snakemake 监控输入文件夹变化

2024-11-09

snakemake使用笔记

snakemake是一个用来编写任务流程的工具,用python编写的,因此其执行的流程脚本也比较通俗易懂,易于理解. 一.从一个简单的例子开始 1.安装snakemake 安装snakemake的方法有多种,snakemake官方推荐的是conda,安装方法如下: conda install -c bioconda snakemake 2.一个简单的snakemake脚本虽然snakemake广泛的应用于生物信息方面的流程编写,但是snakemake的应用并不局限于编写生物信息学的流程,这里以

Storm监控文件夹变化统计文件单词数量

监控指定文件夹,读取文件(新文件动态读取)里的内容,统计单词的数量. FileSpout.java,监控文件夹,读取新文件内容 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65

C#监控文件夹变化

当需要监控某一文件,FileSystemWatcher类提供了Created, Deleted,Rename等事件. 就拿FileSystemWatcher的Created事件来说,该事件类型是FileSystemEventHandler. public delgate void FileSystemEventHandler(Object sender, FileSystemEventArgs e) ○ sender表示事件的发起者○ e表示事件参数在C盘创建temp文件夹. 客户端. cla

使用TheFolderSpy监控文件夹的变化-邮件通知

一.概述当我们的文档或者代码文件发布在公网.共享文件夹中,其他用户具备访问或修改的权限时,就存在文档被覆盖或删除的分享.另外一个典型的场景,发布在Web服务器上的网页文件,在网站版本不更新的时间,服务器上的文件一般保持不变,如果出现异常的变更,一般是由于遭到了黑客攻击,如果我们能够对站点中的文件变更得到实时通知,这对与服务器的安全无疑是非常有利的. 如果共享文档的存储服务器是类似TFS.SharePoint Server等具备版本管理功能的软件,我们还可以通过应用软件自带的版本功能恢复文件,也

java监控指定路径下文件及文件夹变化

之前用jdk7的WatchService API(java.nio.file包)来做目录下的子文件监控,后改为使用commons-io包.主要有下面几点不同:1. WatchService是采用扫描式的,效率低,commons-io是使用事件驱动的,效率高:2. WatchService代码写起来费劲 3. WatchService不能监听到孙文件目录(多级目录),事先父文件夹需要存在,而FileAlterationObserver可以监听多级目录,父目录事先不存在也没问题.http://co

Python 的 pyinotify 模块监控文件夹和文件的变动

官方参考: https://github.com/seb-m/pyinotify/wiki/Events-types https://github.com/seb-m/pyinotify/wiki/Install 最近在网上看到python有个pyinotify模块,其中他们可以监控文件夹内的文件的创建,修改,读取,删除等系列操作,我修改了下,添加了可以吧操作记录写到日志里的一点方法,下面就贴出代码了给大家分享下:#!/usr/bin/env python import os import da

[转帖]Linux下inotify监控文件夹状态，发生变化后触发rsync同步

Linux下inotify监控文件夹状态,发生变化后触发rsync同步 https://www.cnblogs.com/fjping0606/p/6114123.html 1.安装工具--inotify wget http://cloud.github.com/downloads/rvoicilas/inotify-tools/inotify-tools-3.14.tar.gz tar -zxvf inotify-tools-3.14.tar.gz cd inotify-tools-3.14 .

.NET Core的文件系统[1]：读取并监控文件的变化

ASP.NET Core 具有很多针对文件读取的应用.比如我们倾向于采用JSON文件来定义配置,所以应用就会涉及针对配置文件读取.如果用户发送一个针对物理文件的HTTP请求,应用会根据指定的路径读取目标文件的内容并对请求予以响应.在一个ASP.NET Core MVC应用中,针对View的动态编译会涉及到根据预定义的路径映射关系来读取目标View.这些不同应用场景都会出现一个FileProvider对象的身影,以此对象为核心的文件系统提供了统一的API来读取文件的内容并监控内容的改变. [ 本文

angularJS使用$watch监控数据模型的变化

使用$watch监控数据模型的变化在scope 内置的全部函数中,用得最多的可能就是$watch 函数了.当你的数据模型中某一部分发生变化时,$watch 函数能够向你发出通知.你能够监控单个对象的属性.也能够监控须要经过计算的结果(函数),实际上仅仅要能够被当作属性訪问到,或者能够当作一个JavaScript 函数被计算出来,就能够被$watch 函数监控.它的函数签名为 $watch(watchFn, watchAction, deepWatch) 当中每一个參数的具体含义例如以下. wa

nodejs 监听文件夹变化的模块

使用Node.JS监听文件夹变化 fs.watch 其中Node.JS的文件系统也可侦听某个目录的改变, 如fs.watch 其中fs.watch的最大缺点就是不支持子文件夹的侦听,并且在很多情况下会侦听到两次事件(很多编辑器在保存的时侯是先把原文件清空,再进行保存,因此会触发两次文件夹改变事件).因此需要一些开源的模块来监听文件夹目录的改变. chokidar chokidar 是一个基于node.JS的监听文件夹改变模块. 安装 npm install chokidar watch W

