tpm值多少算显著表达

2024-08-09

转录组表达量计RPKM、FPKM、TPM说明

在转录组测序(RNA-Seq)中,基因的表达量是我们关注的重点.基因表达量的衡量指标有:RPKM.FPKM.TPM. RPKM:Reads Per Kilobase Million:说实话,这个英文说明真的很费解,其实可以理解为“Reads Per Kilobase Per Million Reads”,即“每一百万条Reads中,对基因的每1000个Base而言,比对到该1000个base的Reads数”,计算公式. FPKM:Fragments per Kilobase Million,F

RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析

RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析差异分析的步骤:1)比对:2) read count计算:3) read count的归一化:4)差异表达分析: 背景知识:1)比对:普通比对: BWA,SOAP开大GAP比对:Tophat(Bowtie2):2) Read count(多重比对的问题):丢弃平均分配利用Unique region估计并重新分配表达量计算的本质目标基因表达量相对参照系表达量的数值.参照的本质:( 1)假设样本间参照的信号值应该是相同的:( 2)将样本间参照的观测值校

javascript基础程序（算出一个数的平方值、算出一个数的阶乘、输出!- !- !- !- !- -! -! -! -! -! 、函数三个数中的最大数）

<!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8"> <title>Document</title> <script> /* 算出一个数的平方值 function add(a){ var b=Math.sqrt(a); return b; } alert(add(3));*/ /*// 算出一个数的阶乘 func

应用程序框架实战十六:DDD分层架构之值对象（介绍篇）

前面介绍了DDD分层架构的实体,并完成了实体层超类型的开发,同时提供了验证方面的支持.本篇将介绍另一个重要的构造块——值对象,它是聚合中的主要成分. 如果说你已经在使用DDD分层架构,但你却从来没有使用过值对象,这毫不奇怪,因为多年来养成的数据建模思维已经牢牢把你禁锢,以致于你在使用面向对象方式进行开发时,还是以数据为中心. 当我们完成了基本的需求分析以后,如果说需要进行设计,那么你能想到的就是数据库表及表关系的设计,这就是数据建模.数据建模的主要依据是数据库范式设计,根据要求严格程度的递增分为

P值，“差异具有显著性”和“具有显著差异”

P值是论文中最常用的一个统计学指标,可是其误用.解释错误的现象却很常见.因此,很有必要说明p值的意义.用法及常见错误. P值指的是比较的两者的差别是由机遇所致的可能性大小.P值越小,越有理由认为对比事物间存在差异.例如,P<0.05,就是说结果显示的差别是由机遇所致的可能性不足5%,或者说,别人在同样的条件下重复同样的研究,得出相反结论的可能性不足5%.P>0.05称“不显著”:P<=0.05称“显著”,P<=0.01称“非常显著”. 由于常用“显著”来表示P值大小,所

lintcode 中等题：Evaluate Reverse Polish notation逆波兰表达式求值

题目逆波兰表达式求值在逆波兰表达法中,其有效的运算符号包括 +, -, *, / .每个运算对象可以是整数,也可以是另一个逆波兰计数表达. 样例 ["2", "1", "+", "3", "*"] -> ((2 + 1) * 3) -> 9 ["4", "13", "5", "/", "+"]

Swift语言指南(六)--可选值

原文:Swift语言指南(六)--可选值在值可能不存在的情况下使用可选值(optional), 可选值是: · 存在一个值,这个值等于 x 或 · 不存在任何值注: 在 C 和 Objective-C 中可选值的概念并不存在.Objective-C 中(与可选值)最相近的(概念)是,一个以对象为返回值的方法,也可以返回 nil,nil表示“不存在有效的对象”.不过,这规则只对对象有效——对于结构.基本的 C 类型或枚举值无效.对于这些类型,Objective-C 语言的方法通常会返回一个特殊

