常规读取 一般我们读取文件时都会读取全部的文件然后再进行操作,因为R是基于内存进行计算的. data <- read.table("C:\\Users\\Hider\\Desktop\\test.txt", header = TRUE, encoding = "gbk") 但是当读取的数据量很大的时候,读取的时间会让人捉急,而且会把内存给占满,读完数据之后就不用进行下一步操作了,因为电脑都卡死了. 所以只读取数据的前n行是一个不错的选择,边读取边进行处理. 读

1. 在matlab中将数据保存到*.mat 文件夹 save("data.mat","data","label")#将data和label两个变量保存到data.mat文件夹中 2.在R语言中安装R.matlab包 install.packages('R.matlab') 3.读取*.mat 文件中的数据 library(R.matlab) ob<-readMat("data.mat")# 返回的是一个列表,通 $进行

R语言作为BI中ETL的工具,增删改 R语言提供了强大的R_package与各种数据库进行数据交互. 外加其强大数据变换清洗函数,为ETL提供一条方便快捷的道路. RODBC ROracal RMysql Rmongodb http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/web/packages/rmongodb/vignettes/rmongodb_cheat_sheet.pdf step1 新建连接con,并查看其信息 library(RODBC) con<-odbcConn

目的: 1. 计算自定义模序在所有蛋白质的匹配位点和次数 2. 输出超过阈值的蛋白质序列到Hit_sequences.fasta 3. Hit_sequences.fasta中序列用小写字母,匹配用大写字母 4. 返回一个数据框,内容包存储ID.注释行(anno)括--.长度(len).匹配位置(Position),匹配次数(Hits),相应序列(tag) 一.问题思考: 1. 如何快速计算匹配位点 2. 输出文件如何构建 >序列ID(ACCESSION) 序列内容

概率图模型 基于R语言 这本书中的第一个R语言程序 prior <- c(working =0.99,broken =0.01) likelihood <- rbind(working = c(good=0.99,bad=0.01),broken =c(good=0.6,bad=0.4)) data <- c("bad","bad","bad","bad") bayes <- function(prio

1.R语言读取文件,文件类型为.txt 直接使用read.table()即可,若不知道当前的工作目录,可以使用函数getwd()来查看 2.R语言读取文件,文件类型为.xlsx 方法一:可以把excle文件另存为.csv格式,然后使用read.csv()读取,文件转换可能会出现缺失值的情况 这里参数 header=T 即 header=TRUE ,意思是显示该数据集的头部 方法二:安装 readxl 包,然后使用 read_excel() 读取

1. 背景 R语言和Python用于数据分析和数据处理,并生成相应的直方图和散点图 需要实现一个展示平台,后端使用Java,分别调用R语言和调用Python,并返回数据和图给前端显示 这个平台主要实现多维度数据的特征选择,以及数据集协变量偏移(Covariate shift)的纠正的功能 本质就是一个Java调用R语言以及Java调用Python的Demo,做得很简单,大神勿喷 2. 技术栈 Java 用的是 Springboot R语言 Python 前端用的是 Vue + ElementUI

以前还真没有见过数据表中存储XML格式的数据,刚开始听说的时候,还以为是数据表中有XML的字段类型, 再了解,其实也就是字符串类型的,只不过字符串的格式是XML格式的.确实孤陋寡闻!汗... (可添加多个时间) (xml的格式可以自己定义的) 一.如何存储XML格式的数据到表中: 1.定义相关实体类 /// <summary> /// 营业时间实体 /// </summary> [XmlRoot("r")] public class OpenHoursEntit

在SQL SERVER中获取表中的第二条数据, 思路:先根据时间逆排序取出前2条数据作为一个临时表,再按顺时排序在临时表中取出第一条数据 sql语句如下: select top 1 * from(select top 2 * from NumberLog where UserName = '管理员' order by dateTime desc ) [table] order by dateTime asc

今天数据库除了个问题:项目中的一张表,数据是从另外一个系统中相同的表里弄过来的,但是可能由于昨天同事导数据导致我这张表中的数据出现了完全相同的情况(所有字段),全部是两条,需要删除相同的数据. 做法:1.创建中间表, 2.将原表中的不重复数据放入中间表, 3.删除原表数据 4.将中间表数据放入原表 5.删除中间表 --创建中间表 CREATE TABLE ATT_SCATTER_REQ_NUM_TEMP AS (SELECT distinct * FROM ATT_SCATTER_REQ_NUM

项目需求:将某个表中的多行数据在一个字段显示,如下: 比如表A中有字段 ID,NAME, 表B中有字段ID,PID,DES, 表A,表B中的数据分别如下: ID NAME1 张三2 李四 ID PID DES1 1 语文2 1 数学3 1 外语4 2 历史5 2 地理 最终我想显示的效果为: ID NAME KC1 张三 语文,数学,外语2 李四 历史,地理 方法:使用sql中的STUFF函数与for xml path 1.for xml path是将将查询结果集以XML形式展现 比如对于表B,

