tpm数据能DESeq2做差异

2024-09-03

TPM、read counts、RPKM/FPKM你选对了吗？

TPM.read counts.RPKM/FPKM你选对了吗? 已有 3940 次阅读 2017-12-15 15:04 |个人分类:RNA-seq|系统分类:科普集锦|关键词:RNA-seq| RNA-seq 本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权.查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小哈来源:嘉因在RNA测序分析,哪家公司适合我一文中,聊过类似的问题. 这次小哈搬来了statQuest的3个最新视频,https://statquest.org/vid

抓取摩拜单车API数据，并做可视化分析

抓取摩拜单车API数据,并做可视化分析纵聊天下百家号|04-19 15:16 关注警告:此篇文章仅作为学习研究参考用途,请不要用于非法目的. 摩拜是最早进入成都的共享单车,每天我从地铁站下来的时候,在APP中能看到很多单车,但走到那里的时候,才发现车并不在那里.有些车不知道藏到了哪里:有些车或许是在高楼的后面,由于有GPS的误差而找不到了:有些车被放到了小区里面,一墙之隔让骑车人无法获得到车. 那么有没有一个办法通过获得这些单车的数据,来分析这些车是否变成了僵尸车?是否有人故意放到小区里面

领导满意，客户喜欢的数据报表怎么做，交给Smartbi!

财务分析是以会计核算和报表资料及其他相关资料为依据,采用一系列专门的分析技术和方法,对企业等经济组织过去和现在有关筹资活动.投资活动.经营活动.分配活动的盈利能力.营运能力.偿债能力和增长能力状况等进行分析与评价的经济管理活动.从定义上可知,财务分析是立足于财务资料(基础),利用专业技术(手段),对企业的经营管理能力(对象)进行分析,最后从财务角度做出结论,并提出合理化建议.从这里可以看出,财务分析其实是管理会计的一个组成部分. 初入职场,很多同学都很向往财务分析工作,觉得很是高大上,听名字就是

Oracle 取两个表中数据的交集并集差异集合

Oracle 取两个表中数据的交集关键字: Oracle 取两个表中数据的交集 INTERSECT Oracle 作为一个大型的关系数据库,日常应用中往往需要提取两个表的交集数据例如现有如下表,要求找出工资2500(不含2500)以上并且是男性(M)的员工编号,那么就要利用这两个表的关系做一个交集了 employee CODE NAME GENDER 001 Tom M 002 Jerry M 003 Ana F salary CODE SALARY 001 2800 002 2500 00

从 Hadoop 到云原生，大数据平台如何做存算分离

Hadoop 的诞生改变了企业对数据的存储.处理和分析的过程,加速了大数据的发展,受到广泛的应用,给整个行业带来了变革意义的改变:随着云计算时代的到来, 存算分离的架构受到青睐,企业开开始对 Hadoop 的架构进行改造. 今天与大家一起简单回顾 Hadoop 架构以及目前市面上不同的存算分离的架构方案,他们的利弊各有哪些,希望可以给正在存算分离架构改造的企业一些参考和启发. Hadoop 存算耦合架构回顾 2006 年 Hadoop 刚发布,这是一个 all-in-one 的套装,最早有三个核

对需要聚类的数据使用canopy做初步的计算

K值聚类的时候,需要自己指定cluster的数目. 这个cluster数目一般是通过canopy算法进行预处理来确定的. canopy具体描述可以参考这里. 下面是 golang语言的一个实现(对经纬度距离计算进行cluster). package main import ( "fmt" "math" ) const ( EARTH_RADIUS = ) type Point struct { lat float64 lng float64 } func Pop(p

