RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析 差异分析的步骤:1)比对:2) read count计算:3) read count的归一化:4)差异表达分析: 背景知识:1)比对:普通比对: BWA,SOAP开大GAP比对:Tophat(Bowtie2):2) Read count(多重比对的问题):丢弃平均分配利用Unique region估计并重新分配表达量计算的本质目标基因表达量相对参照系表达量的数值.参照的本质:( 1)假设样本间参照的信号值应该是相同的:( 2)将样本间参照的观测值校

两种RNA seq的基因表达量计算方法: 1. RPKM:http://www.plob.org/2011/10/24/294.html 2. RSEM:这个是TCGAdata中使用的.RSEM据说比RPKM更有优势.anyway,原来还以为TCGA 的data需要重新换算成RPKM,现在不需要了~:)

RNA -seq RNA-seq目的.用处::可以帮助我们了解,各种比较条件下,所有基因的表达情况的差异. 比如:正常组织和肿瘤组织的之间的差异:检测药物治疗前后,基因表达的差异:检测发育过程中,不同的发育阶段,不同的组织之间的基因表达差异 等 在所有检测的差异类型中,最常用的一种检测就是:检测所有mRNA的表达量的差异. 还可以检测 RNA 的结构上的差异.例如:mRNA的剪接方式的差异,即“可变剪接”:还可以检测“融合基因”,同时还可以检测基因单点突变导致的SNP. 测序方法.步骤:人的细胞

大数据平台Lambda架构浅析(全量计算+增量计算) 2016年12月23日 22:50:53 scuter_victor 阅读数:1642 标签: spark大数据lambda 更多 个人分类: 造轮子Spark   版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. https://blog.csdn.net/SCTU_vroy/article/details/53844460 笔者刚接触大数据方面时,只知道Hadoop和时下很火的Spark,对Hadoop.Spark的认知只停留在跑跑d

Geotrellis系列文章链接地址http://www.cnblogs.com/shoufengwei/p/5619419.html 目录 前言 问题探索 采样说明 实现方案 总结 一.前言        上一篇文章讲了通过Geotrellis导出自定义的Tiff文件(见geotrellis使用(十四)导出定制的GeoTiff),但是实际中有时会有BUG,就是数据值发生非常明显的变化,理论上只进行了切割.重投影操作,数据值不应该会发生特别大的变化.今天认认真真查找了下问题,发现是因为采样方式造

引言 Hyperledger Fabric是当前比较流行的一种联盟链系统,它隶属于Linux基金会在2015年创建的超级账本项目且是这个项目最重要的一个子项目.目前,与Hyperledger的另外几个子项目Hyperledger Iroha,Hyperledger Indy和Hyperledger Sawtooth一样,Hyperledger Fabric正处于生命周期中的活跃(active)阶段,它的架构设计正在不断地完善并持续为开发者和用户提供更强大,更便捷的区块链服务. 与主流的区块链系统

jQuery中的bind() live() delegate()之间区别分析 首先,你得要了解我们的事件冒泡(事件传播)的概念,我先看一张图 1.bind方式 $('a').bind('click',function (){ alert('click'); }) 解析:这种方式最简单,jq扫描文档找出所有的a,让将函数绑定到每个元素的click事件上 2.live方式 $('a').live('click',function (){ alert('click'); }) 解析:jq将函数绑定到$

在CSDN中发现这篇文章,讲解的比较详细,所以在这里备份一个.原文链接:http://blog.csdn.net/breaksoftware/article/details/8167641 DllMain的相关特性 首先列出<DllMain中不当操作导致死锁问题的分析--进程对DllMain函数的调用规律的研究和分析>中论证的11个特性:  Dll的加载不会导致之前创建的线程调用其DllMain函数. 线程创建后会调用已经加载了的DLL的DllMain,且调用原因是DLL_THREAD_ATT

sql语句中left join和inner join中的on与where的区别分析   关于SQL SERVER的表联接查询INNER JOIN .LEFT JOIN和RIGHT JOIN,经常会用到ON和WHERE的条件查询,以前用的时候有时是凭感觉的,总是没有搞清楚,今日亲自测试了下,理解到了一些内容,在此分享. 要测试,首先我们来创建三张表,数据库就根据自己的情况而定 创建表TestJoinOnOrWhere_A.TestJoinOnOrWhere_B.TestJoinOnOrWhere_

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无线网络中的MIMO与OFDM技术原理分析CNET中国·ZOL 07年08月14日 [原创] 作者: 中关村在线 张伟 从最早的红外线技术到目前被寄予重望的WIFI,无线技术的进步推动我们的网络一步步走向成熟.另外,随着笔记本的不断发展,无线网络模块已经成为了平台标准,以Intel在移动个人处理器市场占有的份额来看,已有用户和潜在用户的数量令人不可低估. 从目前的市场情况和802.11n协议进展的速度来看,无线网络和产品正在走向降低成本,加大软件和相关技术的道路上.这样的做法无疑是非常明智的,对

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