仍然是两年前的笔记 1. prepare-reference 如果用RSEM对比对后的bam进行转录本定量,则在比对过程中要确保比对用到的索引是由rsem-prepare-reference产生的. ~/software/rsem/rsem-prepare-reference \ --transcript-to-gene-map ~/project/RNA-seq/ref_cds/gene_transcript.txt \ #作用是在后面的定量结果文件中,添加gene名称, 转录本名称两列,该文

有朋友问到如何在一个Windows Installer安装包中获取安装包源路径,就是在安装包运行过程中动态获取*.msi所在完整路径. 这个问题分两类,如果我们的安装包只是一个*.msi安装文件,那么可以通过获取Property OriginalDatabase的值来得到(注意:OriginalDatabase值有效的前提是这是初次安装,不适用修复等模式). 第二种情况是我们将MSI包封装在一个*.exe中,则我们需要通过SETUPEXEDIR这个Property来获取.

在命令行中运行eclipse中创建的java项目 博客分类: java相关 javaeclipse命令行  由于项目要求,需要对eclipse中的项目进行打包,似的可以在客户机上不装eclipse的情况下正常运行. 一.环境说明:    eclipse---3.5    jdk-------1.6.0.22    os--------xp,win7 二.解决方案详情:    1.项目不引用外部jar包,仅仅依赖于jdk相关jar包,则有两种解决方案      方案一.通过eclipse/myec

摘自: http://blog.csdn.net/gulijiang2008/article/details/4482993 请在服务器端配置 方法一: 在通过WebService处理大数据量数据时出现如下错误: System.Web.Services.Protocols.SoapException: 在运行配置文件中指定的扩展时出现异常. ---> System.Web.HttpException: 超过了最大请求长度.at System.Web.HttpRequest.GetEntireRa

ionic 运行过程中动态切换API服务器地址 keywords: ionic,phonegap,cordova,网络制式,动态切换,变更,API,服务器地址,$resource,localstorage,url 场景.需求 场景 APP以项目的形式提供,一个客户需要部署一套服务器,一个APP,所以APP的后台服务器地址不能写死.而且要求如果有wifi且在内网,需要用内网服务器地址,如果用3G或者4G,则需切换为外网服务器地址 需求 APP第一次运行,如果没有设置过服务器地址,需要设置好后台服务

这个总结的很好,从前一个项目也用到这中技术 转自:http://blog.csdn.net/myarrow/article/details/9630377 1. 简介 使用ptrace向已运行进程中注入.so并执行相关函数,其中的“注入”二字的真正含义为:此.so被link到已运行进程(以下简称为:目标进程)空间中,从而.so中的函数在目标进程空间中有对应的地址,然后通过此地址便可在目标进程中进行调用. 到底是如何注入的呢? 本文实现方案为:在目标进程中,通过dlopen把需要注入的.so加载到

MyEclipse中修改项目运行地址栏中项目名称 1.如果出现从SVN上检出的项目名称跟运行地址栏中的项目名称不一致, 可以通过以下步骤进行修改 项目鼠标右键,单击"Properties" 2.找到"MyEclipse-->Web-->Web Content-root",对输入框中的内容进行修改 3.确定后,单击"OK" 比如原来的地址:http://localhost:8080/Flex/index.jsp 将上述输入框中修改成&q

转自:http://www.cnblogs.com/xiaoyao2011/archive/2011/09/09/2172427.html 在.NET程序运行过程中,什么是堆,什么是栈? 堆也就是托管堆(managed heap),进程初始化的时候,CLR要保留一块连续的地址空间,这个地址空间最初并没有对应的物理存储空间.这个地址空间就是托管堆. 栈是在程序运行过程中用于保存指令,值类型变量的内存区域(一个线程对应一个栈),栈的结构和数据结构中“栈”的结构是一样的,“先进后出”. 什么情况下会在

1. 简介 使用ptrace向已运行进程中注入.so并执行相关函数,其中的“注入”二字的真正含义为:此.so被link到已运行进程(以下简称为:目标进程)空间中,从而.so中的函数在目标进程空间中有对应的地址,然后通过此地址便可在目标进程中进行调用. 到底是如何注入的呢? 本文实现方案为:在目标进程中,通过dlopen把需要注入的.so加载到目标进程的空间中. 2. 如何让目标进程执行dlopen加载.so? 显然,目标进程本来是没有实现通过dlopen来加载我们想注入的.so,为了实现此功能,

在默认情况下,Jmeter运行过程中,Fiddler是抓不到对应的应答报文的. 但是,在某些时候,我们希望分析Jmeter执行失败的原因,想了解Jmeter获取到的应答报文是否有问题,就需要同服务器返回的应答报文进行对比. 这时,我们想在Jmeter运行过程中,同时用Fiddler抓获服务器的应答报文. 为此,需要给对应的HTTP Request设置Proxy Server