关于淘宝的数据来源,针对做淘宝客网站的淘宝api调用方法

上次写了个淘宝返利模式的博客,直接被移除首页,不知道何故啊.可能是真的跟技术不太刮边. 众所周知,能够支撑一个网站运营的最基础不是程序写的多么好.也不是有多么牛X的运营人员,最主要的是数据,如果没有数据,网站几乎等于没有价值. 想做淘宝客相关的网站,那么如何能够获取淘宝的数据就是一个比较艰巨的任务.好在淘宝提供了一个开放平台,能够使我们方便的获取网站数据.做淘宝客相关的网站,如何得到淘宝的数据呢. 这里我总结一下数据的基本来源,对于经营淘宝客的网站来说,主要是导购业务,也有一些网站的附属业务,运

面向对象的方式进行数据交换网络之间的差异--无缝切换的发展到单机游戏C/S模式

上一页本文描述描述有关数据的发展过程之间的差异支撑点,这里展示的另一个特点:无缝切换的发展,以独立C/S模式一般C/S模式都面临一个问题: 就是开发过程中的调试难题,由于涉及到client和服务端相关方法,假设由某个人来编写那么也是一个简单的事情. 假设由2个人编写,会带来一些平台上的差别以及编码的差别. 简单的说,假设我们在开发时全然的避开C/S,然后经由某个机制,能够直接让模块跑到server上,那么这将让你的开发速度上升好几个倍率. 没有协议,没有交互,没有网络,那么从头写到尾,也是一件

基于Kafka Connect框架DataPipeline在实时数据集成上做了哪些提升？

在不断满足当前企业客户数据集成需求的同时,DataPipeline也基于Kafka Connect 框架做了很多非常重要的提升. 1. 系统架构层面. DataPipeline引入DataPipeline Manager的概念,主要用于优化Source和Sink的全局化生命周期管理.当任务出现异常时,可以实现对目的端和全局生命周期的管理.例如,处理源端到目的端读取速率不匹配以及暂停等状态的协同. 为了加强系统的健壮性,我们把Connector任务的参数保存在ZooKeeper中,方便任务重启后读

相同数据源情况下，使用Kafka实时消费数据 vs 离线环境下全部落表后处理数据，结果存在差异

原因分析: 当某个consumer宕机时,消费位点(例如2s提交一次)尚未提交到zookeeper,此时Kafka集群自动rebalance后另一consumer来接替该宕机consumer继续消费,因为先前宕机consumer最近的消费位点尚未提交,导致数据重复消费突发流量.跨机房(网络请求延时高).网络不稳定,出现丢包现象业务逻辑有偏差常见丢包现象如突然掉线.页面卡住.视频卡住.图片加载卡主等,使用Ping测量丢包的最佳方法是向一个IP地址发送大量的Ping命令,然后检查没有应答的那些

有一张表里面有上百万的数据，在做查询的时候，如何优化？从数据库端，java端和查询语句上回答

原文:https://www.2cto.com/database/201612/580140.html 1)数据库设计方面: a. 对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. b. 应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索引而进行全表扫描,如: select id from t where num is null 可以在num上设置默认值0,确保表中num列没有null值,然后这样查询:

工作框架各种使用整理 -- 展示数据列表并做update

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <screen xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:noNamespaceSchemaLocation="http://moqui.org/xsd/xml-screen-2.0.xsd"

前端数据统计用做Bootstrap的一些柱状图、饼状图和折线图案例

Bootstrap,来自 Twitter,是目前最受欢迎的前端框架.Bootstrap 是基于 HTML.CSS.JAVASCRIPT 的,它简洁灵活,使得 Web 开发更加快捷. Bootstrap 使用了一些 HTML5 元素和 CSS 属性.为了让这些正常工作,您需要使用 HTML5 文档类型(Doctype). 因此,请在使用 Bootstrap 项目的开头包含下面的代码段. <!DOCTYPE html> <html> .... </html> Bootstr

