单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用.其中转录组测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录本的表达情况.但传统的转录组测序技术(bulk RNA-seq)是基于群体细胞,每个样本包含成千上万个细胞,所以最终反映的是基因在群体细胞中平均表达水平,从而掩盖了不同细胞之间的表达异质性.近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-

seq - print a sequence of numbers [root@gechong ~]# man seq 主要有一下三个参数 -f:用来格式化输出 -s:用来指定分隔符号,默认是回车 -w:输出同宽数列,不足的位数用0补齐 例如: [root@gechong ~]# seq -f 100%g 10 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 [root@gechong ~]# seq 1 3 10 1 4 7 一个简单的脚本实现1000

seq: squeue  是一个序列的缩写,主要用来输出序列化的东西 seq常见命令参数 用法:seq [选项]... 尾数 或:seq [选项]... 首数 尾数 或:seq [选项]... 首数 增量 尾数 以指定增量从首数开始打印数字到尾数. -f, --format=格式 使用printf 样式的浮点格式 -s, --separator=字符串 使用指定字符串分隔数字(默认使用:\n) -w, --equal-width 在列前添加0 使得宽度相同[自动补位] --help 显示此帮助信

Transformation和action详解 视频教程: 1.优酷 2.YouTube 什么是算子 算子是RDD中定义的函数,可以对RDD中的数据进行转换和操作. 算子分类: 具体: 1.Value数据类型的Transformation算子,这种变换并不触发提交作业,针对处理的数据项是Value型的数据. 2.Key-Value数据类型的Transfromation算子,这种变换并不触发提交作业,针对处理的数据项是Key-Value型的数据对. 3.Action算子,这类算子会触发SparkC

上篇文章简单讨论了虚拟机的原理,这篇文章我们详细讨论下指令,具体从几种典型的SQL语句来看看每种SQL对应的指令流,以及每个指令的含义.通过explain语句,可以看到语句对应的指令流:通过pragma vdbe_trace=on指令,我们甚至可以得到语句对应的指令执行流程,包括跳转等.测试表结构 CREATE TABLE t1( id integer primary key autoincrement, user_id int, c1 ), c2 ) ); 测试语句(1)INSERT sqli

Linux下history命令用法 ^_^在项目中希望调用history命令来获取用户的历史记录,方便分析,可是我们平时所见到的history结果是下面这样: # history | head -10 30 rm -fr lala 31 for i in `seq 1000`; do 32 sleep 1 33 for i in `seq 1000`; do sleep 10 34 cd /home/ 35 ll 36 cd lib/ 37 ll 38 cd .. 39 ll 貌似达不到我们想要

Bugly 技术干货系列内容主要涉及移动开发方向,是由Bugly邀请腾讯内部各位技术大咖,通过日常工作经验的总结以及感悟撰写而成,内容均属原创,转载请标明出处 微信大家都在用,但微信的本地文件到底隐藏着什么样的信息呢?我们怎么可以把长得都一样的微信,变的跟别人的不一样,来个专业定制100年呢?这个是一个让大家的微信也从开始变得邪魅狷狂霸酷拽的帖子~~ 微信名的hash 值 苹果手机连用 itools 打开微信的文件夹, documents 目录下面是不是一堆文件夹?之类的看起来像天书一样的文字.

1. TCP/IP模型 我们一般知道OSI的网络参考模型是分为7层:“应表会传网数物”——应用层,表示层,会话层,传输层,网络层,数据链路层,物理层.而实际的Linux网络层协议是参照了OSI标准,但是它实现为4层:应用层,传输层,网络层,网络接口层.OSI的多层对应到了实际实现中的一层.我们最为关注的是传输层和网络层.一般而言网络层也就是IP层,负责IP路由寻址等等细节,而传输层TCP/UDP负责数据的可靠/快速的传输功能. 网络的实际运行过程就是发送方,从高层向底层,根据协议对数据进行一层一

  今天看kafka,有一个参数选项中有: 'S'   seq=strtoull(optarg,NULL,10); do_seq=1; 之后查找了下 strtoull 函数的功能,了解如下: ----------------------------------- from:http://zengwu3915.blog.163.com/blog/static/27834897201262562912597/ 名字: strtol, strtoll, strtoul, strtoull conver

