tmalign结构比对

2024-08-19

TM-align TM-score安装

TM-align是由zhang yang LAB开发的一款做蛋白结构比对的软件. 下载链接:http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/TM-align/TMtools20170708.tar.gz 平台:Linux 下载下来的为TMtools,压缩包里包含TM-align及TM-score的可执行文件及编译文件. 如果嫌安装麻烦,那你就可以使用可执行文件,但是作者推荐重新对两个工具进行编译,因为这样可以根据自己的PC的环境,使TM-align的速度最快. tar zx

【.net 深呼吸】细说CodeDom（1）：结构大观

CodeDom 是啥东东?Html Dom听过吧,XML Dom听过吧.DOM一般可翻译为文档对象模型,那 Code + DOM呢,自然是指代码文档模型了.如果你从来没接触过 CodeDom,你大概可以根据这个名字,推断它应该和代码文档模型有关. 这推断是靠谱的,CodeDom的功能,老周厚着脸皮把它归结为两大部分: 1.生成代码文档.这个听起来很玄?不玄,就是咱们在VS里常常耍的代码生成,比如你添加了一个服务引用,VS会帮你生成一个客户端代理类. 2.动态编译程序集.这个也好懂,就是动态编译

读书笔记：《HTML5开发手册》--HTML5新的结构元素

读书笔记:<HTML5开发手册> (HTML5 Developer's CookBook) 虽然从事前端开发已有很长一段时间,对HTML5标签也有使用,但在语义化上面理解还不够清晰.之前在图书馆看到HTML5这类书基本就是略过,想想无非就是介绍一些标签,给一些初学者看,但看了本书之后深受启发,拿来分享,也希望大家多提意见. 一.HTML5中新的结构元素 1. HTML5初始文件 1.1.doctype 在之前,doctype的声明是这样的: <!DOCTYPE HTML PUBLIC &

Python学习--04条件控制与循环结构

Python学习--04条件控制与循环结构条件控制在Python程序中,用if语句实现条件控制. 语法格式: if <条件判断1>: <执行1> elif <条件判断2>: <执行2> elif <条件判断3>: <执行3> else: <执行4> 注意语句后面的冒号:.像经典的C.Java都是以花括号来区分代码块,但是Python没有使用花括号表示,而是缩进,所以一定需要了解它们的语法区别. 示例: age = 3

HTML5 语义元素(一)页面结构

本篇主要介绍HTML5增加的语义元素中关于页面结构方面的,包含: <article>.<aside>.<figure>.<figcaption>.<footer>.<header>.<main>.<nav>.<section>等元素. 目录 1. 语义元素介绍 1.1 何为语义元素 1.2 特点 2. 原先界面布局 3. 页面结构语意元素 3.1 说明 3.2 详细介绍 3.3 示例图 4. 旧版浏

React在开发中的常用结构以及功能详解

一.React什么算法,什么虚拟DOM,什么核心内容网上一大堆,请自行google. 但是能把算法说清楚,虚拟DOM说清楚的聊聊无几.对开发又没卵用,还不如来点干货看看咋用. 二.结构如下: import reqwest from 'reqwest'; import React from 'react'; import ReactDOM from 'react-dom'; var Header = React.createClass({ handleClick:function(){ conso

ElasticSearch 5学习(10)——结构化查询（包括新特性）

之前我们所有的查询都属于命令行查询,但是不利于复杂的查询,而且一般在项目开发中不使用命令行查询方式,只有在调试测试时使用简单命令行查询,但是,如果想要善用搜索,我们必须使用请求体查询(request body search)API.之所以这么称呼,是因为大多数的参数以JSON格式所容纳而非查询字符串.请求体查询,并不仅仅用来处理查询,而且还可以高亮返回结果中的片段,并且给出帮助你的用户找寻最好结果的相关数据建议. 空查询我们以最简单的search API开始,空查询将会返回索引中所有的文档.

ASP.NET Core应用针对静态文件请求的处理[4]: DirectoryBrowserMiddleware中间件如何呈现目录结构

和StaticFileMiddleware中间件一样,DirectoryBrowserMiddleware中间本质上还是定义了一个请求地址与某个物理目录之间的映射关系,而目标目录体现为一个FileProvider对象.当这个中间件接收到匹配的请求后,会根据请求地址解析出对应目录的相对路径,并利用这个FileProvider获取目录的内容.目录的内容最终会以一个HTML文档的形式被定义,而此HTML最终会被这个中间件作为响应的内容,“目录浏览器”的实现原理就这么简单. [本文已经同步到<ASP.N

Go结构体实现类似成员函数机制

Go语言结构体成员能否是函数,从而实现类似类的成员函数的机制呢?答案是肯定的. package main import "fmt" type stru struct { testfunc1 func() testfunc2 func(a int) int } func test(a int) int { fmt.Println(a) return 1 } func main() { s := &stru{ testfunc1: func() { fmt.Println(&quo

CRL快速开发框架系列教程十(导出对象结构)

本系列目录 CRL快速开发框架系列教程一(Code First数据表不需再关心) CRL快速开发框架系列教程二(基于Lambda表达式查询) CRL快速开发框架系列教程三(更新数据) CRL快速开发框架系列教程四(删除数据) CRL快速开发框架系列教程五(使用缓存) CRL快速开发框架系列教程六(分布式缓存解决方案) CRL快速开发框架系列教程七(使用事务) CRL快速开发框架系列教程八(使用CRL.Package) CRL快速开发框架系列教程九(导入/导出数据) CRL快速开发框架系列教程十(

Javacript实现字典结构

字典是一种用[键,值]形式存储元素的数据结构.也称作映射,ECMAScript6中,原生用Map实现了字典结构. 下面代码是尝试用JS的Object对象来模拟实现一个字典结构. <script> //set添加 get获取 has是否有 remove删除 values获取所有value size获取长度 clear清除所有 function Dict(){ this.item = {}; } //是否存在元素 Dict.prototype.has = function(key){ return