JavaScript监控输入框字数变化，超出限制则禁止输入

JavaScript监控输入框字数变化,超出则禁止输入不废话,给你看看效果: 1.无输入状态: 2.输入三个字符: 3.超出5个后报错: 现在粘出代码,首先是html代码: <body> <div class="weui-cells__title" style="font: '微软雅黑';font-size: 17px;color: black;" align="center">大文本框:</div> <

java 监听文件或者文件夹变化的几种方式

1.log4j的实现的文件内容变化监听 package com.jp.filemonitor; import org.apache.log4j.helpers.FileWatchdog; public class Log4jWatchdog { public static void main(String[] args) { GloablConfig gloablConfig = new GloablConfig("D:\\create_lo\\text.txt"); gloablCo

【.Net 学习系列】-- FileSystemWatcher 监控文件夹新生成文件，并在确认文件没有被其他程序占用后将其移动到指定文件夹

监控文件夹测试程序: using System; using System.Collections.Generic; using System.IO; using System.Linq; using System.Text; using System.Threading; using System.Threading.Tasks; namespace FileSystemWatcherTest { class Program { static void Main(string[] args)

【转载】java 监听文件或者文件夹变化的几种方式

DotNetCore跨平台~Quartz热部署的福音～监控文件夹的变化

在DotNetCore出来之后,同时也使用了quartz进行调度中心的设计,将它做到docker里方便部署,在之前的quartz版本里支持配置文件的方式,而现在不支持了,我们应该去想一下,为什么不去支持配置文件?当然大叔也为配置文件设计了支持的方式,但我们还是应该想想作者为什么不去支持配置? 热支持,服务发现? 和上面两个概念可能有点关系,热插拔很容易理解,就是把dll模块放到正在运行的项目时,它可以直接启动,这个功能对调度中心来说,很是必要,因为你可能需要按着不同的功能设计一些服务job,而这

java监控文件夹下的文件变化使用jnotify

https://blog.csdn.net/codepython/article/details/42341243?utm_source=blogxgwz1 使用jnotify https://blog.csdn.net/stalin_/article/details/80234979 下载资源,添加maven导入开发时把jnotify_64bit.dll(64位系统用)扔到jdk的jre文件夹下bin目录比如C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_201\jre\bin

C# FileSystemWatcher 在监控文件夹和文件时的用法

概述最近学习FileSystemWatcher的用法,它主要是监控一个文件夹,当文件夹内的文件要是有更改就要记录下来,我就整理下我对FileSystemWatcher 的理解和用法. FileSystemWatcher 用法在应用FileSystemWatcher对象之前,你必须了解这个对象的一些基本属性和事件.毫无疑问,这个对象的最重要的属性为“EnableRaisingEvents”属性. 这个属性决定对象在收到改变通知时是否提交事件.如果EnableRaisingEvents属性设为假

Java NIO.2 使用Path接口来监听文件、文件夹变化

Java7对NIO进行了大的改进,新增了许多功能: 对文件系统的访问提供了全面的支持提供了基于异步Channel的IO 这些新增的IO功能简称为 NIO.2,依然在java.nio包下. 早期的Java只提供了File类来操作文件.文件夹本身,功能有限,性能也不高. NIO.2为解决这种缺陷,提供了Path接口,并提供了Paths.Files2个工具类,这2个工具类包含的方法都是静态方法,Files类提供了大量的静态方法来操作文件.文件夹. Path接口.Paths工具类使用示例: //获取指

使用FileSystemWatcher监控文件夹及文件

引言这一周主要精力集中学习一个同事开发的本地文件搜索项目上,其中客户端添加共享文件时主要是使用FileSystemWatcher 监控文件,并在各种事件发生时向服务器发送消息. 解决方法 FileSystemWatcher类以前也使用过,没有太仔细去观察,这次使用时才发现其事件提示会很有趣: a):当你添加文件或文件夹时,会触发Created事件,然后修改默认文件夹或文件名称再触发Changed事件. b):复制或移动文件夹文件时则是触发Created事件. c):删除文件夹或文件时触发Del

实时监控mysql数据库变化

对于二次开发来说,很大一部分就找找文件和找数据库的变化情况对于数据库变化.还没有发现比较好用的监控数据库变化监控软件. 今天,我就给大家介绍一个如何使用mysql自带的功能监控数据库变化 1.打开数据库配置文件my.ini (一般在数据库安装目录)(D:\MYSQL) 2.在数据库的最后一行添加 log=log.txt 代码 3.重启mysql数据库 4.去数据库数据目录我的是(D:\MYSQL\data) 你会发现多了一个log.txt文件我的是在C:\Documents and Set

多线程监控文件夹,FlieSystemWatcher,并使用共享函数

发表于: 2011-01-06 09:55:47 C# code ? 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 7

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