杂,无非就是一些路径点的连线,其中的难点都在于一些细节. 坐标转换 为了避免在绘制过程中不断根据

微信小程序绘制分享图例子: demo下载地址:https://gitee.com/v-Xie/wxCanvasShar 大致代码会再以下说明 实际开发项目: 基础知识点: 了解canvas基础知识 wx.createCanvasContext()//微信小程序创建画布 wx.canvasToTempFilePath()//将画布canvas转为图片 wx.saveImageToPhotosAlbum() //微信小程序保存至相册 canvas绘制以及绘制过程中的坑:(请看后面的代码部分) 1.绘

Matplotlib是一个Python工具箱,用于科学计算的数据可视化.借助它,Python可以绘制如Matlab和Octave多种多样的数据图形.下面这篇文章主要介绍了python使用matplotlib如何绘制折线图的方法教程,需要的朋友可以参考借鉴. matplotlib简介 matplotlib 是python最著名的绘图库,它提供了一整套和matlab相似的命令API,十分适合交互式地行制图.而且也可以方便地将它作为绘图控件,嵌入GUI应用程序中. 它的文档相当完备,并且Gallery

流行病学的数据讲究“三间分布”,即人群分布.时间分布和空间分布.其中的“空间分布”最好是在地图上展示,才比较清楚.R软件集统计分析与高级绘图于大成,是最适合做这项工作了.关于地图的绘制过程,谢益辉.邱怡轩和陈丽云等人都早有文章讲述,开R地图中文教程之先河.由于目前指导毕业论文用到,因此研究了一下.本来因为网上教程很多,曾打消了写些文字的计划,但怡轩版主鼓励说“教程者众,整合者鲜”,所以才战胜拖延症,提起拙笔综述整合一下,并对DIY统计GIS地图提出了一点自己的想法. 1 地图GIS数据的来源与R

5.4 绘制数据图 参考视频: 5 - 4 - Plotting Data (10 min) 5.4.1 绘制曲线 1.画一个sin曲线 >> t = [:0.01:0.98]; >> y1 = sin( * pi * * t); >> plot(t,y1); 2.画一个cos曲线 >> y2 = cos( * pi * * t); >> plot(t,y2); 3.将两个曲线合并在一起 >> plot(t,y1); >>

1. Graphviz介绍 Graphviz是大名鼎鼎的贝尔实验室的几位牛人开发的一个画图工具. 它的理念和一般的“所见即所得”的画图工具不一样,是“所想即所得”. Graphviz提供了dot语言来编写绘图脚本.什么?!画个图也需要一个语言!! 不要急,dot语言是非常简单地,只要看了下面几个列子,就能使用了. mac 平台并没有 gvedit.app . 只能用Graphviz.app打开dot 格式的文件. 2. Graphviz的几个例子 下面的几个例子都来自于官方文档.详情请见:Gra

在Android中,当有绘制折线图的需求时.大多数人使用的AChartEngine,来进行折线图的绘制.AChartEngine图表引擎确实能够实现折线图的功能.除此之外,我们还能够使用andbase开发框架里面的图表模块.实现图标的绘制.前面文章介绍了使用andbase开发框架实现側滑栏效果.今天,我们学习怎样实现折线的绘制. 首先,我们还是看一下效果图 我们模拟的是一家公司12个月中,两项不同业务的销售额变化,能够看到,效果还是很不错的. 以下.我们開始介绍怎样使用andbase实现这个效果

一.绘制折线图 glutBitmapCharacter(GLUT_BITMAP_8_BY_13,label[j])函数可以绘制GLUT位图字符,第一个参数是GLUT中指定的特定字形集,第二个参数是要写入的单个字符: #include <glut.h> GLsizei windowWidth=600,windowHeight=600; GLubyte label[36]={'O','n','e', 'T','w','o', 'T','h','r', 'F','o','u', 'F','i','v

热图可以聚合大量的数据,并可以用一种渐进色来优雅地表现,可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低. 本文利用R语言 pheatmap 包从头开始绘制各种漂亮的热图.参数像积木,拼凑出你最喜欢的热图即可,如下图: 基因和样本都可以单独聚类,排序,聚类再分组,行列注释,配色调整,调整聚类线以及单元格的宽度和高度均可实现. 载入数据,R包 #R包library(pheatmap)# 构建测试数据 set.seed(1234)test = matrix(rnorm(200), 20, 10)test[1

本文首发于“生信补给站”微信公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w 更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号,给您干货. 上一篇简单的介绍了COX生存分析结果绘制森林图Forest plot(森林图) | Cox生存分析可视化,本文将介绍根据数据集合的基本信息以及点估计值(置信区间区间)的结果直接绘制森林图的方法. 其中点估计值(置信区间)的结果可以是COX也可以是logistic回归等其他方法的结果,适

[摘要] 用原生canvasAPI实现百度echarts 示例代码托管在:http://www.github.com/dashnowords/blogs 一. 任务说明 使用原生canvasAPI绘制水球图,这将是一个非常有意思的挑战任务.水球图是一种常见的加载动画,属于扩展图形,在echarts中使用时需要下载扩展库(同为扩展库的还包括文字云插件和地图插件,项目地址为https://github.com/ecomfe/echarts-liquidfill). 二. 重点提示 水球图的绘制有以下

[摘要] 用canvas原生API实现百度Echarts基本图表. 示例代码托管在:http://www.github.com/dashnowords/blogs 一. 任务说明 使用原生canvasAPI绘制雷达图.(截图以及数据来自于百度Echarts官方示例库[查看示例链接]). 二. 重点提示 雷达图绘制的看起来并不复杂,无非就是一些路径点的连线,其中的难点都在于一些细节. 坐标转换 为了避免在绘制过程中不断根据夹角来计算某个数据点的坐标,我们可以让坐标系先移动到绘图中心,然后在绘制过程

MATLAB实例:绘制折线图 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/ 条形图的绘制见:MATLAB实例:绘制条形图 用MATLAB将几组不同的数据展示在同一张图片中,并设置图例.横纵坐标范围与名称.重新自定义横坐标刻度,并保存图片到指定位置. 1. demo_1.m clear clc x=1:10; y_1=[0.7 0.7 0.75 0.77 0.78 0.78 0.78 0.78 0.78 0.78]; y_2=[0.8 0.8 0.

python3 读取txt文件数据,绘制趋势图 test1.txt内容如下: 时间/min cpu使用率/% 内存使用率/% 01/12-17:06 0.01 7.61 01/12-17:07 0.03 7.61 01/12-17:08 0.3 7.61 01/12-17:09 0.7 7.61 01/12-17:10 0.1 7.61 脚本如下: import matplotlib.pyplot as plt from itertools import islice import os a =

一.Python绘制折线图 1.1.Python绘制折线图对应代码如下图所示 import matplotlib.pyplot as pltimport numpy as np from pylab import mplmpl.rcParams['font.sans-serif'] = ['STZhongsong'] # 指定默认字体:解决plot不能显示中文问题mpl.rcParams['axes.unicode_minus'] = False #plt.figure(dpi=300,figs