[怪毛匠子 整理] samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步:sort 一下 BAM 文件,得到map.sorted.bam system"samtools sort map.b/am map.sorted"; #第三步:创建一个关于bam的索引文件,我们得到一个map.sorted.b

backbone中,使用最多的莫过于在view中进行操作,如模板的渲染以及事件函数的定义.为了提高代码的可维护性,一般地我们会写多个视图即view,将界面按照功能的不同进行模块化划分,模块与view一一对应. 首先,我们会定义一个父view,在view中控制不同子view的渲染,子view之间尽量不产生联系.这样,代码之间的耦合度会降低很多,模块的功能明确化,同时降低了开发的难度.笔者最近在项目中遇到父子view传值问题,学习到了一个知识点,比较简单易懂.主要想分享两个内容:1.父子view是如

在KakaJSON手册的第2篇文章中提过:由于JSON格式能表达的数据类型是比较有限的,所以服务器返回的JSON数据有时无法自动转换成客户端想要的数据类型 比如客户端想要的是Date类型,服务器返回的可能是字符串"2018-08-08 08:08:08.888"或者"2018/08/08 08:08:08.888" 像上述情况,KakaJSON内部是无法自动转换的,但提供了值过滤机制,允许开发者对JSON值进行自定义处理 日期处理 // 这2个DateFormatt

如果我们有这样一个model: class IPInfoModel(models.Model): TYPE_INTRANET = 1 TYPE_INTERNET = 2 IP_TYPES = ( (TYPE_INTRANET, u'内网'), (TYPE_INTERNET, u'外网'), ) ip = models.GenericIPAddressField("IP", unique=True) ip_type = models.SmallIntegerField(choices=I

<%Html.RenderAction("AscxSideNav", "UI", new {itemName=ViewData["ItemName"].ToString(),itemAlias=ViewData["ItemAlias"].ToString() });%> 可以用过object routeValues参数来传递

https://blog.csdn.net/xiesq5112/article/details/52154169

samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtmlsamtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集.包含有许多命令.以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是:将sam文件转换成bam文件:然后对bam文件进行各种操作,比如数据的排序(不属于本命令的功能)和提取(这些操作 是对bam文件进行的,因而当输入为sam文件的时候,不能进行该操作):最后将排序或提取得到的数据输出为bam或sam(默认的)

转自:samtools常用命令详解 samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtml samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集.包含有许多命令.以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是:将sam文件转换成bam文件:然后对bam文件进行各种操作,比如数据的排序(不属于本命令的功能)和提取(这些操作是对bam文件进行的,因而当输入为sam文件的时候,不能进行该操作):最后将排序或提取得到

samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtml samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集,包含有许多命令.以下是常用命令的介绍: view命令的主要功能: 将sam文件转换成bam文件:然后对bam文件进行各种操作,比如数据的排序(不属于本命令的功能)和提取(这些操作是对bam文件进行的,因而当输入为sam文件的时候,不能进行该操作):最后将排序或提取得到的数据输出为bam或sam(默认的)格式. bam

参考:https://www.sogou.com/link?url=DOb0bgH2eKh1ibpaMGjuy6YnbQPc3cuKbWqIy1k6SBFomuBEhdSpHkUUZED5fr2OTkh3_01_UomO4oOua-YE2A..1.将sam文件转换成bam文件 $ samtools view -bS abc.sam > abc.bam $ samtools view -b -S abc.sam -o abc.bam 2.提取比对到参考序列上的比对结果 $ samtools vie

  感谢eoe社区的分享   最近看关于Android实现ListView的功能问题,一直都是小伙伴们关心探讨的Android开发问题之一,今天看到有关ListView实现A-Z字母排序和过滤搜索功能并且实现汉字转成拼音的功能,转帖来和eoe的小伙伴们一同分享下! Android 有关ListView实现A-Z字母排序和过滤搜索功能并且实现汉字转成拼音的功能 我们知道一般我们对联系人,城市列表等实现A-Z的排序,因为联系人和城市列表我们可以直接从数据库中获取他的汉字拼音,而对于一般的数据,我们怎

