在生信处理流程中,从最初的fastq文件,经过分析处理后,会生成一堆的后续文件,如何在流程中合理的命名呢? 通常在批处理模式中,我们会得到多个样本*.fastq(或*.fq.*.fastq.gz.*.fq.gz)路径名文件sample.txt.如下所示: /home/yhwang/sample/sampe01_R1.trimmed.fastq.gz /home/yhwang/sample/sample01_R2.trimmed.fastq.gz /home/yhwang/sample/sampe

摘自:https://www.jb51.net/article/121290.htm 前言 我们在日常工作中,对于求字符串操作在shell脚本中很常用,实现的方法有很多种,下面就来给大家归纳.汇总了求字符串的几种可能方法,话不多说了,来一起看看详细的介绍吧. 方法如下: [方法一]:利用${#str}来获取字符串的长度 [方法二]:利用awk的length方法 备注: 1) 最好用{}来放置变量 2) 也可以用length($0)来统计文件中每行的长度 [方法三]:利用awk的NF项来获取字符串

方法1: 使用wc -L命令 wc -L可以获取到当前行的长度,因此对于单独行的字符串可以用这个简单的方法获取,另外wc -l则是获取当前字符串内容的行数. 代码如下: echo "abc" |wc -L 方法2: expr length string 使用expr length可以获取string的长度 方法3: awk获取域的个数,但是如果大于10个字符的长度时是否存在问题需要后面确认 代码如下: echo "abc" |awk -F ""

awk 方式 bogon:conf macname$ echo "abcde" | awk '{print length($0)}' 利用${#str}来获取字符串的长度 bogon:conf macname$ a="abcdef" bogon:conf macname$ echo ${#a} wc 方式(注意是包含换行符的) bogon:conf macname$ echo "abcde" | wc -c 参考: https://www.jb5

Shell中获取字符串长度的七种方法 原文:http://blog.csdn.net/jerry_1126/article/details/51835119 求字符串操作在shell脚本中很常用,下面归纳.汇总了求字符串的几种可能方法: [方法一]:利用${#str}来获取字符串的长度 [方法二]:利用awk的length方法 备注: 1) 最好用{}来放置变量 2) 也可以用length($0)来统计文件中每行的长度 [方法三]:利用awk的NF项来获取字符串长度 备注: -F为分隔符,NF为

Application.StartupPath获取执行文件路径substring()取特定长度字符串取得根目录 2012-07-20 10:48 257人阅读 评论(0) 收藏 举报 path using System.Windows.Forms; 控制台程序添加System.Windows.Forms; 因为是控制台应用程序,还要去添加引用 //获取了应用程序路径,不包括可执行文件名称. string path1 = Application.StartupPath; Console.Write

NX9+VS2012 #include <uf.h> UF_initialize(); //UFUN获取环境变量路径 //将环境变量转换为字符串 char* GetName = NULL; UF_translate_variable("UGII_BASE_DIR", &GetName); //环境变量路径字符串拼接 string BaseDir1 = GetName; string BaseDir2 = "\\MODLE\\ABC.prt"; s

获取字符串的MD5值: 字符串“hello”的MD5: $ echo -n 'hello'|md5sum|cut -d ' ' -f1 得到的MD5值: 5d41402abc4b2a76b9719d911017c592 命令解释: md5sum: 显示或检查 MD5(128-bit) 校验和,若没有文件选项,或者文件处为"-",则从标准输入读取. echo -n : 不打印换行符. cut:  cut用来从标准输入或文本文件中剪切列或域.剪切文本可以将之粘贴到一个文本文件. -d 指定

获取字符串长度的七种方法 1. \${#str} 2.awk的length 备注:1) 最好用{}来放置变量2) 也可以用length($0)来统计文件中每行的长度 3.awk的NF 备注: -F为分隔符,NF为域的个数,即单行字符串的长度 4.wc的-L 备注: -L参数1) 对多行文件来说,表示打印最长行的长度! 82,表示/etc/passwd文件最长行的长度为822) 对单行字符串而言,表示当前行字符串的长度! 5.wc -c 备注: 1) -c参数: 统计字符的个数2) -n参数: 去

