tabix 可以对NGS分析中常见格式的文件建立索引,从而加快访问速度,不仅支持VCF文件,还支持BED, GFF,SAM等格式. 下载地址: 1 https://sourceforge.net/projects/samtools/files/tabix/ 2 3 ##安装 4 wget https://sourceforge.net/projects/samtools/files/tabix/tabix-0.2.6.tar.bz2 5 tar xjvf tabix-0.2.6.tar.bz2

这几天实现了个Lucene分布式检索的模块,采用的分布式方案是将数据分块,分别生成N个索引文件,放到N个节点上运行.检索时,对每一个节点发出查询请求,将N个节点返回的结果归并,然后生成一个新的结果.如果没看明白,可以看看我的帖子 http://www.iteye.com/topic/212046 ,这个方案同帖子中的思想是一致的. 用这样的方案,遇到的问题是归并过后的结果,同没有归并结果是有一定区别的.在实现这个方案前我也分析过,Lucene使用TF/IDF算法来计算相关度,所以会产生这样的问题

索引建立时      1.对原有索引文件进行建立,是可以访问索引文件中的数据的      2.建立新索引文件,必须等建立完毕后,才可以访问,新建立的文件如果没有建立完是不可以被访问的     如果想建立200w的数据的索引又想立即查看的话,先建立1w,建好之后再去建立199w,这样做!       新索引文件建立时: [webuser@localhost index]$ ls -l dataIndex/main/ 总计 149612 -rw-r--r-- 1 webuser users 7944

Solr4.8.0源码分析(12)之Lucene的索引文件(5) 1. 存储域数据文件(.fdt和.fdx) Solr4.8.0里面使用的fdt和fdx的格式是lucene4.1的.为了提升压缩比,StoredFieldsFormat以16KB为单位对文档进行压缩,使用的压缩算法是LZ4,由于它更着眼于速度而不是压缩比,所以它能快速压缩以及解压. 1.1 存储域数据文件(.fdt) 真正保存存储域(stored field)信息的是fdt文件,该文件存放了压缩后的文档,按16kb或者更大的模块大

Solr4.8.0源码分析(9)之Lucene的索引文件(2) 一. Segments_N文件 一个索引对应一个目录,索引文件都存放在目录里面.Solr的索引文件存放在Solr/Home下的core/data/index目录中,一个core对应一个索引. Segments_N例举了索引所有有效的segments信息以及删除的具体信息,一个索引可以有多个Segments_N,但是有效的往往总是N最大的那个,为什么会出现多个segments_N,主要是由于暂时无法删除它们或者有indexwriter

如何通过倾斜摄影数据手动配置s3c索引文件? 大家知道,倾斜摄影数据最常见的是OSGB格式,并且是由一个一个的Tile分级文件夹构成的Data文件夹.结构一般如下图所示: 那么,如何才能把模型的各个瓦片整合在一起浏览展示呢?这就需要生成一个索引文件了.下面我给大家一种手动配置s3c文件,在Acute3D Viewer加载的方法. 首先,先随便找一个任意的s3c文件,将其导入到Scene Composer中: 将这个s3c文件中的瓦片信息通过文本编辑的形式打开: 全选复制到Notepad++里,观

前提 安装JDK版本1.8或者以上 1 下载 http://www.sonatype.org/nexus/archived/  选择相应的版本 2 复制到/usr/local 下解压 sudo cp nexus-2.14.2-01-bundle.tar.gz /usr/local sudo tar -xzvf nexus-2.14.2-01-bundle.tar.gz 3 设置运行权限 sudo  chown  用户名 nexus-2.14.2-01 sudo chown 用户名 sonatyp

摘自:http://blog.csdn.net/cangyingzhijia/article/details/8592441 Sphinx使用的文件包括 "sph", "spa", "spi", "spd", "spp", "spm" ,还有锁文件.其中sph是系统的配置文件.其它则为索引文件. .Spi 文件:保存WordId及指向此WordId对应的文档信息在spd文件的指针.Spi

http://www.mubanzhijia.com/jishujiaocheng/826.html 在dedecms后台点击"更新主页Html"时,发生了什么?dedecms生成静态首页html文件的过程: 第一步.点击"更新主页Html". 在firebug下查看,我们知道,它往http://localhost/web_dede/dede/makehtml_homepage.php(我的网站根目录为/web_dede/),同时,我们还看到发送了post信息(注意

利用caffe生成 lmdb 格式的文件,并对网络进行FineTuning 数据的组织格式为: 首先,所需要的脚本指令路径为: /home/wangxiao/Downloads/caffe-master/examples/imagenet/ 其中,生成lmdb的文件为: create_imagenet.sh 接下来的主要任务就是修改自己的data的存放路径了. #!/usr/bin/env sh # Create the imagenet lmdb inputs # N.B. set the p

Solr4.8.0源码分析(10)之Lucene的索引文件(3) 1. .si文件 .si文件存储了段的元数据,主要涉及SegmentInfoFormat.java和Segmentinfo.java这两个文件.由于本文介绍的Solr4.8.0,所以对应的是SegmentInfoFormat的子类Lucene46SegmentInfoFormat. 首先来看下.si文件的格式 头部(header) 版本(SegVersion) doc个数(SegSize) 是否符合文档格式(IsCompoundF

