一.bwa比对软件的使用 1.对参考基因组构建索引 bwa index -a bwtsw hg19.fa   #  -a 参数:is[默认] or bwtsw,即bwa构建索引的两种算法,两种算法都是基于BWT的(BWT search while the CIGAR string by Smith-Waterman alignment.).-a bwtsw对于短的参考序列是不工作的,必须要大于等于10Mb:-a is 不适用于大的参考序列,必须要小于等于2G: output:hg19.fa.am

C 头文件 头文件是扩展名为 .h 的文件,包含了 C 函数声明和宏定义,被多个源文件中引用共享.有两种类型的头文件:程序员编写的头文件和编译器自带的头文件. 在程序中要使用头文件,需要使用 C 预处理指令 #include 来引用它.前面我们已经看过 stdio.h 头文件,它是编译器自带的头文件. 引用头文件相当于复制头文件的内容,但是我们不会直接在源文件中复制头文件的内容,因为这么做很容易出错,特别在程序是由多个源文件组成的时候. A simple practice in C 或 C++

开始前先看一下用户向导吧 http://www.cs.fsu.edu/~engelen/soap.html 中左侧点击Documentation 英语水平确实有限,有些内容可能说的不准确,敬请参考向导中原文,以免误导 向导 1.1节中提供了gSoap开发包的下载地址http://sourceforge.net/projects/gsoap2 下载最新gSoap程序包解压后在\gsoap\bin\win32(windowsXP下,其它操作系统就自己选择)下找到 编译器soapcpp2.exe 和w

我们知道一般情况下Swit要想调用obj-c,c或c++代码必须通过obj-c以及桥接文件才可以办到,但是对于某些简单的代码,我们可以跳过桥接文件和.h头文件,直接和C代码交互呢! 我们再Project中添加一个.c文件,不要创建桥接文件和对应的.h头文件,该.c文件内容如下: #include <stdio.h> int add(int i,int j){ return i + j; } int mul(int i,int times){ return i * times; } 打开需要调用

1,c++宏定义是干啥的?防止重复引用,如何防止重复引用? //a.h //声明一个类,和其他声明 #include <iostream> class A{ public: static int a; static int b; }; //b.h //需要a.h的类,又还有些其他声明 #include "a.h" //main,cpp //既需要a.h,又需要b.h,所以只能把两个头文件都引用过来. #include "a.h" #include &qu

hpp,其实质就是将.cpp的实现代码混入.h头文件当中,定义与实现都包含在同一文件,则该类的调用者只需要include该hpp文件即可,无需再将cpp加入到project中进行编译.而实现代码将直接编译到调用者的obj文件中,不再生成单独的obj,采用hpp将大幅度减少调用 project中的cpp文件数与编译次数,也不用再发布烦人的lib与dll,因此非常适合用来编写公用的开源库.     hpp的优点不少,但是编写中有以下几点要注意: 1.是Header   Plus   Plus 的简写

根据 cpp文件 生成相应的头文件 namespace 声明类定义声明 函数声明 extern 变量声明 选项--------------//[AutoHeader Public] //[AutoHeader Private] 不进行声明

1.cstdlib是C++里面的一个常用头文件, 等价于C中的<stdlib.h>. 2.一般一个带“.h” 扩展名的库文件,比如iostream.h.这是延续C语言的,为了兼容C.在新标准的库中都有一个 不带".h"扩展名的相对应,区别除了后者好多改进之处,还有一点就是后者的东西都放进了“std”名字空间中. 但是 string.h有点特别,问题在于C++要兼容C的标准库,C的标准库里也有一个名字叫做"string.h"的头文件,里面 包含常用的C字符

把如下文件直接贴到root目录下,在编辑新文件的时候显示自定义信息. root@shenlan-qianlan:/home/python/day1# vim shenlanqianlan.sh #!/bin/bash ######################################################################### # File Name: shenlanqianlan.sh # Author :刘琪 # QQ : # Email:@qq.com

假设你的工程名为project,目录为F:\test.但是你想在project中使用文件夹F:\library下面的一些头文件和源程序.由于这些头文件和源程序与工程project不在同一目录下面,所以需要做一些设置.下面介绍两种方法: 1.第一步:在CodeBlocks界面中右击工程名project,点击Add files...菜单,将你所需要的F:\library目录下的头文件和源程序添加到工程project中.第二步:在你的工程project中的源程序要使用F:\library的头文件时,需

背景 之前都是用的MFC已搭好框架,今天想自己从零开始完成添加文件,编译,并解决文件包含问题,在此做个记录. 正文 首先创建一个Win32控制台应用程序,不要直接点击完成,而是点击下一步,然后选择空项目. 在右侧出现头文件,源文件,资源文件,这些看起来是文件夹的东西被称为筛选器,如若想要在对应的文件夹(筛选器)内添加新的文件夹(筛选器),在对应的文件夹(筛选器)右击-->添加-->新建筛选器,如此即可. 添加文件,可以添加类,如若想添加c文件也可,添加-->新建项,则是自己写/现有项,则