Android 的窗口管理系统 (View, Canvas, WindowManager) 在图解Android - Zygote 和 System Server 启动分析一 文里,我们已经知道Android 应用程序是怎么创建出来的,大概的流程是 ActivityManagerService -> Zygote -> Fork App, 然后应用程序在ActivityThread 中的进入loop循环等待处理来自AcitivyManagerService的消息.如果一个Android的应用有

参考资料: SAMtools(官网) SAM Spec v1.4 (SAM格式 说明书) (重要) samtools-1.3.1 使用手册 (SAMtools软件说明书) samtools常用命令详解(博客园) SAM格式定义(博耘生物) samtools使用方法(plob) 这个学习急不来,而且比对非常重要,先把上面的官方SAM/BAM格式说明文件看透`Sequence Alignment/Map Format Specification` SAMtools解决的问题 非常多序列(read),

转载:http://blog.csdn.net/xiaanming/article/details/12684155 转载请注明出处:http://blog.csdn.net/xiaanming/article/details/12684155 前段时间因为换工作的缘故又恰巧碰到国庆节,所以有段时间自己没有更新博客了,过完国庆到新公司报道,感觉还不错,就是现在住的地方离新公司有点远,地铁20站,伤不起啊,我每天早上7点多就要起床,然后屁颠屁颠的去挤地铁上班,晚上下班还要挤地铁,先不说路程远,车费

功能如下: 1.View 主要功能讲sam文件转位bam文件. 涉及的参数: -b 输出bam格式..默认是sam文件 -h 输出的sam文件带header..默认不带 -H 仅仅输出header -S 输入sam文件..默认bam文件 -u 输出bam文件不进行压缩..必须有-b参数 -c 输出比对上的数 -f 输出含有所有flag都reads -F 输出没有flag的reads..数字4代表改reads没有比对上,数字8表示mate序列没有比对上 -q 比对的最低质量值..一般20就可以 例

本篇原文地址:Sorting, Filtering, and Paging 说明:学习笔记参考原文中的流程,为了增加实际操作性,并能够深入理解,部分地方根据实际情况做了一些调整:并且根据自己的理解做了一些扩展. 本人的学习环境: VS2017 + EF 6.1.3 + .NET 4.6.1 上一篇完成基本的CRUD操作:本篇学习如何进行排序显示.过滤查询及分页显示: Step1 排序显示,主要是对Student列表页面进行点击表列头进行该列排序:点击一次从正序变为反序,再点击一次从反序变为正序:

EF6 学习笔记索引目录页: ASP.NET MVC5 及 EF6 学习笔记 - (目录整理) 上篇:EF6 学习笔记(二):操练 CRUD 增删改查 本篇原文地址:Sorting, Filtering, and Paging 说明:学习笔记参考原文中的流程,为了增加实际操作性,并能够深入理解,部分地方根据实际情况做了一些调整:并且根据自己的理解做了一些扩展. 本人的学习环境: VS2017 + EF 6.1.3 + .NET 4.6.1 上一篇完成基本的CRUD操作:本篇学习如何进行排序显示.

http://blog.csdn.net/ritterliu/article/details/39295271 From漫天尘沙 在图解Android - Zygote 和 System Server 启动分析一 文里,我们已经知道Android 应用程序是怎么创建出来的,大概的流程是 ActivityManagerService -> Zygote -> Fork App, 然后应用程序在ActivityThread 中的进入loop循环等待处理来自AcitivyManagerService

1)samtools简介--------------------------------------------------------------------------背景:前面我们讲过sam/bam格式,sam文件虽然是可读的文本文件形式,但是通常是非常大,因此一般会对其压缩来节省磁盘空间,且对于很多软件来说,相比于对sam文件,对bam文件进行处理更加有效.SAMtools 是一款优秀的用以解析.处理sam/bam格式文件的一种软件包工具.其详细的文档可以在其官网里面找到.它主要包含以下