DDD分层架构之值对象（介绍篇）

DDD分层架构之值对象(介绍篇) 前面介绍了DDD分层架构的实体,并完成了实体层超类型的开发,同时提供了验证方面的支持.本篇将介绍另一个重要的构造块——值对象,它是聚合中的主要成分. 如果说你已经在使用DDD分层架构,但你却从来没有使用过值对象,这毫不奇怪,因为多年来养成的数据建模思维已经牢牢把你禁锢,以致于你在使用面向对象方式进行开发时,还是以数据为中心. 当我们完成了基本的需求分析以后,如果说需要进行设计,那么你能想到的就是数据库表及表关系的设计,这就是数据建模.数据建模的主要依据是数据库范

C++11 的右值引用

作者:Tinro链接:https://www.zhihu.com/question/22111546/answer/30801982来源:知乎著作权归作者所有.商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处. 右值引用是C++11中最重要的新特性之一,它解决了C++中大量的历史遗留问题,使C++标准库的实现在多种场景下消除了不必要的额外开销(如std::vector, std::string),也使得另外一些标准库(如std::unique_ptr, std::function)成为可能.即使

P值(P-value)，“差异具有显著性”和“具有显著差异”

郑冰刚提到P值,说P值的定义(着重号是笔者加的,英文是从WikiPedia摘来的): P值就是当原假设为真时,比所得到的样本观察结果更极端的结果出现的概率. The P-value is the probability of obtaining a result at least as extreme as the one that was actually observed, given that the null hypothesis is true. 以下延续白话系列,解释一下,“什么是P

SQL语句增删改字段、表、修改默认值

收集转载: 1.修改字段,默认值 .修改字段默认值 alter table 表名 drop constraint 约束名字 ------说明:删除表的字段的原有约束 alter table 表名 add constraint 约束名字 DEFAULT 默认值 for 字段名称 -------说明:添加一个表的字段的约束并指定默认值 .修改字段名: alter table 表名 rename column A to B .修改字段类型: alter table 表名 alter column Un

创建UI的线程才能访问UI，那么怎样才算访问UI呢

只有创建UI元素的线程(主线程又叫UI线程)才能访问UI元素.在UI线程中工作,不会有这个问题. 在后台线程中,如果直接访问UI元素,会抛出 “调用线程无法访问此对象,因为另一个线程拥有该对象” 异常. 在后台线程中,集合控件绑定在数据集上,增加或减少数据集会引起UI重绘,会抛出 “该类型的 CollectionView 不支持从调度程序线程以外的线程对其 SourceCollection 进行的更改” 异常. 在后台线程中工作,将访问UI的工作封送到UI线程来避免这个问题. 那么,怎么样的动作

【学术篇】luogu1351 [NOIP2014提高组] 联合权值

一道提高组的题..... 传送门:题目在这里.... 现在都懒得更自己的blog了,怕是太颓废了_ (:з」∠) _ 好久没做题了,手都生了.(好吧其实是做题方面手太生了) 这题我都不想讲了,把代码一贴就算了呗.. 但还是要说说的.... 首先,题目里说:"无向连通图G 有n 个点,n - 1 条边." 我们可以知道这是一棵树(怕不是废话..),这样遍历的时候就能保证是O(n)级别了.. 找最大值很简单,遍历树的时候找一下与每个点相连的点的最大值和次大值一乘就完了...显然这么贪心是

MTK Android Camera新增差值

一. 计算需要的插值如果原有的插值列表没有我们需要的插值的时候,要通过计算算出符合需求的插值,比如2700W的插值. 具体计算方法如下: 假设像素的长宽分别为X,Y,则插值为XY.由于MTK规定各参数必须是16的倍数,所以有如下公式: 1.16:9的插值: X = 16*16*n Y = 16*9*n XY = 16*16*n *16*9*n n 为调整插值大小的参数,通过增大或者减小n的值来算出不同的插值XY,例: 15M的n为20,X = 16*16*20 = 5120 Y = 16*9