设计模式之结构类模式大PK

结构类模式大PK 结构类模式包括适配器模式.桥梁模式.组合模式.装饰模式.门面模式.享元模式和代理模式.之所以称其为结构类模式,是因为他们都是通过组合类或对象产生更大结构以适应更高成层次的逻辑需求.我们来分析一下装饰模式和代理模式.装饰模式和适配器模式. 装饰模式VS代理模式首先要说明的是装饰模式是代理模式的特殊应用,两者的共同点是有相同的接口,不同点事代理模式着重对代理过程的控制,而装饰模式则是对类的功能进行加强或减弱,着重

CSS3新特性应用之结构与布局

一.自适应内部元素利用width的新特性min-content实现 width新特性值介绍: fill-available,自动填充盒子模型中剩余的宽度,包含margin.padding.border尺寸,他让非block元素也可实现宽度100%; max-content:假设容器有足够的宽度,足够的空间,此时,所占据的宽度就是max-content,与display为inline不一样,max-content就像white-space:nowrap一样,不会换行的. min-content:

Atitit.软件开发的三层结构isv金字塔模型

Atitit.软件开发的三层结构isv金字塔模型第一层,Implements 层,着重与功能的实现.. 第二次,spec层,理论层,设计规范,接口,等.流程.方法论顶层,val层,价值观层,原则,法则,定律等. 这一建构应从界定内涵出发,从器物.制度和意识形式三个层面厘定其表征:并结合发展轨迹,通过比较,探索.建构有利于“本土”文化,必须着力追寻能推动这一文化特质生成的进路,并以发挥其实践功效为归宿点和落脚点. 作者:: ★(attilax)>>> 绰号:老哇的爪子 ( 全名:

Linux实战教学笔记07:Linux系统目录结构介绍

第七节 Linux系统目录结构介绍标签(空格分隔):Linux实战教学笔记第1章前言 windows目录结构 C:\windows D:\Program Files E:\你懂的\精品 F:\你懂的\动态图 linux 目录结构一切从根开始=====> 这样的linux目录结构,那么可能同学们在初次接触Linux的时候,往往会觉得目录结构比较复杂,没有windows那样视窗简单明了的展示,从而感觉很迷茫. 其实,Linux系统的目录结构知识同样是很简单的,只是Linux系统的应用场景多为

认识ASP.NET 5项目结构和项目文件xproj

ASP.NET 5 在项目结构上做了很大的改变,我们以前熟悉的目录结构与项目文件内容都不太一样了,本篇文章带大家了解 ASP.NET 5 到底跟以前有哪些不一样的地方. 我们先用 Visual Studio 2015 建立一个全新的 ASP.NET 5 网站项目,打开VS2015,创建Web项目,.net framework 选择.net 4.5 以上,选择ASP.NET Web Application,在弹出的窗口里选择ASP.NET 5 Website模板创建项目,图示如下: 创建好项目后,

ucos实时操作系统学习笔记——内核结构和任务创建

对于ucos实时操作系统,邵贝贝的那本书已经写得很详细了,我因为之前不深的研究过ucos,所以在这里做一个笔记,写一些个人对该操作系统的理解,仅仅是个人理解,如果有人看到这边随笔有不对的地方,望给我指正.同时,锻炼一下自己组织语言的能力,有时候知道那么个意思,却总也说不出口. ucos内种中有几个人变量比较重要,被贯穿在ucos内核的设计中.这几个变量中有在PCB中的局部变量,也有在整个系统内核设计中的全局变量.下面将分别介绍一下这几个变量. 首先,从OS_PCB中的局部变量讲起,如果去掉OS_

【完全开源】知乎日报UWP版：项目结构说明、关键源代码解释

目录说明项目结构关键代码演示视频说明上一篇博客将源码放出来了,但是并没有做过多的介绍,所以如果自己硬看可能需要花费很长的时间,尤其这些代码并不是自己写的.项目不算复杂但是也不算简单,这篇文章我尽我所能将整个项目结构.关键的代码全部解释一下,希望能给对本项目感兴趣的童鞋.以及那些UWP初学者一些帮助. 背景了解 [完全开源]知乎日报UWP(上篇):界面设计.官方API分析. [完全开源]知乎日报UWP(下篇):商店APP.github源码.Windows APP良心出品. github

JVM虚拟机结构

JVM的主要结构如下图所示,图片引用自舒の随想日记. 方法区和堆由所有线程共享,其他区域都是线程私有的程序计数器(Program Counter Register) 类似于PC寄存器,是一块较小的内存区域,通过程序计数器中的值寻找要执行的指令的字节码,由于多线程间切换时要恢复每一个线程的当前执行位置,所以每个线程都有自己的程序计算器.这一个区域不会有OutOfMemeryError.当执行Java方法时,这里存储的执行的指令的地址,如果执行的是本地方法,这里的值是Undefined. 虚拟机栈

.NET 基础一步步一幕幕[方法、结构、枚举]

方法.结构.枚举方法: 将一堆代码进行重用的一种机制. 语法: [访问修饰符] 返回类型 <方法名>(参数列表){ 方法主体: } 返回值类型:如果不需要写返回值,写void 方法名:Pascal 每个单词的首字母都大些.其余字母小写参数列表:完成这个方法所必须要提供给这个方法的条件.如果没有参数,小括号也不省略. 方法写好后,如果想要被执行,必须要调用. 方法的调用语法:类名.方法名(参数); 案例: 结构: 一次性声明多个不同类型的变量.自定义数据类型,可以在其内部定义方法, 属于值类

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