以前有的是非完整时间写的博客,抽时间需要统一整理一下. 今天在重新装repeatmasker. 整个过程是这样的,有关联的事情有两个. 1. 装repeatmasker需要各种Prerequisites,其中就可能用到了blast,而之前一直找这个版本的blast,在ncbi硬是没有找到: For RMBlast ( NCBI Blast modified for use with RepeatMasker/RepeatModeler ) please go to our download pa

目录 1.conda安装 2.配置RepBase 3.RepeatMasker避坑 4.RepeatProteinMask避坑 5.RepeatModeler避坑 6.自定义重复序列库 后记 1.conda安装 conda安装虽然简单,但还是有很多坑,而且很多都是隐形的坑. # conda install -c bioconda repeatmasker conda install -c bioconda repeatmodeler repeatmodeler依赖于repeatmasker,因此

RM是library-based,通过相似性比对来识别重复序列,可以屏蔽序列中转座子重复序列和低复杂度序列(默认将其替换成N).使用数据库Dfam和Repbase. The Dfam database is a collection of Repetitive DNA element sequence alignments, hidden Markov models (HMMs) and matches lists for complete Eukaryote genomes. Repbase是

1.简介 RepeatMasker是一款基于Library-based,通过相似性比对来识别重复序列,可以屏蔽序列中转座子重复序列和低复杂度序列(默认将其替换成N).提供有在线服务.RepeatMasker在进行序列比对时可以选用常见的几种算法,包括nhmmer.cross_match.ABBlast/WUBlast.RMBlast .Decypher(可以安装多个比对引擎,但每次只能使用其中一个). Repbase是由美国遗传信息研究所(GIRI)创建并维护,收录了转座子和其他重复序列及其注释

1:下载adnroid sdk安装包 官方下载地址无法打开,没有vpn,使用下面这个地址下载,地址:http://www.android-studio.org/

以前用Eclicps 用习惯了现在 想学学 用Android Studio 两天的钻研终于 在我电脑上装了一个Android Studio 并完成了AndroidAnnotations 的配置. AndroidAnnotations是一个能够让你快速进行Android开发的开源框架,它能让你专注于真正重要的地方.使代码更加精简,使项目更加容易维护,它的目标就是“Fast Android Development.Easy maintainance”. 说白了 就是可以少写很多代码,哈哈. Andr

1. react-router 对象式配置 和 组件式配置    组件式配置(Redirect) ----对应---- 对象式配置(onEnter钩子) IndexRedirect -----对应-------indexRoute的onEnter钩子函数

新年新气象,在2016年的第一天,我入手了人生中第一台自己的电脑(大一时好友赠送的电脑在一次无意中烧坏了主板,此后便不断借用别人的或者网站的).macbook air,身上已无分文...接下来半年的房租都不知道该怎么半了,都怪消费太冲动. 不过,眼下需要解决的不是房租问题,而是在新电脑上搭建开发环境,正好在搭建的时候总结一下: 1.FQ工具:lantern 地址:https://github.com/getlantern/lantern 2.命令行工具:term2 官网:http://www.i

看完这篇你学到什么: 熟悉gradle的构建配置 熟悉代码构建环境的目录结构,你知道的不仅仅是只有src/main 开发.生成环境等等环境可以任意切换打包 多渠道打包 APK输出文件配置 需求 一般我们开发的环境分为:debug 和 release,但是你想再分内测1环境.内测2环境等等怎么办呢? 这就需要依赖强大的gradle 来配置了. 相关的配置也可以参考谷歌官方文档. 配置构建类型 buildTypes 您可以在模块级 build.gradle 文件的 android {} 代码块内部创

之前很多次安装CentOS7虚拟机,每次配置网络在网上找教程,今天总结一下,全图文配置,方便以后查看. Virtual Box可选的网络接入方式包括: NAT 网络地址转换模式(NAT,Network Address Translation) Bridged Adapter 桥接模式 Internal 内部网络模式 Host-only Adapter 主机模式 具体的区别网上的资料很多,就不再描述了,下面是一个最直接有效的配置,配置CentOS7虚拟机里面能上外网,而主机与CentOS7虚拟机也

