1. sparse模块的官方document地址:http://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/sparse.html   2. sparse matrix的存储形式有很多种,见此帖子http://blog.csdn.net/anshan1984/article/details/8580952 不同的存储形式在sparse模块中对应如下: bsr_matrix(arg1[, shape, dtype, copy, blocksize]) Block Spar

本文以csr_matrix为例来说明sparse矩阵的使用方法,其他类型的sparse矩阵可以参考https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/sparse.html csr_matrix是Compressed Sparse Row matrix的缩写组合,下面介绍其两种初始化方法 csr_matrix((data, (row_ind, col_ind)), [shape=(M, N)]) where data, row_ind and col_ind s

print(train_set.tdm) print(type(train_set.tdm)) 输出得到: (0, 3200) 0.264940780338 (0, 1682) 0.356545827856 (0, 3875) 0.404535449364 (0, 2638) 0.375094236628 (0, 2643) 0.420086333071 (0, 558) 0.332314202381 (0, 2383) 0.215711023304 (0, 3233) 0.3048846436

import numpy as np import scipy.sparse as sp m = sp.lil_matrix((7329,7329)) np.save(path,m) #用numpy的load方法存储矩阵,path为存储的路径 mat = np.load(path)[()] #读取存储的矩阵,注意[()]这个符号可以抽取对象 mat = mat.toarray() #将稀疏矩阵转为稠密矩阵

一.scipy.sparse中七种稀疏矩阵类型 1.bsr_matrix:分块压缩稀疏行格式 介绍 BSR矩阵中的inptr列表的第i个元素与i+1个元素是储存第i行的数据的列索引以及数据的区间索引,即indices[indptr[i]:indptr[i+1]]为第i行元素的列索引,data[indptr[i]: indptr[i+1]]为第i行元素的data. 在下面的例子中,对于第0行,indptr[0]:indptr[1] -> 0:2,因此第0行的列为indice[0:2]=[0,2],

from 博客园(华夏35度)http://www.cnblogs.com/zhangchaoyang 作者:Orisun 本文主要围绕scipy中的稀疏矩阵展开,也会介绍几种scipy之外的稀疏矩阵的存储方式. dok_matrix 继承自dict,key是(row,col)构成的二元组,value是非0元素. 优点: 非常高效地添加.删除.查找元素 转换成coo_matrix很快 缺点: 继承了dict的缺点,即内存开销大 不能有重复的(row,col) 适用场景: 加载数据文件时使用dok

scipy 里面的sparse函数进行的矩阵存储 可以节省内存 主要是scipy包里面的 sparse 这里目前只用到两个 稀疏矩阵的读取 sparse.load() 转稀疏矩阵为普通矩阵 sparse.to_dense() 处理成为普通矩阵之后可以调用pd.DataFrame()转化为数据框之后的操作就比较好进行了.可以基于pandas和numpy包进行了 处理成为稀疏矩阵之后可以参考官方文档 参考笔记 学完补充,去写个demo

特定函数 例贝塞尔函数: 积分 quad,dblquad,tplquad对应单重积分,双重积分,三重积分 from scipy.integrate import quad,dblquad,tplquad 需要传递参数使用args 对于简单函数可知直接使用匿名函数 -Inf和Inf可以表示数值极限 高阶微分的用法相似 常微分方程: scipy提供了两种方式解常微分方程,基于odeint的API和基于ode类面向对象的API from scipy.integrate import odeint,od

最近写了个小程序,用PyQt5做的界面,写完之后用py2exe打包成独立的exe文件,运行正常. 后来由于需要,调用SciPy.io.loadmat,改写setup.py,打包之后运行错误,提示: Traceback (most recent call last): File "comtrade.py", line 7, in <module> File "C:\Anaconda3\lib\site-packages\scipy\io\__init__.py&qu

SciPy - 科学计算库(上) 一.实验说明 SciPy 库建立在 Numpy 库之上,提供了大量科学算法,主要包括这些主题: 特殊函数 (scipy.special) 积分 (scipy.integrate) 最优化 (scipy.optimize) 插值 (scipy.interpolate) 傅立叶变换 (scipy.fftpack) 信号处理 (scipy.signal) 线性代数 (scipy.linalg) 稀疏特征值 (scipy.sparse) 统计 (scipy.stats)