Shell的字符串处理   1 得到长度   %x="abcd"  #方法一      %expr length $x      4  # 方法二      %echo ${#x}      4  # 方法三      %expr "$x" : ".*"      4  # expr 的帮助  # STRING : REGEXP   anchored pattern match of REGEXP in STRING 2 查找子串     %ex

1.替换字符串,即将某一字符串中的特定字符或字符串替换为给定的字符串.举例说明其功能:========================================= @echo off set aa=伟大的中国!我为你自豪! echo 替换前:%aa% echo 替换后:%aa:中国=中华人民共和国% echo aa = %aa% set "aa=%aa:中国=中华人民共和国%" echo aa = %aa% pause ==============================

Linux Shell 截取字符串 shell中截取字符串的方法很多 ${var#*/} ${var##*/} ${var%/*} ${var%%/*} ${var:start:len} ${var:start} ${var:0-start:len} ${var:0-start} 下面用几个例子展示一下: 1) 获得字符串的长度 语法: ${#var} 示例代码: str="http://www.fengbohello.xin3e.com/blog/shell-truncating-string

C#.ASP.NET获取当前应用程序的绝对路径,获取程序工作路径   ============================================ 使用 Application.StartupPath 至于 System.IO.Directory.GetCurrentDirectory不行,因为应用程序有个当前工作目录,这个工作目录是会变的,不总是程序的启动目录(当然默认启动是应用程序目录). 比如说,你打开命令行(cmd),它就会显示一个路径,你会发现这个路径(通常是 C:/Doc

废话不多说直接看代码 JavaScript中的代码: var re = /src=\"([^\"]*?)\"/i; var arr = str.match(re); if (arr != undefined && arr.length > 0) { insertHtml = arr[1]; } ASP.NET中获取方式: /// <summary> /// 获取字符串中img的url集合 /// </summary> /// &l

java获取classpath文件路径空格转变成了转义字符%20的问题 这个问题很纠结,服务器的文件路径带有空格,空格被转化是%20了,悲剧就出现了 下面展示一段代码String path = getClass().getResource("/").getPath();或String path = getClass().getClassLoader.getResource("").getPath();  如果当前路径中包含了空格,则返回的路径字符串空格则被转义为(%

一. 获取执行程序所在路径 1.获取和设置当前目录的完全限定路径. string str = System.Environment.CurrentDirectory;  //获取的是主程序目录,线程启动的子程序内获取的路径也是主程序的工作目录 Result: C:\xxx\xxx 2.获取启动了应用程序的可执行文件的路径,不包括可执行文件的名称. string str = System.Windows.Forms.Application.StartupPath; //exe 执行目录 Resul

string str = "<form id=\"form1\" runat=\"server\"><div><p><img src=\"img/01300000278409123123126754611.jpg\" alt=\"\" /></p><p><img src=\"img/16583711.jpg\" alt=

#include <stdio.h> #include <locale.h> #include <windows.h> #include <tlhelp32.h> #include <tchar.h> #include <Psapi.h> #pragma comment (lib,"Psapi.lib") BOOL DosPathToNtPath(LPTSTR pszDosPath, LPTSTR pszNtPat

1)获取web上下文路径 public void doGet(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response) throws ServletException, IOException { //获取ServletContext对象 //this.getServletConfig().getServletContext(); //等同于下面一句,因为创建getServletContext必须要通过getServletConfig对象

取文件名 ExtractFileName(FileName); 取文件扩展名: ExtractFileExt(filename); 取文件名,不带扩展名: 方法一:   Function ExtractFileNameNoExt(FileString: String): String;   Var   FileWithExtString: String;   FileExtString: String;   LenExt: Integer;   LenNameWithExt: Integer;

Linux shell获取时间和时间间隔(ms级别) 说明:在进行一些性能测试的时候,有时候我们希望能计算一个程序运行的时间,有时候可能会自己写一个shell脚本方便进行一些性能测试的控制(比如希望能运行N次取平均值等),总之,这其中有一个需求可能就是获取一个时间戳或时间差. 1. Linux shell获取时间的相关命令 time命令:获取一个程序的执行时间,可以获取到实际运行时间以及程序在用户态和内核态分别的时间,大部分的性能测试,可能只需要关注实际时间. time命令的使用就很简单了,在原