Solr4.8.0源码分析(8)之Lucene的索引文件(1) 题记:最近有幸看到觉先大神的Lucene的博客,感觉自己之前学习的以及工作的太为肤浅,所以决定先跟随觉先大神的博客学习下Lucene的原理.由于觉先大神主要介绍的是Lucene3.X系的,那我就根据源码以及结合觉先大神的来学习下4.X系的.内容可能会有些变化,且加入下我个人的理解. http://www.cnblogs.com/forfuture1978/archive/2009/12/14/1623597.html 一. 基本类型

http://os.51cto.com/art/201108/282184_all.htm   1.Linux下重要日志文件介绍 /var/log/boot.log 该文件记录了系统在引导过程中发生的事件,就是Linux系统开机自检过程显示的信息,如图1所示: 图1 /var/log/boot.log示意 /var/log/cron 该日志文件记录crontab守护进程crond所派生的子进程的动作,前面加上用户.登录时间和PID,以及派生出的进程的动作.CMD的一个动作是cron派生出一个调度

使用ajax异步传值生成首字母索引大致有以下几个步骤: 1.服务器端使用servlet提取出数据库里的数据; 2.使用首字母工具类对数据进处理得到首字母; 3.再将首字母和数据一一对应存入json数组,并返回到客户端: 4.HBuilder中的html文件使用ajax接受传值并动态添加数据显示. 四点详细阐释如下: 1.用servlet提取数据库的数据应该不是什么问题,sql server.mysql等之类的数据库语句都是通用的,只是驱动和使用的jar包有所不同. public List<bai

POI生成Web版Word文件 1       通过URL的输入流实现 2       直接把Html文本写入到Word文件 所谓的使用POI生成Web版Word文件是指利用POI将Html代码插入到Word文件中使之呈现出Html代码对应的Web样式.下面将介绍两种方法来实现这一功能. 1       通过URL的输入流实现 通过URL实现的方式主要分为以下几步: 根据对应资源的Http路径构建一个URL. 获取URL对应的输入流. 构建一个默认的POIFSFileSystem. 通过构建的P

问题内容:在重装win10系统情况下,有可能会出现安装Git后右击Git bash会出现闪退并生成mintty.exe.stackdump文件 个人解决方案:查看网络上各位网友的意见和解决方法后,自己动手去实施,其中绝大部分是解决不了我遇到的上述的问题,但是有一个解决方案行得通,就是在C:/Window/System32/drivers/找到null.sys文件,并用其他运行成功的系统的null.sys文件替换掉它,然后在C:/Window/System32/找到cmd并右键管理员模式运行,输入

Lucene的索引里面存了些什么,如何存放的,也即Lucene的索引文件格式,是读懂Lucene源代码的一把钥匙. 当我们真正进入到Lucene源代码之中的时候,我们会发现: Lucene的索引过程,就是按照全文检索的基本过程,将倒排表写成此文件格式的过程. Lucene的搜索过程,就是按照此文件格式将索引进去的信息读出来,然后计算每篇文档打分(score)的过程. 本文详细解读了Apache Lucene - Index File Formats(http://lucene.apache.or

# dd if=/dev/zero of=50M.file bs=1M count=50在当前目录下生成一个50M的文件 虚拟块设备文件更通用的名称是硬盘镜像文件(Hard Disk Image),但不是所有的硬盘镜像文件都是虚拟块设备文件,例如,目前Ghost的GHO格式的镜像文件就不能成为虚拟机中的硬盘. Linux的dd命令,用来生成虚拟块设备文件.既可以用于创建空镜像文件,也可以用于创建物理硬盘的镜像. # dd if=/dev/hda0 of=/home/oldsong/hda0.im

前言 EDF文件可以直接导入Vivado,而无需Verilog源文件. 好处: (1)    避免沙雕队友修改源代码,则可以直接提交EDF网表文件. (2)    避免用户剽窃劳动成果. (3)    对于无需更改的设计复用,直接用EDF网表会贼方便. 软件版本:Vivado2018.3 流程 生成EDF网表文件 (1)设置需提交的源代码的最顶层为TOP层.可以看到内部调用了2个IP块. (2)在设置选项的综合设置中选中打平整个设计,防止别人看到模块层次. 设置-mode out_of_cont

在Windows环境下的实现方法   使用fsutil命令,在windows xp和win 7下应该都自带了这个命令.命令的格式是 fsutil file createnew 新文件名 文件大小.例如生成一个1K大小的文件,可以使用 fsutil file createnew test.txt 1024 可以使用dir 文件名 的方式查看生成的文件大小.操作结果如下图所示 如果用记事本打开生成的test.txt文件,记事本显示的内容为空.这是因为文件是通过二进制的方式写入的,并且二进制的内容恰好

实现:前台用的框架是Easyui+Bootstrap结合使用,需要引入相应的Js.Css文件.页面:Jsp.拦截请求:Servlet.逻辑处理:ClassBean.数据库:SQLserver. 注意:Bean中操作SQL语句进行处理是公司内部方法,可替换为其它方法自行扩展!主要看代码逻辑业务处理! 使用SQLserver数据库进行多表连接查询得出需要展出的数据 则前台数据展示使用的是Easyui中的datagrid数据列表进行展示. 随机点击一行数据,点击详情个人信息弹窗打开,数据以及被填充到弹