Scipy简介 文件输入和输出scipyio 线性代数操作scipylinalg 快速傅里叶变换scipyfftpack 优化器scipyoptimize 统计工具scipystats Scipy简介 Scipy是一个高级的科学计算库,它和Numpy联系很密切,Scipy一般都是操控Numpy数组来进行科学计算,所以可以说是基于Numpy之上了.Scipy有很多子模块可以应对不同的应用,例如插值运算,优化算法.图像处理.数学统计等. 以下列出Scipy的子模块: 模块名 功能 scipy.clu

coo_matrix.tocsr(copy = False ) 将此矩阵转换为压缩稀疏行格式,重复的条目将汇总在一起. 举例: from numpy import array from scipy.sparse import coo_matrix row = array([0, 0, 1, 3, 1, 0, 0]) col = array([0, 2, 1, 3, 1, 0, 0]) data = array([1, 1, 1, 1, 1, 1, 1]) A = coo_matrix((data

from scipy.sparse import csr_matrix import numpy as np indptr = np.array([0, 2, 3, 6]) indices = np.array([0, 2, 2, 0, 1, 2]) data = np.array([1, 2, 3, 4, 5, 6]) #表示要构建稀疏矩阵的数据 #按照行来压缩, #方法:第i行(本例中i=0,1,2), #非零数据列的索引为indices[indptr[i]:indptr[i+1]] #非零

参考文档补充原本的文档: https://www.cnblogs.com/mrchige/p/6504324.html 一:原本的简单介绍 1.Scipy库 Scipy库是基于python生态的一款开源数值计算,科学与工程应用的开源软件,包括常用的NumPy,pandas,matplotlib等库. https://www.scipy.org/: 2.介绍 SciPy是一款方便.易于使用.专为科学和工程设计的Python工具包.它包括统计,优化,整合,线性代数模块,傅里叶变换,信号和图像处理,常

Scipy扩展包括多种多样的工具箱,这些工具致力于解决科学计算中的常见问题.不同的子模块对应不同的应用,比如插值, 整合, 优化, 图像处理, 统计, 特殊功能等等. scipy可以和其他的标准科学计算包相提并论,比如GSL(C 和 C++编写的GNU科学库), 或者 Matlab 的工具箱. scipy是Python科学计算中的核心扩展:它能够在numpy列表上有效的运作,以便numpy 和 scipy 能够互相协同. 在执行一个历程之前,值得核对期望的数据处理工作是否已经在Scipy中执行.

sklearn实战-乳腺癌细胞数据挖掘(博主亲自录制视频教程) https://study.163.com/course/introduction.htm?courseId=1005269003&utm_campaign=commission&utm_source=cp-400000000398149&utm_medium=share 医药统计项目可联系 QQ:231469242 http://www.kancloud.cn/wizardforcel/scipy-lecture-n

1.生成随机稀疏矩阵: scipy中生成随机稀疏矩阵的函数如下: scipy.sparse.rand(m,n,density,format,dtype,random_state) 1 参数介绍: 参数 含义 m,n 整型:表示矩阵的行和列 density 实数类型:表示矩阵的稀疏度 format str类型:表示矩阵的类型:如format=‘coo’ dtype dtype;表示返回矩阵值的类型 ranom_state {numpy.random.RandomState,int};可选的随机种子

一.sparse模块: python中scipy模块中,有一个模块叫sparse模块,就是专门为了解决稀疏矩阵而生.本文的大部分内容,其实就是基于sparse模块而来的 导入模块:from scipy import sparse 二.七种矩阵类型 coo_matrix dok_matrix lil_matrix dia_matrix csr_matrix csc_matrix bsr_matrix 三.coo_matrix coo_matrix是最简单的存储方式.采用三个数组row.col和da

推荐直接看官方文档:https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/generated/scipy.sparse.coo_matrix.html#scipy.sparse.coo_matrix 1分钟搞懂简版,首先直接看例子: >>> # Constructing a matrix using ijv format >>> row = np.array([0, 3, 1, 0]) >>> col = np.arra