Oracle数据表比较记录差异（转）

liuyx_know|七级你可以参照一下Oracle的UNION [ALL], INTERSECT, MINUS操作符,至于你的问题你可以使用MINUS操作符,语句如下: SELECT * FROM TBLB MINUS SELECT * FROM TBLA

sql server 备份与恢复系列四大容量模式下的备份与还原

一. 概述在sql server 备份与恢复系列的第一篇里,有讲到大容量模式下备份与还原的相关知识.这篇重点来演示在大容量模式下常用的备份与还原模式“完整备份+差异备份+日志备份”. 在大容量恢复模式下,特别要注意的是在什么情况下会导致数据还原丢失风险,带着这个问题,来进行演示说明.备份策略如下图所示: 二.备份我这里有TestBulkLogged库,库里新建了一个product空表.备份SQL语句如下所示: use master -- 设置大容量模式 ALTER DATABASE Test

现在很火的数据科学到底是什么？你对做DATA SCIENTIST感兴趣吗？

转自– Warald (Email: iamxiaoning@gmail.com) 博客: http://www.1point3acres.com,微博:http://www.weibo.com/warald 开头:如果你极其讨厌编程.大学数学勉强合格,或者跟人交流能力巨挫,那这篇文章可能不适合你看,你也可以自动叉掉其他关于data science/scientist的文章.Warald会花一周时间集中介绍一下这门科学,用具体的例子谈一下数据科学家到底做哪些工作.读什么专业.需要什么样的技能,欢

BAT、网易、京东等如何做大数据风控的？

大数据风控目前应该是前沿技术在金融领域的最成熟应用,相对于智能投顾.区块链等还在初期的金融科技应用,大数据风控目前已经在业界逐步普及,从BATJ这样的大企业,到交易规模比较大的网贷平台,再到做现金贷.消费金融的创业公司,都在通过大数据风控技术来控制贷款规模扩张中的风险. 现在提到互联网金融.Fintech,首先想到的就是大数据风控.随着网易北斗大数据风控平台的上线,业内包括BAT.网易在内的主要国内互联网巨头都开始在大数据和金融衍生应用领域进入了金融科技化阶段,和互联网金融第一阶段相比,目前产生

TGCA数据的标准化以及差异分析--转载

转载果子学生信 https://mp.weixin.qq.com/s/Ph1O6V5RkxkyrKpVmB5ODA 前面我们从GDC下载了TCGA肿瘤数据库的数据,也能够把GDC下载的多个TCGA文件批量读入R 今天我们讲一下TCGA数据的标准化,以及差异分析,得到了标准化后的数据,我们就可以按照以前的帖子,做一系列操作 Y叔推荐的这个图有毒! 图有毒系列之2 多个基因在多亚组疾病中的展示在得到了差异分析的结果后,我们可以完成热图,火山图,GO分析,KEGG分析,GSEA分析,就跟这个帖子中

MySQL自动化运维之用mysqldump和mysqlbinlog实现某一数据库的每周全备和每天差异备份，并添加到执行计划【热备】

案例: 线上有一数据库,需要每周全备一次,每天差备一次[安全起见还是差备吧,不要增备,不要吝啬磁盘哦,而且差备恢复还很快] 1.每周对数据库hellodb做完全备份 crontab任务计划: * * /bin/bash /work/dump-complete-hello.sh ===>每周周一凌晨1点10分执行全备脚本/work/dump-complete-hello.sh 全备脚本/work/dump-complete-hello.sh内容如下: #!/bin/bash # 全备文件存放位置

大型web系统数据缓存设计

1. 前言在高访问量的web系统中,缓存几乎是离不开的:但是一个适当.高效的缓存方案设计却并不容易:所以接下来将讨论一下应用系统缓存的设计方面应该注意哪些东西,包括缓存的选型.常见缓存系统的特点和数据指标.缓存对象结构设计和失效策略以及缓存对象的压缩等等,以期让有需求的同学尤其是初学者能够快速.系统的了解相关知识. 2. 数据库的瓶颈 2.1 数据量关系型数据库的数据量是比较小的,以我们常用的MySQL为例,单表数据条数一般应该控制在2000w以内,如果业务很复杂的话,可能还要低一些.即便是

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