B表中的pid对应A表中id,查询A表中数据,根据b表中对应a表中该id的数据数目排序 select a.*,count(*) as c from a left join b on a.id=b.aid group by a.id ORDER BY c desc

Oracle 数据库表中已有重复数据添加唯一键(唯一约束) 问题描述 以 demo 举例,模拟真实场景. 表 TEST_TABLE 有如下字段和数据:id 是主键,code 没有设置键和索引 ID CODE 1 code1 2 code2 3 code2 4 code2 5 code3 通过以上表中数据可以看出 code 是有重复数据的,此时如果我们直接添加唯一键,会报错. 通过 PL/SQL 可视化操作,或者通过 SQL 语句添加(ENABLE NOVALIDATE 的作用是约束新增数据但不会

目的:读入序列文件(fasta格式),返回一个数据框,内容包括--存储ID.注释行(anno).长度(len).序列内容(content) 一.问题思考: 1. 如何识别注释行和序列内容行 2. 如何快速定位序列内容所在位置 二.你可能需要的知识--基本的R语言基础 1. R语言基本数据类型 2. 会使用帮助(help,?)及网络资源 3. 其他的部分可能需要你针对自己看到的问题自己想办法解决或者留言 ##--构建函数--## seq_import <- function( file ){ se

R通过RJDBC包连接Hive 目前Hive集群是可以通过跳板机来访问 HiveServer, 将Hive 中的批量数据读入R环境,并进行后续的模型和算法运算. 1. 登录跳板机后需要首先在Linux下进行配置 从root权限切换到bzsys用户,才能够通过验证读取Hive.首先需要配置Hadoop的临时环境变量CLASSPATH路径 su bzsys export CLASSPATH=$CLASSPATH:/etc/hadoop/conf 2. 下载并安装RJDBC包 Linux下直接运行R的

1.R中安装RODBC包 install.packages("RODBC") 2.在Windows系统下安装MySQL的ODBC驱动 注意区分32位和64位版本: http://dev.mysql.com/downloads/connector/odbc 3.ODBC的系统配置 在Windows操作系统下:控制面板->管理工具->数据源(ODBC)->双击->添加->选中mysql ODBC driver一项 填写:data source name 一项填

在R语言数据管理(三):数据读写一博文中,我曾写到有关读取xls.xlsx文件时一般将文档改成csv文件读取,这是一般做法.csv文件也有其缺点,修改较为麻烦,当文件数据较大时尤为明显.而生活中必不可少的会出现xls文件,例如时间序列有关文件,且常常数据量较大.读取xls类文件,我想还是有必要学一下. 一般使用RODBC包来访问Excel文件,现在我们读取mydata.xls文件中第一个工作表中的数据,格式如下: library("RODBC") channel<-odbcCon

问题: 使用forecast.Arima对带xreg的arima模型进行预测,报xreg Error pre.m4x <- forecast.Arima(m4x, h = 20, xreg = seq(429,448,by = 1)) 报错: Error in if (ncol(xreg) != ncol(object$call$xreg)) stop("Number of regressors does not match fitted model") : argument i

--如果是一个表插入另外一个表.insert into tb1 需要的列名 select 按照前面写上需要的列名 from tb2 --如果两表结构一样.insert into tb1 * select * from tb2 --也可以尝试从excel或access或TXT等文件导入.参考如下:导入导出大全 导出到excel EXEC master..xp_cmdshell 'bcp SettleDB.dbo.shanghu out c:\temp1.xls -c -q -S"GNETDATA/

  当我们想研究不同sample的某个变量A之间的差异时,往往会因为其它一些变量B对该变量的固有影响,而影响不同sample变量A的比较,这个时候需要对sample变量A进行标准化之后才能进行比较.标准化的方法是对sample 的 A变量和B变量进行loess回归,拟合变量A关于变量B的函数 f(b),f(b)则表示在B的影响下A的理论取值,A-f(B)(A对f(b)残差)就可以去掉B变量对A变量的影响,此时残差值就可以作为标准化的A值在不同sample之间进行比较. Loess局部加权多项式回

当我们想研究不同sample的某个变量A之间的差异时,往往会因为其它一些变量B对该变量的固有影响,而影响不同sample变量A的比较,这个时候需要对sample变量A进行标准化之后才能进行比较.标准化的方法是对sample 的 A变量和B变量进行loess回归,拟合变量A关于变量B的函数 f(b),f(b)则表示在B的影响下A的理论取值,A-f(B)(A对f(b)残差)就可以去掉B变量对A变量的影响,此时残差值就可以作为标准化的A值在不同sample之间进行比较. Loess局部加权多项式回归