公司服务器使用的第三方云端服务,即阿里云,而本地需要经常去登录到服务器做相应的配置工作,鉴于此,每次登录都要使用密码是比较烦躁的,本着极速思想,我们需要配置我们的免登陆. 一 理论概述 SSH介绍 SSH 为 Secure Shell 的缩写,由 IETF 的Network Working Group提出. SSH 是建立与应用层基础上的安全协议. SSH 相对可靠,专为远程s登录会话和其他网络服务提供安全性的协议. SSH好处 利用 SSH 协议可以有效防止远程管理过程中的信息泄露问题. SS

午休完上班后,同事说测试站点访问接口出现400 Bad Request  Request Header Or Cookie Too Large提示,心想还好是测试服务器出现问题,影响不大,不过也赶紧上服务器进行测试查看,打开nginx与ugwsi日志与配置,发现后端服务日志记录正常,而测试站点的访问日志有7百多M(才运行两三天没几个访问,几M的话才是正常现象),在浏览器里直接访问后端服务接口也正常没有问题(我们的服务器软件架构是微服务架构,将很多模块分拆后分别部署,前端是一个纯HTML站点,通过

本篇博客算是一个开头,接下来会持续更新使用Swift3.0开发服务端相关的博客.当然,我们使用目前使用Swift开发服务端较为成熟的框架Perfect来实现.Perfect框架是加拿大一个创业团队开发的,目前是Perfect2.0版本,关于Perfect框架,下方会详细的介绍.本篇博客会演示一个完整的Demo, 该Demo完全由Swift3.0开发,其中包括服务端和iOS客户端,数据库采用的是MySQL. 进一步说,本篇博客将会演示一个使用Swift3.0开发的记事本,当然该记事本的服务端和iO

前面讨论了 OVS local network,今天开始学习 flat network. flat network 是不带 tag 的网络,宿主机的物理网卡通过网桥与 flat network 连接,每个 flat network 都会占用一个物理网卡. 在 ML2 配置中 enable flat network 在控制节点 /etc/neutron/plugins/ml2/ml2_conf.ini 中设置 flat network 相关参数: tenant_network_types = fl

2016年9月22日凌晨,微信宣布“小程序”问世,当然只是开始内测了,微信公众平台对200个服务号发送了小程序内测邀请.那么什么是“小程序”呢,来看微信之父怎么说 看完之后,相信大家大概都有些明白了吧,对于开发者来说或许都有些小激动吧,毕竟多关注一些新东西没什么不好.那么问题是“小程序”只有200个内测账号,怎么办?还好,天朝的人才太多了,在消息发布后的几小时内网上已经出了IDE的破解版,废话不多说,看配置步骤: 1. IDE下载 MAC版链接: http://pan.baidu.com/s/1

从0开始搭建SQL Server AlwaysOn 第一篇(配置域控) 第一篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4678330.html第二篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4682028.html第三篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4682986.html第四篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/6136227.html AlwaysOn是SQL Server2012推出

从0开始搭建SQL Server AlwaysOn 第二篇(配置故障转移集群) 第一篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4678330.html第二篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4682028.html第三篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4682986.html第四篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/6136227.html 这一篇是从0开始搭建SQL Server

从0开始搭建SQL Server AlwaysOn 第三篇(配置AlwaysOn) 第一篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4678330.html第二篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4682028.html第三篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4682986.html第四篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/6136227.html 这一篇是从0开始搭建SQL Serve

从0开始搭建SQL Server AlwaysOn 第四篇(配置异地机房节点) 第一篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4678330.html第二篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4682028.html第三篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/4682986.html第四篇http://www.cnblogs.com/lyhabc/p/6136227.html 这一篇是从0开始搭建SQL Server

背景: 今天去深圳溜达了一天,刚回来,看到首页都是微软大法好,看来离.NET的春天就差3个月了~~ 回到正题,这篇的教程讲解下拉配置. 查询区的下拉配置: 1:查询框怎么配置成下拉? 在配置表头:格式化配置 #是否 PS:格式化配置除了用来格式化表格的内容,同样也会下拉进行格式化. 效果: 那“#是否”是哪里来的? 在配置维护里来的,对于固定的选项,统一在这里配置: 2:查询框下拉能不能多选? 配置格式规则即可:multiple属性 效果: 3:查询框下拉能不能级联? 配置格式化规则指向上一级即