分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离ggplot2是按图层作图ggplot2保有命令式作图的调整函数,使其更具灵活性ggplot2将常见的统计变换融入到了绘图中.ggplot的绘图有以下几个特点:第一,有明确的起始(以ggplot函数开始)与终止(一句语句一幅图):其二,图层之间的叠加是靠"+"号实现的,越后面其

输入文件 Scalding既可以处理HDFS上的数据,也可以很方便地在本地运行处理一些test case便于debug,Source有好多种 1 TextLine(filename) TextLine(args("input"))或者TextLine("~/data/input.txt") 对每行数据,产生包含'line和'offset两个field的tuple 2 Csv和Tsv 本地文件和HDFS文件都可以用,读时可以指定field名 Tsv(args(&quo

code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && document.readyState && document.readyState === "complete") { window.setTimeout(function() { hljs.initHighlighting(); }, 0);}.main-container {

1. [命令]:cat [功能说明]: concatenate files and print on the standard output #连接文件并打印到标准输出,有标准输出的都可以用重定向定向导入到文件里面 [语法格式]: cat [OPTION]...[FILE]... [选项参数]: 参数 说明 简解 -b,--number-nonblank number nonempty output lines 非空输出行编号 -n,--number number all outputnline

cubrid的中sql查询语法Hierarchical QuerySQL层级查询 ------ 官方文档是英文的,看不明白可以参看ocracle的同类函数说明.很多都是一样的. ORACLE中CONNECT BY...START WITH 和ocracle的差不多 ,下面的说明就直接抄袭过来 http://www.iwwenbo.com/oracle-start-with-connect-by/ 其中,[where 条件1] 可以不需要,[where 条件1]是对根据[start with 条件

一般人都知道 H 和 S 的表面上的区别,即 S 就是 soft, H 就是 hard,S 后,序列里还是会保留序列的信息,而 H 则不会. -------------------------------------------后面都不用看了,H和S没有区别,比对软件不能发现嵌合体-------------------------------------- 但这只是表面上的,在深层次的意义上, H 和 S 又有什么本质的不同呢? 首先要了解嵌合体的概念: 嵌合体就是两个不同的序列错误的拼接到了一

从今天开始认真复习<Play for JAVA>,该书以一个案例为主线,以前为应付项目马马虎虎看了一遍,好多地方都不明白!现在跟着这本书再走一遍,认真模拟,当做一个项目啦!! 一.Play设置和新建Play项目 1.Play设置 1) 从http://playframework.org下载Play,并解压到你选择的目录 2) 设置path

R语言最基本的数据类型-向量(vector) 1.插入向量元素,同一向量中的所有的元素必须是相同的模式(数据类型),如整型.数值型(浮点数).字符型(字符串).逻辑型.复数型等.查看变量的类型可以用typeof(x)函数查询. > #插入向量元素 > x <- c(88,5,12,13) > x [1] 88 5 12 13 > x <- c(x[1:3],168,x[4]) #插入168数字在13之前 > x [1] 88 5 12 168 13 > 2.

颜色.图例和线 在散点图中添加信息.图例以及回归线. 模拟数据 #模拟数据 dat <- data.frame(X = runif(100,-2,2),T1 = gl(n=4,k=25,labels = c("Small","Medium","Large","Big")),Site = rep(c("Site1","Site2"),time = 50)) mm <- mode

一 什么是sqlmap sqlmap is an open source penetration testing tool that automates the process of detecting and exploiting SQL injection flaws and taking over of database servers. It comes with a powerful detection engine, many niche features for the ultim

创建向量矩阵 > x1=c(2,3,6,8) > x2=c(1,2,3,4) > a1=(1:100) > length(a1) [1] 100 > length(x1) [1] 4 > mode(x1) [1] "numeric" > rbind(x1,x2) [,1] [,2] [,3] [,4] x1 2 3 6 8 x2 1 2 3 4 > cbind(x1,x2) x1 x2 [1,] 2 1 [2,] 3 2 [3,] 6 3

1:grep命令: grep -v  "char"  file_name 匹配不包括"char"的文本 grep -n -w "char" file_name 完整匹配某个字符 grep ^s $s  分别为匹配行首为s的 或者行末为s的文本. 2:tr 命令 tr set1  set2   替换集合set1 为set2 tr -s set1  压缩字符 tr -t  ":"     指定分隔符 默觉得空格 tr -d &qu