关于C++的右值引用的一些看法

简介关于C++中的右值引用的详细可以看这一批博文<从4行代码看右值引用>.那一篇博文详细结合四行简单的代码详细介绍了右值引用的使用方法和一些场景,非常实用. 而本篇博文主要介绍一下我在学习右值引用的一些心得.因为在学习右值引用的时候,有一些地方非常难理解.所以写下这一篇博文,防止遗忘,由于对于C++涉猎不多,所以有一些不正确的地方,欢迎斧正. 为什么要使用右值引用? 对于普通开发者来说,右值引用的好处在于可以将保证在取用函数返回值的时候,减少一次复制的机会.如: #include <i

红黑树规则,TreeSet原理,HashSet特点,什么是哈希值,HashSet底层原理,Map集合特点,Map集合遍历方法

==学习目标== 1.能够了解红黑树 2.能够掌握HashSet集合的特点以及使用(特点以及使用,哈希表数据结构) 3.能够掌握Map集合的特点以及使用(特点,常见方法,Map集合的遍历) 4.能够掌握HashMap集合的特点以及使用 5.能够掌握TreeMap集合的特点以及使用 ==知识点== 红黑树 HashSet Map HashMap TreeMap ==知识点梳理== ==超详细讲义== 1.红黑树 1.1红黑树-概述[了解](视频01) (2'') 1.什么是红黑树平衡二叉B树,每

EasyPR--开发详解（3）高斯模糊、灰度化和Sobel算子

在上篇文章中我们了解了PlateLocate的过程中的所有步骤.在本篇文章中我们对前3个步骤,分别是高斯模糊.灰度化和Sobel算子进行分析. 一.高斯模糊 1.目标对图像去噪,为边缘检测算法做准备. 2.效果在我们的车牌定位中的第一步就是高斯模糊处理. 图1 高斯模糊效果 3.理论详细说明可以看这篇:阮一峰讲高斯模糊. 高斯模糊是非常有名的一种图像处理技术.顾名思义,其一般应用是将图像变得模糊,但同时高斯模糊也应用在图像的预处理阶段.理解高斯模糊前,先看一下平均模糊算法.平均模糊的算法非

php易混淆知识点

一.define(“constant”, “hello world”);和const constant = “hello world”;的区别? (0).使用const使得代码简单易读,const本身就是一个语言结构,而define是一个函数.另外const在编译时要比define快很多. (1).const用于类成员(或者接口成员)变量的定义,一经定义,不可修改.php5.3以上支持类外通过const定义常量,并且在使用命名空间时只能用这个来定义常量. define不可用于类成员变量的定义,

stm32 中断几个库函数实现过程分析

感谢原文作者:鱼竿的传说,这篇文章写得不错,转载自 http://www.cnblogs.com/chineseboy/archive/2013/03/14/2956782.html 前题: 闭门造车,两周了,经过各种的思考和求问,反复阅读了<<M3权威指南>>和<<stm32不完全手册>>的相关章节,以及开发板厂商的实验例程,对stm32这块中断终有所悟,是以记之. 至于中断的什么优先级,什么优先级分组,使能之类的原理,就不再赘述.这里主要是记载以下如何使

浅谈Logistic回归及过拟合

判断学习速率是否合适?每步都下降即可.这篇先不整理吧... 这节学习的是逻辑回归(Logistic Regression),也算进入了比较正统的机器学习算法.啥叫正统呢?我概念里面机器学习算法一般是这样一个步骤: 1)对于一个问题,我们用数学语言来描述它,然后建立一个模型,例如回归模型或者分类模型等来描述这个问题: 2)通过最大似然.最大后验概率或者最小化分类误差等等建立模型的代价函数,也就是一个最优化问题.找到最优化问题的解,也就是能拟合我们的数据的最好的模型参数: 3)然后我们需要求解这个代

(C++) 基本面试题（整理）

1.new.delete.malloc.free关系 new/delete是C++的运算符.new 调用构造函数用于动态申请内存,delete调用对象的析构函数,用于释放内存. malloc与free是C++/C语言的标准库函数, 也是用来申请和释放内存.由于malloc/free是库函数而不是运算符,不在编译器控制权限之内,不能够把执行构造函数和析构函数的任务强加于malloc/free. 2.delete与 delete []区别 delete只会调用一次析构函数,而delete[]会调用每

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