这几天的工作挖了不少的坑.遇到了各种千奇百怪的错误,如今好好总结一下. 新建一个project,然后新建HelloCPP.h,HelloCPP.cpp文件.HelloCPP.h文件内容例如以下: #ifndef __CPPWrong__HelloCPP__ #define __CPPWrong__HelloCPP__ //#include <stdio.h> namespace hello { }; #endif /* defined(__CPPWrong__HelloCPP__) 就一个空的

转自:http://blog.csdn.net/figo77ll/article/details/3156052 Linux下如果要对文件进行读取访问,需要包含至少以下两个头文件: #inlcude <unistd.h> #inlcude <fcntl.h> 其中fcntl.h包含了create和open命令,unistd包含了其他的诸如read, write, close等命令.很奇怪为什么不把fcntl的功能直接放到unistd里面呢..       如果要对STDIN,STD

可以使用import语句,如import "x.h"; 则在自动生成的xxx_i.h中将会有include "x.h", 于是x.h就被include到工程中了.

今天再看二叉树的知识,看着看着就看到C/C++的头文件及头文件重复定义这一块去了.以前就看到过这个问题,但是自己一直没有用到这方面的东西,今天遇到就顺便总结一下,等以后忘了再回来看看. 首先明确一点C/C++头文件是要来干什么的?(http://baike.baidu.com/link?url=lMbCZqCAsBJ_rhifA82koGGjoJmbZUy1tTPNPzertEc7nxNr71Xqfm63GEuqA8Ze) 头文件的作用有三: 1.C\C++采用源文件单独编译为object文件,

一.关于全局变量的定义.声明.引用: (只要是在.h文件中定义的变量,然后在main.c中包含该.h文件,那么定义的变量就可以在main函数中作为全局变量使用) 方法1: 在某个c文件里定义全局变量后,在其它c文件要用,则在要用c文件里用extern进行声明.说来轻巧但还是很多同学会出问题.请看下面注意事项方可解决! 注: (1)在定义全局变量时可同时将其初始化 (2)在用extern声明时不能再初始化,否则编译器报错 举例:有两个c文件分别为one.c和two.c,two中要用到one中的全局

以前写单片机程序时总是把所用函数和变量都写在一个c文件里,后来遇到大点的项目,程序动则几千行,这种方式无疑会带来N多麻烦,相信大家都有所体验吧! 后来学会了在keil里进行模块化编程,即只把功能相同或相近的函数写在同一个c文件,这样以来一个项目往往由很多个c文件组成,但又带来一个问题即是某些c文件之间需要相互通信,一般我们都采用了全局变量,对吧.很多同学虽然知道在其它c文件里引用全局变量要用extern进行声明,但对此操作时往往思路不清,迷迷糊糊,经常遇到一堆错误提示,然后一个一个排除,既费时又

转自 https://www.cnblogs.com/chengmin/archive/2011/09/26/2192008.html 当你要引用一个全局变量的时候,你就要声明,extern int a;这时候extern不能省略,因为省略了,就变成int a;这是一个定义,不是声明. 用#include可以包含其他头文件中变量.函数的声明,为什么还要extern关键字,如果我想引用一个全局变量或函数a,我只要直接在源文件中包含#include<xxx.h> (xxx.h包含了a的声明)不就可

 用#include可以包含其他头文件中变量.函数的声明,为什么还要extern关键字? 如果我想引用一个全局变量或函数a,我只要直接在源文件中包含#include<xxx.h> (xxx.h包含了a的声明)不就可以了么,为什么还要用extern呢?? 这个问题一直也是似是而非的困扰着我许久,经过实践和查找资料,有如下总结: 一.头文件 首先说下头文件,其实头文件对计算机而言没什么作用,她只是在预编译时在#include的地方展开一下,没别的意义了,其实头文件主要是给别人看的. 我做过一个实验

本文转自: http://lpy999.blog.163.com/blog/static/117372061201182051413310/ http://blog.csdn.net/feitianxuxue/article/details/7204116 感谢博主,如有侵犯请告知删除  用#include可以包含其他头文件中变量.函数的声明,为什么还要extern关键字? 如果我想引用一个全局变量或函数a,我只要直接在源文件中包含#include<xxx.h> (xxx.h包含了a的声明)不

头文件没啥好说的,无非就是" "和< >的区别,这估计只要是学过C/C++的人都明白.现在的编译器对头文件的包含顺序没有要求,但老的C实现则不一样.当然,我们现在无需关心头文件顺序了. 我们为啥要包含头文件呢?头文件里面有定义嘛,使用任何函数之前都必须定义该函数.所以我们并不强求包含头文件,只要你自己在库函数使用之前定义该函数,有些编译器还会自动的添加标准库定义.但是呐,我们还是推荐将头文件添加上去,头文件里面有时候还会包含类型定义.常量定义.宏定义. 在linux环境下,