LoadRunner中Action的迭代次数的设置和运行场景中设置 LoadRunner是怎么重复迭代和怎么增加并发运行的呢? 另外,在参数化时,对于一次压力测试中均只能用一次的资源应该怎么参数化呢?就是说这些资源用了一次就不能在用了的. --参数化时,在select  next row选择unique,update value on选择 each occurence, 1. 迭代跟虚拟用户数没什么必然联系 迭代是这样的: 迭代1次   迭代2次  迭代3次 用户1     X1        

问题一:Loadrunner超时错误问题描述 Loadrunner超时错误:在录制Web协议脚本回放时超时情况经常出现,产生错误的原因也有很多,解决的方法也不同. 问题现象Error -27728: Step download timeout (120 seconds) has expired when downloading non-resource(s). 错误分析对于HTTP协议,默认的超时时间是120秒(可以在LoadRunner中修改),客户端发送一个请求到服务器端,如果超过120秒服

Hadoop例子——运行example中的wordCount例子 一.   需求说明 单词计数是最简单也是最能体现MapReduce思想的程序之一,可以称为 MapReduce版"Hello World",该程序的完整代码可以在Hadoop安装包的"src/examples"目录下找到.单词计数主要完成功能是:统计一系列文本文件中每个 单词出现的次数,如下图所示.

0.踩坑背景 仍然是torch-rnn/LanguageModel.lua文件中的一些问题,仍然是这个狗血的LM:encode_string函数: function LM:encode_string(s) local encoded = torch.LongTensor(#s) , #s do local token = s:sub(i, i) local idx = self.token_to_idx[token] assert(idx ~= nil, 'Got invalid idx') e

0.踩坑背景 执行Torch-RNN的时候,在LanguageModel.lua中的encode_string函数中,对start_text的各个character进行id映射编码,实现功能类似“北京天安门”-->“5 10 88 32 111”,方便后面的计算. 这个函数会利用一个全局的类似HashMap的table,hashmap中的key是character(char),value是id(int),涉及到一个从hashmap中按照key取值的操作,代码如下: local idx = sel

0.Lua & LuaJIT简介 Lua 是一种轻量小巧的脚本语言,用标准C语言编写并以源代码形式开放, 其设计目的是为了嵌入应用程序中,从而为应用程序提供灵活的扩展和定制功能. Lua 是巴西里约热内卢天主教大学(Pontifical Catholic University of Rio de Janeiro)里的一个研究小组,由Roberto Ierusalimschy.Waldemar Celes 和 Luiz Henrique de Figueiredo所组成并于1993年开发,Lua在

在上一篇文章也谈SQL Server 2008 处理隐式数据类型转换在运行计划中的增强中,我提到了隐式数据类型转换添加对于数据分布非常不平均的表.评估的数据行数与实际值有非常大出入的问题,进一步測试之后.我发现这种评估不准确性应该确实与推測的一样,它使用了变量的评估方式. 通过例如以下測试验证.首先建立数据分布不平均的測试表. USE tempdb GO CREATE TABLE _t( c varchar(50) ); CREATE INDEX IX_c ON _t( c ); GO -- 添

c#,winform程序,数据批量入oracle库时用到DataAdaper的.FillSchema函数,如:da.FillSchema(dt2, SchemaType.Mapped); 程序运行一段时间后在此出现中断,错误提示:ORA-03114: not connected to ORACLE. 经从网上查找相关解决方案,有说重启应用程序的:有说这是此函数本身的一个bug,需要添加什么微软官方所说的解决方案的. 经本人试验,重启应用程序是会变好.但是运行过程中还会难免出现上面的错误,这时候就

前文: [学习笔记] 在Eclipse中导出可以直接运行的jar,依赖的jar打在jar包中 使用7z打开压缩包,查看所有依赖的jar都被解压以包名及class的方式存储在了运行jar中,此时jar的大小为11MB左右了. 然后执行如下命令运行即可. java -jar Hibernate_demo_003.jar

可能是被释放的property本身是OC对象而它的属性被误写成assign,例如: @interface MyItem : Object @property (nonatomic, assign) NSString *string; @end MyItem *item = [[MyItem alloc] init]; NSArray *array = @[item]; 那么,在程序运行期间,一直在使用的array中的item对象,其string有可能会变成悬浮指针,导致读取时崩溃.

本文要阐述的主要有两点,一是介绍自动化测试框架JBehave,二是介绍如何在Github上拉项目,编译成myeclipse环境中的项目,并最终导入Myeclipse中运行. JBehave是何物? JBehave是基于BDD框架的开源自动化测试框架.提供Web集成的BDD层扩展. JBehave特征: JBehave是纯Java实现,可以利用Java丰富的API为己所用: 具有基于文本的story,可以对其进行定义并执行,比较灵活和易扩展: 基于注解(Annotation)的运行配置信息,指定s